SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2327 2328 2329 2330 2331 2332 2333 2334 2335 2336 2337 2338 2339 2340 2341 2342 2343 2344 2345 2346 2347 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    467201 6fwi:A (1.25) BS02 GLC ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467202 6fwj:A (1.04) BS01 MAN ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467203 6fwj:A (1.04) BS02 MAN ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467204 6fwj:A (1.04) BS03 E9K ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467205 6fwj:A (1.04) BS04 GLC ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467206 6fwk:A (2.503) BS01 dna 2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0000166 ... P21951 30670696
    467207 6fwk:A (2.503) BS02 dna 2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0000166 ... P21951 30670696
    467208 6fwk:A (2.503) BS03 DTP 2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0000166 ... P21951 30670696
    467209 6fwk:A (2.503) BS04 CA 2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0000166 ... P21951 30670696
    467210 6fwk:A (2.503) BS05 CA 2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0000166 ... P21951 30670696
    467211 6fwk:A (2.503) BS06 FE 2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0000166 ... P21951 30670696
    467212 6fwk:B (2.503) BS01 dna 2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0000166 ... P21951 30670696
    467213 6fwk:B (2.503) BS02 dna 2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0000166 ... P21951 30670696
    467214 6fwk:B (2.503) BS03 dna 2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0000166 ... P21951 30670696
    467215 6fwk:B (2.503) BS04 dna 2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0000166 ... P21951 30670696
    467216 6fwk:B (2.503) BS05 DTP 2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0000166 ... P21951 30670696
    467217 6fwk:B (2.503) BS06 CA 2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0000166 ... P21951 30670696
    467218 6fwk:B (2.503) BS07 CA 2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0000166 ... P21951 30670696
    467219 6fwk:B (2.503) BS08 CA 2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0000166 ... P21951 30670696
    467220 6fwk:B (2.503) BS09 FE 2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0000166 ... P21951 30670696
    467221 6fwl:A (1.12) BS01 BO0 ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467222 6fwl:A (1.12) BS02 GLC ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467223 6fwm:A (1.28) BS01 M96 ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467224 6fwm:A (1.28) BS02 GLC ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467225 6fwo:A (1.34) BS01 M96 ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467226 6fwo:A (1.34) BS02 GLC ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467227 6fwp:A (1.08) BS01 MAN ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467228 6fwp:A (1.08) BS02 MAN ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467229 6fwp:A (1.08) BS03 MAN ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467230 6fwp:A (1.08) BS04 MAN ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467231 6fwq:A (1.65) BS01 MAN ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467232 6fwq:A (1.65) BS02 MAN ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467233 6fwq:A (1.65) BS03 MAN ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467234 6fwq:A (1.65) BS04 MAN ? GO:0004559 ... D6D1V7 32490192
    467235 6fwr:A (2.5) BS01 dna 3.6.4.12 GO:0003676 ... P27296 30520735
    467236 6fwr:A (2.5) BS02 SF4 3.6.4.12 GO:0003676 ... P27296 30520735
    467237 6fws:A (2.5) BS01 dna 3.6.4.12 GO:0003676 ... P27296 30520735
    467238 6fws:A (2.5) BS02 SF4 3.6.4.12 GO:0003676 ... P27296 30520735
    467239 6fws:A (2.5) BS03 ADP 3.6.4.12 GO:0003676 ... P27296 30520735
    467240 6fws:A (2.5) BS04 BEF 3.6.4.12 GO:0003676 ... P27296 30520735
    467241 6fws:B (2.5) BS01 dna 3.6.4.12 GO:0003676 ... P27296 30520735
    467242 6fws:B (2.5) BS02 SF4 3.6.4.12 GO:0003676 ... P27296 30520735
    467243 6fws:B (2.5) BS03 ADP 3.6.4.12 GO:0003676 ... P27296 30520735
    467244 6fws:B (2.5) BS04 BEF 3.6.4.12 GO:0003676 ... P27296 30520735
    467245 6fwv:A (2.58) BS01 ZN ? N/A A0A6L8P957 30052296
    467246 6fwv:A (2.58) BS02 ZN ? N/A A0A6L8P957 30052296
    467247 6fwv:B (2.58) BS01 ZN ? N/A A0A6L8P957 30052296
    467248 6fwv:B (2.58) BS02 ZN ? N/A A0A6L8P957 30052296
    467249 6fwz:A (3.1) BS01 MG 2.7.8.15 GO:0003975 ... Q9H3H5 30388443
    467250 6fwz:A (3.1) BS02 UD1 2.7.8.15 GO:0003975 ... Q9H3H5 30388443
    467251 6fx0:A (1.9) BS01 E9T ? GO:0000122 ... P13631 29706423 BindingDB: Ki=77nM, EC50=49nM
    467252 6fx1:A (2.1) BS01 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467253 6fx1:A (2.1) BS02 C4W ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467254 6fx1:A (2.1) BS03 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467255 6fx1:A (2.1) BS04 OOA ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467256 6fx1:B (2.1) BS01 C4W ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467257 6fx1:B (2.1) BS02 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467258 6fx1:B (2.1) BS03 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467259 6fx1:C (2.1) BS01 C4W ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467260 6fx1:C (2.1) BS02 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467261 6fx1:C (2.1) BS03 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467262 6fx1:D (2.1) BS01 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467263 6fx1:D (2.1) BS02 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467264 6fx1:E (2.1) BS01 C4W ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467265 6fx1:E (2.1) BS02 