SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2338 2339 2340 2341 2342 2343 2344 2345 2346 2347 2348 2349 2350 2351 2352 2353 2354 2355 2356 2357 2358 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    469401 6gck:D (2.14) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469402 6gck:D (2.14) BS02 EUB ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=0.67uM
    469403 6gcl:A (1.95) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469404 6gcl:A (1.95) BS02 EUE ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=34.2uM
    469405 6gcl:B (1.95) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469406 6gcl:B (1.95) BS02 EUE ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=34.2uM
    469407 6gcl:C (1.95) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469408 6gcl:C (1.95) BS02 EUE ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=34.2uM
    469409 6gcl:D (1.95) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469410 6gcl:D (1.95) BS02 EUE ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=34.2uM
    469411 6gcn:A (2.949) BS01 ADP 3.4.24.- GO:0004176 ... O67077 30118817
    469412 6gcn:A (2.949) BS02 ZN 3.4.24.- GO:0004176 ... O67077 30118817
    469413 6gcn:B (2.949) BS01 ADP 3.4.24.- GO:0004176 ... O67077 30118817
    469414 6gcn:B (2.949) BS02 ZN 3.4.24.- GO:0004176 ... O67077 30118817
    469415 6gcn:B (2.949) BS03 ALA 3.4.24.- GO:0004176 ... O67077 30118817
    469416 6gcn:C (2.949) BS01 ADP 3.4.24.- GO:0004176 ... O67077 30118817
    469417 6gcn:C (2.949) BS02 ZN 3.4.24.- GO:0004176 ... O67077 30118817
    469418 6gcn:D (2.949) BS01 ADP 3.4.24.- GO:0004176 ... O67077 30118817
    469419 6gcn:D (2.949) BS02 ZN 3.4.24.- GO:0004176 ... O67077 30118817
    469420 6gco:A (3.323) BS01 ADP 3.4.24.- GO:0004176 ... O67077 30118817
    469421 6gco:A (3.323) BS02 ZN 3.4.24.- GO:0004176 ... O67077 30118817
    469422 6gco:B (3.323) BS01 ADP 3.4.24.- GO:0004176 ... O67077 30118817
    469423 6gco:B (3.323) BS02 ZN 3.4.24.- GO:0004176 ... O67077 30118817
    469424 6gcp:A (1.52) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469425 6gcp:A (1.52) BS02 EUK ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=0.9uM
    469426 6gcp:B (1.52) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469427 6gcp:B (1.52) BS02 EUK ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=0.9uM
    469428 6gcp:C (1.52) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469429 6gcp:C (1.52) BS02 EUK ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=0.9uM
    469430 6gcp:D (1.52) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469431 6gcp:D (1.52) BS02 EUK ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=0.9uM
    469432 6gcq:A (1.58) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469433 6gcq:A (1.58) BS02 EUH ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=0.5uM
    469434 6gcq:B (1.58) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469435 6gcq:B (1.58) BS02 EUH ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=0.5uM
    469436 6gcq:C (1.58) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469437 6gcq:C (1.58) BS02 EUH ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=0.5uM
    469438 6gcq:D (1.58) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469439 6gcq:D (1.58) BS02 EUH ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=0.5uM
    469440 6gcr:A (2.3) BS01 EUW 2.7.10.2 GO:0004672 ... Q00944 29897729
    469441 6gcs:A (4.32) BS01 SF4 1.6.99.3 GO:0008137 ... Q9UUU3 30277212
    469442 6gcs:A (4.32) BS02 SF4 1.6.99.3 GO:0008137 ... Q9UUU3 30277212
    469443 6gcs:A (4.32) BS03 FES 1.6.99.3 GO:0008137 ... Q9UUU3 30277212
    469444 6gcs:B (4.32) BS01 SF4 7.1.1.2 GO:0005739 ... Q9UUU2 30277212
    469445 6gcs:B (4.32) BS02 FMN 7.1.1.2 GO:0005739 ... Q9UUU2 30277212
    469446 6gcs:E (4.32) BS01 NDP ? GO:0005739 ... Q6C7X4 30277212
    469447 6gcs:H (4.32) BS01 FES 1.6.99.3 GO:0016491 ... Q9UUT9 30277212
