SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2311 2312 2313 2314 2315 2316 2317 2318 2319 2320 2321 2322 2323 2324 2325 2326 2327 2328 2329 2330 2331 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    464001 6fag:B (1.79) BS02 EON 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0004064 ... P00915 29962205 BindingDB: Ki=255nM
    464002 6fah:A (3.133) BS01 FAD 1.3.1.108 GO:0005737 ... H6LGM8 29325219
    464003 6fah:A (3.133) BS02 SF4 1.3.1.108 GO:0005737 ... H6LGM8 29325219
    464004 6fah:A (3.133) BS03 SF4 1.3.1.108 GO:0005737 ... H6LGM8 29325219
    464005 6fah:A (3.133) BS04 FAD 1.3.1.108 GO:0005737 ... H6LGM8 29325219
    464006 6fah:B (3.133) BS01 FAD 1.3.1.108 GO:0005737 ... H6LGM7 29325219
    464007 6fah:C (3.133) BS01 FAD 1.3.1.108 GO:0003995 ... H6LGM6 29325219
    464008 6fah:C (3.133) BS02 FAD 1.3.1.108 GO:0003995 ... H6LGM6 29325219
    464009 6fah:C (3.133) BS03 FAD 1.3.1.108 GO:0003995 ... H6LGM6 29325219
    464010 6fah:D (3.133) BS01 FAD 1.3.1.108 GO:0003995 ... H6LGM6 29325219
    464011 6fah:D (3.133) BS02 FAD 1.3.1.108 GO:0003995 ... H6LGM6 29325219
    464012 6fah:D (3.133) BS03 FAD 1.3.1.108 GO:0003995 ... H6LGM6 29325219
    464013 6fah:E (3.133) BS01 FAD 1.3.1.108 GO:0005737 ... H6LGM8 29325219
    464014 6fah:E (3.133) BS02 SF4 1.3.1.108 GO:0005737 ... H6LGM8 29325219
    464015 6fah:E (3.133) BS03 SF4 1.3.1.108 GO:0005737 ... H6LGM8 29325219
    464016 6fah:E (3.133) BS04 FAD 1.3.1.108 GO:0005737 ... H6LGM8 29325219
    464017 6fah:F (3.133) BS01 FAD 1.3.1.108 GO:0005737 ... H6LGM7 29325219
    464018 6fai:A (3.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P32905 29459436
    464019 6fai:B (3.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... P33442 29459436
    464020 6fai:C (3.4) BS01 rna ? GO:0000054 ... P25443 29459436
    464021 6fai:D (3.4) BS01 rna ? GO:0000054 ... P05750 29459436
    464022 6fai:E (3.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX35 29459436
    464023 6fai:F (3.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P26783 29459436
    464024 6fai:G (3.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX37 29459436
    464025 6fai:H (3.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P26786 29459436
    464026 6fai:I (3.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX39 29459436
    464027 6fai:J (3.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... O13516 29459436
    464028 6fai:L (3.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0CX47 29459436
    464029 6fai:M (3.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P48589 29459436
    464030 6fai:N (3.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... P05756 29459436
    464031 6fai:O (3.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P06367 29459436
    464032 6fai:P (3.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... Q01855 29459436
    464033 6fai:Q (3.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX51 29459436
    464034 6fai:R (3.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P02407 29459436
    464035 6fai:S (3.4) BS01 rna ? GO:0000054 ... P0CX55 29459436
    464036 6fai:T (3.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P07280 29459436
    464037 6fai:U (3.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... P38701 29459436
    464038 6fai:V (3.4) BS01 rna ? GO:0000447 ... P0C0V8 29459436
    464039 6fai:W (3.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C0W1 29459436
    464040 6fai:X (3.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX29 29459436
    464041 6fai:Y (3.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX31 29459436
    464042 6fai:Z (3.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q3E792 29459436
    464043 6fai:b (3.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P35997 29459436
    464044 6fai:b (3.4) BS02 ZN ? GO:0000028 ... P35997 29459436
    464045 6fai:c (3.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... Q3E7X9 29459436
