SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2340 2341 2342 2343 2344 2345 2346 2347 2348 2349 2350 2351 2352 2353 2354 2355 2356 2357 2358 2359 2360 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    469801 6ggb:B (1.32) BS01 ZN ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469802 6ggb:B (1.32) BS02 EXQ ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469803 6ggc:A (1.24) BS01 ZN ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469804 6ggc:A (1.24) BS02 EXN ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469805 6ggc:B (1.24) BS01 ZN ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469806 6ggc:B (1.24) BS02 EXN ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469807 6ggd:A (1.40001) BS01 ZN ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469808 6ggd:A (1.40001) BS02 EYB ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469809 6ggd:B (1.40001) BS01 ZN ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469810 6ggd:B (1.40001) BS02 EYB ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469811 6gge:A (1.25001) BS01 ZN ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469812 6gge:A (1.25001) BS02 EYE ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469813 6gge:B (1.25001) BS01 ZN ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469814 6gge:B (1.25001) BS02 EYE ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469815 6ggf:A (1.32) BS01 ZN ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469816 6ggf:A (1.32) BS02 EXQ ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469817 6ggf:B (1.32) BS01 ZN ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469818 6ggf:B (1.32) BS02 EXQ ? GO:0000976 ... P04637 31633398
    469819 6ggg:A (1.71) BS01 peptide ? N/A P08235 30596500
    469820 6ggg:A (1.71) BS02 EYN ? N/A P08235 30596500 MOAD: Ki=0.63nM
    BindingDB: IC50=20nM, Ki=0.630957nM
    469821 6ggh:A (1.7) BS01 EYQ 2.7.10.2 GO:0004672 ... P23458 N/A BindingDB: IC50=180nM
    469822 6ggh:B (1.7) BS01 EYQ 2.7.10.2 GO:0004672 ... P23458 N/A BindingDB: IC50=180nM
    469823 6ggi:A (1.803) BS01 MG 4.2.3.146 GO:0016829 ... C9K1X5 30266969
    469824 6ggi:A (1.803) BS02 MG 4.2.3.146 GO:0016829 ... C9K1X5 30266969
    469825 6ggi:A (1.803) BS03 MG 4.2.3.146 GO:0016829 ... C9K1X5 30266969
    469826 6ggi:A (1.803) BS04 EXW 4.2.3.146 GO:0016829 ... C9K1X5 30266969
    469827 6ggi:B (1.803) BS01 MG 4.2.3.146 GO:0016829 ... C9K1X5 30266969
    469828 6ggi:B (1.803) BS02 EXW 4.2.3.146 GO:0016829 ... C9K1X5 30266969
    469829 6ggj:A (2.1) BS01 AHD 4.2.3.146 GO:0016829 ... C9K1X5 30266969
    469830 6ggj:A (2.1) BS02 MG 4.2.3.146 GO:0016829 ... C9K1X5 30266969
    469831 6ggj:B (2.1) BS01 AHD 4.2.3.146 GO:0016829 ... C9K1X5 30266969
    469832 6ggj:B (2.1) BS02 MG 4.2.3.146 GO:0016829 ... C9K1X5 30266969
    469833 6ggk:A (2.15) BS01 MG 4.2.3.146 GO:0016829 ... C9K1X5 30266969
    469834 6ggk:B (2.15) BS01 MG 4.2.3.146 GO:0016829 ... C9K1X5 30266969
