SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2334 2335 2336 2337 2338 2339 2340 2341 2342 2343 2344 2345 2346 2347 2348 2349 2350 2351 2352 2353 2354 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    468601 6g7d:A (1.35) BS01 SAH 2.1.1.365 GO:0005886 ... K5B7F3 30606802
    468602 6g7d:A (1.35) BS02 MG 2.1.1.365 GO:0005886 ... K5B7F3 30606802
    468603 6g7f:G (2.7) BS01 MG 3.4.25.1 GO:0000502 ... P21243 30165344
    468604 6g7f:H (2.7) BS01 EPW 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30165344
    468605 6g7f:H (2.7) BS02 EPW 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30165344
    468606 6g7f:K (2.7) BS01 EPW 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30165344
    468607 6g7f:K (2.7) BS02 MG 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30165344
    468608 6g7f:N (2.7) BS01 EPW 3.4.25.1 GO:0000502 ... P38624 30165344
    468609 6g7f:N (2.7) BS02 MG 3.4.25.1 GO:0000502 ... P38624 30165344
    468610 6g7f:V (2.7) BS01 EPW 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30165344
    468611 6g7f:V (2.7) BS02 MG 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30165344
    468612 6g7f:V (2.7) BS03 EPW 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30165344
    468613 6g7f:W (2.7) BS01 MG 3.4.25.1 GO:0000502 ... P25451 30165344
    468614 6g7f:Y (2.7) BS01 EPW 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30165344
    468615 6g7f:Y (2.7) BS02 MG 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30165344
    468616 6g7f:Z (2.7) BS01 MG 3.4.25.1 GO:0000502 ... P23724 30165344
    468617 6g7f:b (2.7) BS01 EPW 3.4.25.1 GO:0000502 ... P38624 30165344
    468618 6g7h:A (1.5) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 29903883
    468619 6g7i:A (1.9) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 29903883
    468620 6g7j:A (1.9) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 29903883
    468621 6g7k:A (1.9) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 29903883
    468622 6g7l:A (1.9) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 29903883
    468623 6g7m:L (1.71) BS01 F3S 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 N/A
    468624 6g7m:L (1.71) BS02 FCO 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 N/A
    468625 6g7m:L (1.71) BS03 MG 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 N/A
    468626 6g7m:M (1.71) BS01 FCO 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 N/A
    468627 6g7m:M (1.71) BS02 MG 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 N/A
    468628 6g7m:S (1.71) BS01 SF4 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 N/A
    468629 6g7m:S (1.71) BS02 F3S 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 N/A
    468630 6g7m:S (1.71) BS03 SF4 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 N/A
    468631 6g7m:T (1.71) BS01 SF4 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 N/A
    468632 6g7m:T (1.71) BS02 F3S 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 N/A
    468633 6g7m:T (1.71) BS03 SF4 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 N/A
    468634 6g7n:A (1.1) BS01 DAL ? GO:0006826 ... Q10Z45 30217820
    468635 6g7n:A (1.1) BS02 DGL ? GO:0006826 ... Q10Z45 30217820
    468636 6g7n:A (1.1) BS03 FE ? GO:0006826 ... Q10Z45 30217820
    468637 6g7n:B (1.1) BS01 DAL ? GO:0006826 ... Q10Z45 30217820
    468638 6g7n:B (1.1) BS02 DGL ? GO:0006826 ... Q10Z45 30217820
    468639 6g7n:B (1.1) BS03 FE ? GO:0006826 ... Q10Z45 30217820
    468640 6g7o:A (2.7) BS01 ZN 3.5.1.-
    3.5.1.23
    GO:0000139 ... P0ABE7
    Q9NUN7
    30575723
    468641 6g7o:A (2.7) BS02 CA 3.5.1.-
    3.5.1.23
    GO:0000139 ... P0ABE7
    Q9NUN7
    30575723
    468642 6g7o:A (2.7) BS03 MG 3.5.1.-
    3.5.1.23
    GO:0000139 ... P0ABE7
    Q9NUN7
    30575723
    468643 6g7p:A (1.5) BS01 FE ? GO:0006826 ... Q10Z45 30217820
    468644 6g7p:B (1.5) BS01 FE ? GO:0006826 ... Q10Z45 30217820
    468645 6g7r:L (1.2) BS01 EJ2 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 30070475
    468646 6g7r:L (1.2) BS02 MG 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 30070475
    468647 6g7r:M (1.2) BS01 EJ2 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 30070475
