SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 1701 1702 1703 1704 1705 1706 1707 1708 1709 1710 1711 1712 1713 1714 1715 1716 1717 1718 1719 1720 1721 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    342001 5erp:A (2.7) BS02 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342002 5erp:A (2.7) BS03 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342003 5erp:A (2.7) BS04 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342004 5erp:A (2.7) BS05 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342005 5erp:A (2.7) BS06 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342006 5erp:A (2.7) BS07 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342007 5erp:A (2.7) BS08 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342008 5erp:A (2.7) BS09 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342009 5erp:A (2.7) BS10 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342010 5erp:A (2.7) BS11 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342011 5erp:B (2.7) BS01 MAN ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342012 5erp:B (2.7) BS02 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342013 5erp:B (2.7) BS03 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342014 5erp:B (2.7) BS04 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342015 5erp:B (2.7) BS05 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342016 5erp:B (2.7) BS06 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342017 5erp:B (2.7) BS07 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342018 5erp:B (2.7) BS08 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342019 5erp:B (2.7) BS09 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342020 5erp:B (2.7) BS10 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342021 5erp:B (2.7) BS11 CA ? GO:0005509 ... Q02487 27298358
    342022 5err:A (1.65) BS01 ADP 2.10.1.1
    2.7.7.75
    GO:0006777 ... Q03555 27112598 MOAD: Kd=260uM
    342023 5ers:A (1.7) BS01 AMP 2.10.1.1
    2.7.7.75
    GO:0006777 ... Q03555 27112598 MOAD: Kd=2mM
    342024 5ert:A (2.0) BS01 ADP 2.10.1.1
    2.7.7.75
    GO:0006777 ... Q03555 27112598
    342025 5eru:A (1.6) BS01 ADP 2.10.1.1
    2.7.7.75
    GO:0006777 ... Q03555 27112598
    342026 5eru:A (1.6) BS02 MOO 2.10.1.1
    2.7.7.75
    GO:0006777 ... Q03555 27112598
    342027 5erv:A (1.8) BS01 ADP 2.10.1.1
    2.7.7.75
    GO:0006777 ... Q03555 27112598
    342028 5erv:A (1.8) BS02 WO4 2.10.1.1
    2.7.7.75
    GO:0006777 ... Q03555 27112598
    342029 5erw:A (2.9) BS01 peptide N/A N/A N/A N/A
    342030 5erw:B (2.9) BS01 peptide N/A N/A N/A N/A
    342031 5es1:A (2.8) BS01 5RC 2.7.11.1 GO:0004672 ... Q96L34 26841763
    342032 5es4:A (3.3) BS01 MAN ? GO:0005178 ... P20702 26936951
    342033 5es4:A (3.3) BS02 CA ? GO:0005178 ... P20702 26936951
    342034 5es4:A (3.3) BS03 CA ? GO:0005178 ... P20702 26936951
    342035 5es4:A (3.3) BS04 CA ? GO:0005178 ... P20702 26936951
    342036 5es4:A (3.3) BS05 MG ? GO:0005178 ... P20702 26936951
    342037 5es4:B (3.3) BS01 CA ? GO:0001540 ... P05107 26936951
    342038 5es4:C (3.3) BS01 CA ? GO:0005178 ... P20702 26936951
    342039 5es4:C (3.3) BS02 CA ? GO:0005178 ... P20702 26936951
    342040 5es4:C (3.3) BS03 CA ? GO:0005178 ... P20702 26936951
    342041 5es4:D (3.3) BS01 CA ? GO:0001540 ... P05107 26936951
    342042 5es4:E (3.3) BS01 CA ? GO:0005178 ... P20702 26936951
    342043 5es4:E (3.3) BS02 CA ? GO:0005178 ... P20702 26936951
    342044 5es4:E (3.3) BS03 CA ? GO:0005178 ... P20702 26936951
    342045 5es4:F (3.3) BS01 CA ? GO:0001540 ... P05107 26936951
    342046 5es4:G (3.3) BS01 CA ? GO:0005178 ... P20702 26936951
    342047 5es4:G (3.3) BS02 CA ? GO:0005178 ... P20702 26936951
    342048 5es4:G (3.3) BS03 CA ? GO:0005178 ... P20702 26936951
    342049 5es4:H (3.3) BS01 CA ? GO:0001540 ... P05107 26936951
    342050 5es7:A (2.805) BS01 FON ? GO:0009058 ... Q70LM7 26762462