    469835 6ggl:A (1.9) BS01 MG 4.2.3.146 GO:0016829 ... C9K1X5 30266969
    469836 6ggl:B (1.9) BS01 MG 4.2.3.146 GO:0016829 ... C9K1X5 30266969
    469837 6ggm:A (2.734) BS01 peptide ? N/A P13747 30087334
    469838 6ggm:A (2.734) BS02 ZN ? N/A P13747 30087334
    469839 6ggm:A (2.734) BS03 ZN ? N/A P13747 30087334
    469840 6ggm:A (2.734) BS04 ZN ? N/A P13747 30087334
    469841 6ggm:C (2.734) BS01 peptide ? N/A P13747 30087334
    469842 6ggm:C (2.734) BS02 ZN ? N/A P13747 30087334
    469843 6ggn:A (2.0) BS01 EYH 2.3.2.27 GO:0005634 ... Q00987 30217415 MOAD: ic50=0.08nM
    BindingDB: IC50=0.17nM
    469844 6ggo:A (2.6) BS01 ZN ? GO:0046872 ... A0A0F6AZI6 30049795
    469845 6ggo:B (2.6) BS01 ZN ? GO:0046872 ... A0A0F6AZI6 30049795
    469846 6ggu:A (2.6) BS01 FE9 1.12.98.2 GO:0006730 ... P32440 N/A
    469847 6ggv:A (2.69) BS01 ARG ? GO:0015276 ... Q9WZ62 29860047
    469848 6ggv:B (2.69) BS01 ARG ? GO:0015276 ... Q9WZ62 29860047
    469849 6gh1:A (2.1) BS01 peptide ? N/A P13747 30087334
    469850 6gh1:C (2.1) BS01 peptide ? N/A P13747 30087334
    469851 6gh1:C (2.1) BS02 peptide ? N/A P13747 30087334
    469852 6gh1:E (2.1) BS01 peptide ? N/A P13747 30087334
    469853 6gh1:E (2.1) BS02 peptide ? N/A P13747 30087334
    469854 6gh1:G (2.1) BS01 peptide ? N/A P13747 30087334
    469855 6gh1:G (2.1) BS02 ZN ? N/A P13747 30087334
    469856 6gh2:A (2.5) BS01 G1P 2.4.1.31 GO:0003824 ... D7UT17 29856496
    469857 6gh2:B (2.5) BS01 G1P 2.4.1.31 GO:0003824 ... D7UT17 29856496
    469858 6gh3:A (1.82) BS01 M1P 2.4.1.31 GO:0003824 ... D7UT17 29856496
    469859 6gh3:B (1.82) BS01 M1P 2.4.1.31 GO:0003824 ... D7UT17 29856496
    469860 6gh4:A (2.16) BS01 peptide ? N/A P13747 30087334
    469861 6gh4:C (2.16) BS01 peptide ? N/A P13747 30087334
    469862 6gh4:C (2.16) BS02 ZN ? N/A P13747 30087334
    469863 6gh4:E (2.16) BS01 peptide ? N/A P13747 30087334
    469864 6gh4:E (2.16) BS02 ZN ? N/A P13747 30087334
    469865 6gh4:G (2.16) BS01 peptide ? N/A P13747 30087334
    469866 6gh5:C (3.4) BS01 dna 2.7.7.6 GO:0000345 ... P0A8V2 29932903
    469867 6gh5:C (3.4) BS02 dna 2.7.7.6 GO:0000345 ... P0A8V2 29932903
    469868 6gh5:D (3.4) BS01 dna 2.7.7.6 GO:0000287 ... P0A8T7 29932903
    469869 6gh5:D (3.4) BS02 dna 2.7.7.6 GO:0000287 ... P0A8T7 29932903
    469870 6gh5:M (3.4) BS01 dna 2.7.7.6 GO:0000428 ... P06223 29932903
    469871 6gh5:M (3.4) BS02 dna 2.7.7.6 GO:0000428 ... P06223 29932903
    469872 6gh6:M (4.1) BS01 dna ? GO:0000428 ... P06223 29932903
    469873 6gh6:M (4.1) BS02 dna ? GO:0000428 ... P06223 29932903
    469874 6gh7:A (1.08) BS01 EYW ? GO:0009374 ... P22629 30027571
    469875 6gh7:B (1.08) BS01 EYW ? GO:0009374 ... P22629 30027571
    469876 6gh7:C (1.08) BS01 EYW ? GO:0009374 ... P22629 30027571
    469877 6gh7:D (1.08) BS01 EYW ? GO:0009374 ... P22629 30027571
    469878 6gh8:A (2.44) BS01 CA ? N/A O60462 30150732
    469879 6gh8:C (2.44) BS01 CA ? N/A O60462 30150732
    469880 6gh9:A (2.09) BS01 ZN 3.4.19.12 GO:0004843 ... Q9Y4E8 30228188
