SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2348 2349 2350 2351 2352 2353 2354 2355 2356 2357 2358 2359 2360 2361 2362 2363 2364 2365 2366 2367 2368 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    471401 6gsj:8A (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY7 29931292
    471402 6gsj:8E (2.96) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80374 29931292
    471403 6gsj:8E (2.96) BS02 rna ? GO:0000049 ... P80374 29931292
    471404 6gsj:8I (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY7 29931292
    471405 6gsj:95 (2.96) BS01 rna ? GO:0003723 ... P60492 29931292
    471406 6gsj:98 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q9Z9H5 29931292
    471407 6gsj:9A (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ0 29931292
    471408 6gsj:9I (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ0 29931292
    471409 6gsj:A5 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP3 29931292
    471410 6gsj:A8 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 29931292
    471411 6gsj:A8 (2.96) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 29931292
    471412 6gsj:AA (2.96) BS01 rna ? GO:0000028 ... Q5SHP2 29931292
    471413 6gsj:AI (2.96) BS01 rna ? GO:0000028 ... Q5SHP2 29931292
    471414 6gsj:B5 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP0 29931292
    471415 6gsj:B5 (2.96) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHP0 29931292
    471416 6gsj:B8 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60490 29931292
    471417 6gsj:B8 (2.96) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60490 29931292
    471418 6gsj:BA (2.96) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80380 29931292
    471419 6gsj:BA (2.96) BS02 MG ? GO:0003723 ... P80380 29931292
    471420 6gsj:BI (2.96) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80380 29931292
    471421 6gsj:BI (2.96) BS02 MG ? GO:0003723 ... P80380 29931292
    471422 6gsj:C5 (2.96) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP9 29931292
    471423 6gsj:C8 (2.96) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60491 29931292
    471424 6gsj:C8 (2.96) BS02 MG ? GO:0000027 ... P60491 29931292
    471425 6gsj:D5 (2.96) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHZ1 29931292
    471426 6gsj:D5 (2.96) BS02 rna ? GO:0003723 ... Q5SHZ1 29931292
    471427 6gsj:D8 (2.96) BS01 rna ? GO:0003723 ... P60492 29931292
    471428 6gsj:D8 (2.96) BS02 MG ? GO:0003723 ... P60492 29931292
    471429 6gsj:E5 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60493 29931292
    471430 6gsj:E5 (2.96) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60493 29931292
    471431 6gsj:E8 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP3 29931292
    471432 6gsj:F5 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60494 29931292
    471433 6gsj:F8 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP0 29931292
    471434 6gsj:G5 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP6 29931292
    471435 6gsj:G8 (2.96) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP9 29931292
    471436 6gsj:H5 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 29931292
    471437 6gsj:H5 (2.96) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 29931292
    471438 6gsj:H8 (2.96) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHZ1 29931292
    471439 6gsj:I8 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60493 29931292
    471440 6gsj:I8 (2.96) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60493 29931292
    471441 6gsj:J5 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80339 29931292
    471442 6gsj:J8 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60494 29931292
    471443 6gsj:K8 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP6 29931292
    471444 6gsj:L5 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80340 29931292
    471445 6gsj:L8 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 29931292
    471446 6gsj:L8 (2.96) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 29931292
    471447 6gsj:M5 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SKU1 29931292
    471448 6gsj:M8 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJE1 29931292
    471449 6gsj:M8 (2.96) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SJE1 29931292
    471450 6gsj:N8 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80339 29931292
    471451 6gsj:P8 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80340 29931292
    471452 6gsj:Q8 (2.96) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SKU1 29931292
    471453 6gsk:11 (3.36) BS01 rna ? GO:0002181 ... P60405 29931292
    471454 6gsk:11 (3.36) BS02 MG ? GO:0002181 ... P60405 29931292
    471455 6gsk:11 (3.36) BS03 MG ? GO:0002181 ... P60405 29931292
    471456 6gsk:12 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80371 29931292
    471457 6gsk:15 (3.36) BS01 rna ? GO:0003729 ... P60488 29931292
    471458 6gsk:19 (3.36) BS01 rna ? GO:0002181 ... P60405 29931292
    471459 6gsk:19 (3.36) BS02 rna ? GO:0002181 ... P60405 29931292
    471460 6gsk:19 (3.36) BS03 MG ? GO:0002181 ... P60405 29931292
    471461 6gsk:1A (3.36) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN7 29931292
    471462 6gsk:1E (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80371 29931292
    471463 6gsk:1I (3.36) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN7 29931292
    471464 6gsk:21 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN8 29931292
    471465 6gsk:21 (3.36) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHN8 29931292