    468648 6g7r:M (1.2) BS02 MG 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 30070475
    468649 6g7r:S (1.2) BS01 SF4 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 30070475
    468650 6g7r:S (1.2) BS02 F3S 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 30070475
    468651 6g7r:S (1.2) BS03 SF3 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 30070475
    468652 6g7r:T (1.2) BS01 SF4 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 30070475
    468653 6g7r:T (1.2) BS02 F3S 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 30070475
    468654 6g7r:T (1.2) BS03 SF3 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 30070475
    468655 6g80:A (2.05) BS01 SAH 2.1.1.365 GO:0005886 ... K5B7F3 30606802
    468656 6g80:C (2.05) BS01 SAH 2.1.1.365 GO:0005886 ... K5B7F3 30606802
    468657 6g80:M (2.05) BS01 SAH 2.1.1.365 GO:0005886 ... K5B7F3 30606802
    468658 6g81:A (-1.00) BS01 ZN ? GO:0008270 ... P0A0U5 30264175
    468659 6g82:A (2.401) BS01 CA N/A GO:0004064 ... N/A 31873734
    468660 6g82:A (2.401) BS02 CA N/A GO:0004064 ... N/A 31873734
    468661 6g83:A (2.4) BS01 FAD 1.1.98.3 GO:0003885 ... P9WJF1 30012754
    468662 6g83:A (2.4) BS02 EQ8 1.1.98.3 GO:0003885 ... P9WJF1 30012754
    468663 6g83:B (2.4) BS01 FAD 1.1.98.3 GO:0003885 ... P9WJF1 30012754
    468664 6g83:B (2.4) BS02 EQ8 1.1.98.3 GO:0003885 ... P9WJF1 30012754
    468665 6g84:A (2.47) BS01 peptide 3.1.3.48 GO:0006470 ... Q00684 30455435
    468666 6g84:B (2.47) BS01 peptide 3.1.3.48 GO:0006470 ... Q00684 30455435
    468667 6g84:B (2.47) BS02 ZN 3.1.3.48 GO:0006470 ... Q00684 30455435
    468668 6g85:A (1.528) BS01 peptide 3.1.3.48 GO:0006470 ... Q00684 30455435
    468669 6g85:A (1.528) BS02 ZN 3.1.3.48 GO:0006470 ... Q00684 30455435
    468670 6g85:B (1.528) BS01 peptide 3.1.3.48 GO:0006470 ... Q00684 30455435
    468671 6g86:A (1.74) BS01 peptide 3.1.3.48 GO:0006470 ... Q00684 30455435
    468672 6g86:A (1.74) BS02 ZN 3.1.3.48 GO:0006470 ... Q00684 30455435
    468673 6g86:B (1.74) BS01 peptide 3.1.3.48 GO:0006470 ... Q00684 30455435
    468674 6g86:B (1.74) BS02 ZN 3.1.3.48 GO:0006470 ... Q00684 30455435
    468675 6g88:A (3.3) BS01 RB6 ? GO:0005886 ... Q47759 N/A
    468676 6g88:B (3.3) BS01 RB6 ? GO:0005886 ... Q47759 N/A
    468677 6g88:C (3.3) BS01 RB6 ? GO:0005886 ... Q47759 N/A
    468678 6g8b:A (2.374) BS01 ZN 3.4.11.2 GO:0004177 ... P04825 30275593
    468679 6g8b:A (2.374) BS02 7MF 3.4.11.2 GO:0004177 ... P04825 30275593
    468680 6g8f:A (2.043) BS01 MN 1.14.11.68 N/A O15550 30226987
    468681 6g8f:A (2.043) BS02 ZN 1.14.11.68 N/A O15550 30226987
    468682 6g8f:A (2.043) BS03 K0I 1.14.11.68 N/A O15550 30226987 BindingDB: IC50=69000nM
    468683 6g8g:A (2.6) BS01 GEN N/A GO:0003677 ... N/A 34314575
    468684 6g8g:B (2.6) BS01 GEN N/A GO:0003677 ... N/A 34314575
    468685 6g8g:C (2.6) BS01 GEN N/A GO:0003677 ... N/A 34314575
    468686 6g8g:D (2.6) BS01 GEN N/A GO:0003677 ... N/A 34314575
    468687 6g8h:BBB (2.6) BS01 NAR ? GO:0003677 ... Q89M71 34314575
    468688 6g8h:CCC (2.6) BS01 CWE ? GO:0003677 ... Q89M71 34314575
    468689 6g8i:A (1.6) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P31947 31763628
    468690 6g8j:A (1.47) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P31947 31763628
    468691 6g8k:A (1.25) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P31947 31763628
    468692 6g8l:A (1.37) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P31947 31763628
    468693 6g8m:G (2.7) BS01 MG 3.4.25.1 GO:0000502 ... P21243 30165344
    468694 6g8m:H (2.7) BS01 EQE 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30165344
    468695 6g8m:I (2.7) BS01 MG 3.4.25.1 GO:0000502 ... P25451 30165344
    468696 6g8m:K (2.7) BS01 EQE 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30165344
    468697 6g8m:K (2.7) BS02 MG 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30165344
    468698 6g8m:N (2.7) BS01 EQE 3.4.25.1 GO:0000502 ... P38624 30165344
    468699 6g8m:V (2.7) BS01 EQE 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30165344
    468700 6g8m:V (2.7) BS02 MG 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30165344
