SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2330 2331 2332 2333 2334 2335 2336 2337 2338 2339 2340 2341 2342 2343 2344 2345 2346 2347 2348 2349 2350 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    467801 6g0l:H (10.0) BS01 dna N/A GO:0000786 ... N/A 30079888
    467802 6g0l:M (10.0) BS01 dna 3.6.4.- GO:0000123 ... P32657 30079888
    467803 6g0l:M (10.0) BS02 dna 3.6.4.- GO:0000123 ... P32657 30079888
    467804 6g0l:M (10.0) BS03 ADP 3.6.4.- GO:0000123 ... P32657 30079888
    467805 6g0l:M (10.0) BS04 BEF 3.6.4.- GO:0000123 ... P32657 30079888
    467806 6g0l:W (10.0) BS01 dna 3.6.4.- GO:0000123 ... P32657 30079888
    467807 6g0l:W (10.0) BS02 dna 3.6.4.- GO:0000123 ... P32657 30079888
    467808 6g0l:W (10.0) BS03 ADP 3.6.4.- GO:0000123 ... P32657 30079888
    467809 6g0m:A () BS01 ZN N/A N/A N/A N/A
    467810 6g0m:A () BS02 ZN N/A N/A N/A N/A
    467811 6g0m:A () BS03 VX N/A N/A N/A N/A
    467812 6g0m:A () BS04 E8N N/A N/A N/A N/A
    467813 6g0m:A () BS05 VX N/A N/A N/A N/A
    467814 6g0n:A (1.8) BS01 XYP 3.2.1.4 GO:0004553 ... C5BJ89 30289404
    467815 6g0n:A (1.8) BS02 XYP 3.2.1.4 GO:0004553 ... C5BJ89 30289404
    467816 6g0n:A (1.8) BS03 XYP 3.2.1.4 GO:0004553 ... C5BJ89 30289404
    467817 6g0n:A (1.8) BS04 XYP 3.2.1.4 GO:0004553 ... C5BJ89 30289404
    467818 6g0o:A (1.4) BS01 peptide ? N/A O60885 30554943
    467819 6g0p:A (1.3) BS01 peptide ? N/A O60885 30554943
    467820 6g0q:A (1.4) BS01 peptide ? N/A O60885 30554943
    467821 6g0r:A (1.25) BS01 peptide ? N/A O60885 30554943
    467822 6g0s:A (1.48) BS01 peptide ? N/A O60885 30554943
    467823 6g0s:B (1.48) BS01 peptide ? N/A O60885 30554943
    467824 6g0v:A (1.09) BS01 EGZ ? GO:0030246 ... P17931 30094951 MOAD: Kd=166uM
    467825 6g0w:A (2.34) BS01 EGW 2.4.2.- GO:0003950 ... Q460N5 29748053 MOAD: ic50=5.2uM
    BindingDB: IC50=5248nM
    467826 6g0w:B (2.34) BS01 EGW 2.4.2.- GO:0003950 ... Q460N5 29748053 MOAD: ic50=5.2uM
    BindingDB: IC50=5248nM
    467827 6g0x:A (1.41) BS01 RAM ? N/A Q9AYY6 30044908
    467828 6g0y:A (2.42) BS01 peptide ? GO:0003723 ... P04545 30425144
    467829 6g0y:A (2.42) BS02 ZN ? GO:0003723 ... P04545 30425144
    467830 6g0y:C (2.42) BS01 peptide ? GO:0003723 ... P04545 30425144
    467831 6g0y:C (2.42) BS02 ZN ? GO:0003723 ... P04545 30425144
    467832 6g0y:E (2.42) BS01 peptide ? GO:0003723 ... P04545 30425144
    467833 6g0y:E (2.42) BS02 ZN ? GO:0003723 ... P04545 30425144
    467834 6g0y:F (2.42) BS01 peptide ? GO:0003723 ... P04545 30425144
    467835 6g0y:F (2.42) BS02 ZN ? GO:0003723 ... P04545 30425144
    467836 6g0z:A (2.15) BS01 GDP ? GO:0003924 ... A0A0H2XK72 30366986 MOAD: Kd=4.84uM
    467837 6g0z:B (2.15) BS01 GDP ? GO:0003924 ... A0A0H2XK72 30366986 MOAD: Kd=4.84uM
    467838 6g12:A (1.929) BS01 GNP ? GO:0003924 ... A0A0H2XK72 30366986
    467839 6g12:B (1.929) BS01 GNP ? GO:0003924 ... A0A0H2XK72 30366986
    467840 6g13:A (1.97) BS01 TMO ? GO:0003723 ... A0A0D3MU51 30644840
    467841 6g13:B (1.97) BS01 TMO ? GO:0003723 ... A0A0D3MU51 30644840
