SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2337 2338 2339 2340 2341 2342 2343 2344 2345 2346 2347 2348 2349 2350 2351 2352 2353 2354 2355 2356 2357 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    469201 6gbx:B (1.72) BS01 ZN 2.3.2.5 GO:0005515 ... Q16769 30132075
    469202 6gbx:B (1.72) BS02 S77 2.3.2.5 GO:0005515 ... Q16769 30132075 MOAD: Ki=0.02uM
    BindingDB: IC50=17nM
    469203 6gbx:C (1.72) BS01 ZN 2.3.2.5 GO:0005515 ... Q16769 30132075
    469204 6gbx:C (1.72) BS02 S77 2.3.2.5 GO:0005515 ... Q16769 30132075 MOAD: Ki=0.02uM
    BindingDB: IC50=17nM
    469205 6gby:A (1.48) BS01 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P25006 30821704
    469206 6gby:A (1.48) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P25006 30821704
    469207 6gby:A (1.48) BS03 NO2 1.7.2.1 GO:0005507 ... P25006 30821704
    469208 6gbz:0 (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N4 29883607
    469209 6gbz:1 (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N9 29883607
    469210 6gbz:2 (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7P5 29883607
    469211 6gbz:3 (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7Q1 29883607
    469212 6gbz:C (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60422 29883607
    469213 6gbz:D (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60438 29883607
    469214 6gbz:E (3.8) BS01 rna ? GO:0001070 ... P60723 29883607
    469215 6gbz:F (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P62399 29883607
    469216 6gbz:F (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P62399 29883607
    469217 6gbz:G (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG55 29883607
    469218 6gbz:H (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7R1 29883607
    469219 6gbz:J (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AA10 29883607
    469220 6gbz:K (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 29883607
    469221 6gbz:L (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P02413 29883607
    469222 6gbz:M (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADY7 29883607
    469223 6gbz:M (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0ADY7 29883607
    469224 6gbz:N (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG44 29883607
    469225 6gbz:O (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C018 29883607
    469226 6gbz:O (3.8) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0C018 29883607
    469227 6gbz:P (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 29883607
    469228 6gbz:Q (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7L3 29883607
    469229 6gbz:R (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AG48 29883607
    469230 6gbz:S (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61175 29883607
    469231 6gbz:T (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADZ0 29883607
    469232 6gbz:U (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60624 29883607
    469233 6gbz:V (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P68919 29883607
    469234 6gbz:V (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P68919 29883607
    469235 6gbz:W (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 29883607
    469236 6gbz:W (3.8) BS02 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 29883607
    469237 6gbz:X (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M2 29883607
    469238 6gbz:Y (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M6 29883607
    469239 6gbz:Z (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 29883607
    469240 6gc0:0 (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N4 29883607
    469241 6gc0:1 (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N9 29883607
    469242 6gc0:2 (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7P5 29883607
    469243 6gc0:3 (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7Q1 29883607
    469244 6gc0:C (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60422 29883607
    469245 6gc0:D (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60438 29883607
    469246 6gc0:E (3.8) BS01 rna ? GO:0001070 ... P60723 29883607
    469247 6gc0:F (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P62399 29883607
    469248 6gc0:F (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P62399 29883607
    469249 6gc0:G (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG55 29883607
    469250 6gc0:H (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7R1 29883607
    469251 6gc0:J (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AA10 29883607
    469252 6gc0:K (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 29883607
    469253 6gc0:L (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P02413 29883607
    469254 6gc0:N (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG44 29883607
    469255 6gc0:O (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C018 29883607
    469256 6gc0:O (3.8) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0C018 29883607
    469257 6gc0:P (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 29883607
    469258 6gc0:Q (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7L3 29883607
    469259 6gc0:R (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AG48 29883607
    469260 6gc0:S (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61175 29883607
    469261 6gc0:T (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADZ0 29883607
    469262 6gc0:U (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60624 29883607
    469263 6gc0:V (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P68919 29883607
