SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2332 2333 2334 2335 2336 2337 2338 2339 2340 2341 2342 2343 2344 2345 2346 2347 2348 2349 2350 2351 2352 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    468201 6g4s:A (4.0) BS01 rna ? GO:0000028 ... P08865 29875412
    468202 6g4s:B (4.0) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61247 29875412
    468203 6g4s:C (4.0) BS01 rna ? GO:0002181 ... P15880 29875412
    468204 6g4s:E (4.0) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62701 29875412
    468205 6g4s:F (4.0) BS01 rna ? GO:0000028 ... P46782 29875412
    468206 6g4s:G (4.0) BS01 rna ? GO:0000082 ... P62753 29875412
    468207 6g4s:H (4.0) BS01 rna ? GO:0001843 ... P62081 29875412
    468208 6g4s:I (4.0) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62241 29875412
    468209 6g4s:J (4.0) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46781 29875412
    468210 6g4s:L (4.0) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62280 29875412
    468211 6g4s:N (4.0) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62277 29875412
    468212 6g4s:O (4.0) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62263 29875412
    468213 6g4s:P (4.0) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62841 29875412
    468214 6g4s:Q (4.0) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62249 29875412
    468215 6g4s:R (4.0) BS01 rna ? GO:0002181 ... P08708 29875412
    468216 6g4s:S (4.0) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62269 29875412
    468217 6g4s:T (4.0) BS01 rna ? GO:0000028 ... P39019 29875412
    468218 6g4s:W (4.0) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62244 29875412
    468219 6g4s:X (4.0) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62266 29875412
    468220 6g4s:Y (4.0) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62847 29875412
    468221 6g4s:Z (4.0) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62851 29875412
    468222 6g4s:b (4.0) BS01 rna ? GO:0000028 ... P42677 29875412
    468223 6g4s:c (4.0) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62857 29875412
    468224 6g4s:e (4.0) BS01 rna ? GO:0003735 ... P62861 29875412
    468225 6g4s:s (4.0) BS01 rna N/A N/A N/A 29875412
    468226 6g4s:u (4.0) BS01 rna ? GO:0000462 ... Q2NL82 29875412
    468227 6g4s:w (4.0) BS01 rna ? GO:0000462 ... Q13895 29875412
    468228 6g4s:x (4.0) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q9NRX1 29875412
    468229 6g4s:y (4.0) BS01 rna 3.1.-.- GO:0004519 ... Q9ULX3 29875412
    468230 6g4t:A (1.91) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... P43166 29795045
    468231 6g4w:B (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61247 29875412
    468232 6g4w:E (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62701 29875412
    468233 6g4w:F (4.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P46782 29875412
    468234 6g4w:G (4.5) BS01 rna ? GO:0000082 ... P62753 29875412
    468235 6g4w:H (4.5) BS01 rna ? GO:0001843 ... P62081 29875412
    468236 6g4w:I (4.5) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62241 29875412
    468237 6g4w:J (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46781 29875412
    468238 6g4w:L (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62280 29875412
    468239 6g4w:N (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62277 29875412
    468240 6g4w:O (4.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62263 29875412
    468241 6g4w:P (4.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62841 29875412
    468242 6g4w:Q (4.5) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62249 29875412
    468243 6g4w:R (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P08708 29875412
    468244 6g4w:S (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62269 29875412
    468245 6g4w:T (4.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P39019 29875412
    468246 6g4w:W (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62244 29875412
    468247 6g4w:X (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62266 29875412
    468248 6g4w:Y (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62847 29875412
    468249 6g4w:Z (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62851 29875412
    468250 6g4w:b (4.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P42677 29875412
    468251 6g4w:c (4.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62857 29875412
    468252 6g4w:e (4.5) BS01 rna ? GO:0003735 ... P62861 29875412
    468253 6g4w:q (4.5) BS01 rna 2.1.1.- GO:0003723 ... O43709 29875412
    468254 6g4w:s (4.5) BS01 rna N/A N/A N/A 29875412
    468255 6g4w:u (4.5) BS01 rna ? GO:0000462 ... Q2NL82 29875412
    468256 6g4w:u (4.5) BS02 peptide ? GO:0000462 ... Q2NL82 29875412
    468257 6g4w:w (4.5) BS01 rna ? GO:0000462 ... Q13895 29875412
    468258 6g4w:x (4.5) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q9NRX1 29875412
    468259 6g4y:A (2.65) BS01 ELZ 2.7.11.25 GO:0004672 ... Q9WUL6 29940120
    468260 6g4y:B (2.65) BS01 ELZ 2.7.11.25 GO:0004672 ... Q9WUL6 29940120
    468261 6g4z:A (2.84) BS01 ELW 2.7.11.25 GO:0004672 ... Q9WUL6 29940120
    468262 6g4z:B (2.84) BS01 ELW 2.7.11.25 GO:0004672 ... Q9WUL6 29940120
    468263 6g50:A (1.65) BS01 CU ? N/A W0DP94 32094184
    468264 6g50:B (1.65) BS01 CU ? N/A W0DP94 32094184
    468265 6g50:B (1.65) BS02 CU ? N/A W0DP94 32094184
    468266 6g50:C (1.65) BS01 CU ? N/A W0DP94 32094184