    468701 6g8m:W (2.7) BS01 MG 3.4.25.1 GO:0000502 ... P25451 30165344
    468702 6g8m:Y (2.7) BS01 EQE 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30165344
    468703 6g8m:Y (2.7) BS02 MG 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30165344
    468704 6g8m:Z (2.7) BS01 MG 3.4.25.1 GO:0000502 ... P23724 30165344
    468705 6g8m:b (2.7) BS01 EQE 3.4.25.1 GO:0000502 ... P38624 30165344
    468706 6g8n:G (3.0) BS01 MG 3.4.25.1 GO:0000502 ... P21243 30165344
    468707 6g8n:H (3.0) BS01 EQB 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30165344
    468708 6g8n:H (3.0) BS02 EQB 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30165344
    468709 6g8n:K (3.0) BS01 EQB 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30165344
    468710 6g8n:K (3.0) BS02 MG 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30165344
    468711 6g8n:N (3.0) BS01 EQB 3.4.25.1 GO:0000502 ... P38624 30165344
    468712 6g8n:N (3.0) BS02 MG 3.4.25.1 GO:0000502 ... P38624 30165344
    468713 6g8n:V (3.0) BS01 EQB 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30165344
    468714 6g8n:V (3.0) BS02 MG 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30165344
    468715 6g8n:V (3.0) BS03 EQB 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30165344
    468716 6g8n:Y (3.0) BS01 EQB 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30165344
    468717 6g8n:Y (3.0) BS02 MG 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30165344
    468718 6g8n:Z (3.0) BS01 MG 3.4.25.1 GO:0000502 ... P23724 30165344
    468719 6g8n:b (3.0) BS01 EQB 3.4.25.1 GO:0000502 ... P38624 30165344
    468720 6g8p:A (1.9) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P31947 31763628
    468721 6g8q:A (1.85) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P31947 31763628
    468722 6g8q:A (1.85) BS02 CA ? GO:0000122 ... P31947 31763628
    468723 6g8r:B (2.74) BS01 ZN ? N/A Q13342 N/A
    468724 6g8r:B (2.74) BS02 ZN ? N/A Q13342 N/A
    468725 6g8u:A (1.308) BS01 ZN 3.4.24.69 GO:0004222 ... P0DPK1 N/A
    468726 6g8v:A (1.45) BS01 ZN 3.4.24.69 GO:0004222 ... P0DPK1 N/A
    468727 6g8x:A (1.76) BS01 EQT 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310
    468728 6g8x:A (1.76) BS02 EQT 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310
    468729 6g90:A (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... P32605 29995849
    468730 6g90:B (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... Q00916 29995849
    468731 6g90:C (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... Q05900 29995849
    468732 6g90:C (4.0) BS02 rna ? GO:0000243 ... Q05900 29995849
    468733 6g90:C (4.0) BS03 ZN ? GO:0000243 ... Q05900 29995849
    468734 6g90:E (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... Q03776 29995849
    468735 6g90:G (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... Q03782 29995849
    468736 6g90:H (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... Q07508 29995849
    468737 6g90:H (4.0) BS02 rna ? GO:0000243 ... Q07508 29995849
    468738 6g90:H (4.0) BS03 ZN ? GO:0000243 ... Q07508 29995849
    468739 6g90:H (4.0) BS04 ZN ? GO:0000243 ... Q07508 29995849
    468740 6g90:O (4.0) BS01 rna ? GO:0000245 ... P49955 29995849
    468741 6g90:O (4.0) BS02 rna ? GO:0000245 ... P49955 29995849
    468742 6g90:Q (4.0) BS01 rna ? GO:0000245 ... Q02554 29995849
    468743 6g90:R (4.0) BS01 rna ? GO:0000398 ... Q99181 29995849
    468744 6g90:S (4.0) BS01 rna ? GO:0000245 ... Q06835 29995849
    468745 6g90:S (4.0) BS02 rna ? GO:0000245 ... Q06835 29995849
    468746 6g90:S (4.0) BS03 ZN ? GO:0000245 ... Q06835 29995849
    468747 6g90:S (4.0) BS04 ZN ? GO:0000245 ... Q06835 29995849
    468748 6g90:S (4.0) BS05 ZN ? GO:0000245 ... Q06835 29995849
    468749 6g90:T (4.0) BS01 rna ? GO:0000395 ... P19736 29995849
    468750 6g90:T (4.0) BS02 rna ? GO:0000395 ... P19736 29995849
    468751 6g90:T (4.0) BS03 ZN ? GO:0000395 ... P19736 29995849
    468752 6g90:T (4.0) BS04 ZN ? GO:0000395 ... P19736 29995849
    468753 6g90:U (4.0) BS01 rna ? GO:0000245 ... Q07350 29995849
    468754 6g90:U (4.0) BS02 rna ? GO:0000245 ... Q07350 29995849
    468755 6g90:U (4.0) BS03 ZN ? GO:0000245 ... Q07350 29995849
