SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2344 2345 2346 2347 2348 2349 2350 2351 2352 2353 2354 2355 2356 2357 2358 2359 2360 2361 2362 2363 2364 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    470601 6go7:A (2.55) BS05 DCT 2.7.7.31
    2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0003677 ... P09838
    Q9JIW4
    31138645
    470602 6go7:A (2.55) BS06 MG 2.7.7.31
    2.7.7.7
    3.1.11.-
    GO:0003677 ... P09838
    Q9JIW4
    31138645
    470603 6gob:A (1.96) BS01 F6Q 3.2.1.17 GO:0003796 ... P00698 30004541
    470604 6gob:A (1.96) BS02 F6Q 3.2.1.17 GO:0003796 ... P00698 30004541
    470605 6gob:A (1.96) BS03 F6Q 3.2.1.17 GO:0003796 ... P00698 30004541
    470606 6goc:A (1.9) BS01 ZN ? GO:0016787 ... Q8A900 N/A
    470607 6god:A (1.71) BS01 MG 3.6.5.2 GO:0000139 ... P01116 30683716
    470608 6god:A (1.71) BS02 GNP 3.6.5.2 GO:0000139 ... P01116 30683716
    470609 6god:A (1.71) BS03 MG 3.6.5.2 GO:0000139 ... P01116 30683716
    470610 6goe:A (1.6) BS01 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470611 6goe:A (1.6) BS02 GNP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470612 6gof:A (1.98) BS01 MG 3.6.5.2 GO:0000139 ... P01116 30683716
    470613 6gof:A (1.98) BS02 GNP 3.6.5.2 GO:0000139 ... P01116 30683716
    470614 6gof:A (1.98) BS03 MG 3.6.5.2 GO:0000139 ... P01116 30683716
    470615 6gog:A (2.05) BS01 GNP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470616 6gog:A (2.05) BS02 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470617 6gog:B (2.05) BS01 GNP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470618 6gog:B (2.05) BS02 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470619 6gog:C (2.05) BS01 GNP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470620 6gog:C (2.05) BS02 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470621 6gog:D (2.05) BS01 GNP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470622 6gog:D (2.05) BS02 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470623 6gog:E (2.05) BS01 GNP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470624 6gog:E (2.05) BS02 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470625 6gog:F (2.05) BS01 GNP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470626 6gog:F (2.05) BS02 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470627 6goh:A (2.43) BS01 F7T 3.2.1.17 GO:0003796 ... P00698 30004541
    470628 6gok:A (2.65) BS01 F6Q 4.6.1.18 GO:0003676 ... P61823 30004541
    470629 6gok:B (2.65) BS01 F6Q 4.6.1.18 GO:0003676 ... P61823 30004541
    470630 6gom:A (1.63) BS01 GNP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470631 6gom:A (1.63) BS02 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470632 6gom:A (1.63) BS03 F6E 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470633 6gom:B (1.63) BS01 GNP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470634 6gom:B (1.63) BS02 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470635 6gom:C (1.63) BS01 GNP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470636 6gom:D (1.63) BS01 GNP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470637 6gom:E (1.63) BS01 GNP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470638 6gom:E (1.63) BS02 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470639 6gom:F (1.63) BS01 GNP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 30683716
    470640 6gon:A (1.65) BS01 8PF ? GO:0005179 ... Q9PTT3 30226982 MOAD: Kd=2.16uM
    470641 6gon:B (1.65) BS01 8PF ? GO:0005179 ... Q9PTT3 30226982
    470642 6gon:C (1.65) BS01 8PF ? GO:0005179 ... Q9PTT3 30226982
    470643 6gon:D (1.65) BS01 8PF ? GO:0005179 ... Q9PTT3 30226982 MOAD: Kd=2.16uM
    470644 6goo:A (1.8) BS01 8PF ? GO:0005179 ... Q9PTT3 30226982 MOAD: Kd=2.16uM
    470645 6goo:B (1.8) BS01 8PF ? GO:0005179 ... Q9PTT3 30226982 MOAD: Kd=2.16uM
    470646 6gop:G (2.9) BS01 MG 3.4.25.1 GO:0000502 ... P21243 30029468
