SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2335 2336 2337 2338 2339 2340 2341 2342 2343 2344 2345 2346 2347 2348 2349 2350 2351 2352 2353 2354 2355 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    468801 6g97:A (1.9) BS01 EQZ 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310 MOAD: ic50=4.2nM
    BindingDB: IC50=3.90nM
    468802 6g98:A (2.47) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486
    468803 6g98:A (2.47) BS02 ER5 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486 MOAD: Kd=0.16nM
    468804 6g98:B (2.47) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486
    468805 6g98:B (2.47) BS02 ER5 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486 MOAD: Kd=0.16nM
    468806 6g98:C (2.47) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486
    468807 6g98:C (2.47) BS02 ER5 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486 MOAD: Kd=0.16nM
    468808 6g98:D (2.47) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486
    468809 6g98:D (2.47) BS02 ER5 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486 MOAD: Kd=0.16nM
    468810 6g99:B (-1.00) BS01 rna ? GO:0003723 ... P35637 30581145
    468811 6g99:B (-1.00) BS02 ZN ? GO:0003723 ... P35637 30581145
    468812 6g9a:A (1.91) BS01 ESQ 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310 MOAD: ic50=21nM
    BindingDB: IC50=12.0nM
    468813 6g9b:A (2.26) BS01 IXX ? N/A Q05320 29741894 MOAD: Kd=584uM
    BindingDB: Kd=584000nM
    468814 6g9b:B (2.26) BS01 IXX ? N/A Q05320 29741894 MOAD: Kd=584uM
    BindingDB: Kd=584000nM
    468815 6g9d:A (1.8) BS01 ER8 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310 MOAD: ic50=4.3nM
    BindingDB: IC50=9.00nM
    468816 6g9f:A (2.35) BS01 NXL 3.4.16.4 GO:0008658 ... P0AD65 30995398
    468817 6g9h:A (1.73) BS01 ERW 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310 MOAD: ic50=4nM
    BindingDB: IC50=3.00nM
    468818 6g9j:A (1.98) BS01 ERK 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310 MOAD: ic50=4.1nM
    BindingDB: IC50=4.30nM
    468819 6g9k:A (1.94) BS01 ESK 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310
    468820 6g9m:A (1.86) BS01 ESW 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310 MOAD: ic50=7.9nM
    BindingDB: IC50=7.90nM
    468821 6g9n:A (1.76) BS01 ESN 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310 MOAD: ic50=3nM
    BindingDB: IC50=3.00nM
    468822 6g9q:A (1.89) BS01 peptide ? N/A P01899 N/A
    468823 6g9q:H (1.89) BS01 peptide ? GO:0002250 ... P01852
    P04213
    N/A
    468824 6g9r:A (2.7) BS01 peptide ? N/A P01899 N/A
    468825 6g9r:C (2.7) BS01 peptide ? N/A P01899 N/A
    468826 6g9r:E (2.7) BS01 peptide ? N/A P01899 N/A
    468827 6g9r:G (2.7) BS01 peptide ? N/A P01899 N/A
    468828 6g9s:A (2.001) BS01 ET5 3.4.16.4 GO:0004180 ... P0AD65 30995398
    468829 6g9u:A (1.75) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486
    468830 6g9u:A (1.75) BS02 ETK 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486 MOAD: Kd=0.2nM
    468831 6g9u:B (1.75) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486
    468832 6g9u:B (1.75) BS02 ETK 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486 MOAD: Kd=0.2nM
    468833 6g9u:C (1.75) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486
    468834 6g9u:C (1.75) BS02 ETK 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486 MOAD: Kd=0.2nM
    468835 6g9u:D (1.75) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486
    468836 6g9u:D (1.75) BS02 ETK 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q16790 29928486 MOAD: Kd=0.2nM
    468837 6g9v:B (1.75) BS01 UD1 2.7.7.23 GO:0003977 ... Q4WAR0 N/A
    468838 6g9w:A (2.4) BS01 UTP 2.7.7.23 GO:0003977 ... Q4WAR0 N/A
    468839 6g9w:B (2.4) BS01 UTP 2.7.7.23 GO:0003977 ... Q4WAR0 N/A
    468840 6g9x:A (2.3) BS01 JKE ? GO:0005886 ... A0LNN5 31201333
    468841 6g9x:B (2.3) BS01 JKE ? GO:0005886 ... A0LNN5 31201333
    468842 6ga0:A (2.0) BS01 ETW 2.1.1.63 GO:0003824 ... Q97VW7 29684348