    469264 6gc0:W (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 29883607
    469265 6gc0:W (3.8) BS02 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 29883607
    469266 6gc0:X (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M2 29883607
    469267 6gc0:Y (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M6 29883607
    469268 6gc0:Z (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 29883607
    469269 6gc3:A (-1.00) BS01 peptide ? N/A P53617 N/A
    469270 6gc4:0 (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N4 29883607
    469271 6gc4:2 (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7P5 29883607
    469272 6gc4:C (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60422 29883607
    469273 6gc4:D (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60438 29883607
    469274 6gc4:E (4.3) BS01 rna ? GO:0001070 ... P60723 29883607
    469275 6gc4:F (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P62399 29883607
    469276 6gc4:F (4.3) BS02 rna ? GO:0000027 ... P62399 29883607
    469277 6gc4:G (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG55 29883607
    469278 6gc4:H (4.3) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7R1 29883607
    469279 6gc4:J (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AA10 29883607
    469280 6gc4:K (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 29883607
    469281 6gc4:L (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P02413 29883607
    469282 6gc4:N (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG44 29883607
    469283 6gc4:O (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C018 29883607
    469284 6gc4:O (4.3) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0C018 29883607
    469285 6gc4:P (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 29883607
    469286 6gc4:Q (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7L3 29883607
    469287 6gc4:R (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AG48 29883607
    469288 6gc4:S (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61175 29883607
    469289 6gc4:T (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADZ0 29883607
    469290 6gc4:U (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60624 29883607
    469291 6gc4:V (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P68919 29883607
    469292 6gc4:W (4.3) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 29883607
    469293 6gc4:W (4.3) BS02 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 29883607
    469294 6gc4:X (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M2 29883607
    469295 6gc4:Y (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M6 29883607
    469296 6gc4:Z (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 29883607
    469297 6gc4:Z (4.3) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 29883607
    469298 6gc5:A (1.9) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q15717 30718402
    469299 6gc5:B (1.9) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q15717 30718402
    469300 6gc5:C (1.9) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q15717 30718402
    469301 6gc5:D (1.9) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q15717 30718402
    469302 6gc6:0 (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N4 29883607
    469303 6gc6:2 (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7P5 29883607
    469304 6gc6:C (4.3) BS01 rna ? GO:0003723 ... P60422 29883607
    469305 6gc6:D (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60438 29883607
    469306 6gc6:E (4.3) BS01 rna ? GO:0001070 ... P60723 29883607
    469307 6gc6:G (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG55 29883607
    469308 6gc6:J (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AA10 29883607
    469309 6gc6:K (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 29883607
    469310 6gc6:L (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P02413 29883607
    469311 6gc6:N (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG44 29883607
    469312 6gc6:P (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 29883607
    469313 6gc6:Q (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7L3 29883607
    469314 6gc6:R (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AG48 29883607
    469315 6gc6:S (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61175 29883607
    469316 6gc6:T (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADZ0 29883607
    469317 6gc6:U (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60624 29883607
    469318 6gc6:Y (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M6 29883607
    469319 6gc6:Z (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 29883607
    469320 6gc7:0 (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N4 29883607
    469321 6gc7:2 (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7P5 29883607
    469322 6gc7:D (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60438 29883607
    469323 6gc7:E (4.3) BS01 rna ? GO:0001070 ... P60723 29883607
    469324 6gc7:J (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AA10 29883607
    469325 6gc7:K (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 29883607
    469326 6gc7:L (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P02413 29883607
    469327 6gc7:N (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG44 29883607
    469328 6gc7:P (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 29883607
    469329 6gc7:Q (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7L3 29883607
    469330 6gc7:R (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AG48 29883607