    464046 6fai:d (3.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P41057 29459436
    464047 6fai:d (3.4) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P41057 29459436
    464048 6fai:e (3.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX33 29459436
    464049 6fai:g (3.4) BS01 rna ? GO:0001965 ... P38011 29459436
    464050 6fai:h (3.4) BS01 rna ? GO:0000056 ... Q99216 29459436
    464051 6fai:i (3.4) BS01 rna ? GO:0000447 ... P38333 29459436
    464052 6fai:k (3.4) BS01 rna ? GO:0000461 ... Q07381 29459436
    464053 6fai:l (3.4) BS01 rna 2.7.11.1 GO:0000462 ... P40160 29459436
    464054 6fal:A (1.2) BS01 IOP ? GO:0003677 ... P0A881 N/A
    464055 6fal:A (1.2) BS02 IOP ? GO:0003677 ... P0A881 N/A
    464056 6fal:B (1.2) BS01 IOP ? GO:0003677 ... P0A881 N/A
    464057 6fam:A (1.13) BS01 MAN ? GO:0004559 ... D6D1V7 29508463
    464058 6fam:A (1.13) BS02 G63 ? GO:0004559 ... D6D1V7 29508463
    464059 6fap:A (2.7) BS01 ZN ? N/A Q9UIF9 29529862
    464060 6fap:A (2.7) BS02 ZN ? N/A Q9UIF9 29529862
    464061 6fap:B (2.7) BS01 ZN ? N/A Q9UIF9 29529862
    464062 6fap:B (2.7) BS02 ZN ? N/A Q9UIF9 29529862
    464063 6fap:B (2.7) BS03 D3H ? N/A Q9UIF9 29529862
    464064 6fap:C (2.7) BS01 ZN ? N/A Q9UIF9 29529862
    464065 6fap:C (2.7) BS02 ZN ? N/A Q9UIF9 29529862
    464066 6fap:C (2.7) BS03 D3H ? N/A Q9UIF9 29529862
    464067 6fap:D (2.7) BS01 ZN ? N/A Q9UIF9 29529862
    464068 6fap:D (2.7) BS02 ZN ? N/A Q9UIF9 29529862
    464069 6far:A (1.3) BS01 MAN ? GO:0004559 ... D6D1V7 29508463
    464070 6far:A (1.3) BS02 MVL ? GO:0004559 ... D6D1V7 29508463
    464071 6fas:A (1.9) BS01 dna ? GO:0003677 ... Q8W4L5 29660015
    464072 6fas:A (1.9) BS02 dna ? GO:0003677 ... Q8W4L5 29660015
    464073 6fas:B (1.9) BS01 dna ? GO:0003677 ... Q8W4L5 29660015
    464074 6fas:B (1.9) BS02 dna ? GO:0003677 ... Q8W4L5 29660015
    464075 6fat:A (2.3) BS01 MAN 3.1.1.-
    3.1.1.73
    GO:0030600 ... A0A1D3S5H0 N/A
    464076 6fat:A (2.3) BS02 CA 3.1.1.-
    3.1.1.73
    GO:0030600 ... A0A1D3S5H0 N/A
    464077 6fat:B (2.3) BS01 BMA 3.1.1.-
    3.1.1.73
    GO:0030600 ... A0A1D3S5H0 N/A
    464078 6fat:B (2.3) BS02 MAN 3.1.1.-
    3.1.1.73
    GO:0030600 ... A0A1D3S5H0 N/A
    464079 6fat:B (2.3) BS03 CA 3.1.1.-
    3.1.1.73
    GO:0030600 ... A0A1D3S5H0 N/A
    464080 6fau:A (1.25) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P31947 29722962
    464081 6fau:A (1.25) BS02 D3W ? GO:0000122 ... P31947 29722962
    464082 6fau:C (1.25) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P31947 29722962
    464083 6fau:C (1.25) BS02 D3W ? GO:0000122 ... P31947 29722962
    464084 6fav:A (1.4) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P31947 29722962
    464085 6fav:A (1.4) BS02 D3Q ? GO:0000122 ... P31947 29722962
    464086 6fav:C (1.4) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P31947 29722962
    464087 6fav:C (1.4) BS02 D3Q ? GO:0000122 ... P31947 29722962
    464088 6faw:A (1.4) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P31947 29722962
    464089 6faw:A (1.4) BS02 D3K ? GO:0000122 ... P31947 29722962
    464090 6faw:C (1.4) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P31947 29722962
    464091 6faw:C (1.4) BS02 D3K ? GO:0000122 ... P31947 29722962
    464092 6faz:A (1.4) BS01 GLU ? GO:0015276 ... P19491 29775064
    464093 6faz:A (1.4) BS02 D45 ? GO:0015276 ... P19491 29775064
    464094 6faz:B (1.4) BS01 D45 ? GO:0015276 ... P19491 29775064
    464095 6faz:B (1.4) BS02 GLU ? GO:0015276 ... P19491 29775064