    469448 6gcs:I (4.32) BS01 SF4 1.6.99.3 GO:0003954 ... Q9UUT8 30277212
    469449 6gcs:I (4.32) BS02 SF4 1.6.99.3 GO:0003954 ... Q9UUT8 30277212
    469450 6gcs:K (4.32) BS01 SF4 1.6.99.3 GO:0005739 ... Q9UUT7 30277212
    469451 6gcs:M (4.32) BS01 ZN ? GO:0005739 ... Q6C8J9 30277212
    469452 6gcs:O (4.32) BS01 ZMP ? GO:0000035 ... Q6C926 30277212
    469453 6gcs:P (4.32) BS01 ZMP ? GO:0005739 ... Q6CI60 30277212
    469454 6gct:A (3.85) BS01 GLN ? GO:0001618 ... Q15758 29872227
    469455 6gct:B (3.85) BS01 GLN ? GO:0001618 ... Q15758 29872227
    469456 6gct:C (3.85) BS01 GLN ? GO:0001618 ... Q15758 29872227
    469457 6gcv:A (1.3) BS01 NO3 ? N/A Q9I055 30782655
    469458 6gcv:B (1.3) BS01 NO3 ? N/A Q9I055 30782655
    469459 6gcv:C (1.3) BS01 NO3 ? N/A Q9I055 30782655
    469460 6gcw:A (2.0) BS01 EUQ 2.7.10.2 GO:0004672 ... Q00944 29897729 MOAD: ic50=4.7nM
    469461 6gcw:B (2.0) BS01 EUQ 2.7.10.2 GO:0004672 ... Q00944 29897729 MOAD: ic50=4.7nM
    469462 6gcx:A (1.553) BS01 EUW 2.7.10.2 GO:0004672 ... Q00944 29897729 MOAD: ic50=0.6nM
    469463 6gcy:A (1.3) BS01 ZN 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 30639924
    469464 6gcy:A (1.3) BS02 3QR 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 30639924 MOAD: Ki=50nM
    469465 6gd0:A (1.74) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469466 6gd0:A (1.74) BS02 EV8 ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=21.8uM
    469467 6gd0:B (1.74) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469468 6gd0:B (1.74) BS02 EV8 ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=21.8uM
    469469 6gd0:C (1.74) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469470 6gd0:D (1.74) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469471 6gd0:D (1.74) BS02 EV8 ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=21.8uM
    469472 6gd2:A (1.9) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q15717 30418581
    469473 6gd2:B (1.9) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q15717 30418581
    469474 6gd3:B (1.35) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q15717 30418581
    469475 6gd3:C (1.35) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q15717 30418581
    469476 6gd4:A (1.42) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469477 6gd4:A (1.42) BS02 6KT ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469478 6gd4:B (1.42) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469479 6gd4:B (1.42) BS02 6KT ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469480 6gd4:C (1.42) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469481 6gd4:C (1.42) BS02 6KT ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469482 6gd4:D (1.42) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469483 6gd4:D (1.42) BS02 6KT ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469484 6gd5:A (-1.00) BS01 peptide ? GO:0001530 ... P0ADV1 30443594
    469485 6gd6:A (1.2) BS01 HEC ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469486 6gd6:A (1.2) BS02 EVB ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469487 6gd7:A (1.55) BS01 HEC ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469488 6gd7:A (1.55) BS02 EVB ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469489 6gd8:A (2.5) BS01 HEC ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469490 6gd8:A (2.5) BS02 EVB ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469491 6gd8:A (2.5) BS03 EVB ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469492 6gd8:B (2.5) BS01 EVB ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469493 6gd8:B (2.5) BS02 HEC ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469494 6gd8:B (2.5) BS03 EVB ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469495 6gd8:C (2.5) BS01 EVB ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469496 6gd8:C (2.5) BS02 HEC ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469497 6gd8:C (2.5) BS03 EVB ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469498 6gd8:D (2.5) BS01 EVB ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469499 6gd8:D (2.5) BS02 HEC ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469500 6gd9:A (2.65) BS01 HEC ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469501 6gd9:A (2.65) BS02 EVB ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469502 6gd9:A (2.65) BS03 EVB ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469503 6gd9:A (2.65) BS04 EVB ? GO:0005515 ... P00044 30109907