    470647 6gop:H (2.9) BS01 F6K 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30029468
    470648 6gop:K (2.9) BS01 F6K 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30029468
    470649 6gop:K (2.9) BS02 MG 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30029468
    470650 6gop:N (2.9) BS01 F6K 3.4.25.1 GO:0000502 ... P38624 30029468
    470651 6gop:N (2.9) BS02 MG 3.4.25.1 GO:0000502 ... P38624 30029468
    470652 6gop:V (2.9) BS01 MG 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30029468
    470653 6gop:V (2.9) BS02 F6K 3.4.25.1 GO:0004298 ... P25043 30029468
    470654 6gop:Y (2.9) BS01 MG 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30029468
    470655 6gop:Y (2.9) BS02 F6K 3.4.25.1 GO:0004298 ... P30656 30029468
    470656 6gop:Z (2.9) BS01 MG 3.4.25.1 GO:0000502 ... P23724 30029468
    470657 6gop:b (2.9) BS01 F6K 3.4.25.1 GO:0000502 ... P38624 30029468
    470658 6gos:1 (2.1) BS01 peptide ? GO:0005737 ... P23184 30661981
    470659 6gos:1 (2.1) BS02 ZN ? GO:0005737 ... P23184 30661981
    470660 6gos:2 (2.1) BS01 peptide ? GO:0005737 ... P23184 30661981
    470661 6gos:2 (2.1) BS02 ZN ? GO:0005737 ... P23184 30661981
    470662 6gos:C (2.1) BS01 peptide ? GO:0005737 ... P23185 30661981
    470663 6gos:C (2.1) BS02 FMN ? GO:0005737 ... P23185 30661981
    470664 6gos:D (2.1) BS01 peptide ? GO:0005737 ... P23186 30661981
    470665 6got:A (1.56) BS01 ZN 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 30253337
    470666 6got:A (1.56) BS02 F6W 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 30253337 MOAD: Ki=0.4nM
    BindingDB: Kd=25nM
    470667 6gou:A (2.9) BS01 FAD 2.5.1.26 GO:0003824 ... P97275 30576903
    470668 6gou:A (2.9) BS02 F6T 2.5.1.26 GO:0003824 ... P97275 30576903
    470669 6gou:B (2.9) BS01 FAD 2.5.1.26 GO:0003824 ... P97275 30576903
    470670 6gou:B (2.9) BS02 F6T 2.5.1.26 GO:0003824 ... P97275 30576903
    470671 6gou:C (2.9) BS01 FAD 2.5.1.26 GO:0003824 ... P97275 30576903
    470672 6gou:D (2.9) BS01 FAD 2.5.1.26 GO:0003824 ... P97275 30576903
    470673 6gou:D (2.9) BS02 F6T 2.5.1.26 GO:0003824 ... P97275 30576903
    470674 6gov:A (3.7) BS01 rna ? GO:0000166 ... P0AFF6 30795892
    470675 6gov:B (3.7) BS01 rna ? GO:0003723 ... P0A780 30795892
    470676 6gov:E (3.7) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7R5 30795892
    470677 6gov:G (3.7) BS01 dna ? GO:0005515 ... P0AFG0 30795892
    470678 6gov:N (3.7) BS01 dna ? GO:0001000 ... P03045 30795892
    470679 6gov:N (3.7) BS02 rna ? GO:0001000 ... P03045 30795892
    470680 6gov:X (3.7) BS01 dna 2.7.7.6 GO:0000345 ... P0A8V2 30795892
    470681 6gov:X (3.7) BS02 dna 2.7.7.6 GO:0000345 ... P0A8V2 30795892
    470682 6gov:X (3.7) BS03 rna 2.7.7.6 GO:0000345 ... P0A8V2 30795892
    470683 6gov:Y (3.7) BS01 dna 2.7.7.6 GO:0000287 ... P0A8T7 30795892
    470684 6gov:Y (3.7) BS02 dna 2.7.7.6 GO:0000287 ... P0A8T7 30795892
    470685 6gov:Y (3.7) BS03 rna 2.7.7.6 GO:0000287 ... P0A8T7 30795892
    470686 6gov:Y (3.7) BS04 MG 2.7.7.6 GO:0000287 ... P0A8T7 30795892
    470687 6gov:Y (3.7) BS05 ZN 2.7.7.6 GO:0000287 ... P0A8T7 30795892
    470688 6gov:Y (3.7) BS06 ZN 2.7.7.6 GO:0000287 ... P0A8T7 30795892
    470689 6gp2:A (1.48) BS01 CA 1.17.4.1 GO:0004748 ... Q6F0T5 30429545
    470690 6gp2:B (1.48) BS01 CA 1.17.4.1 GO:0004748 ... Q6F0T5 30429545
    470691 6gp3:A (1.23) BS01 CA 1.17.4.1 GO:0004748 ... Q6F0T5 30429545
    470692 6gp3:B (1.23) BS01 CA 1.17.4.1 GO:0004748 ... Q6F0T5 30429545
    470693 6gp7:B (1.95002) BS01 peptide ? N/A P0CI74 30651563
    470694 6gp8:A (1.75) BS01 APC 3.6.4.10 GO:0005524 ... P07900 30248409
    470695 6gpa:A (1.79) BS01 GAL 3.2.1.89 GO:0015926 ... Q89YR3 30553858
    470696 6gpa:B (1.79) BS01 GAL 3.2.1.89 GO:0015926 ... Q89YR3 30553858
    470697 6gpb:A (2.86) BS01 GLC 2.4.1.1 GO:0000166 ... P00489 2106586
    470698 6gpb:A (2.86) BS02 GLC 2.4.1.1 GO:0000166 ... P00489 2106586