    468843 6ga1:A (1.7) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468844 6ga2:A (1.8) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468845 6ga3:A (2.1) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468846 6ga4:A (1.8) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468847 6ga5:A (1.9) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468848 6ga6:A (1.8) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468849 6ga7:A (1.8) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468850 6ga8:A (1.8) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468851 6ga9:A (1.8) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468852 6gaa:A (1.8) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468853 6gab:A (1.8) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468854 6gac:A (1.8) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468855 6gad:A (1.8) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468856 6gae:A (1.8) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468857 6gaf:A (1.8) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468858 6gag:A (1.8) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468859 6gah:A (1.8) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468860 6gai:A (1.8) BS01 RET ? GO:0005216 ... P02945 31320619
    468861 6gal:L (1.25) BS01 EJ2 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 30070475
    468862 6gal:L (1.25) BS02 MG 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 30070475
    468863 6gal:M (1.25) BS01 EJ2 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 30070475
    468864 6gal:M (1.25) BS02 MG 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACD8 30070475
    468865 6gal:S (1.25) BS01 SF4 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 30070475
    468866 6gal:S (1.25) BS02 F3S 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 30070475
    468867 6gal:S (1.25) BS03 SF3 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 30070475
    468868 6gal:T (1.25) BS01 SF4 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 30070475
    468869 6gal:T (1.25) BS02 F3S 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 30070475
    468870 6gal:T (1.25) BS03 SF3 1.12.99.6 GO:0005515 ... P69739 30070475
    468871 6gam:L (1.4) BS01 F3S 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468872 6gam:L (1.4) BS02 SF4 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468873 6gam:L (1.4) BS03 FCO 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468874 6gam:L (1.4) BS04 MG 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468875 6gam:M (1.4) BS01 F3S 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468876 6gam:M (1.4) BS02 SF4 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468877 6gam:M (1.4) BS03 FCO 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468878 6gam:M (1.4) BS04 MG 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468879 6gam:S (1.4) BS01 SF4 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 30070475
    468880 6gam:S (1.4) BS02 F3S 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 30070475
    468881 6gam:S (1.4) BS03 SF4 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 30070475
    468882 6gam:T (1.4) BS01 SF4 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 30070475
    468883 6gam:T (1.4) BS02 F3S 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 30070475
    468884 6gam:T (1.4) BS03 SF4 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 30070475
    468885 6gan:L (1.6) BS01 F3S 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468886 6gan:L (1.6) BS02 SF4 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468887 6gan:L (1.6) BS03 FCO 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468888 6gan:L (1.6) BS04 MG 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468889 6gan:M (1.6) BS01 F3S 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468890 6gan:M (1.6) BS02 SF4 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468891 6gan:M (1.6) BS03 FCO 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468892 6gan:M (1.6) BS04 MG 1.12.99.6 GO:0005515 ... P0ACE0 30070475
    468893 6gan:S (1.6) BS01 SF4 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 30070475
    468894 6gan:S (1.6) BS02 F3S 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 30070475
