SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 1072681 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 1216 1217 1218 1219 1220 1221 1222 1223 1224 1225 1226 1227 1228 1229 1230 1231 1232 1233 1234 1235 1236 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    245001 4lnf:D (2.949) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245002 4lnf:D (2.949) BS03 GLN 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245003 4lnf:E (2.949) BS01 GLN 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245004 4lnf:E (2.949) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245005 4lnf:E (2.949) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245006 4lnf:E (2.949) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245007 4lnf:F (2.949) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245008 4lnf:F (2.949) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245009 4lnf:F (2.949) BS03 GLN 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245010 4lnf:G (2.949) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245011 4lnf:G (2.949) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245012 4lnf:G (2.949) BS03 GLN 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245013 4lnf:H (2.949) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245014 4lnf:H (2.949) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245015 4lnf:H (2.949) BS03 GLN 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245016 4lnf:I (2.949) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245017 4lnf:I (2.949) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245018 4lnf:I (2.949) BS03 GLN 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245019 4lnf:J (2.949) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245020 4lnf:J (2.949) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245021 4lnf:J (2.949) BS03 GLN 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245022 4lnf:K (2.949) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245023 4lnf:K (2.949) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245024 4lnf:K (2.949) BS03 GLN 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245025 4lnf:L (2.949) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245026 4lnf:L (2.949) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245027 4lnf:L (2.949) BS03 GLN 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245028 4lng:B (1.905) BS01 ZN 2.5.1.58 GO:0003824 ... Q4WPS9 24347326
    245029 4lng:B (1.905) BS02 JAN 2.5.1.58 GO:0003824 ... Q4WPS9 24347326
    245030 4lng:B (1.905) BS03 FPP 2.5.1.58 GO:0003824 ... Q4WPS9 24347326
    245031 4lni:A (2.5793) BS01 P3S 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245032 4lni:A (2.5793) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245033 4lni:A (2.5793) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245034 4lni:A (2.5793) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245035 4lni:A (2.5793) BS05 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245036 4lni:B (2.5793) BS01 P3S 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245037 4lni:B (2.5793) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245038 4lni:B (2.5793) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245039 4lni:B (2.5793) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245040 4lni:B (2.5793) BS05 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245041 4lni:C (2.5793) BS01 P3S 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245042 4lni:C (2.5793) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245043 4lni:C (2.5793) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245044 4lni:C (2.5793) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245045 4lni:C (2.5793) BS05 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245046 4lni:D (2.5793) BS01 P3S 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245047 4lni:D (2.5793) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245048 4lni:D (2.5793) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245049 4lni:D (2.5793) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245050 4lni:D (2.5793) BS05 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245051 4lni:E (2.5793) BS01 P3S 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245052 4lni:E (2.5793) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245053 4lni:E (2.5793) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245054 4lni:E (2.5793) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245055 4lni:E (2.5793) BS05 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245056 4lni:F (2.5793) BS01 P3S 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245057 4lni:F (2.5793) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245058 4lni:F (2.5793) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245059 4lni:F (2.5793) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245060 4lni:F (2.5793) BS05 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245061 4lni:G (2.5793) BS01 P3S 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245062 4lni:G (2.5793) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245063 4lni:G (2.5793) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245064 4lni:G (2.5793) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245065 4lni:G (2.5793) BS05 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245066 4lni:H (2.5793) BS01 P3S 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245067 4lni:H (2.5793) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245068 4lni:H (2.5793) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245069 4lni:H (2.5793) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245070 4lni:H (2.5793) BS05 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245071 4lni:I (2.5793) BS01 P3S 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245072 4lni:I (2.5793) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245073 4lni:I (2.5793) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245074 4lni:I (2.5793) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245075 4lni:I (2.5793) BS05 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245076 4lni:J (2.5793) BS01 P3S 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245077 4lni:J (2.5793) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245078 4lni:J (2.5793) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245079 4lni:J (2.5793) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245080 4lni:J (2.5793) BS05 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245081 4lni:K (2.5793) BS01 P3S 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245082 4lni:K (2.5793) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245083 4lni:K (2.5793) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245084 4lni:K (2.5793) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245085 4lni:K (2.5793) BS05 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245086 4lni:L (2.5793) BS01 P3S 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245087 4lni:L (2.5793) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245088 4lni:L (2.5793) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245089 4lni:L (2.5793) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245090 4lni:L (2.5793) BS05 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245091 4lnj:A (2.1) BS01 MG N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245092 4lnj:A (2.1) BS02 PLR N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245093 4lnj:B (2.1) BS01 MG N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245094 4lnj:B (2.1) BS02 PLR N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245095 4lnk:A (2.87) BS01 GLU 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245096 4lnk:A (2.87) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245097 4lnk:A (2.87) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245098 4lnk:A (2.87) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245099 4lnk:A (2.87) BS05 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245100 4lnk:B (2.87) BS01 GLU 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245101 4lnk:B (2.87) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245102 4lnk:B (2.87) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245103 4lnk:B (2.87) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245104 4lnk:C (2.87) BS01 GLU 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245105 4lnk:C (2.87) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245106 4lnk:C (2.87) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245107 4lnk:D (2.87) BS01 GLU 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245108 4lnk:D (2.87) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245109 4lnk:D (2.87) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245110 4lnk:D (2.87) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245111 4lnk:E (2.87) BS01 GLU 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245112 4lnk:E (2.87) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245113 4lnk:E (2.87) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245114 4lnk:E (2.87) BS04 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245115 4lnk:F (2.87) BS01 GLU 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245116 4lnk:F (2.87) BS02 ADP 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245117 4lnk:F (2.87) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245118 4lnl:A (2.1) BS01 MG N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245119 4lnl:A (2.1) BS02 2BO N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245120 4lnl:A (2.1) BS03 2BK N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245121 4lnl:A (2.1) BS04 MG N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245122 4lnl:B (2.1) BS01 MG N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245123 4lnl:B (2.1) BS02 PLG N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245124 4lnm:A (2.1) BS01 CA N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245125 4lnm:A (2.1) BS02 PLR N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245126 4lnm:A (2.1) BS03 CA N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245127 4lnm:B (2.1) BS01 PLG N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245128 4lnm:B (2.1) BS02 CA N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245129 4lnm:B (2.1) BS03 CA N/A GO:0006520 ... N/A 24165453
    245130 4lnn:A (3.1) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245131 4lnn:A (3.1) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245132 4lnn:B (3.1) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245133 4lnn:B (3.1) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245134 4lnn:C (3.1) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245135 4lnn:C (3.1) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245136 4lnn:D (3.1) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245137 4lnn:D (3.1) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245138 4lnn:E (3.1) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245139 4lnn:E (3.1) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245140 4lnn:F (3.1) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245141 4lnn:F (3.1) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245142 4lnn:G (3.1) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245143 4lnn:H (3.1) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245144 4lnn:H (3.1) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245145 4lnn:I (3.1) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245146 4lnn:I (3.1) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245147 4lnn:J (3.1) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245148 4lnn:J (3.1) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245149 4lnn:K (3.1) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245150 4lnn:K (3.1) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245151 4lnn:L (3.1) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245152 4lnn:L (3.1) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245153 4lno:A (2.9) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245154 4lno:A (2.9) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245155 4lno:A (2.9) BS03 GLN 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245156 4lno:B (2.9) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245157 4lno:B (2.9) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245158 4lno:B (2.9) BS03 GLN 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245159 4lno:C (2.9) BS01 GLN 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245160 4lno:C (2.9) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245161 4lno:C (2.9) BS03 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245162 4lno:D (2.9) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245163 4lno:D (2.9) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245164 4lno:D (2.9) BS03 GLN 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245165 4lno:E (2.9) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245166 4lno:E (2.9) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245167 4lno:E (2.9) BS03 GLN 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245168 4lno:F (2.9) BS01 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245169 4lno:F (2.9) BS02 MG 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245170 4lno:F (2.9) BS03 GLN 6.3.1.2 GO:0000287 ... P12425 24158439
    245171 4lnp:A (1.41) BS01 peptide ? N/A Q9BX66 24878663
    245172 4lnq:A (2.0) BS01 dna ? GO:0002218 ... Q9R002 24419611
    245173 4lnq:A (2.0) BS02 dna ? GO:0002218 ... Q9R002 24419611
    245174 4lnq:B (2.0) BS01 dna ? GO:0002218 ... Q9R002 24419611
    245175 4lnq:B (2.0) BS02 dna ? GO:0002218 ... Q9R002 24419611
    245176 4lnr:A (2.0) BS01 peptide ? N/A P01889 25028510
    245177 4lnt:QB (2.94) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80371 25128388
    245178 4lnt:QC (2.94) BS01 rna ? GO:0003676 ... P80372 25128388
    245179 4lnt:QD (2.94) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80373 25128388
    245180 4lnt:QD (2.94) BS02 ZN ? GO:0003723 ... P80373 25128388
    245181 4lnt:QE (2.94) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 25128388
    245182 4lnt:QF (2.94) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLP8 25128388
    245183 4lnt:QF (2.94) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SLP8 25128388
    245184 4lnt:QG (2.94) BS01 rna ? GO:0000049 ... P17291 25128388
    245185 4lnt:QH (2.94) BS01 rna N/A GO:0003735 ... P0DOY9 25128388
    245186 4lnt:QH (2.94) BS02 MG N/A GO:0003735 ... P0DOY9 25128388
    245187 4lnt:QI (2.94) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80374 25128388
    245188 4lnt:QI (2.94) BS02 rna ? GO:0003723 ... P80374 25128388
    245189 4lnt:QJ (2.94) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN7 25128388
    245190 4lnt:QK (2.94) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80376 25128388
    245191 4lnt:QL (2.94) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN3 25128388
    245192 4lnt:QM (2.94) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80377 25128388
    245193 4lnt:QM (2.94) BS02 rna ? GO:0000049 ... P80377 25128388
    245194 4lnt:QM (2.94) BS03 MG ? GO:0000049 ... P80377 25128388
    245195 4lnt:QN (2.94) BS01 rna N/A GO:0003735 ... P0DOY6 25128388
    245196 4lnt:QN (2.94) BS02 ZN N/A GO:0003735 ... P0DOY6 25128388
    245197 4lnt:QO (2.94) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 25128388
    245198 4lnt:QO (2.94) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 25128388
    245199 4lnt:QP (2.94) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJH3 25128388
    245200 4lnt:QQ (2.94) BS01 rna N/A GO:0003735 ... P0DOY7 25128388

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).