SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2341 2342 2343 2344 2345 2346 2347 2348 2349 2350 2351 2352 2353 2354 2355 2356 2357 2358 2359 2360 2361 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    470001 6giq:P (3.23) BS01 FES 7.1.1.8 GO:0005739 ... P08067 30598556
    470002 6giq:a (3.23) BS01 peptide 7.1.1.9 GO:0004129 ... P00401 30598556
    470003 6giq:a (3.23) BS02 CU 7.1.1.9 GO:0004129 ... P00401 30598556
    470004 6giq:a (3.23) BS03 HEA 7.1.1.9 GO:0004129 ... P00401 30598556
    470005 6giq:a (3.23) BS04 HEA 7.1.1.9 GO:0004129 ... P00401 30598556
    470006 6giq:b (3.23) BS01 CUA 7.1.1.9 GO:0004129 ... P00410 30598556
    470007 6giq:c (3.23) BS01 peptide 7.1.1.9 GO:0004129 ... P00420 30598556
    470008 6giq:c (3.23) BS02 peptide 7.1.1.9 GO:0004129 ... P00420 30598556
    470009 6gis:A (2.82) BS01 dna ? GO:0000122 ... P12004 28071730
    470010 6git:A (1.418) BS01 FE 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 35529950
    470011 6git:A (1.418) BS02 FE 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 35529950
    470012 6git:A (1.418) BS03 PO4 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 35529950
    470013 6git:A (1.418) BS04 PO4 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 35529950
    470014 6giu:A (1.39) BS01 MN 3.1.3.25
    3.1.3.94
    GO:0000287 ... P29218 30289407
    470015 6giu:A (1.39) BS02 MN 3.1.3.25
    3.1.3.94
    GO:0000287 ... P29218 30289407
    470016 6giu:A (1.39) BS03 L69 3.1.3.25
    3.1.3.94
    GO:0000287 ... P29218 30289407
    470017 6giu:B (1.39) BS01 MN 3.1.3.25
    3.1.3.94
    GO:0000287 ... P29218 30289407
    470018 6giu:B (1.39) BS02 MN 3.1.3.25
    3.1.3.94
    GO:0000287 ... P29218 30289407
    470019 6giu:B (1.39) BS03 L69 3.1.3.25
    3.1.3.94
    GO:0000287 ... P29218 30289407
    470020 6giv:A (1.75) BS01 GLU ? GO:0015276 ... P19491 31053408
    470021 6giw:A (2.8) BS01 CLA ? GO:0004866 ... O04797 30297830
    470022 6giw:A (2.8) BS02 CLA ? GO:0004866 ... O04797 30297830
    470023 6giw:A (2.8) BS03 CLA ? GO:0004866 ... O04797 30297830
    470024 6giw:B (2.8) BS01 CLA ? GO:0004866 ... O04797 30297830
    470025 6giw:C (2.8) BS01 CLA ? GO:0004866 ... O04797 30297830
    470026 6giw:C (2.8) BS02 CLA ? GO:0004866 ... O04797 30297830
    470027 6giw:D (2.8) BS01 CLA ? GO:0004866 ... O04797 30297830
    470028 6giw:D (2.8) BS02 CLA ? GO:0004866 ... O04797 30297830
    470029 6gix:A (2.8) BS01 CHL ? GO:0004866 ... O04797 30297830
    470030 6gix:A (2.8) BS02 CHL ? GO:0004866 ... O04797 30297830
    470031 6gix:B (2.8) BS01 CHL ? GO:0004866 ... O04797 30297830
    470032 6gix:B (2.8) BS02 CHL ? GO:0004866 ... O04797 30297830
    470033 6gix:C (2.8) BS01 CHL ? GO:0004866 ... O04797 30297830
    470034 6gix:C (2.8) BS02 CHL ? GO:0004866 ... O04797 30297830
    470035 6gix:D (2.8) BS01 CHL ? GO:0004866 ... O04797 30297830
    470036 6giz:A (1.54) BS01 FE 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 35529950
    470037 6giz:A (1.54) BS02 FE 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 35529950
    470038 6giz:A (1.54) BS03 PO4 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 35529950