    470699 6gpb:A (2.86) BS03 GLC 2.4.1.1 GO:0000166 ... P00489 2106586
    470700 6gpb:A (2.86) BS04 H2P 2.4.1.1 GO:0000166 ... P00489 2106586
    470701 6gpb:A (2.86) BS05 PLP 2.4.1.1 GO:0000166 ... P00489 2106586
    470702 6gpb:A (2.86) BS06 AMP 2.4.1.1 GO:0000166 ... P00489 2106586
    470703 6gpb:A (2.86) BS07 AMP 2.4.1.1 GO:0000166 ... P00489 2106586
    470704 6gpc:A (1.75) BS01 ARG ? N/A Q9WZ62 30059738
    470705 6gpc:A (1.75) BS02 ARG ? N/A Q9WZ62 30059738
    470706 6gpc:B (1.75) BS01 ARG ? N/A Q9WZ62 30059738
    470707 6gpc:B (1.75) BS02 ARG ? N/A Q9WZ62 30059738
    470708 6gpe:A (2.2) BS01 FE2 1.14.11.64 GO:0005506 ... P76621 30498244
    470709 6gpe:B (2.2) BS01 FE2 1.14.11.64 GO:0005506 ... P76621 30498244
    470710 6gpf:A (1.55) BS01 ANP 3.6.4.10 GO:0005524 ... P07900 30248409
    470711 6gpg:A (2.894) BS01 rna 3.6.4.13 GO:0003676 ... O95786 30047865
    470712 6gpg:A (2.894) BS02 rna 3.6.4.13 GO:0003676 ... O95786 30047865
    470713 6gpg:A (2.894) BS03 ZN 3.6.4.13 GO:0003676 ... O95786 30047865
    470714 6gph:A (1.56) BS01 A12 3.6.4.10 GO:0005524 ... P07900 30248409
    470715 6gpj:A (1.94) BS01 G4F 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470716 6gpj:A (1.94) BS02 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470717 6gpj:A (1.94) BS03 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470718 6gpj:B (1.94) BS01 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470719 6gpj:B (1.94) BS02 G4F 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470720 6gpj:B (1.94) BS03 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470721 6gpj:C (1.94) BS01 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470722 6gpj:C (1.94) BS02 G4F 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470723 6gpj:C (1.94) BS03 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470724 6gpj:D (1.94) BS01 G4F 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470725 6gpj:D (1.94) BS02 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470726 6gpj:D (1.94) BS03 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470727 6gpk:A (1.47) BS01 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470728 6gpk:A (1.47) BS02 GDD 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470729 6gpk:A (1.47) BS03 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470730 6gpk:B (1.47) BS01 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470731 6gpk:B (1.47) BS02 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470732 6gpk:B (1.47) BS03 GDD 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470733 6gpk:C (1.47) BS01 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470734 6gpk:C (1.47) BS02 GDD 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470735 6gpk:C (1.47) BS03 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470736 6gpk:D (1.47) BS01 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470737 6gpk:D (1.47) BS02 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470738 6gpk:D (1.47) BS03 GDD 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470739 6gpl:B (1.76) BS01 F7E 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470740 6gpl:B (1.76) BS02 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470741 6gpl:B (1.76) BS03 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470742 6gpl:C (1.76) BS01 F7E 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470743 6gpl:C (1.76) BS02 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470744 6gpl:C (1.76) BS03 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470745 6gpl:D (1.76) BS01 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470746 6gpl:D (1.76) BS02 F7E 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470747 6gpl:D (1.76) BS03 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470748 6gpl:E (1.76) BS01 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470749 6gpl:E (1.76) BS02 F7E 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470750 6gpl:E (1.76) BS03 NAP 4.2.1.47 GO:0005515 ... O60547 30984471