    464096 6fb0:A (2.15) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464097 6fb0:A (2.15) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464098 6fb0:A (2.15) BS03 CA 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464099 6fb0:B (2.15) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464100 6fb0:B (2.15) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464101 6fb0:B (2.15) BS03 CA 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464102 6fb1:A (3.024) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464103 6fb1:A (3.024) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464104 6fb1:A (3.024) BS03 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464105 6fb1:B (3.024) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464106 6fb1:B (3.024) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464107 6fb1:B (3.024) BS03 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464108 6fb2:A (2.95) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464109 6fb2:A (2.95) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464110 6fb2:A (2.95) BS03 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464111 6fb2:B (2.95) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464112 6fb2:B (2.95) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464113 6fb2:B (2.95) BS03 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464114 6fb3:A (2.38) BS01 MAN ? N/A Q9DER5 29540701
    464115 6fb3:B (2.38) BS01 MAN ? N/A Q9DER5 29540701
    464116 6fb3:C (2.38) BS01 MAN ? N/A Q9DER5 29540701
    464117 6fb3:D (2.38) BS01 MAN ? N/A Q9DER5 29540701
    464118 6fb5:A (2.2) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464119 6fb5:A (2.2) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464120 6fb5:A (2.2) BS03 MG 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464121 6fb5:B (2.2) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464122 6fb5:B (2.2) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464123 6fb5:B (2.2) BS03 MG 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464124 6fb6:A (2.6) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464125 6fb6:A (2.6) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464126 6fb6:A (2.6) BS03 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464127 6fb6:B (2.6) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464128 6fb6:B (2.6) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464129 6fb6:B (2.6) BS03 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464130 6fb7:A (2.689) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464131 6fb7:A (2.689) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464132 6fb7:A (2.689) BS03 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464133 6fb7:B (2.689) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464134 6fb7:B (2.689) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464135 6fb7:B (2.689) BS03 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464136 6fb8:A (2.45) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464137 6fb8:A (2.45) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464138 6fb8:A (2.45) BS03 MG 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464139 6fb8:B (2.45) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464140 6fb8:B (2.45) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464141 6fb8:B (2.45) BS03 MG 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464142 6fb9:A (2.95) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464143 6fb9:A (2.95) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464144 6fb9:A (2.95) BS03 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464145 6fb9:A (2.95) BS04 MN 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464146 6fb9:B (2.95) BS01 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464147 6fb9:B (2.95) BS02 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464148 6fb9:B (2.95) BS03 dna 3.1.-.- GO:0004519 ... P05725 29980759
    464149 6fba:A (2.0) BS01 D48 2.1.3.2 GO:0004070 ... O15804 29476738 MOAD: Kd=19.9uM
    464150 6fba:B (2.0) BS01 D48 2.1.3.2 GO:0004070 ... O15804 29476738 MOAD: Kd=19.9uM
    464151 6fba:B (2.0) BS02 D48 2.1.3.2 GO:0004070 ... O15804 29476738 MOAD: Kd=19.9uM
    464152 6fba:C (2.0) BS01 D48 2.1.3.2 GO:0004070 ... O15804 29476738 MOAD: Kd=19.9uM