    470039 6giz:A (1.54) BS04 PO4 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 35529950
    470040 6gj0:A (1.73) BS01 MN 3.1.3.25
    3.1.3.94
    GO:0000287 ... P29218 30289407
    470041 6gj0:A (1.73) BS02 MN 3.1.3.25
    3.1.3.94
    GO:0000287 ... P29218 30289407
    470042 6gj0:B (1.73) BS01 MN 3.1.3.25
    3.1.3.94
    GO:0000287 ... P29218 30289407
    470043 6gj0:B (1.73) BS02 MN 3.1.3.25
    3.1.3.94
    GO:0000287 ... P29218 30289407
    470044 6gj2:A (1.68) BS01 FE 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 35529950
    470045 6gj2:A (1.68) BS02 FE 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 35529950
    470046 6gj2:A (1.68) BS03 PO4 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 35529950
    470047 6gj2:A (1.68) BS04 IHS 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 35529950
    470048 6gj4:A (2.4) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... P81947 30448418
    470049 6gj4:A (2.4) BS02 CA 3.6.5.- GO:0000226 ... P81947 30448418
    470050 6gj4:B (2.4) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q6B856 30448418
    470051 6gj4:B (2.4) BS02 EZW ? GO:0000226 ... Q6B856 30448418 MOAD: Ka=70000000M^-1
    470052 6gj4:C (2.4) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... P81947 30448418
    470053 6gj4:C (2.4) BS02 CA 3.6.5.- GO:0000226 ... P81947 30448418
    470054 6gj4:D (2.4) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q6B856 30448418
    470055 6gj4:D (2.4) BS02 EZW ? GO:0000226 ... Q6B856 30448418 MOAD: Ka=70000000M^-1
    470056 6gj4:F (2.4) BS01 ACP N/A GO:0036211 ... N/A 30448418
    470057 6gj5:A (1.499) BS01 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 31332011
    470058 6gj5:A (1.499) BS02 F0N 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 31332011 MOAD: Kd=440uM
    470059 6gj5:B (1.499) BS01 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 31332011
    470060 6gj5:B (1.499) BS02 F0N 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 31332011 MOAD: Kd=440uM
    470061 6gj6:A (1.761) BS01 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 31332011
    470062 6gj6:A (1.761) BS02 EZZ 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 31332011 MOAD: Kd=20.4uM
    470063 6gj7:A (1.67) BS01 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 31332011
    470064 6gj7:A (1.67) BS02 F0B 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 31332011
    470065 6gj8:A (1.65) BS01 F0K 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 31332011
    470066 6gj8:A (1.65) BS02 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 31332011
    470067 6gj9:A (1.76) BS01 FE 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 N/A
    470068 6gj9:A (1.76) BS02 FE 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 N/A
    470069 6gja:A (1.5) BS01 FE 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 35529950
    470070 6gja:A (1.5) BS02 FE 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 35529950
    470071 6gja:A (1.5) BS03 PO4 3.1.3.2 GO:0003993 ... F6MIW5 35529950