    468895 6gan:S (1.6) BS03 SF4 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 30070475
    468896 6gan:T (1.6) BS01 SF4 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 30070475
    468897 6gan:T (1.6) BS02 F3S 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 30070475
    468898 6gan:T (1.6) BS03 SF4 1.12.99.6 GO:0008901 ... P69741 30070475
    468899 6gaq:A (2.5) BS01 FMN ? GO:0000166 ... Q81AM1 30142264
    468900 6gaq:A (2.5) BS02 CA ? GO:0000166 ... Q81AM1 30142264
    468901 6gaq:A (2.5) BS03 CA ? GO:0000166 ... Q81AM1 30142264
    468902 6gaq:B (2.5) BS01 FMN ? GO:0000166 ... Q81AM1 30142264
    468903 6gaq:B (2.5) BS02 CA ? GO:0000166 ... Q81AM1 30142264
    468904 6gar:A (2.4) BS01 FAD 1.18.1.2 GO:0000166 ... Q81IK1 30142264
    468905 6gar:A (2.4) BS02 FAD 1.18.1.2 GO:0000166 ... Q81IK1 30142264
    468906 6gar:B (2.4) BS01 FAD 1.18.1.2 GO:0000166 ... Q81IK1 30142264
    468907 6gar:B (2.4) BS02 FAD 1.18.1.2 GO:0000166 ... Q81IK1 30142264
    468908 6gas:A (2.4) BS01 FAD 1.18.1.2 GO:0004324 ... Q816D9 30142264
    468909 6gas:A (2.4) BS02 FAD 1.18.1.2 GO:0004324 ... Q816D9 30142264
    468910 6gas:B (2.4) BS01 FAD 1.18.1.2 GO:0004324 ... Q816D9 30142264
    468911 6gas:B (2.4) BS02 FAD 1.18.1.2 GO:0004324 ... Q816D9 30142264
    468912 6gas:C (2.4) BS01 FAD 1.18.1.2 GO:0004324 ... Q816D9 30142264
    468913 6gas:C (2.4) BS02 FAD 1.18.1.2 GO:0004324 ... Q816D9 30142264
    468914 6gas:D (2.4) BS01 FAD 1.18.1.2 GO:0004324 ... Q816D9 30142264
    468915 6gas:D (2.4) BS02 FAD 1.18.1.2 GO:0004324 ... Q816D9 30142264
    468916 6gat:A (-1.00) BS01 dna ? GO:0003700 ... P17429 9533884
    468917 6gat:A (-1.00) BS02 dna ? GO:0003700 ... P17429 9533884
    468918 6gat:A (-1.00) BS03 ZN ? GO:0003700 ... P17429 9533884
    468919 6gau:A (3.3) BS01 ANP 5.6.2.2 GO:0000287 ... P9WG45
    P9WG47
    30744994
    468920 6gau:A (3.3) BS02 MG 5.6.2.2 GO:0000287 ... P9WG45
    P9WG47
    30744994
    468921 6gau:B (3.3) BS01 ANP 5.6.2.2 GO:0000287 ... P9WG45
    P9WG47
    30744994
    468922 6gau:B (3.3) BS02 MG 5.6.2.2 GO:0000287 ... P9WG45
    P9WG47
    30744994
    468923 6gaw:AB (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... F1S001 30089917
    468924 6gaw:AB (3.2) BS02 MG ? GO:0003735 ... F1S001 30089917
    468925 6gaw:AC (3.2) BS01 rna ? GO:0005739 ... A0A287ANU4 30089917
    468926 6gaw:AE (3.2) BS01 rna ? GO:0003723 ... F1SU66 30089917
    468927 6gaw:AE (3.2) BS02 rna ? GO:0003723 ... F1SU66 30089917
    468928 6gaw:AF (3.2) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30089917
    468929 6gaw:AG (3.2) BS01 rna ? GO:0000028 ... A0A286ZJ25 30089917
    468930 6gaw:AI (3.2) BS01 rna ? GO:0003723 ... I3LU08 30089917
    468931 6gaw:AI (3.2) BS02 rna ? GO:0003723 ... I3LU08 30089917
    468932 6gaw:AJ (3.2) BS01 rna ? GO:0005763 ... F1RUU2 30089917
    468933 6gaw:AK (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A286ZJJ6 30089917
    468934 6gaw:AL (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A0M3KL52 30089917
    468935 6gaw:AN (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A0M3KL53 30089917
    468936 6gaw:AO (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A287BMP0 30089917
    468937 6gaw:AP (3.2) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30089917
    468938 6gaw:AQ (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A8D1UDM1 30089917
    468939 6gaw:AR (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A0M3KL54 30089917
    468940 6gaw:AR (3.2) BS02 ZN ? GO:0003735 ... A0A0M3KL54 30089917
    468941 6gaw:AU (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A286ZNB3 30089917
    468942 6gaw:Ab (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A287AEW3 30089917
    468943 6gaw:Ac (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A0M3KL55 30089917
    468944 6gaw:Ac (3.2) BS02 ZN ? GO:0003735 ... A0A0M3KL55 30089917
    468945 6gaw:Ad (3.2) BS01 rna ? GO:0005763 ... A0A287AY01 30089917
    468946 6gaw:Ae (3.2) BS01 rna N/A N/A N/A 30089917
    468947 6gaw:Ag (3.2) BS01 rna ? GO:0005654 ... A0A8D1XNL0 30089917
    468948 6gaw:Ag (3.2) BS02 GTP ? GO:0005654 ... A0A8D1XNL0 30089917