    342051 5es7:A (2.805) BS02 VAL ? GO:0009058 ... Q70LM7 26762462
    342052 5es7:A (2.805) BS03 APC ? GO:0009058 ... Q70LM7 26762462
    342053 5es8:A (2.547) BS01 5S4 ? GO:0009058 ... Q70LM7 26762462
    342054 5es8:B (2.547) BS01 5S4 ? GO:0009058 ... Q70LM7 26762462
    342055 5es9:A (3.77) BS01 PNS ? GO:0009058 ... Q70LM7 26762462
    342056 5esb:A (2.4) BS01 ZN 3.6.4.13 GO:0006508 ... A0A0B4WYC6 27512818
    342057 5esb:A (2.4) BS02 SU3 3.6.4.13 GO:0006508 ... A0A0B4WYC6 27512818
    342058 5esd:A (2.25) BS01 MN 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342059 5esd:A (2.25) BS02 TPP 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342060 5esd:A (2.25) BS03 TPP 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342061 5esd:B (2.25) BS01 TPP 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342062 5esd:B (2.25) BS02 MN 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342063 5esd:B (2.25) BS03 TPP 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342064 5esd:C (2.25) BS01 TPP 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342065 5esd:C (2.25) BS02 TPP 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342066 5esd:C (2.25) BS03 MN 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342067 5esd:D (2.25) BS01 TPP 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342068 5esd:D (2.25) BS02 MN 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342069 5ese:A (2.2) BS01 HEM 1.14.13.70 GO:0004497 ... A6ZSR0 29263059
    342070 5ese:A (2.2) BS02 TPF 1.14.13.70 GO:0004497 ... A6ZSR0 29263059
    342071 5esf:A (2.25) BS01 HEM 1.14.13.70 GO:0004497 ... A6ZSR0 29263059
    342072 5esf:A (2.25) BS02 TPF 1.14.13.70 GO:0004497 ... A6ZSR0 29263059
    342073 5esg:A (1.981) BS01 1YN 1.14.13.70 GO:0004497 ... A6ZSR0 29263059
    342074 5esg:A (1.981) BS02 HEM 1.14.13.70 GO:0004497 ... A6ZSR0 29263059
    342075 5esh:A (2.15) BS01 HEM 1.14.13.70 GO:0004497 ... A6ZSR0 29263059
    342076 5esh:A (2.15) BS02 1YN 1.14.13.70 GO:0004497 ... A6ZSR0 29263059
    342077 5esi:A (2.1) BS01 HEM ? GO:0004497 ... A6ZSR0 29263059
    342078 5esj:A (2.15) BS01 HEM ? GO:0004497 ... A6ZSR0 29263059
    342079 5esj:A (2.15) BS02 TPF ? GO:0004497 ... A6ZSR0 29263059
    342080 5esk:A (2.24) BS01 1YN ? GO:0004497 ... A6ZSR0 29263059
    342081 5esk:A (2.24) BS02 HEM ? GO:0004497 ... A6ZSR0 29263059
    342082 5esl:A (2.35) BS01 1YN ? GO:0004497 ... A6ZSR0 N/A
    342083 5esl:A (2.35) BS02 HEM ? GO:0004497 ... A6ZSR0 N/A
    342084 5esm:A (2.0) BS01 HEM 1.14.13.70 GO:0004497 ... A6ZSR0 N/A
    342085 5esm:A (2.0) BS02 TPF 1.14.13.70 GO:0004497 ... A6ZSR0 N/A
    342086 5esn:A (2.35) BS01 HEM 1.14.13.70 GO:0004497 ... A6ZSR0 N/A
    342087 5eso:A (2.05) BS01 ISC 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342088 5eso:A (2.05) BS02 TPP 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342089 5eso:B (2.05) BS01 MG 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342090 5eso:B (2.05) BS02 ISC 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342091 5eso:B (2.05) BS03 TPP 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342092 5eso:C (2.05) BS01 ISC 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342093 5eso:C (2.05) BS02 MG 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342094 5eso:C (2.05) BS03 TPP 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342095 5eso:D (2.05) BS01 ISC 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342096 5eso:D (2.05) BS02 MG 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342097 5eso:D (2.05) BS03 TPP 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342098 5esp:A (2.995) BS01 dna ? GO:0004519 ... P15563 27133026
    342099 5esp:A (2.995) BS02 dna ? GO:0004519 ... P15563 27133026
    342100 5esp:A (2.995) BS03 CA ? GO:0004519 ... P15563 27133026
    342101 5esp:A (2.995) BS04 CA ? GO:0004519 ... P15563 27133026
    342102 5esp:B (2.995) BS01 dna ? GO:0004519 ... P15563 27133026