    467842 6g14:A (1.8) BS01 G4P ? GO:0003924 ... A0A0H2XK72 30366986 MOAD: Kd=3.26uM
    467843 6g14:B (1.8) BS01 G4P ? GO:0003924 ... A0A0H2XK72 30366986 MOAD: Kd=3.26uM
    467844 6g15:A (1.65) BS01 0O2 ? GO:0003924 ... A0A0H2XK72 30366986
    467845 6g15:B (1.65) BS01 0O2 ? GO:0003924 ... A0A0H2XK72 30366986
    467846 6g17:A (2.2) BS01 NTJ 3.1.1.7 GO:0001507 ... P04058 30125110
    467847 6g18:A (3.6) BS01 rna ? GO:0000028 ... P08865 29875412
    467848 6g18:B (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61247 29875412
    467849 6g18:C (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P15880 29875412
    467850 6g18:E (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62701 29875412
    467851 6g18:F (3.6) BS01 rna ? GO:0000028 ... P46782 29875412
    467852 6g18:G (3.6) BS01 rna ? GO:0000082 ... P62753 29875412
    467853 6g18:H (3.6) BS01 rna ? GO:0001843 ... P62081 29875412
    467854 6g18:I (3.6) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62241 29875412
    467855 6g18:J (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46781 29875412
    467856 6g18:L (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62280 29875412
    467857 6g18:M (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P25398 29875412
    467858 6g18:N (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62277 29875412
    467859 6g18:O (3.6) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62263 29875412
    467860 6g18:P (3.6) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62841 29875412
    467861 6g18:Q (3.6) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62249 29875412
    467862 6g18:R (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P08708 29875412
    467863 6g18:S (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62269 29875412
    467864 6g18:T (3.6) BS01 rna ? GO:0000028 ... P39019 29875412
    467865 6g18:W (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62244 29875412
    467866 6g18:X (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62266 29875412
    467867 6g18:Y (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62847 29875412
    467868 6g18:Z (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62851 29875412
    467869 6g18:b (3.6) BS01 rna ? GO:0000028 ... P42677 29875412
    467870 6g18:c (3.6) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62857 29875412
    467871 6g18:e (3.6) BS01 rna ? GO:0003735 ... P62861 29875412
    467872 6g18:f (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62979 29875412
    467873 6g18:f (3.6) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P62979 29875412
    467874 6g18:g (3.6) BS01 rna ? GO:0001891 ... P63244 29875412
    467875 6g18:t (3.6) BS01 rna ? GO:0000056 ... Q96GA3 29875412
    467876 6g18:u (3.6) BS01 rna ? GO:0000462 ... Q2NL82 29875412
    467877 6g18:v (3.6) BS01 rna 2.7.11.1 GO:0003824 ... Q9BVS4 29875412
    467878 6g18:w (3.6) BS01 rna ? GO:0000462 ... Q13895 29875412