    469331 6gc7:S (4.3) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61175 29883607
    469332 6gc7:T (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADZ0 29883607
    469333 6gc7:U (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60624 29883607
    469334 6gc7:Y (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M6 29883607
    469335 6gc7:Z (4.3) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 29883607
    469336 6gc8:0 (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N4 29883607
    469337 6gc8:1 (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N9 29883607
    469338 6gc8:2 (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7P5 29883607
    469339 6gc8:3 (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7Q1 29883607
    469340 6gc8:C (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60422 29883607
    469341 6gc8:D (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60438 29883607
    469342 6gc8:E (3.8) BS01 rna ? GO:0001070 ... P60723 29883607
    469343 6gc8:F (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P62399 29883607
    469344 6gc8:F (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P62399 29883607
    469345 6gc8:G (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG55 29883607
    469346 6gc8:H (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7R1 29883607
    469347 6gc8:J (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AA10 29883607
    469348 6gc8:K (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 29883607
    469349 6gc8:L (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P02413 29883607
    469350 6gc8:M (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADY7 29883607
    469351 6gc8:M (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0ADY7 29883607
    469352 6gc8:N (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG44 29883607
    469353 6gc8:O (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C018 29883607
    469354 6gc8:O (3.8) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0C018 29883607
    469355 6gc8:P (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 29883607
    469356 6gc8:Q (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7L3 29883607
    469357 6gc8:R (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AG48 29883607
    469358 6gc8:S (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61175 29883607
    469359 6gc8:T (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADZ0 29883607
    469360 6gc8:U (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60624 29883607
    469361 6gc8:V (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P68919 29883607
    469362 6gc8:V (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P68919 29883607
    469363 6gc8:W (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 29883607
    469364 6gc8:W (3.8) BS02 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 29883607
    469365 6gc8:X (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M2 29883607
    469366 6gc8:Y (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M6 29883607
    469367 6gc8:Z (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 29883607
    469368 6gc8:Z (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 29883607
    469369 6gcb:A (1.795) BS01 GSH 2.5.1.18 GO:0004364 ... A0A3F2YM27 30112765
    469370 6gcb:B (1.795) BS01 GSH 2.5.1.18 GO:0004364 ... A0A3F2YM27 30112765
    469371 6gcc:A (1.9) BS01 TUJ ? GO:0004364 ... A0A3F2YM29 30112765
    469372 6gcc:A (1.9) BS02 TUG ? GO:0004364 ... A0A3F2YM29 30112765
    469373 6gcc:A (1.9) BS03 5LT ? GO:0004364 ... A0A3F2YM29 30112765
    469374 6gcc:B (1.9) BS01 TUJ ? GO:0004364 ... A0A3F2YM29 30112765
    469375 6gcc:B (1.9) BS02 TUG ? GO:0004364 ... A0A3F2YM29 30112765
    469376 6gcc:B (1.9) BS03 5LT ? GO:0004364 ... A0A3F2YM29 30112765
    469377 6gcd:A (1.8) BS01 dna 3.1.21.- N/A P15005 30194838
    469378 6gcd:A (1.8) BS02 dna 3.1.21.- N/A P15005 30194838
    469379 6gcd:B (1.8) BS01 dna 3.1.21.- N/A P15005 30194838
    469380 6gcd:B (1.8) BS02 dna 3.1.21.- N/A P15005 30194838
    469381 6gce:A (1.6) BS01 dna 3.1.21.- N/A P15005 30194838
    469382 6gce:A (1.6) BS02 dna 3.1.21.- N/A P15005 30194838
    469383 6gce:B (1.6) BS01 dna 3.1.21.- N/A P15005 30194838
    469384 6gce:B (1.6) BS02 dna 3.1.21.- N/A P15005 30194838
    469385 6gcf:A (1.55) BS01 dna 3.1.21.- N/A P15005 30194838
    469386 6gcf:A (1.55) BS02 dna 3.1.21.- N/A P15005 30194838
    469387 6gcf:B (1.55) BS01 dna 3.1.21.- N/A P15005 30194838
    469388 6gcf:B (1.55) BS02 dna 3.1.21.- N/A P15005 30194838
    469389 6gcg:A (1.80015) BS01 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P25006 30821704
    469390 6gcg:A (1.80015) BS02 CU 1.7.2.1 GO:0005507 ... P25006 30821704
    469391 6gch:F (2.1) BS01 peptide 3.4.21.1 GO:0004252 ... P00766 2271520
    469392 6gch:G (2.1) BS01 peptide 3.4.21.1 GO:0004252 ... P00766 2271520
    469393 6gch:G (2.1) BS02 APF 3.4.21.1 GO:0004252 ... P00766 2271520
    469394 6gci:A (3.3) BS01 BKC ? GO:0005471 ... G2QNH0 30611538
    469395 6gck:A (2.14) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469396 6gck:A (2.14) BS02 EUB ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=0.67uM
    469397 6gck:B (2.14) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469398 6gck:B (2.14) BS02 EUB ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=0.67uM
    469399 6gck:C (2.14) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469400 6gck:C (2.14) BS02 EUB ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=0.67uM

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).