SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2345 2346 2347 2348 2349 2350 2351 2352 2353 2354 2355 2356 2357 2358 2359 2360 2361 2362 2363 2364 2365 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    470801 6gq1:AZ (4.4) BS03 SO1 3.6.5.- GO:0003746 ... P32324 29886014
    470802 6gq1:B (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P14126 29886014
    470803 6gq1:C (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P10664 29886014
    470804 6gq1:C (4.4) BS02 rna ? GO:0002181 ... P10664 29886014
    470805 6gq1:D (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P26321 29886014
    470806 6gq1:D (4.4) BS02 rna ? GO:0000027 ... P26321 29886014
    470807 6gq1:E (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... Q02326 29886014
    470808 6gq1:F (4.4) BS01 rna ? GO:0000463 ... P05737 29886014
    470809 6gq1:F (4.4) BS02 rna ? GO:0000463 ... P05737 29886014
    470810 6gq1:G (4.4) BS01 rna ? GO:0000470 ... P17076 29886014
    470811 6gq1:G (4.4) BS02 rna ? GO:0000470 ... P17076 29886014
    470812 6gq1:H (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P05738 29886014
    470813 6gq1:I (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P41805 29886014
    470814 6gq1:I (4.4) BS02 rna ? GO:0000027 ... P41805 29886014
    470815 6gq1:J (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... Q3E757 29886014
    470816 6gq1:J (4.4) BS02 rna ? GO:0000027 ... Q3E757 29886014
    470817 6gq1:L (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q12690 29886014
    470818 6gq1:L (4.4) BS02 rna ? GO:0002181 ... Q12690 29886014
    470819 6gq1:M (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P36105 29886014
    470820 6gq1:N (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P05748 29886014
    470821 6gq1:N (4.4) BS02 rna ? GO:0002181 ... P05748 29886014
    470822 6gq1:O (4.4) BS01 rna ? GO:0000470 ... P26784 29886014
    470823 6gq1:P (4.4) BS01 rna ? GO:0000448 ... P05740 29886014
    470824 6gq1:P (4.4) BS02 rna ? GO:0000448 ... P05740 29886014
    470825 6gq1:P0 (4.4) BS01 rna ? N/A P05317 29886014
    470826 6gq1:P2 (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0CX53 29886014
    470827 6gq1:Q (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX49 29886014
    470828 6gq1:R (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX82 29886014
    470829 6gq1:R (4.4) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0CX82 29886014
    470830 6gq1:S (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX23 29886014
    470831 6gq1:S (4.4) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0CX23 29886014
    470832 6gq1:T (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q02753 29886014
    470833 6gq1:T (4.4) BS02 rna ? GO:0002181 ... Q02753 29886014
    470834 6gq1:U (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P05749 29886014
    470835 6gq1:V (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX41 29886014
    470836 6gq1:V (4.4) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0CX41 29886014
    470837 6gq1:W (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P04449 29886014
    470838 6gq1:X (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P04456 29886014
    470839 6gq1:X (4.4) BS02 rna ? GO:0003735 ... P04456 29886014
    470840 6gq1:Y (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P05743 29886014
    470841 6gq1:Y (4.4) BS02 rna ? GO:0002181 ... P05743 29886014
    470842 6gq1:Z (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C2H6 29886014
    470843 6gq1:a (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P02406 29886014
    470844 6gq1:b (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P05747 29886014
    470845 6gq1:c (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P14120 29886014
    470846 6gq1:d (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C2H8 29886014
    470847 6gq1:e (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P38061 29886014
    470848 6gq1:f (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P05744 29886014
    470849 6gq1:g (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P87262 29886014
    470850 6gq1:h (4.4) BS01 rna ? GO:0000463 ... P0CX84 29886014
    470851 6gq1:h (4.4) BS02 rna ? GO:0000463 ... P0CX84 29886014
    470852 6gq1:i (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P05745 29886014
    470853 6gq1:j (4.4) BS01 rna ? GO:0000448 ... P49166 29886014
    470854 6gq1:j (4.4) BS02 rna ? GO:0000448 ... P49166 29886014
    470855 6gq1:j (4.4) BS03 ZN ? GO:0000448 ... P49166 29886014
    470856 6gq1:k (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P49167 29886014
    470857 6gq1:l (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P04650 29886014
    470858 6gq1:l (4.4) BS02 rna ? GO:0002181 ... P04650 29886014
    470859 6gq1:m (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0CH08 29886014
    470860 6gq1:m (4.4) BS02 ZN ? GO:0003735 ... P0CH08 29886014
    470861 6gq1:o (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX27 29886014
    470862 6gq1:o (4.4) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0CX27 29886014
    470863 6gq1:o (4.4) BS03 ZN ? GO:0002181 ... P0CX27 29886014
    470864 6gq1:p (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX25 29886014
    470865 6gq1:p (4.4) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0CX25 29886014