    469881 6gh9:A (2.09) BS02 MIX 3.4.19.12 GO:0004843 ... Q9Y4E8 30228188
    469882 6gha:A (1.98) BS01 ZN 3.4.19.12 GO:0004843 ... Q9Y4E8 30228188
    469883 6ghb:D (3.104) BS01 MG ? GO:0005737 ... Q5L1S1 30982633
    469884 6ghc:A (2.85) BS01 ZN 3.1.21.- GO:0003676 ... P24200 30107581
    469885 6ghc:A (2.85) BS02 ZN 3.1.21.- GO:0003676 ... P24200 30107581
    469886 6ghc:B (2.85) BS01 ZN 3.1.21.- GO:0003676 ... P24200 30107581
    469887 6ghc:B (2.85) BS02 ZN 3.1.21.- GO:0003676 ... P24200 30107581
    469888 6ghh:A (1.9) BS01 TDA ? GO:0005515 ... P02754 29879410 MOAD: Kd=0.000000064M
    469889 6ghj:A (2.26) BS01 peptide ? GO:0005886 ... Q5M4H8 30194725
    469890 6ghj:A (2.26) BS02 78N ? GO:0005886 ... Q5M4H8 30194725
    469891 6ghj:A (2.26) BS03 78N ? GO:0005886 ... Q5M4H8 30194725
    469892 6ghj:A (2.26) BS04 78M ? GO:0005886 ... Q5M4H8 30194725
    469893 6ghj:A (2.26) BS05 78N ? GO:0005886 ... Q5M4H8 30194725
    469894 6ghj:A (2.26) BS06 78N ? GO:0005886 ... Q5M4H8 30194725
    469895 6ghj:A (2.26) BS07 78N ? GO:0005886 ... Q5M4H8 30194725
    469896 6ghj:A (2.26) BS08 78N ? GO:0005886 ... Q5M4H8 30194725
    469897 6ghj:A (2.26) BS09 78N ? GO:0005886 ... Q5M4H8 30194725
    469898 6ghj:A (2.26) BS10 78N ? GO:0005886 ... Q5M4H8 30194725
    469899 6ghk:A (2.28) BS01 EZ2 2.4.2.-
    2.4.2.30
    GO:0003950 ... P09874 N/A
    469900 6ghk:B (2.28) BS01 EZ2 2.4.2.-
    2.4.2.30
    GO:0003950 ... P09874 N/A
    469901 6ghl:A (2.378) BS01 peptide 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    469902 6ghl:A (2.378) BS02 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    469903 6ghl:B (2.378) BS01 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    469904 6ghl:C (2.378) BS01 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    469905 6ghl:D (2.378) BS01 peptide 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    469906 6ghl:D (2.378) BS02 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    469907 6ghl:F (2.378) BS01 NAD ? GO:0080153 ... Q8DHX3 31570616
    469908 6ghm:A (2.15) BS01 MN 3.1.3.16 GO:0000164 ... P62136 30770806
    469909 6ghm:A (2.15) BS02 MN 3.1.3.16 GO:0000164 ... P62136 30770806
    469910 6ghm:B (2.15) BS01 MN 3.1.3.16 GO:0000164 ... P62136 30770806
    469911 6ghm:B (2.15) BS02 MN 3.1.3.16 GO:0000164 ... P62136 30770806
    469912 6ghn:A (2.542) BS01 peptide ? N/A P13747 30087334
    469913 6ghn:C (2.542) BS01 peptide ? N/A P13747 30087334
    469914 6ghp:A (1.95) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P31947 30025189
    469915 6ghp:A (1.95) BS02 EZ5 ? GO:0000122 ... P31947 30025189
    469916 6ghr:A (2.249) BS01 peptide 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    469917 6ghr:A (2.249) BS02 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    469918 6ghr:B (2.249) BS01 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    469919 6ghr:C (2.249) BS01 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    469920 6ghr:D (2.249) BS01 peptide 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    469921 6ghr:D (2.249) BS02 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    469922 6ghr:F (2.249) BS01 NAD ? GO:0080153 ... Q8DHX3 31570616