    467879 6g18:x (3.6) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q9NRX1 29875412
    467880 6g18:y (3.6) BS01 rna 3.1.-.- GO:0004519 ... Q9ULX3 29875412
    467881 6g18:y (3.6) BS02 ZN 3.1.-.- GO:0004519 ... Q9ULX3 29875412
    467882 6g19:A (3.68) BS01 rna 3.6.4.13 GO:0003677 ... Q8R5F7 30449722
    467883 6g19:A (3.68) BS02 rna 3.6.4.13 GO:0003677 ... Q8R5F7 30449722
    467884 6g19:A (3.68) BS03 ZN 3.6.4.13 GO:0003677 ... Q8R5F7 30449722
    467885 6g19:A (3.68) BS04 ANP 3.6.4.13 GO:0003677 ... Q8R5F7 30449722
    467886 6g1b:J (2.28) BS01 1PS ? GO:0003677 ... Q8NP91 30463959
    467887 6g1e:A (1.88) BS01 BMA ? N/A P01857
    P01860
    32404368
    467888 6g1e:A (1.88) BS02 GAL ? N/A P01857
    P01860
    32404368
    467889 6g1e:B (1.88) BS01 BMA ? N/A P0DOX5 32404368
    467890 6g1e:B (1.88) BS02 GAL ? N/A P0DOX5 32404368
    467891 6g1e:B (1.88) BS03 FUL ? N/A P0DOX5 32404368
    467892 6g1g:A (1.04) BS01 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467893 6g1g:A (1.04) BS02 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467894 6g1g:A (1.04) BS03 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467895 6g1g:A (1.04) BS04 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467896 6g1g:A (1.04) BS05 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467897 6g1g:A (1.04) BS06 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467898 6g1g:A (1.04) BS07 MN ? N/A A3DCJ4 30084399
    467899 6g1h:A (1.79) BS01 NAD ? GO:0000166 ... A9BHL2 N/A
    467900 6g1i:A (0.99) BS01 FRU ? N/A A3DCJ4 30084399
    467901 6g1i:A (0.99) BS02 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467902 6g1i:A (0.99) BS03 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467903 6g1i:A (0.99) BS04 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467904 6g1i:A (0.99) BS05 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467905 6g1i:A (0.99) BS06 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467906 6g1i:A (0.99) BS07 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467907 6g1i:A (0.99) BS08 MN ? N/A A3DCJ4 30084399
    467908 6g1i:B (0.99) BS01 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467909 6g1i:B (0.99) BS02 FRU ? N/A A3DCJ4 30084399
    467910 6g1i:B (0.99) BS03 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467911 6g1i:B (0.99) BS04 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467912 6g1i:B (0.99) BS05 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467913 6g1i:B (0.99) BS06 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467914 6g1i:B (0.99) BS07 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467915 6g1i:B (0.99) BS08 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467916 6g1i:B (0.99) BS09 BGC ? N/A A3DCJ4 30084399
    467917 6g1i:B (0.99) BS10 MN ? N/A A3DCJ4 30084399
    467918 6g1j:A (2.1) BS01 ZN 3.1.8.1 GO:0004063 ... P0A434 N/A
    467919 6g1j:A (2.1) BS02 ZN 3.1.8.1 GO:0004063 ... P0A434 N/A
    467920 6g1j:A (2.1) BS03 E8N 3.1.8.1 GO:0004063 ... P0A434 N/A
    467921 6g1k:A (3.6) BS01 Y01 ? GO:0005216 ... U3N7D8 29717981