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467266 6fx1:E (2.1) BS03 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467267 6fx1:F (2.1) BS01 C4W ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467268 6fx1:F (2.1) BS02 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467269 6fx1:F (2.1) BS03 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467270 6fx1:G (2.1) BS01 C4W ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467271 6fx1:G (2.1) BS02 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467272 6fx1:G (2.1) BS03 C4W ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467273 6fx1:G (2.1) BS04 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467274 6fx1:G (2.1) BS05 OOA ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467275 6fx1:H (2.1) BS01 C4W ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467276 6fx1:H (2.1) BS02 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467277 6fx1:H (2.1) BS03 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467278 6fx1:I (2.1) BS01 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467279 6fx1:I (2.1) BS02 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467280 6fx1:J (2.1) BS01 C4W ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467281 6fx1:J (2.1) BS02 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467282 6fx1:K (2.1) BS01 C4W ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467283 6fx1:K (2.1) BS02 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467284 6fx1:K (2.1) BS03 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467285 6fx1:L (2.1) BS01 C4W ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467286 6fx1:L (2.1) BS02 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467287 6fx1:L (2.1) BS03 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467288 6fx2:A (1.7) BS01 GAL ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467289 6fx2:A (1.7) BS02 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467290 6fx2:B (1.7) BS01 GAL ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467291 6fx2:B (1.7) BS02 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467292 6fx3:A (1.7) BS01 SIA ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467293 6fx3:A (1.7) BS02 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467294 6fx3:B (1.7) BS01 SIA ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467295 6fx3:B (1.7) BS02 FUC ? GO:0046872 ... A0A3B6UEU4 29956878
    467296 6fx7:A (1.82) BS01 AR6 3.2.2.- GO:0016787 ... O28751 33060572
    467297 6fx8:A (1.8) BS01 AU ? GO:0005506 ... P02791 29709536
    467298 6fx9:A (1.5) BS01 AU ? GO:0005506 ... P02791 29709536
    467299 6fxc:A1 (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A077V2P0 28959035
    467300 6fxc:A2 (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YZB6 28959035
    467301 6fxc:A3 (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YTB0 28959035
    467302 6fxc:A4 (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A077UGV8 28959035
    467303 6fxc:AC (6.76) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q2YYP9 28959035
    467304 6fxc:AC (6.76) BS02 rna ? GO:0002181 ... Q2YYP9 28959035
    467305 6fxc:AD (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYP6 28959035
    467306 6fxc:AE (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYP7 28959035
    467307 6fxc:AF (6.76) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q2YYK9 28959035
    467308 6fxc:AF (6.76) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q2YYK9 28959035
    467309 6fxc:AG (6.76) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q2YYL2 28959035
    467310 6fxc:AH (6.76) BS01 rna ? GO:0003729 ... Q2YYM8 28959035
    467311 6fxc:AI (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYK7 28959035
    467312 6fxc:AI (6.76) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q2YYK7 28959035
    467313 6fxc:AJ (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYL6 28959035
    467314 6fxc:AK (6.76) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q2YYQ3 28959035
    467315 6fxc:AK (6.76) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q2YYQ3 28959035
    467316 6fxc:AL (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYM3 28959035
    467317 6fxc:AM (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... W8TRE0 28959035
    467318 6fxc:AM (6.76) BS02 rna ? GO:0003735 ... W8TRE0 28959035
    467319 6fxc:AN (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YXM4 28959035
    467320 6fxc:AN (6.76) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q2YXM4 28959035
    467321 6fxc:AO (6.76) BS01 rna ? GO:0000027 ... Q2YTB1 28959035
    467322 6fxc:AP (6.76) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q2YT83 28959035
    467323 6fxc:AQ (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYQ1 28959035
    467324 6fxc:AR (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYP8 28959035
    467325 6fxc:AS (6.76) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q2YYK8 28959035
    467326 6fxc:AT (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... N/A 28959035
    467327 6fxc:AU (6.76) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 28959035
    467328 6fxc:AV (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YXJ2 28959035
    467329 6fxc:AW (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYN0 28959035
    467330 6fxc:AX (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYL5 28959035
    467331 6fxc:AX (6.76) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q2YYL5 28959035
    467332 6fxc:AY (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YUN3 28959035
    467333 6fxc:AZ (6.76) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 28959035
    467334 6fxc:Ab (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YXL2 28959035