    464153 6fbb:A (1.3) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P31947 29476007
    464154 6fbb:A (1.3) BS02 MG ? GO:0000122 ... P31947 29476007
    464155 6fbc:A (1.54) BS01 dna 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464156 6fbc:A (1.54) BS02 dna 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464157 6fbc:A (1.54) BS03 XG4 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464158 6fbc:A (1.54) BS04 MN 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464159 6fbc:A (1.54) BS05 MN 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464160 6fbd:A (2.099) BS01 dna 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464161 6fbd:A (2.099) BS02 dna 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464162 6fbd:A (2.099) BS03 MN 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464163 6fbd:A (2.099) BS04 MN 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464164 6fbd:A (2.099) BS05 XG4 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464165 6fbe:A (1.589) BS01 dna 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464166 6fbe:A (1.589) BS02 dna 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464167 6fbe:A (1.589) BS03 MN 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464168 6fbe:A (1.589) BS04 MN 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464169 6fbe:A (1.589) BS05 XG4 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464170 6fbe:A (1.589) BS06 MG 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464171 6fbf:A (2.001) BS01 dna 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464172 6fbf:A (2.001) BS02 dna 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464173 6fbf:A (2.001) BS03 MN 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464174 6fbf:A (2.001) BS04 MN 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464175 6fbf:A (2.001) BS05 XG4 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464176 6fbg:A (1.702) BS01 dna 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464177 6fbg:A (1.702) BS02 dna 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464178 6fbg:A (1.702) BS03 MN 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464179 6fbg:A (1.702) BS04 MN 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464180 6fbg:A (1.702) BS05 XG4 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464181 6fbh:A (1.8) BS01 dna 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464182 6fbh:A (1.8) BS02 dna 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464183 6fbh:A (1.8) BS03 MN 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464184 6fbh:A (1.8) BS04 MN 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464185 6fbh:A (1.8) BS05 XG4 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464186 6fbi:A (1.9) BS01 dna 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464187 6fbi:A (1.9) BS02 dna 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464188 6fbi:A (1.9) BS03 XG4 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464189 6fbi:A (1.9) BS04 MN 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464190 6fbi:A (1.9) BS05 MN 2.7.7.7 GO:0001882 ... P19821 30224478
    464191 6fbk:A (1.743) BS01 peptide 2.7.11.1 GO:0004674 ... Q9Y3S1 N/A
    464192 6fbn:A (2.7) BS01 SAM 2.5.1.6 GO:0004478 ... P31153 30776190
    464193 6fbn:A (2.7) BS02 PPK 2.5.1.6 GO:0004478 ... P31153 30776190
    464194 6fbn:B (2.7) BS01 SAM 2.5.1.6 GO:0004478 ... P31153 30776190
    464195 6fbn:B (2.7) BS02 PPK 2.5.1.6 GO:0004478 ... P31153 30776190
    464196 6fbo:A (1.8) BS01 PPK 2.5.1.6 GO:0004478 ... P31153 30776190
    464197 6fbo:A (1.8) BS02 ADN 2.5.1.6 GO:0004478 ... P31153 30776190
    464198 6fbp:A (1.65) BS01 PPK 2.5.1.6 GO:0004478 ... P31153 30776190
    464199 6fbp:A (1.65) BS02 ADN 2.5.1.6 GO:0004478 ... P31153 30776190
    464200 6fbp:B (1.65) BS01 PPK 2.5.1.6 GO:0004478 ... P31153 30776190

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).