    467922 6g1k:A (3.6) BS02 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 29717981
    467923 6g1k:A (3.6) BS03 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 29717981
    467924 6g1k:B (3.6) BS01 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 29717981
    467925 6g1k:B (3.6) BS02 Y01 ? GO:0005216 ... U3N7D8 29717981
    467926 6g1k:B (3.6) BS03 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 29717981
    467927 6g1k:C (3.6) BS01 Y01 ? GO:0005216 ... U3N7D8 29717981
    467928 6g1k:C (3.6) BS02 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 29717981
    467929 6g1k:C (3.6) BS03 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 29717981
    467930 6g1k:D (3.6) BS01 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 29717981
    467931 6g1k:D (3.6) BS02 Y01 ? GO:0005216 ... U3N7D8 29717981
    467932 6g1k:D (3.6) BS03 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 29717981
    467933 6g1l:A (2.4) BS01 dna ? GO:0046983 ... Q08874 30705290
    467934 6g1m:A (2.32) BS01 NAD ? GO:0000166 ... A9BHL2 N/A
    467935 6g1m:B (2.32) BS01 NAD ? GO:0000166 ... A9BHL2 N/A
    467936 6g1m:C (2.32) BS01 NAD ? GO:0000166 ... A9BHL2 N/A
    467937 6g1m:D (2.32) BS01 NAD ? GO:0000166 ... A9BHL2 N/A
    467938 6g1o:A (1.882) BS01 CA 4.1.3.1 GO:0003824 ... Q9I0K4 30030382
    467939 6g1o:A (1.882) BS02 GLV 4.1.3.1 GO:0003824 ... Q9I0K4 30030382
    467940 6g1p:A (1.55) BS01 MG 3.2.1.143
    3.2.2.-
    3.5.1.-
    GO:0000287 ... H3BCW1 30472116
    467941 6g1p:B (1.55) BS01 MG 3.2.1.143
    3.2.2.-
    3.5.1.-
    GO:0000287 ... H3BCW1 30472116
    467942 6g1q:A (2.1) BS01 MG 3.2.1.143
    3.2.2.-
    3.5.1.-
    GO:0000287 ... H3BCW1 30472116
    467943 6g1q:A (2.1) BS02 AR6 3.2.1.143
    3.2.2.-
    3.5.1.-
    GO:0000287 ... H3BCW1 30472116
    467944 6g1q:B (2.1) BS01 MG 3.2.1.143
    3.2.2.-
    3.5.1.-
    GO:0000287 ... H3BCW1 30472116
    467945 6g1q:B (2.1) BS02 AR6 3.2.1.143
    3.2.2.-
    3.5.1.-
    GO:0000287 ... H3BCW1 30472116
    467946 6g1s:A (3.93) BS01 rna 3.6.4.13 GO:0003676 ... Q8R5F7 30449722
    467947 6g1s:A (3.93) BS02 rna 3.6.4.13 GO:0003676 ... Q8R5F7 30449722
    467948 6g1s:A (3.93) BS03 ZN 3.6.4.13 GO:0003676 ... Q8R5F7 30449722
    467949 6g1t:A (1.93) BS01 dna ? GO:0016853 ... Q7BVV5 30060171
    467950 6g1t:A (1.93) BS02 dna ? GO:0016853 ... Q7BVV5 30060171
    467951 6g1u:A (1.79) BS01 E1K 3.1.1.7 GO:0001507 ... P04058 29534488
    467952 6g1u:A (1.79) BS02 E1K 3.1.1.7 GO:0001507 ... P04058 29534488
    467953 6g1u:A (1.79) BS03 E1K 3.1.1.7 GO:0001507 ... P04058 29534488
    467954 6g1u:B (1.79) BS01 E1K 3.1.1.7 GO:0001507 ... P04058 29534488
    467955 6g1u:B (1.79) BS02 E1K 3.1.1.7 GO:0001507 ... P04058 29534488
    467956 6g1u:B (1.79) BS03 E1K 3.1.1.7 GO:0001507 ... P04058 29534488
    467957 6g1v:A (1.82) BS01 E1N 3.1.1.7 GO:0001507 ... P04058 29534488
    467958 6g1v:B (1.82) BS01 E1N 3.1.1.7 GO:0001507 ... P04058 29534488
    467959 6g1w:A (1.9) BS01 E0Z 3.1.1.7 GO:0001507 ... P04058 29534488