    470072 6gjb:A (1.82) BS01 F0H 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 30568786 MOAD: ic50=0.008uM
    470073 6gjc:A (3.3) BS01 FMN N/A GO:0004312 ... N/A 30250274
    470074 6gjc:B (3.3) BS01 FMN N/A GO:0004312 ... N/A 30250274
    470075 6gjc:C (3.3) BS01 FMN N/A GO:0004312 ... N/A 30250274
    470076 6gjc:D (3.3) BS01 FMN N/A GO:0004312 ... N/A 30250274
    470077 6gjc:E (3.3) BS01 FMN N/A GO:0004312 ... N/A 30250274
    470078 6gjc:F (3.3) BS01 FMN N/A GO:0004312 ... N/A 30250274
    470079 6gjd:A (1.58) BS01 F0E 2.7.11.24 GO:0000165 ... P28482 30568786 MOAD: ic50=0.022uM
    470080 6gjg:A (1.99) BS01 FMN 1.3.5.2 GO:0004152 ... Q08210 30197997
    470081 6gjg:A (1.99) BS02 F1T 1.3.5.2 GO:0004152 ... Q08210 30197997
    470082 6gjg:B (1.99) BS01 FMN 1.3.5.2 GO:0004152 ... Q08210 30197997
    470083 6gjg:B (1.99) BS02 F1T 1.3.5.2 GO:0004152 ... Q08210 30197997
    470084 6gjh:B (2.1) BS01 peptide ? N/A P04792 31131323
    470085 6gjh:D (2.1) BS01 peptide ? N/A P04792 31131323
    470086 6gjh:F (2.1) BS01 peptide ? N/A P04792 31131323
    470087 6gjh:H (2.1) BS01 peptide ? N/A P04792 31131323
    470088 6gji:A (1.6) BS01 F1E 5.2.1.8 GO:0000413 ... P62937 30746096
    470089 6gjj:A (1.38) BS01 L36 5.2.1.8 GO:0000413 ... P62937 30746096
    470090 6gjk:A (1.47) BS01 ZN 3.5.1.- GO:0004407 ... Q70I53 30611847
    470091 6gjk:A (1.47) BS02 F0Z 3.5.1.- GO:0004407 ... Q70I53 30611847
    470092 6gjk:A (1.47) BS03 F0Z 3.5.1.- GO:0004407 ... Q70I53 30611847
    470093 6gjk:A (1.47) BS04 F0Z 3.5.1.- GO:0004407 ... Q70I53 30611847
    470094 6gjk:B (1.47) BS01 F0Z 3.5.1.- GO:0004407 ... Q70I53 30611847
    470095 6gjk:B (1.47) BS02 ZN 3.5.1.- GO:0004407 ... Q70I53 30611847
    470096 6gjk:B (1.47) BS03 F0Z 3.5.1.- GO:0004407 ... Q70I53 30611847
    470097 6gjk:B (1.47) BS04 F0Z 3.5.1.- GO:0004407 ... Q70I53 30611847
    470098 6gjl:A (1.16) BS01 F1Q 5.2.1.8 GO:0000413 ... P62937 30746096
    470099 6gjm:A (1.354) BS01 L36 5.2.1.8 GO:0000413 ... P62937 30746096
    470100 6gjn:A (1.7) BS01 F0Q 5.2.1.8 GO:0000413 ... P62937 30746096
    470101 6gjo:A (2.91) BS01 F1B 2.7.11.1
    2.7.11.26
    GO:0001837 ... P49841 N/A
    470102 6gjo:B (2.91) BS01 F1B 2.7.11.1
    2.7.11.26
    GO:0001837 ... P49841 N/A
    470103 6gjp:A (1.94) BS01 F0T 5.2.1.8 GO:0000413 ... P62937 30746096
    470104 6gjq:A (2.49) BS01 ATP 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470105 6gjq:C (2.49) BS01 ATP 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470106 6gjq:E (2.49) BS01 ATP 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470107 6gjq:G (2.49) BS01 ATP 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470108 6gjr:A (1.69) BS01 F0W 5.2.1.8 GO:0000413 ... P62937 30746096
    470109 6gjs:A (1.95) BS01 MG 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470110 6gjs:A (1.95) BS02 ATP 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470111 6gjt:A (1.98) BS01 K ? N/A P0CE18 30002845
    470112 6gjt:A (1.98) BS02 K ? N/A P0CE18 30002845
    470113 6gjt:A (1.98) BS03 K ? N/A P0CE18 30002845
    470114 6gjt:B (1.98) BS01 K ? N/A P0CE18 30002845
    470115 6gjt:B (1.98) BS02 K ? N/A P0CE18 30002845