    470866 6gq1:p (4.4) BS03 ZN ? GO:0002181 ... P0CX25 29886014
    470867 6gq1:q (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P32905 29886014
    470868 6gq1:r (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P33442 29886014
    470869 6gq1:s (4.4) BS01 rna ? GO:0003723 ... P25443 29886014
    470870 6gq1:t (4.4) BS01 rna ? GO:0000054 ... P05750 29886014
    470871 6gq1:u (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX35 29886014
    470872 6gq1:v (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P26783 29886014
    470873 6gq1:w (4.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX37 29886014
    470874 6gq1:x (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P26786 29886014
    470875 6gq1:y (4.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX39 29886014
    470876 6gq1:y (4.4) BS02 rna ? GO:0000462 ... P0CX39 29886014
    470877 6gq1:z (4.4) BS01 rna ? GO:0000462 ... O13516 29886014
    470878 6gq3:A (1.85) BS01 ONL 6.3.5.4 GO:0004066 ... P08243 31552298
    470879 6gq3:B (1.85) BS01 ONL 6.3.5.4 GO:0004066 ... P08243 31552298
    470880 6gq6:A (2.25) BS01 ADP 3.6.4.10 GO:0005524 ... P07900 30248409
    470881 6gq7:A (2.84) BS01 DD8 2.7.11.1
    2.7.1.137
    2.7.1.153
    2.7.1.154
    GO:0016301 ... P48736 N/A
    470882 6gq8:A (1.9) BS01 FE ? GO:0005506 ... Q74MF3 29939726
    470883 6gq8:B (1.9) BS01 FE ? GO:0005506 ... Q74MF3 29939726
    470884 6gq8:C (1.9) BS01 FE ? GO:0005506 ... Q74MF3 29939726
    470885 6gq8:D (1.9) BS01 FE ? GO:0005506 ... Q74MF3 29939726
    470886 6gqb:A (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX45 29886014
    470887 6gqb:A (3.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0CX45 29886014
    470888 6gqb:AA (3.9) BS01 rna ? GO:0000054 ... Q08745 29886014
    470889 6gqb:AB (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0CX47 29886014
    470890 6gqb:AC (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P48589 29886014
    470891 6gqb:AD (3.9) BS01 rna ? GO:0000462 ... P05756 29886014
    470892 6gqb:AD (3.9) BS02 rna ? GO:0000462 ... P05756 29886014
    470893 6gqb:AE (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P39516 29886014
    470894 6gqb:AF (3.9) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q01855 29886014
    470895 6gqb:AG (3.9) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX51 29886014
    470896 6gqb:AH (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P14127 29886014
    470897 6gqb:AI (3.9) BS01 rna ? GO:0000054 ... P0CX55 29886014
    470898 6gqb:AJ (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P07280 29886014
    470899 6gqb:AK (3.9) BS01 rna ? GO:0003723 ... P38701 29886014
    470900 6gqb:AM (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C0W1 29886014
    470901 6gqb:AN (3.9) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX29 29886014
    470902 6gqb:AO (3.9) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX31 29886014
    470903 6gqb:AP (3.9) BS01 rna ? N/A Q3E792 29886014
    470904 6gqb:AQ (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P39939 29886014
    470905 6gqb:AQ (3.9) BS02 ZN ? GO:0003735 ... P39939 29886014
    470906 6gqb:AR (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P35997 29886014
    470907 6gqb:AR (3.9) BS02 ZN ? GO:0000028 ... P35997 29886014
    470908 6gqb:AS (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... Q3E7X9 29886014
    470909 6gqb:AT (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P41057 29886014
    470910 6gqb:AU (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX33 29886014
    470911 6gqb:AV (3.9) BS01 rna ? GO:0001965 ... P38011 29886014
    470912 6gqb:AW (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P05759 29886014
    470913 6gqb:AZ (3.9) BS01 rna 3.6.5.- GO:0003746 ... P32324 29886014
    470914 6gqb:AZ (3.9) BS02 rna 3.6.5.- GO:0003746 ... P32324 29886014
    470915 6gqb:AZ (3.9) BS03 SO1 3.6.5.- GO:0003746 ... P32324 29886014
    470916 6gqb:AZ (3.9) BS04 GDP 3.6.5.- GO:0003746 ... P32324 29886014
    470917 6gqb:AZ (3.9) BS05 ALF 3.6.5.- GO:0003746 ... P32324 29886014
    470918 6gqb:B (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P14126 29886014
    470919 6gqb:BA (3.9) BS01 rna ? GO:0000055 ... P0CX43 29886014
    470920 6gqb:BA (3.9) BS02 rna ? GO:0000055 ... P0CX43 29886014
    470921 6gqb:C (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P10664 29886014
    470922 6gqb:C (3.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P10664 29886014
    470923 6gqb:D (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P26321 29886014
    470924 6gqb:D (3.9) BS02 rna ? GO:0000027 ... P26321 29886014
    470925 6gqb:E (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... Q02326 29886014
    470926 6gqb:F (3.9) BS01 rna ? GO:0000463 ... P05737 29886014
    470927 6gqb:F (3.9) BS02 rna ? GO:0000463 ... P05737 29886014
    470928 6gqb:G (3.9) BS01 rna ? GO:0000470 ... P17076 29886014
    470929 6gqb:G (3.9) BS02 rna ? GO:0000470 ... P17076 29886014
    470930 6gqb:H (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P05738 29886014
    470931 6gqb:I (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P41805 29886014
    470932 6gqb:I (3.9) BS02 rna ? GO:0000027 ... P41805 29886014
    470933 6gqb:J (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... Q3E757 29886014