    470751 6gpn:A (2.2) BS01 FE2 1.14.11.64 GO:0005506 ... P76621 30498244
    470752 6gpn:B (2.2) BS01 FE2 1.14.11.64 GO:0005506 ... P76621 30498244
    470753 6gpo:A (1.48) BS01 CMP 3.6.4.10 GO:0005524 ... P07900 30248409
    470754 6gpp:A (1.51) BS01 ADP 3.6.4.10 GO:0005524 ... P07900 30248409
    470755 6gpr:A (2.35) BS01 CMP 3.6.4.10 GO:0005524 ... P07900 30248409
    470756 6gps:A (3.3) BS01 F7N ? GO:0001974 ... P00268
    P41597
    30581043
    470757 6gpt:A (2.0) BS01 A12 3.6.4.10 GO:0005524 ... P07900 30248409
    470758 6gpu:A (1.17) BS01 FMN 2.7.11.1 N/A P93025 30787421
    470759 6gpv:A (2.0) BS01 FMN 2.7.11.1 N/A P93025 30787421
    470760 6gpv:A (2.0) BS02 LUM 2.7.11.1 N/A P93025 30787421
    470761 6gpx:A (2.7) BS01 ZN ? GO:0004930 ... P00268
    P41597
    30581043
    470762 6gpx:A (2.7) BS02 F7N ? GO:0004930 ... P00268
    P41597
    30581043
    470763 6gpx:B (2.7) BS01 F7N ? GO:0004930 ... P00268
    P41597
    30581043
    470764 6gpy:A (2.25) BS01 ANP 3.6.4.10 GO:0005524 ... P07900 30248409
    470765 6gpz:A (1.6) BS01 ZN ? N/A P0CI74 30651563
    470766 6gpz:B (1.6) BS01 peptide ? N/A P0CI74 30651563
    470767 6gpz:B (1.6) BS02 ZN ? N/A P0CI74 30651563
    470768 6gpz:B (1.6) BS03 ZN ? N/A P0CI74 30651563
    470769 6gpz:B (1.6) BS04 ZN ? N/A P0CI74 30651563
    470770 6gq1:A (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX45 29886014
    470771 6gq1:A (4.4) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0CX45 29886014
    470772 6gq1:AA (4.4) BS01 rna ? GO:0000054 ... Q08745 29886014
    470773 6gq1:AB (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0CX47 29886014
    470774 6gq1:AC (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P48589 29886014
    470775 6gq1:AD (4.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... P05756 29886014
    470776 6gq1:AE (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P39516 29886014
    470777 6gq1:AF (4.4) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q01855 29886014
    470778 6gq1:AG (4.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX51 29886014
    470779 6gq1:AH (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P14127 29886014
    470780 6gq1:AI (4.4) BS01 rna ? GO:0000054 ... P0CX55 29886014
    470781 6gq1:AJ (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P07280 29886014
    470782 6gq1:AK (4.4) BS01 rna ? GO:0003723 ... P38701 29886014
    470783 6gq1:AL (4.4) BS01 rna ? GO:0000447 ... P0C0V8 29886014
    470784 6gq1:AM (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C0W1 29886014
    470785 6gq1:AN (4.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX29 29886014
    470786 6gq1:AO (4.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX31 29886014
    470787 6gq1:AP (4.4) BS01 rna ? N/A Q3E792 29886014
    470788 6gq1:AQ (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P39939 29886014
    470789 6gq1:AQ (4.4) BS02 ZN ? GO:0003735 ... P39939 29886014
    470790 6gq1:AR (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P35997 29886014
    470791 6gq1:AR (4.4) BS02 ZN ? GO:0000028 ... P35997 29886014
    470792 6gq1:AS (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... Q3E7X9 29886014
    470793 6gq1:AT (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P41057 29886014
    470794 6gq1:AT (4.4) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P41057 29886014
    470795 6gq1:AU (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX33 29886014
    470796 6gq1:AV (4.4) BS01 rna ? GO:0001965 ... P38011 29886014
    470797 6gq1:AW (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P05759 29886014
    470798 6gq1:AW (4.4) BS02 ZN ? GO:0003735 ... P05759 29886014
    470799 6gq1:AZ (4.4) BS01 rna 3.6.5.- GO:0003746 ... P32324 29886014
    470800 6gq1:AZ (4.4) BS02 rna 3.6.5.- GO:0003746 ... P32324 29886014

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).