    342103 5esp:B (2.995) BS02 dna ? GO:0004519 ... P15563 27133026
    342104 5esp:B (2.995) BS03 CA ? GO:0004519 ... P15563 27133026
    342105 5esp:B (2.995) BS04 CA ? GO:0004519 ... P15563 27133026
    342106 5esq:A (2.55) BS01 peptide N/A N/A N/A 27303895
    342107 5esq:B (2.55) BS01 peptide N/A N/A N/A 27303895
    342108 5esq:C (2.55) BS01 peptide N/A N/A N/A 27303895
    342109 5esq:D (2.55) BS01 peptide N/A N/A N/A 27303895
    342110 5esr:A (1.476) BS01 CO 3.8.1.5 GO:0003824 ... Q9A919 26833751
    342111 5esr:A (1.476) BS02 CO 3.8.1.5 GO:0003824 ... Q9A919 26833751
    342112 5esr:A (1.476) BS03 MG 3.8.1.5 GO:0003824 ... Q9A919 26833751
    342113 5esr:A (1.476) BS04 CO 3.8.1.5 GO:0003824 ... Q9A919 26833751
    342114 5esr:A (1.476) BS05 MG 3.8.1.5 GO:0003824 ... Q9A919 26833751
    342115 5ess:A (2.2) BS01 MG 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342116 5ess:A (2.2) BS02 DPO 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342117 5ess:A (2.2) BS03 TOG 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342118 5ess:B (2.2) BS01 TOG 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342119 5ess:C (2.2) BS01 TOG 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342120 5ess:C (2.2) BS02 MG 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342121 5ess:D (2.2) BS01 TOG 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342122 5ess:D (2.2) BS02 MG 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342123 5est:E (2.09) BS01 0P2 3.4.21.36 GO:0004252 ... P00772 2611205
    342124 5est:E (2.09) BS02 CA 3.4.21.36 GO:0004252 ... P00772 2611205
    342125 5esu:A (2.2) BS01 MG 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342126 5esu:A (2.2) BS02 TOI 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342127 5esu:B (2.2) BS01 TOI 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342128 5esu:C (2.2) BS01 TOI 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342129 5esu:C (2.2) BS02 MG 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342130 5esu:D (2.2) BS01 MG 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342131 5esu:D (2.2) BS02 TOI 2.2.1.9 GO:0000287 ... P9WK11 27291649
    342132 5esv:A (3.105) BS01 BMA ? N/A S6BGE0 26689967
    342133 5esv:A (3.105) BS02 MAN ? N/A S6BGE0 26689967
    342134 5esv:B (3.105) BS01 MAN ? GO:0002250 ... P01834 26689967
    342135 5esv:D (3.105) BS01 MAN ? GO:0002250 ... P01834 26689967
    342136 5esv:E (3.105) BS01 ZN 4.6.1.12 GO:0008685 ... P44815
    W6ICC0
    26689967
    342137 5esv:F (3.105) BS01 ZN 4.6.1.12 GO:0008685 ... P44815
    W6ICC0
    26689967
    342138 5esv:G (3.105) BS01 ZN 4.6.1.12 GO:0008685 ... P44815
    W6ICC0
    26689967
    342139 5esv:H (3.105) BS01 MAN ? N/A S6BGE0 26689967
    342140 5esv:L (3.105) BS01 MAN ? GO:0002250 ... P01834 26689967
    342141 5esw:A (2.4) BS01 PO4 2.4.2.8 GO:0000287 ... Q5ZVC1 26968365
    342142 5esx:A (2.71) BS01 5GP N/A N/A N/A 26968365
    342143 5esx:B (2.71) BS01 5GP N/A N/A N/A 26968365
    342144 5esz:A (4.191) BS01 MAN N/A N/A N/A 26689967
    342145 5esz:L (4.191) BS01 MAN ? GO:0002250 ... P01834 26689967
    342146 5et0:A (2.3) BS01 peptide ? N/A Q9ET47 26785147
    342147 5et0:C (2.3) BS01 peptide ? N/A Q9ET47 26785147
    342148 5et1:A (1.65) BS01 peptide ? N/A Q9ET47 26785147
    342149 5et1:B (1.65) BS01 peptide ? N/A Q9ET47 26785147
    342150 5et3:A (1.671) BS01 60C N/A N/A N/A 27113637
    342151 5et4:A (2.1) BS01 C3P 4.6.1.18 GO:0003676 ... P61823 30287244 BindingDB: Ki=103000nM
    342152 5et4:B (2.1) BS01 C3P 4.6.1.18 GO:0003676 ... P61823 30287244 BindingDB: Ki=103000nM
    342153 5et4:C (2.1) BS01 C3P 4.6.1.18 GO:0003676 ... P61823 30287244 BindingDB: Ki=103000nM
    342154 5et4:D (2.1) BS01 C3P 4.6.1.18 GO:0003676 ... P61823 30287244 BindingDB: Ki=103000nM
    342155 5et6:A (1.845) BS01 AMP 3.1.3.11 GO:0005515 ... O00757 27050133
    342156 5et6:B (1.845) BS01 AMP 3.1.3.11 GO:0005515 ... O00757 27050133