    467335 6fxc:Ac (6.76) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q2YYQ2 28959035
    467336 6fxc:Ad (6.76) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q2YTH0 28959035
    467337 6fxc:Ae (6.76) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q2YYL4 28959035
    467338 6fxc:Af (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YVJ2 28959035
    467339 6fxc:Ag (6.76) BS01 rna ? GO:0000049 ... A0A077VHU6 28959035
    467340 6fxc:Ah (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYL1 28959035
    467341 6fxc:Ai (6.76) BS01 rna ? GO:0003723 ... A0A1Q4GY48 28959035
    467342 6fxc:Aj (6.76) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q2YYP5 28959035
    467343 6fxc:Ak (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYM1 28959035
    467344 6fxc:Al (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... N/A 28959035
    467345 6fxc:Am (6.76) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q2YYM0 28959035
    467346 6fxc:An (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYL0 28959035
    467347 6fxc:Ao (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YXP3 28959035
    467348 6fxc:Ao (6.76) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q2YXP3 28959035
    467349 6fxc:Ap (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YXH8 28959035
    467350 6fxc:Aq (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYK6 28959035
    467351 6fxc:Ar (6.76) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 28959035
    467352 6fxc:As (6.76) BS01 rna ? GO:0003723 ... N/A 28959035
    467353 6fxc:At (6.76) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q2YT41 28959035
    467354 6fxc:Au (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YT04 28959035
    467355 6fxc:Av (6.76) BS01 rna ? GO:0005737 ... Q2YSH7 28959035
    467356 6fxc:B1 (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A077V2P0 28959035
    467357 6fxc:B2 (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YZB6 28959035
    467358 6fxc:B3 (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YTB0 28959035
    467359 6fxc:B4 (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A077UGV8 28959035
    467360 6fxc:BC (6.76) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q2YYP9 28959035
    467361 6fxc:BC (6.76) BS02 rna ? GO:0002181 ... Q2YYP9 28959035
    467362 6fxc:BD (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYP6 28959035
    467363 6fxc:BE (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYP7 28959035
    467364 6fxc:BF (6.76) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q2YYK9 28959035
    467365 6fxc:BF (6.76) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q2YYK9 28959035
    467366 6fxc:BG (6.76) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q2YYL2 28959035
    467367 6fxc:BH (6.76) BS01 rna ? GO:0003729 ... Q2YYM8 28959035
    467368 6fxc:BI (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYK7 28959035
    467369 6fxc:BI (6.76) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q2YYK7 28959035
    467370 6fxc:BJ (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYL6 28959035
    467371 6fxc:BK (6.76) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q2YYQ3 28959035
    467372 6fxc:BK (6.76) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q2YYQ3 28959035
    467373 6fxc:BL (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYM3 28959035
    467374 6fxc:BM (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... W8TRE0 28959035
    467375 6fxc:BM (6.76) BS02 rna ? GO:0003735 ... W8TRE0 28959035
    467376 6fxc:BN (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YXM4 28959035
    467377 6fxc:BN (6.76) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q2YXM4 28959035
    467378 6fxc:BO (6.76) BS01 rna ? GO:0000027 ... Q2YTB1 28959035
    467379 6fxc:BP (6.76) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q2YT83 28959035
    467380 6fxc:BQ (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYQ1 28959035
    467381 6fxc:BR (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYP8 28959035
    467382 6fxc:BS (6.76) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q2YYK8 28959035
    467383 6fxc:BT (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... N/A 28959035
    467384 6fxc:BU (6.76) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 28959035
    467385 6fxc:BV (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YXJ2 28959035
    467386 6fxc:BW (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYN0 28959035
    467387 6fxc:BX (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYL5 28959035
    467388 6fxc:BX (6.76) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q2YYL5 28959035
    467389 6fxc:BY (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YUN3 28959035
    467390 6fxc:BZ (6.76) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 28959035
    467391 6fxc:Bb (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YXL2 28959035
    467392 6fxc:Bb (6.76) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q2YXL2 28959035
    467393 6fxc:Bc (6.76) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q2YYQ2 28959035
    467394 6fxc:Bd (6.76) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q2YTH0 28959035
    467395 6fxc:Be (6.76) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q2YYL4 28959035
    467396 6fxc:Bf (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YVJ2 28959035
    467397 6fxc:Bg (6.76) BS01 rna ? GO:0000049 ... A0A077VHU6 28959035
    467398 6fxc:Bh (6.76) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q2YYL1 28959035
    467399 6fxc:Bi (6.76) BS01 rna ? GO:0003723 ... A0A1Q4GY48 28959035
    467400 6fxc:Bj (6.76) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q2YYP5 28959035

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).