    469923 6ghs:A (2.92) BS01 ZN ? GO:0016567 ... A0A3F2YM30 30202937
    469924 6ght:A (1.12) BS01 HP4 ? GO:0043190 ... O69061 31308436
    469925 6ghv:A (2.1) BS01 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469926 6ghv:A (2.1) BS02 CA ? N/A Q9NNX6 31469191
    469927 6ghv:A (2.1) BS03 CA ? N/A Q9NNX6 31469191
    469928 6ghv:A (2.1) BS04 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469929 6ghv:A (2.1) BS05 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469930 6ghv:B (2.1) BS01 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469931 6ghv:B (2.1) BS02 CA ? N/A Q9NNX6 31469191
    469932 6ghv:B (2.1) BS03 CA ? N/A Q9NNX6 31469191
    469933 6ghv:B (2.1) BS04 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469934 6ghv:B (2.1) BS05 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469935 6ghv:C (2.1) BS01 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469936 6ghv:C (2.1) BS02 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469937 6ghv:C (2.1) BS03 CA ? N/A Q9NNX6 31469191
    469938 6ghv:C (2.1) BS04 CA ? N/A Q9NNX6 31469191
    469939 6ghv:C (2.1) BS05 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469940 6ghv:D (2.1) BS01 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469941 6ghv:D (2.1) BS02 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469942 6ghv:D (2.1) BS03 CA ? N/A Q9NNX6 31469191
    469943 6ghv:D (2.1) BS04 CA ? N/A Q9NNX6 31469191
    469944 6ghv:E (2.1) BS01 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469945 6ghv:E (2.1) BS02 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469946 6ghv:E (2.1) BS03 CA ? N/A Q9NNX6 31469191
    469947 6ghv:E (2.1) BS04 CA ? N/A Q9NNX6 31469191
    469948 6ghv:E (2.1) BS05 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469949 6ghv:F (2.1) BS01 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469950 6ghv:F (2.1) BS02 EZ8 ? N/A Q9NNX6 31469191 MOAD: Kd=52uM
    469951 6ghv:F (2.1) BS03 CA ? N/A Q9NNX6 31469191
    469952 6ghv:F (2.1) BS04 CA ? N/A Q9NNX6 31469191
    469953 6ghw:C (2.3) BS01 CA 5.3.2.6 GO:0009056 ... Q01468 30804446
    469954 6ghx:A (1.156) BS01 CA 3.4.24.27 GO:0004222 ... P43133 30403288
    469955 6ghx:A (1.156) BS02 CA 3.4.24.27 GO:0004222 ... P43133 30403288
    469956 6ghx:A (1.156) BS03 CA 3.4.24.27 GO:0004222 ... P43133 30403288
    469957 6ghx:A (1.156) BS04 CA 3.4.24.27 GO:0004222 ... P43133 30403288
    469958 6ghx:A (1.156) BS05 ILE 3.4.24.27 GO:0004222 ... P43133 30403288
    469959 6ghx:A (1.156) BS06 ILE 3.4.24.27 GO:0004222 ... P43133 30403288
    469960 6gi1:A (1.66) BS01 DBS 3.1.1.108 GO:0016788 ... Q9I0F2 30086222
    469961 6gi1:B (1.66) BS01 EB4 3.1.1.108 GO:0016788 ... Q9I0F2 30086222
    469962 6gi2:A (1.49) BS01 8SW 3.1.1.108 GO:0016788 ... Q9I0F2 30086222