    467960 6g1w:B (1.9) BS01 E0Z 3.1.1.7 GO:0001507 ... P04058 29534488
    467961 6g1x:A (3.93) BS01 rna 3.6.4.13 GO:0003677 ... Q8R5F7 30449722
    467962 6g1x:A (3.93) BS02 rna 3.6.4.13 GO:0003677 ... Q8R5F7 30449722
    467963 6g1y:A (2.5) BS01 EL5 2.7.13.3 GO:0006355 ... A9CI81 30464203
    467964 6g1y:B (2.5) BS01 EL5 2.7.13.3 GO:0006355 ... A9CI81 30464203
    467965 6g1z:A (2.03) BS01 EL5 2.7.13.3 GO:0006355 ... A9CI81 30464203
    467966 6g1z:B (2.03) BS01 EL5 2.7.13.3 GO:0006355 ... A9CI81 30464203
    467967 6g20:A (2.16) BS01 EL5 2.7.13.3 GO:0006355 ... A9CI81 30464203
    467968 6g20:B (2.16) BS01 EL5 2.7.13.3 GO:0006355 ... A9CI81 30464203
    467969 6g21:A (2.1) BS01 CA 3.1.1.73 GO:0005575 ... Q2UMX6 N/A
    467970 6g21:B (2.1) BS01 CA 3.1.1.73 GO:0005575 ... Q2UMX6 N/A
    467971 6g22:A (1.85) BS01 MG 3.1.3.- GO:0008253 ... Q9NPB1 N/A
    467972 6g22:A (1.85) BS02 2O2 3.1.3.- GO:0008253 ... Q9NPB1 N/A
    467973 6g23:A () BS01 ZN N/A N/A N/A N/A
    467974 6g23:A () BS02 ZN N/A N/A N/A N/A
    467975 6g23:A () BS03 E8N N/A N/A N/A N/A
    467976 6g24:A (2.1) BS01 EH2 2.1.1.370
    2.1.1.371
    N/A Q9BZ95 31285596
    467977 6g25:A (1.432) BS01 EHQ 2.1.1.370
    2.1.1.371
    N/A Q9BZ95 31285596
    467978 6g27:A (1.65) BS01 EHE 2.1.1.370
    2.1.1.371
    N/A Q9BZ95 31285596
    467979 6g28:A (1.23) BS01 AR6 3.2.2.19 GO:0000287 ... P54922 30472116
    467980 6g28:A (1.23) BS02 MG 3.2.2.19 GO:0000287 ... P54922 30472116
    467981 6g28:A (1.23) BS03 MG 3.2.2.19 GO:0000287 ... P54922 30472116
    467982 6g29:A (1.7) BS01 EHK 2.1.1.370
    2.1.1.371
    N/A Q9BZ95 31285596
    467983 6g2a:A (1.8) BS01 A3R 3.2.2.19 GO:0000287 ... P54922 30472116
    467984 6g2a:A (1.8) BS02 MG 3.2.2.19 GO:0000287 ... P54922 30472116
    467985 6g2b:A (1.61) BS01 EH8 2.1.1.370
    2.1.1.371
    N/A Q9BZ95 31285596
    467986 6g2c:A (1.76) BS01 EHT 2.1.1.370
    2.1.1.371
    N/A Q9BZ95 31285596
    467987 6g2e:A (1.85) BS01 EHH 2.1.1.370
    2.1.1.371
    N/A Q9BZ95 31285596
    467988 6g2f:A (1.74) BS01 EHW 2.1.1.370
    2.1.1.371
    N/A Q9BZ95 31285596
    467989 6g2g:A (2.57) BS01 SF4 ? GO:0005524 ... G0SH86 30201724
    467990 6g2g:B (2.57) BS01 SF4 ? GO:0005524 ... G0SH86 30201724
    467991 6g2j:B (3.3) BS01 SF4 7.1.1.2 GO:0003954 ... Q9DC70 29915388
    467992 6g2j:D (3.3) BS01 SF4 7.1.1.2 GO:0003954 ... Q91WD5 29915388
    467993 6g2j:E (3.3) BS01 FES 7.1.1.2 GO:0005739 ... Q9D6J6 29915388
    467994 6g2j:F (3.3) BS01 FMN 7.1.1.2 GO:0005515 ... Q91YT0 29915388
    467995 6g2j:F (3.3) BS02 SF4 7.1.1.2 GO:0005515 ... Q91YT0 29915388
    467996 6g2j:G (3.3) BS01 SF4 7.1.1.2 GO:0005515 ... Q91VD9 29915388
    467997 6g2j:G (3.3) BS02 SF4 7.1.1.2 GO:0005515 ... Q91VD9 29915388
    467998 6g2j:G (3.3) BS03 FES 7.1.1.2 GO:0005515 ... Q91VD9 29915388
    467999 6g2j:I (3.3) BS01 SF4 7.1.1.2 GO:0003954 ... Q8K3J1 29915388
    468000 6g2j:I (3.3) BS02 SF4 7.1.1.2 GO:0003954 ... Q8K3J1 29915388

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).