    468267 6g50:C (1.65) BS02 CU ? N/A W0DP94 32094184
    468268 6g50:C (1.65) BS03 CU ? N/A W0DP94 32094184
    468269 6g50:D (1.65) BS01 CU ? N/A W0DP94 32094184
    468270 6g50:D (1.65) BS02 CU ? N/A W0DP94 32094184
    468271 6g50:D (1.65) BS03 CU ? N/A W0DP94 32094184
    468272 6g51:A (4.1) BS01 rna ? GO:0000028 ... P08865 29875412
    468273 6g51:B (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61247 29875412
    468274 6g51:C (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P15880 29875412
    468275 6g51:D (4.1) BS01 rna 4.2.99.18 GO:0000977 ... P23396 29875412
    468276 6g51:E (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62701 29875412
    468277 6g51:F (4.1) BS01 rna ? GO:0000028 ... P46782 29875412
    468278 6g51:G (4.1) BS01 rna ? GO:0000082 ... P62753 29875412
    468279 6g51:H (4.1) BS01 rna ? GO:0001843 ... P62081 29875412
    468280 6g51:I (4.1) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62241 29875412
    468281 6g51:J (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46781 29875412
    468282 6g51:K (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46783 29875412
    468283 6g51:L (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62280 29875412
    468284 6g51:M (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P25398 29875412
    468285 6g51:N (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62277 29875412
    468286 6g51:O (4.1) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62263 29875412
    468287 6g51:P (4.1) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62841 29875412
    468288 6g51:Q (4.1) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62249 29875412
    468289 6g51:R (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P08708 29875412
    468290 6g51:S (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62269 29875412
    468291 6g51:T (4.1) BS01 rna ? GO:0000028 ... P39019 29875412
    468292 6g51:U (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P60866 29875412
    468293 6g51:W (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62244 29875412
    468294 6g51:X (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62266 29875412
    468295 6g51:Y (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62847 29875412
    468296 6g51:Z (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62851 29875412
    468297 6g51:b (4.1) BS01 rna ? GO:0000028 ... P42677 29875412
    468298 6g51:c (4.1) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62857 29875412
    468299 6g51:d (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62273 29875412
    468300 6g51:e (4.1) BS01 rna ? GO:0003735 ... P62861 29875412
    468301 6g51:f (4.1) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62979 29875412
    468302 6g51:g (4.1) BS01 rna ? GO:0001891 ... P63244 29875412
    468303 6g51:u (4.1) BS01 rna ? GO:0000462 ... Q2NL82 29875412
    468304 6g51:v (4.1) BS01 rna 2.7.11.1 GO:0003824 ... Q9BVS4 29875412
    468305 6g51:x (4.1) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q9NRX1 29875412
    468306 6g51:y (4.1) BS01 rna 3.1.-.- GO:0004519 ... Q9ULX3 29875412
    468307 6g53:A (4.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P08865 29875412
    468308 6g53:B (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61247 29875412
    468309 6g53:C (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P15880 29875412
    468310 6g53:D (4.5) BS01 rna 4.2.99.18 GO:0000977 ... P23396 29875412
    468311 6g53:E (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62701 29875412
    468312 6g53:F (4.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P46782 29875412
    468313 6g53:G (4.5) BS01 rna ? GO:0000082 ... P62753 29875412
    468314 6g53:H (4.5) BS01 rna ? GO:0001843 ... P62081 29875412
    468315 6g53:I (4.5) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62241 29875412
    468316 6g53:J (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46781 29875412
    468317 6g53:K (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46783 29875412
    468318 6g53:L (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62280 29875412
    468319 6g53:M (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P25398 29875412
    468320 6g53:N (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62277 29875412
    468321 6g53:O (4.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62263 29875412
    468322 6g53:P (4.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62841 29875412
    468323 6g53:Q (4.5) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62249 29875412
    468324 6g53:R (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P08708 29875412
    468325 6g53:S (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62269 29875412
    468326 6g53:T (4.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P39019 29875412
    468327 6g53:U (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P60866 29875412
    468328 6g53:W (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62244 29875412
    468329 6g53:X (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62266 29875412
    468330 6g53:Y (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62847 29875412
    468331 6g53:Z (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62851 29875412
    468332 6g53:b (4.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P42677 29875412
    468333 6g53:c (4.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62857 29875412