    470934 6gqb:J (3.9) BS02 rna ? GO:0000027 ... Q3E757 29886014
    470935 6gqb:L (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q12690 29886014
    470936 6gqb:M (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P36105 29886014
    470937 6gqb:N (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P05748 29886014
    470938 6gqb:N (3.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P05748 29886014
    470939 6gqb:O (3.9) BS01 rna ? GO:0000470 ... P26784 29886014
    470940 6gqb:P (3.9) BS01 rna ? GO:0000448 ... P05740 29886014
    470941 6gqb:P (3.9) BS02 rna ? GO:0000448 ... P05740 29886014
    470942 6gqb:P0 (3.9) BS01 rna ? N/A P05317 29886014
    470943 6gqb:P2 (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0CX53 29886014
    470944 6gqb:Q (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX49 29886014
    470945 6gqb:R (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX82 29886014
    470946 6gqb:R (3.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0CX82 29886014
    470947 6gqb:S (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX23 29886014
    470948 6gqb:S (3.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0CX23 29886014
    470949 6gqb:T (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q02753 29886014
    470950 6gqb:T (3.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... Q02753 29886014
    470951 6gqb:U (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P05749 29886014
    470952 6gqb:V (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX41 29886014
    470953 6gqb:W (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P04449 29886014
    470954 6gqb:X (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P04456 29886014
    470955 6gqb:X (3.9) BS02 rna ? GO:0003735 ... P04456 29886014
    470956 6gqb:Y (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P05743 29886014
    470957 6gqb:Y (3.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P05743 29886014
    470958 6gqb:Z (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C2H6 29886014
    470959 6gqb:a (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P02406 29886014
    470960 6gqb:b (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P05747 29886014
    470961 6gqb:c (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P14120 29886014
    470962 6gqb:d (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C2H8 29886014
    470963 6gqb:e (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P38061 29886014
    470964 6gqb:f (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P05744 29886014
    470965 6gqb:g (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P87262 29886014
    470966 6gqb:h (3.9) BS01 rna ? GO:0000463 ... P0CX84 29886014
    470967 6gqb:h (3.9) BS02 rna ? GO:0000463 ... P0CX84 29886014
    470968 6gqb:i (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P05745 29886014
    470969 6gqb:j (3.9) BS01 rna ? GO:0000448 ... P49166 29886014
    470970 6gqb:j (3.9) BS02 rna ? GO:0000448 ... P49166 29886014
    470971 6gqb:j (3.9) BS03 ZN ? GO:0000448 ... P49166 29886014
    470972 6gqb:k (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P49167 29886014
    470973 6gqb:l (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P04650 29886014
    470974 6gqb:l (3.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P04650 29886014
    470975 6gqb:m (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0CH08 29886014
    470976 6gqb:m (3.9) BS02 ZN ? GO:0003735 ... P0CH08 29886014
    470977 6gqb:o (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX27 29886014
    470978 6gqb:o (3.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0CX27 29886014
    470979 6gqb:p (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX25 29886014
    470980 6gqb:p (3.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0CX25 29886014
    470981 6gqb:p (3.9) BS03 ZN ? GO:0002181 ... P0CX25 29886014
    470982 6gqb:q (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P32905 29886014
    470983 6gqb:r (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P33442 29886014
    470984 6gqb:r (3.9) BS02 rna ? GO:0003735 ... P33442 29886014
    470985 6gqb:s (3.9) BS01 rna ? GO:0003723 ... P25443 29886014
    470986 6gqb:t (3.9) BS01 rna ? GO:0000054 ... P05750 29886014
    470987 6gqb:u (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX35 29886014
    470988 6gqb:v (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P26783 29886014
    470989 6gqb:w (3.9) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX37 29886014
    470990 6gqb:x (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P26786 29886014
    470991 6gqb:y (3.9) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX39 29886014
    470992 6gqb:y (3.9) BS02 rna ? GO:0000462 ... P0CX39 29886014
    470993 6gqb:z (3.9) BS01 rna ? GO:0000462 ... O13516 29886014
    470994 6gqd:A (1.523) BS01 ZN 2.7.7.12 GO:0005515 ... P07902 N/A
    470995 6gqd:A (1.523) BS02 H2U 2.7.7.12 GO:0005515 ... P07902 N/A
    470996 6gqf:A (2.9) BS01 HC3 ? N/A Q8VEF1 30220461
    470997 6gqf:B (2.9) BS01 HC3 ? N/A Q8VEF1 30220461
    470998 6gqf:C (2.9) BS01 HC3 ? N/A Q8VEF1 30220461
    470999 6gqf:D (2.9) BS01 HC3 ? N/A Q8VEF1 30220461
    471000 6gqg:A (1.792) BS01 CA ? GO:0006091 ... P42212 30179482

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).