    469963 6gi2:B (1.49) BS01 8SW 3.1.1.108 GO:0016788 ... Q9I0F2 30086222
    469964 6gi5:A (3.11) BS01 8SW 3.1.1.108 GO:0016788 ... Q9I0F2 30086222
    469965 6gi5:B (3.11) BS01 8SW 3.1.1.108 GO:0016788 ... Q9I0F2 30086222
    469966 6gi6:A (1.98) BS01 EZB 2.7.11.30 GO:0004672 ... Q04771 30085668 MOAD: ic50=0.194uM
    BindingDB: IC50=194nM
    469967 6gi7:A (1.3) BS01 FMN ? GO:0000166 ... P71278 31119061
    469968 6gi8:A (1.42) BS01 FMN ? GO:0000166 ... P71278 31119061
    469969 6gi9:A (1.45) BS01 FMN ? GO:0000166 ... P71278 31119061
    469970 6gia:A (1.7) BS01 FMN ? GO:0000166 ... P71278 31119061
    469971 6gib:B (2.194) BS01 MG ? GO:0005737 ... A0A452CSY5 N/A
    469972 6gic:A (2.304) BS01 EZH ? GO:0005737 ... A0A452CSY5 N/A
    469973 6gic:B (2.304) BS01 MG ? GO:0005737 ... A0A452CSY5 N/A
    469974 6gic:B (2.304) BS02 EZE ? GO:0005737 ... A0A452CSY5 N/A
    469975 6gic:B (2.304) BS03 EZH ? GO:0005737 ... A0A452CSY5 N/A
    469976 6gid:A (1.9) BS01 ZN 3.4.24.11 GO:0001786 ... P08473 29906506
    469977 6gie:A (2.1) BS01 C8E ? N/A A0A081GU02 30198896
    469978 6gie:A (2.1) BS02 C8E ? N/A A0A081GU02 30198896
    469979 6gie:A (2.1) BS03 C8E ? N/A A0A081GU02 30198896
    469980 6gih:A (1.96) BS01 EZN 2.7.11.1 GO:0004672 ... P68400 29759799 BindingDB: IC50=44000nM
    469981 6gii:A (1.9) BS01 HEM ? GO:0004497 ... A0A0K6ITW2 29738765
    469982 6gin:A (2.2) BS01 IR2 2.7.11.30 GO:0004672 ... Q04771 30085668 MOAD: ic50=0.032uM
    BindingDB: IC50=32nM, Kd=330nM
    469983 6gin:B (2.2) BS01 IR2 2.7.11.30 GO:0004672 ... Q04771 30085668 MOAD: ic50=0.032uM
    BindingDB: IC50=32nM, Kd=330nM
    469984 6gio:A (1.87) BS01 PLP ? GO:0008483 ... Q06K28 29897155
    469985 6gio:B (1.87) BS01 PLP ? GO:0008483 ... Q06K28 29897155
    469986 6gio:C (1.87) BS01 PLP ? GO:0008483 ... Q06K28 29897155
    469987 6gio:C (1.87) BS02 PLP ? GO:0008483 ... Q06K28 29897155
    469988 6gio:D (1.87) BS01 PLP ? GO:0008483 ... Q06K28 29897155
    469989 6gip:A (2.17) BS01 EUN 2.7.11.30 GO:0004672 ... Q04771 30085668 MOAD: ic50=0.042uM
    BindingDB: Kd=640nM, IC50=42nM
    469990 6giq:C (3.23) BS01 HEM 7.1.1.8 GO:0005739 ... P00163 30598556
    469991 6giq:C (3.23) BS02 HEM 7.1.1.8 GO:0005739 ... P00163 30598556
    469992 6giq:C (3.23) BS03 CN5 7.1.1.8 GO:0005739 ... P00163 30598556
    469993 6giq:C (3.23) BS04 UQ6 7.1.1.8 GO:0005739 ... P00163 30598556
    469994 6giq:D (3.23) BS01 HEM 7.1.1.8 GO:0005739 ... P07143 30598556
    469995 6giq:E (3.23) BS01 FES 7.1.1.8 GO:0005739 ... P08067 30598556
    469996 6giq:N (3.23) BS01 CN5 7.1.1.8 GO:0005739 ... P00163 30598556
    469997 6giq:N (3.23) BS02 HEM 7.1.1.8 GO:0005739 ... P00163 30598556
    469998 6giq:N (3.23) BS03 HEM 7.1.1.8 GO:0005739 ... P00163 30598556
    469999 6giq:N (3.23) BS04 UQ6 7.1.1.8 GO:0005739 ... P00163 30598556
    470000 6giq:O (3.23) BS01 HEM 7.1.1.8 GO:0005739 ... P07143 30598556

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).