    469504 6gda:A (2.8) BS01 HEC ? GO:0005515 ... P00044 31490058
    469505 6gda:A (2.8) BS02 EVB ? GO:0005515 ... P00044 31490058
    469506 6gda:A (2.8) BS03 EVB ? GO:0005515 ... P00044 31490058
    469507 6gda:A (2.8) BS04 EVB ? GO:0005515 ... P00044 31490058
    469508 6gdc:A (1.079) BS01 ZN 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 32027480
    469509 6gdc:A (1.079) BS02 BGC 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 32027480
    469510 6gdc:A (1.079) BS03 FB2 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 32027480 BindingDB: Ki=1103nM, Kd=1149700nM
    469511 6gdc:A (1.079) BS04 FB2 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 32027480 BindingDB: Ki=1103nM, Kd=1149700nM
    469512 6gdc:A (1.079) BS05 GLC 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 32027480
    469513 6gdd:A (2.6) BS01 ZN 3.5.2.3 GO:0004038 ... O66990 30657257
    469514 6gde:A (2.45) BS01 ZN 3.5.2.3 GO:0004038 ... O66990 30657257
    469515 6gdf:A (2.5) BS01 ZN 3.5.2.3 GO:0004038 ... O66990 30657257
    469516 6gdg:A (4.11) BS01 NEC ? GO:0001609 ... P0AA25
    P29274
    29726815
    469517 6gdk:A (-1.00) BS01 CA ? GO:0000086 ... P0DP23 30348784
    469518 6gdk:A (-1.00) BS02 CA ? GO:0000086 ... P0DP23 30348784
    469519 6gdk:A (-1.00) BS03 CA ? GO:0000086 ... P0DP23 30348784
    469520 6gdk:A (-1.00) BS04 CA ? GO:0000086 ... P0DP23 30348784
    469521 6gdm:A (1.91) BS01 F3Z 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310 BindingDB: IC50=1.000000nM, Kd=0.100000nM
    469522 6gdo:A (1.78) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469523 6gdo:A (1.78) BS02 EVZ ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=0.93uM
    469524 6gdo:B (1.78) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469525 6gdo:B (1.78) BS02 EVZ ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=0.93uM
    469526 6gdo:C (1.78) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469527 6gdo:D (1.78) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469528 6gdo:D (1.78) BS02 EVZ ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=0.93uM
    469529 6gdp:A (1.52) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469530 6gdp:A (1.52) BS02 EVW ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=18.5uM
    469531 6gdp:B (1.52) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469532 6gdp:B (1.52) BS02 EVW ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=18.5uM
    469533 6gdp:C (1.52) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469534 6gdp:D (1.52) BS01 NAP ? GO:0000166 ... O76290 30908048
    469535 6gdp:D (1.52) BS02 EVW ? GO:0000166 ... O76290 30908048 MOAD: ic50=18.5uM
    469536 6gdq:A (1.86) BS01 EVK 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310 BindingDB: IC50=<0.300000nM, Kd=0.316228nM
    469537 6gdr:A (2.33) BS01 dna N/A GO:0003910 ... N/A 30007325
    469538 6gdr:A (2.33) BS02 dna N/A GO:0003910 ... N/A 30007325
    469539 6gdr:A (2.33) BS03 dna N/A GO:0003910 ... N/A 30007325
    469540 6gdr:A (2.33) BS04 AMP N/A GO:0003910 ... N/A 30007325
    469541 6gdy:A (2.04) BS01 FE 1.14.11.- N/A Q6NYC1 31147442
    469542 6gdy:A (2.04) BS02 AKG 1.14.11.- N/A Q6NYC1 31147442 MOAD: Kd=3.5uM
    469543 6gdy:B (2.04) BS01 FE 1.14.11.- N/A Q6NYC1 31147442
    469544 6gdy:B (2.04) BS02 AKG 1.14.11.- N/A Q6NYC1 31147442 MOAD: Kd=3.5uM
    469545 6gdz:A (-1.00) BS01 EVT ? GO:0005179 ... P26349 29879354