    468756 6g90:W (4.0) BS01 rna ? GO:0000398 ... Q08963 29995849
    468757 6g90:Y (4.0) BS01 rna ? GO:0000398 ... P40567 29995849
    468758 6g90:b (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... P40018 29995849
    468759 6g90:d (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... P43321 29995849
    468760 6g90:e (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... Q12330 29995849
    468761 6g90:f (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... P54999 29995849
    468762 6g90:g (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... P40204 29995849
    468763 6g90:h (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... Q02260 29995849
    468764 6g90:i (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... Q06217 29995849
    468765 6g90:s (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... P40018 29995849
    468766 6g90:t (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... Q02260 29995849
    468767 6g90:u (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... Q06217 29995849
    468768 6g90:v (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... P43321 29995849
    468769 6g90:w (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... Q12330 29995849
    468770 6g90:x (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... P54999 29995849
    468771 6g90:y (4.0) BS01 rna ? GO:0000243 ... P40204 29995849
    468772 6g91:A (1.8) BS01 EQW 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310 MOAD: ic50=3200nM
    BindingDB: IC50=3200nM
    468773 6g92:A (1.99) BS01 ERZ 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310 MOAD: ic50=76000nM
    BindingDB: IC50=76000nM
    468774 6g93:A (1.67) BS01 EU2 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310 MOAD: ic50=11nM
    BindingDB: IC50=11.0nM
    468775 6g94:A (2.5) BS01 HEM ? GO:0005506 ... P0AAM1 29888350
    468776 6g94:B (2.5) BS01 HEM ? GO:0005506 ... P0AAM1 29888350
    468777 6g94:J (2.5) BS01 FCO 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 29888350
    468778 6g94:J (2.5) BS02 MG 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 29888350
    468779 6g94:K (2.5) BS01 FCO 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 29888350
    468780 6g94:K (2.5) BS02 MG 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 29888350
    468781 6g94:L (2.5) BS01 FCO 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 29888350
    468782 6g94:L (2.5) BS02 MG 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 29888350
    468783 6g94:M (2.5) BS01 FCO 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 29888350
    468784 6g94:M (2.5) BS02 MG 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 29888350
    468785 6g94:Q (2.5) BS01 SF4 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 29888350
    468786 6g94:Q (2.5) BS02 F3S 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 29888350
    468787 6g94:Q (2.5) BS03 ER2 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 29888350
    468788 6g94:R (2.5) BS01 SF4 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 29888350
    468789 6g94:R (2.5) BS02 F3S 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 29888350
    468790 6g94:R (2.5) BS03 ER2 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 29888350
    468791 6g94:S (2.5) BS01 SF4 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 29888350
    468792 6g94:S (2.5) BS02 F3S 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 29888350
    468793 6g94:S (2.5) BS03 ER2 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 29888350
    468794 6g94:T (2.5) BS01 SF4 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 29888350
    468795 6g94:T (2.5) BS02 F3S 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 29888350
    468796 6g94:T (2.5) BS03 ER2 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 29888350
    468797 6g95:A (2.31) BS01 RTZ ? N/A Q05320 29741894
    468798 6g95:B (2.31) BS01 RTZ ? N/A Q05320 29741894
    468799 6g96:A (1.47661) BS01 ACO ? GO:0000049 ... A0A0F6B5X4 29777131
    468800 6g96:B (1.47661) BS01 ACO ? GO:0000049 ... A0A0F6B5X4 29777131

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).