    470116 6gjt:C (1.98) BS01 K ? N/A P0CE18 30002845
    470117 6gjt:D (1.98) BS01 K ? N/A P0CE18 30002845
    470118 6gjt:D (1.98) BS02 K ? N/A P0CE18 30002845
    470119 6gjt:E (1.98) BS01 K ? N/A P0CE18 30002845
    470120 6gjt:F (1.98) BS01 K ? N/A P0CE18 30002845
    470121 6gjw:A (1.9) BS01 ZN 2.3.2.27 N/A P98170 31011505
    470122 6gjw:A (1.9) BS02 F2H 2.3.2.27 N/A P98170 31011505
    470123 6gjw:B (1.9) BS01 ZN 2.3.2.27 N/A P98170 31011505
    470124 6gjw:B (1.9) BS02 F2H 2.3.2.27 N/A P98170 31011505
    470125 6gjw:C (1.9) BS01 ZN 2.3.2.27 N/A P98170 31011505
    470126 6gjw:C (1.9) BS02 F2H 2.3.2.27 N/A P98170 31011505 MOAD: Kd=9uM
    470127 6gjw:D (1.9) BS01 ZN 2.3.2.27 N/A P98170 31011505
    470128 6gjw:D (1.9) BS02 F2H 2.3.2.27 N/A P98170 31011505 MOAD: Kd=9uM
    470129 6gjy:A (1.29) BS01 F1Z 5.2.1.8 GO:0000413 ... P62937 30746096
    470130 6gjz:A (4.06) BS01 rna 3.6.4.13 GO:0002376 ... Q8R5F7 30449722
    470131 6gjz:A (4.06) BS02 rna 3.6.4.13 GO:0002376 ... Q8R5F7 30449722
    470132 6gjz:A (4.06) BS03 ZN 3.6.4.13 GO:0002376 ... Q8R5F7 30449722
    470133 6gjz:A (4.06) BS04 ANP 3.6.4.13 GO:0002376 ... Q8R5F7 30449722
    470134 6gk0:A (1.85) BS01 FMN 1.3.5.2 GO:0004151 ... Q02127 32900849
    470135 6gk0:A (1.85) BS02 DOR 1.3.5.2 GO:0004151 ... Q02127 32900849
    470136 6gk0:A (1.85) BS03 F1W 1.3.5.2 GO:0004151 ... Q02127 32900849
    470137 6gk4:A (2.91) BS01 MG 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470138 6gk4:A (2.91) BS02 ATP 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470139 6gk4:D (2.91) BS01 ATP 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470140 6gk4:D (2.91) BS02 MG 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470141 6gk5:A (1.6) BS01 HEM 1.14.-.- GO:0004497 ... A9ERX9 30045877
    470142 6gk6:A (1.6) BS01 HEM 1.14.-.- GO:0004497 ... A9ERX9 30045877
    470143 6gk7:H (2.95) BS01 peptide N/A N/A N/A 29855358
    470144 6gk7:L (2.95) BS01 peptide N/A N/A N/A 29855358
    470145 6gk8:H (2.85) BS01 peptide N/A N/A N/A 29855358
    470146 6gk8:L (2.85) BS01 peptide N/A N/A N/A 29855358
    470147 6gk9:A (2.54) BS01 F2K 1.1.1.205 GO:0000166 ... Q9HXM5 30769241 BindingDB: IC50=4000nM
    470148 6gk9:D (2.54) BS01 F2K 1.1.1.205 GO:0000166 ... Q9HXM5 30769241 BindingDB: IC50=4000nM
    470149 6gka:A (1.76) BS01 FE 1.16.3.2 GO:0005737 ... Q0I9X8 30659147
    470150 6gka:A (1.76) BS02 FE 1.16.3.2 GO:0005737 ... Q0I9X8 30659147
    470151 6gkb:A (1.9) BS01 FE 1.16.3.2 GO:0005737 ... Q0I9X8 30659147
    470152 6gkc:A (1.97) BS01 FE 1.16.3.2 GO:0005737 ... Q0I9X8 30659147
    470153 6gkc:A (1.97) BS02 FE 1.16.3.2 GO:0005737 ... Q0I9X8 30659147
    470154 6gkd:A (2.99) BS01 GLC 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470155 6gkd:A (2.99) BS02 Z9N 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470156 6gkd:A (2.99) BS03 ATP 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470157 6gkd:A (2.99) BS04 MG 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470158 6gkd:F (2.99) BS01 GLC 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470159 6gkd:F (2.99) BS02 Z9N 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470160 