    469546 6ge0:A (1.82) BS01 EVQ 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 29775310 MOAD: ic50=2.1nM
    BindingDB: IC50=2.10nM
    469547 6ge2:A (-1.00) BS01 EVT ? GO:0005179 ... P26349 29879354
    469548 6ge7:A (2.3) BS01 EW8 ? GO:0005515 ... P02754 29879410 MOAD: Kd=0.867uM
    469549 6ge8:A (1.869) BS01 EWE N/A GO:0004015 ... N/A N/A
    469550 6ge8:A (1.869) BS02 EWE N/A GO:0004015 ... N/A N/A
    469551 6ge8:B (1.869) BS01 EWE N/A GO:0004015 ... N/A N/A
    469552 6ge8:B (1.869) BS02 EWE N/A GO:0004015 ... N/A N/A
    469553 6ge8:B (1.869) BS03 MG N/A GO:0004015 ... N/A N/A
    469554 6ge9:A (2.26) BS01 MG 2.3.1.157
    2.7.7.23
    GO:0000287 ... P9WMN3 29684272
    469555 6ge9:A (2.26) BS02 G1P 2.3.1.157
    2.7.7.23
    GO:0000287 ... P9WMN3 29684272
    469556 6ge9:A (2.26) BS03 ACO 2.3.1.157
    2.7.7.23
    GO:0000287 ... P9WMN3 29684272 MOAD: Kd=250uM
    469557 6ged:A (1.794) BS01 dna ? N/A Q04112 29723434
    469558 6geh:A (1.15) BS01 MG ? GO:0000166 ... Q080S8 30420426
    469559 6geh:A (1.15) BS02 MG ? GO:0000166 ... Q080S8 30420426
    469560 6geh:A (1.15) BS03 MG ? GO:0000166 ... Q080S8 30420426
    469561 6geh:A (1.15) BS04 FAD ? GO:0000166 ... Q080S8 30420426
    469562 6gej:A (3.6) BS01 dna ? GO:0000500 ... P61830 30309918
    469563 6gej:A (3.6) BS02 dna ? GO:0000500 ... P61830 30309918
    469564 6gej:B (3.6) BS01 dna ? GO:0000500 ... P61830 30309918
    469565 6gej:B (3.6) BS02 dna ? GO:0000500 ... P61830 30309918
    469566 6gej:C (3.6) BS01 dna ? GO:0000500 ... P02309 30309918
    469567 6gej:D (3.6) BS01 dna ? GO:0000500 ... P02309 30309918
    469568 6gej:D (3.6) BS02 dna ? GO:0000500 ... P02309 30309918
    469569 6gej:E (3.6) BS01 dna ? GO:0000122 ... P04911 30309918
    469570 6gej:E (3.6) BS02 dna ? GO:0000122 ... P04911 30309918
    469571 6gej:F (3.6) BS01 dna ? GO:0000122 ... P04911 30309918
    469572 6gej:F (3.6) BS02 dna ? GO:0000122 ... P04911 30309918
    469573 6gej:G (3.6) BS01 dna ? GO:0000122 ... P02293 30309918
    469574 6gej:G (3.6) BS02 dna ? GO:0000122 ... P02293 30309918
    469575 6gej:H (3.6) BS01 dna ? GO:0000122 ... P02293 30309918
    469576 6gej:M (3.6) BS01 dna 3.6.4.12 GO:0000725 ... Q05471 30309918
    469577 6gej:M (3.6) BS02 dna 3.6.4.12 GO:0000725 ... Q05471 30309918
    469578 6gej:M (3.6) BS03 ADP 3.6.4.12 GO:0000725 ... Q05471 30309918
    469579 6gej:M (3.6) BS04 BEF 3.6.4.12 GO:0000725 ... Q05471 30309918
    469580 6gej:R (3.6) BS01 ADP ? GO:0000785 ... Q12509 30309918
    469581 6gej:R (3.6) BS02 BEF ? GO:0000785 ... Q12509 30309918
    469582 6gej:S (3.6) BS01 ZN ? GO:0000785 ... Q03433 30309918
    469583 6gej:S (3.6) BS02 ZN ? GO:0000785 ... Q03433 30309918
    469584 6gej:T (3.6) BS01 ADP 3.6.4.12 GO:0000492 ... Q03940 30309918
    469585 6gej:U (3.6) BS01 MG 3.6.4.12 GO:0000492 ... Q12464 30309918
    469586 6gej:U (3.6) BS02 ADP 3.6.4.12 GO:0000492 ... Q12464 30309918
    469587 6gej:V (3.6) BS01 ADP 3.6.4.12 GO:0000492 ... Q03940 30309918
    469588 6gej:W (3.6) BS01 ADP 3.6.4.12 GO:0000492 ... Q12464 30309918
    469589 6gej:X (3.6) BS01 ADP 3.6.4.12 GO:0000492 ... Q03940 30309918
    469590 6gej:Y (3.6) BS01 ADP 3.6.4.12 GO:0000492 ... Q12464 30309918
    469591 6gej:Y (3.6) BS02 MG 3.6.4.12 GO:0000492 ... Q12464 30309918
    469592 6gel:A (2.51) BS01 CA ? GO:0005509 ... P42212
    W5IDB2
    31457088
    469593 6gel:A (2.51) BS02 CA ? GO:0005509 ... P42212
    W5IDB2
    31457088
    469594 6gel:B (2.51) BS01 CA ? GO:0005509 ... P42212
    W5IDB2
    31457088
    469595 6gel:B (2.51) BS02 CA ? GO:0005509 ... P42212
    W5IDB2
    31457088
    469596 6gem:A (3.462) BS01 FE ? GO:0046872 ... A0A075X7F9 N/A
    469597 6gem:A (3.462) BS02 AKG ? GO:0046872 ... A0A075X7F9 N/A
    469598 6gem:B (3.462) BS01 FE ? GO:0046872 ... A0A075X7F9 N/A
    469599 6gem:B (3.462) BS02 AKG ? GO:0046872 ... A0A075X7F9 N/A
    469600 6gem:C (3.462) BS01 FE ? GO:0046872 ... A0A075X7F9 N/A

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).