    342157 5et6:C (1.845) BS01 AMP 3.1.3.11 GO:0005515 ... O00757 27050133
    342158 5et6:D (1.845) BS01 AMP 3.1.3.11 GO:0005515 ... O00757 27050133
    342159 5et8:A (1.92) BS01 F6P 3.1.3.11 GO:0005515 ... O00757 N/A
    342160 5eta:A (2.8) BS01 peptide 2.7.11.24 GO:0000077 ... Q16539 27889209
    342161 5eta:B (2.8) BS01 peptide 2.7.11.24 GO:0000077 ... Q16539 27889209
    342162 5etb:A (1.33) BS01 5RO ? N/A P55201 27167503 MOAD: Kd=29uM
    BindingDB: Kd=29000nM
    342163 5etd:A (1.4) BS01 5RN ? N/A P55201 27167503
    342164 5etf:A (2.4) BS01 peptide 2.7.11.24 GO:0000077 ... Q16539 27889209
    342165 5eth:A (2.803) BS01 5RT ? GO:0003677 ... P51449 27080181 BindingDB: IC50=56nM
    342166 5eth:B (2.803) BS01 5RT ? GO:0003677 ... P51449 27080181 BindingDB: IC50=56nM
    342167 5etj:A (2.3) BS01 IM5 2.4.2.1 GO:0000255 ... P00491 26927977 MOAD: Kd=66pM
    BindingDB: Ki=7nM
    342168 5etj:B (2.3) BS01 IM5 2.4.2.1 GO:0000255 ... P00491 26927977 MOAD: Kd=66pM
    BindingDB: Ki=7nM
    342169 5etj:C (2.3) BS01 IM5 2.4.2.1 GO:0000255 ... P00491 26927977 MOAD: Kd=66pM
    BindingDB: Ki=7nM
    342170 5etj:D (2.3) BS01 IM5 2.4.2.1 GO:0000255 ... P00491 26927977 MOAD: Kd=66pM
    BindingDB: Ki=7nM
    342171 5etj:E (2.3) BS01 IM5 2.4.2.1 GO:0000255 ... P00491 26927977 MOAD: Kd=66pM
    BindingDB: Ki=7nM
    342172 5etj:F (2.3) BS01 IM5 2.4.2.1 GO:0000255 ... P00491 26927977 MOAD: Kd=66pM
    BindingDB: Ki=7nM
    342173 5etk:A (1.09) BS01 APC 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342174 5etk:A (1.09) BS02 5RU 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768 MOAD: Kd=1.5uM
    342175 5etk:A (1.09) BS03 CA 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342176 5etk:A (1.09) BS04 CA 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342177 5etk:A (1.09) BS05 CA 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342178 5etk:A (1.09) BS06 CA 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342179 5etl:A (1.82) BS01 CA 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342180 5etl:A (1.82) BS02 CA 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342181 5etl:A (1.82) BS03 CA 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342182 5etl:A (1.82) BS04 ATP 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342183 5etl:A (1.82) BS05 5RV 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768 MOAD: Kd=23uM
    342184 5etl:B (1.82) BS01 CA 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342185 5etl:B (1.82) BS02 CA 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342186 5etl:B (1.82) BS03 ATP 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342187 5etl:B (1.82) BS04 5RV 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768 MOAD: Kd=23uM
    342188 5etl:C (1.82) BS01 CA 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342189 5etl:C (1.82) BS02 CA 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342190 5etl:C (1.82) BS03 ATP 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342191 5etl:C (1.82) BS04 5RV 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768 MOAD: Kd=23uM
    342192 5etl:D (1.82) BS01 5RV 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768 MOAD: Kd=23uM
    342193 5etl:D (1.82) BS02 CA 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342194 5etl:D (1.82) BS03 CA 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342195 5etl:D (1.82) BS04 ATP 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342196 5etl:D (1.82) BS05 5RV 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768 MOAD: Kd=23uM
    342197 5etm:A (1.46) BS01 5RW 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768 MOAD: Kd=3.9uM
    342198 5etm:A (1.46) BS02 APC 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342199 5etm:A (1.46) BS03 CA 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768
    342200 5etm:A (1.46) BS04 CA 2.7.6.3 GO:0000287 ... P26281 27094768

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).