6gkd:F (2.99) BS03 ATP 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470161 6gkd:F (2.99) BS04 MG 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470162 6gkd:I (2.99) BS01 Z9N 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470163 6gkd:I (2.99) BS02 GLC 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470164 6gkd:I (2.99) BS03 Z9N 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470165 6gkd:I (2.99) BS04 ATP 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470166 6gkd:I (2.99) BS05 MG 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470167 6gkd:L (2.99) BS01 Z9N 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470168 6gkd:L (2.99) BS02 ATP 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470169 6gkd:L (2.99) BS03 MG 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470170 6gkd:O (2.99) BS01 GLC 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470171 6gkd:O (2.99) BS02 ATP 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470172 6gkd:O (2.99) BS03 MG 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470173 6gkd:R (2.99) BS01 GLC 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470174 6gkd:R (2.99) BS02 ATP 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470175 6gkd:R (2.99) BS03 MG 5.6.1.6 GO:0005524 ... P13569 31201318
    470176 6gke:A (1.08) BS01 FUC ? GO:0030246 ... P18891 N/A
    470177 6gke:A (1.08) BS02 FUC ? GO:0030246 ... P18891 N/A
    470178 6gke:A (1.08) BS03 FUC ? GO:0030246 ... P18891 N/A
    470179 6gke:A (1.08) BS04 FUC ? GO:0030246 ... P18891 N/A
    470180 6gke:A (1.08) BS05 FUC ? GO:0030246 ... P18891 N/A
    470181 6gkf:A (2.598) BS01 peptide ? GO:0002842 ... P61981 30281929
    470182 6gkf:B (2.598) BS01 peptide ? GO:0002842 ... P61981 30281929
    470183 6gkf:C (2.598) BS01 peptide ? GO:0002842 ... P61981 30281929
    470184 6gkf:D (2.598) BS01 peptide ? GO:0002842 ... P61981 30281929
    470185 6gkf:E (2.598) BS01 peptide ? GO:0002842 ... P61981 30281929
    470186 6gkf:F (2.598) BS01 peptide ? GO:0002842 ... P61981 30281929
    470187 6gkf:G (2.598) BS01 peptide ? GO:0002842 ... P61981 30281929
    470188 6gkf:H (2.598) BS01 peptide ? GO:0002842 ... P61981 30281929
    470189 6gkg:A (2.847) BS01 peptide ? GO:0002842 ... P61981 30281929
    470190 6gkg:B (2.847) BS01 peptide ? GO:0002842 ... P61981 30281929
    470191 6gkg:C (2.847) BS01 peptide ? GO:0002842 ... P61981 30281929
    470192 6gkg:E (2.847) BS01 peptide ? GO:0002842 ... P61981 30281929
    470193 6gkg:F (2.847) BS01 peptide ? GO:0002842 ... P61981 30281929
    470194 6gkg:G (2.847) BS01 peptide ? GO:0002842 ... P61981 30281929
    470195 6gkh:A (4.06) BS01 rna 3.6.4.13 GO:0002376 ... Q8R5F7 30449722
    470196 6gkh:A (4.06) BS02 rna 3.6.4.13 GO:0002376 ... Q8R5F7 30449722
    470197 6gkh:A (4.06) BS03 ADP 3.6.4.13 GO:0002376 ... Q8R5F7 30449722
    470198 6gkh:A (4.06) BS04 ALF 3.6.4.13 GO:0002376 ... Q8R5F7 30449722
    470199 6gkh:A (4.06) BS05 ZN 3.6.4.13 GO:0002376 ... Q8R5F7 30449722
    470200 6gkj:A (2.068) BS01 MGP ? GO:0003723 ... P63073 N/A BindingDB: Kd=10nM

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).