    468334 6g53:d (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62273 29875412
    468335 6g53:e (4.5) BS01 rna ? GO:0003735 ... P62861 29875412
    468336 6g53:f (4.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62979 29875412
    468337 6g53:g (4.5) BS01 rna ? GO:0001891 ... P63244 29875412
    468338 6g53:x (4.5) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q9NRX1 29875412
    468339 6g53:y (4.5) BS01 rna 3.1.-.- GO:0004519 ... Q9ULX3 29875412
    468340 6g54:A (2.05) BS01 6H3 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 30982749
    468341 6g55:A (1.65) BS01 peptide ? N/A V6F235 30811856
    468342 6g55:A (1.65) BS02 BCT ? N/A V6F235 30811856
    468343 6g58:A (1.9) BS01 EOW 5.1.1.1 GO:0003824 ... P63479 30297752
    468344 6g58:B (1.9) BS01 EOW 5.1.1.1 GO:0003824 ... P63479 30297752
    468345 6g59:A (2.45) BS01 EM2 5.1.1.1 GO:0003824 ... P63479 30297752
    468346 6g59:B (2.45) BS01 EM2 5.1.1.1 GO:0003824 ... P63479 30297752
    468347 6g5a:A (1.483) BS01 HEM 1.11.1.-
    1.7.-.-
    GO:0004601 ... P02185 N/A
    468348 6g5a:A (1.483) BS02 EEE 1.11.1.-
    1.7.-.-
    GO:0004601 ... P02185 N/A
    468349 6g5b:A (1.6) BS01 HEM 1.11.1.-
    1.7.-.-
    GO:0004601 ... P02185 N/A
    468350 6g5b:A (1.6) BS02 EEE 1.11.1.-
    1.7.-.-
    GO:0004601 ... P02185 N/A
    468351 6g5c:A (1.8) BS01 4TI 3.2.1.17 GO:0003796 ... P00698 N/A
    468352 6g5f:B (2.5) BS01 peptide 3.4.24.69 GO:0004222 ... P10844 30746458
    468353 6g5g:B (2.0) BS01 peptide 3.4.24.69 GO:0004222 ... P10844 30746458
    468354 6g5h:A (3.6) BS01 rna ? GO:0000028 ... P08865 29875412
    468355 6g5h:B (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61247 29875412
    468356 6g5h:C (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P15880 29875412
    468357 6g5h:D (3.6) BS01 rna 4.2.99.18 GO:0000977 ... P23396 29875412
    468358 6g5h:E (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62701 29875412
    468359 6g5h:F (3.6) BS01 rna ? GO:0000028 ... P46782 29875412
    468360 6g5h:G (3.6) BS01 rna ? GO:0000082 ... P62753 29875412
    468361 6g5h:H (3.6) BS01 rna ? GO:0001843 ... P62081 29875412
    468362 6g5h:I (3.6) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62241 29875412
    468363 6g5h:J (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46781 29875412
    468364 6g5h:K (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46783 29875412
    468365 6g5h:L (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62280 29875412
    468366 6g5h:M (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P25398 29875412
    468367 6g5h:N (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62277 29875412
    468368 6g5h:O (3.6) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62263 29875412
    468369 6g5h:P (3.6) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62841 29875412
    468370 6g5h:Q (3.6) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62249 29875412
    468371 6g5h:R (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P08708 29875412
    468372 6g5h:S (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62269 29875412
    468373 6g5h:T (3.6) BS01 rna ? GO:0000028 ... P39019 29875412
    468374 6g5h:U (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P60866 29875412
    468375 6g5h:W (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62244 29875412
    468376 6g5h:X (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62266 29875412
    468377 6g5h:Y (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62847 29875412
    468378 6g5h:Z (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62851 29875412
    468379 6g5h:a (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62854 29875412
    468380 6g5h:a (3.6) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P62854 29875412
    468381 6g5h:b (3.6) BS01 rna ? GO:0000028 ... P42677 29875412
    468382 6g5h:c (3.6) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62857 29875412
    468383 6g5h:d (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62273 29875412
    468384 6g5h:d (3.6) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P62273 29875412
    468385 6g5h:e (3.6) BS01 rna ? GO:0003735 ... P62861 29875412
    468386 6g5h:f (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62979 29875412
    468387 6g5h:f (3.6) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P62979 29875412
    468388 6g5h:g (3.6) BS01 rna ? GO:0001891 ... P63244 29875412
    468389 6g5i:A (3.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P08865 29875412
    468390 6g5i:B (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61247 29875412
    468391 6g5i:C (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P15880 29875412
    468392 6g5i:D (3.5) BS01 rna 4.2.99.18 GO:0000977 ... P23396 29875412
    468393 6g5i:E (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62701 29875412
    468394 6g5i:F (3.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P46782 29875412
    468395 6g5i:G (3.5) BS01 rna ? GO:0000082 ... P62753 29875412
    468396 6g5i:H (3.5) BS01 rna ? GO:0001843 ... P62081 29875412
    468397 6g5i:I (3.5) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62241 29875412
    468398 6g5i:J (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46781 29875412
    468399 6g5i:K (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46783 29875412
    468400 6g5i:L (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62280 29875412

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).