    468949 6gaw:Ah (3.2) BS01 peptide N/A GO:0003735 ... N/A 30089917
    468950 6gaw:Ai (3.2) BS01 rna ? N/A A0A4X1V2H3 30089917
    468951 6gaw:Ai (3.2) BS02 peptide ? N/A A0A4X1V2H3 30089917
    468952 6gaw:Aj (3.2) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30089917
    468953 6gaw:Am (3.2) BS01 rna ? GO:0005739 ... A0A4X1SZV4 30089917
    468954 6gaw:An (3.2) BS01 rna ? GO:0005634 ... A0A8D2A802 30089917
    468955 6gaw:An (3.2) BS02 rna ? GO:0005634 ... A0A8D2A802 30089917
    468956 6gaw:Ao (3.2) BS01 rna ? GO:0005739 ... K7GKS8 30089917
    468957 6gaw:Ap (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q767K8 30089917
    468958 6gaw:Ap (3.2) BS02 ZN ? GO:0003735 ... Q767K8 30089917
    468959 6gaw:B0 (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A4X1U0F6 30089917
    468960 6gaw:B1 (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A286ZTW8 30089917
    468961 6gaw:B2 (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... F1SGC7 30089917
    468962 6gaw:B3 (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A8D1MIP3 30089917
    468963 6gaw:B4 (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A4X1ULI6 30089917
    468964 6gaw:B5 (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... I3LTC4 30089917
    468965 6gaw:B5 (3.2) BS02 ZN ? GO:0003735 ... I3LTC4 30089917
    468966 6gaw:B6 (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A4X1TLP9 30089917
    468967 6gaw:B7 (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A4X1UFR4 30089917
    468968 6gaw:B8 (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... F1SVC5 30089917
    468969 6gaw:B9 (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A287A731 30089917
    468970 6gaw:B9 (3.2) BS02 ZN ? GO:0003735 ... A0A287A731 30089917
    468971 6gaw:BC (3.2) BS01 rna ? GO:0003743 ... P46199 30089917
    468972 6gaw:BC (3.2) BS02 rna ? GO:0003743 ... P46199 30089917
    468973 6gaw:BC (3.2) BS03 rna ? GO:0003743 ... P46199 30089917
    468974 6gaw:BC (3.2) BS04 GSP ? GO:0003743 ... P46199 30089917
    468975 6gaw:BC (3.2) BS05 MG ? GO:0003743 ... P46199 30089917
    468976 6gaw:BC (3.2) BS06 FME ? GO:0003743 ... P46199 30089917
    468977 6gaw:BD (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... F1RRN2 30089917
    468978 6gaw:BD (3.2) BS02 MG ? GO:0003735 ... F1RRN2 30089917
    468979 6gaw:BE (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A140UHW4 30089917
    468980 6gaw:BF (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A287B9C4 30089917
    468981 6gaw:BI (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... I3LR45 30089917
    468982 6gaw:BJ (3.2) BS01 peptide ? GO:0005840 ... F1RWJ0 30089917
    468983 6gaw:BJ (3.2) BS02 peptide ? GO:0005840 ... F1RWJ0 30089917
    468984 6gaw:BJ (3.2) BS03 peptide ? GO:0005840 ... F1RWJ0 30089917
    468985 6gaw:BJ (3.2) BS04 peptide ? GO:0005840 ... F1RWJ0 30089917
    468986 6gaw:BJ (3.2) BS05 peptide ? GO:0005840 ... F1RWJ0 30089917
    468987 6gaw:BJ (3.2) BS06 rna ? GO:0005840 ... F1RWJ0 30089917
    468988 6gaw:BK (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... F1RU54 30089917
    468989 6gaw:BN (3.2) BS01 rna ? GO:0003729 ... K7GP19 30089917
    468990 6gaw:BO (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... F1RQV7 30089917
    468991 6gaw:BP (3.2) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30089917
    468992 6gaw:BP (3.2) BS02 MG N/A GO:0003735 ... N/A 30089917
    468993 6gaw:BQ (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... F1RI89 30089917
    468994 6gaw:BR (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... F1RMQ4 30089917
    468995 6gaw:BS (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A286ZNK1 30089917
    468996 6gaw:BS (3.2) BS02 rna ? GO:0003735 ... A0A286ZNK1 30089917
    468997 6gaw:BT (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... I3LNJ0 30089917
    468998 6gaw:BU (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A286ZU56 30089917
    468999 6gaw:BV (3.2) BS01 rna ? GO:0003723 ... F1RY70 30089917
    469000 6gaw:BW (3.2) BS01 rna ? GO:0003735 ... A0A4X1TXR4 30089917

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).