    471466 6gsk:22 (3.36) BS01 rna ? GO:0003676 ... P80372 29931292
    471467 6gsk:22 (3.36) BS02 rna ? GO:0003676 ... P80372 29931292
    471468 6gsk:25 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 29931292
    471469 6gsk:25 (3.36) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 29931292
    471470 6gsk:29 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN8 29931292
    471471 6gsk:2A (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80376 29931292
    471472 6gsk:2A (3.36) BS02 MG ? GO:0003735 ... P80376 29931292
    471473 6gsk:2E (3.36) BS01 rna ? GO:0003676 ... P80372 29931292
    471474 6gsk:2I (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80376 29931292
    471475 6gsk:31 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN9 29931292
    471476 6gsk:32 (3.36) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80373 29931292
    471477 6gsk:32 (3.36) BS02 MG ? GO:0003723 ... P80373 29931292
    471478 6gsk:32 (3.36) BS03 SF4 ? GO:0003723 ... P80373 29931292
    471479 6gsk:35 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 29931292
    471480 6gsk:39 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN9 29931292
    471481 6gsk:39 (3.36) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHN9 29931292
    471482 6gsk:3A (3.36) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN3 29931292
    471483 6gsk:3E (3.36) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80373 29931292
    471484 6gsk:3E (3.36) BS02 rna ? GO:0003723 ... P80373 29931292
    471485 6gsk:3E (3.36) BS03 SF4 ? GO:0003723 ... P80373 29931292
    471486 6gsk:3I (3.36) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN3 29931292
    471487 6gsk:3I (3.36) BS02 MG ? GO:0000049 ... Q5SHN3 29931292
    471488 6gsk:41 (3.36) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 29931292
    471489 6gsk:41 (3.36) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 29931292
    471490 6gsk:41 (3.36) BS03 MG ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 29931292
    471491 6gsk:42 (3.36) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 29931292
    471492 6gsk:42 (3.36) BS02 rna ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 29931292
    471493 6gsk:42 (3.36) BS03 MG ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 29931292
    471494 6gsk:45 (3.36) BS01 rna ? GO:0000049 ... P60489 29931292
    471495 6gsk:45 (3.36) BS02 rna ? GO:0000049 ... P60489 29931292
    471496 6gsk:45 (3.36) BS03 rna ? GO:0000049 ... P60489 29931292
    471497 6gsk:45 (3.36) BS04 MG ? GO:0000049 ... P60489 29931292
    471498 6gsk:49 (3.36) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 29931292
    471499 6gsk:49 (3.36) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 29931292
    471500 6gsk:49 (3.36) BS03 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 29931292
    471501 6gsk:4A (3.36) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80377 29931292
    471502 6gsk:4E (3.36) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 29931292
    471503 6gsk:4E (3.36) BS02 rna ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 29931292
    471504 6gsk:4I (3.36) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80377 29931292
    471505 6gsk:51 (3.36) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0DOY8 29931292
    471506 6gsk:52 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLP8 29931292
    471507 6gsk:55 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q9Z9H5 29931292
    471508 6gsk:58 (3.36) BS01 rna ? GO:0003729 ... P60488 29931292
    471509 6gsk:59 (3.36) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0DOY8 29931292
    471510 6gsk:5A (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY6 29931292
    471511 6gsk:5A (3.36) BS02 ZN ? GO:0003735 ... P0DOY6 29931292
    471512 6gsk:5E (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLP8 29931292
    471513 6gsk:5I (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY6 29931292
    471514 6gsk:5I (3.36) BS02 MG ? GO:0003735 ... P0DOY6 29931292
    471515 6gsk:5I (3.36) BS03 ZN ? GO:0003735 ... P0DOY6 29931292
    471516 6gsk:61 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ1 29931292
    471517 6gsk:62 (3.36) BS01 rna ? GO:0000049 ... P17291 29931292
    471518 6gsk:65 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 29931292
    471519 6gsk:65 (3.36) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 29931292
    471520 6gsk:68 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 29931292
    471521 6gsk:68 (3.36) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 29931292
    471522 6gsk:69 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ1 29931292
    471523 6gsk:69 (3.36) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ1 29931292
    471524 6gsk:6A (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 29931292
    471525 6gsk:6A (3.36) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 29931292
    471526 6gsk:6E (3.36) BS01 rna ? GO:0000049 ... P17291 29931292
    471527 6gsk:6E (3.36) BS02 rna ? GO:0000049 ... P17291 29931292
    471528 6gsk:6I (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 29931292
    471529 6gsk:6I (3.36) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 29931292
    471530 6gsk:72 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY9 29931292
    471531 6gsk:75 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60490 29931292
    471532 6gsk:75 (3.36) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60490 29931292
    471533 6gsk:78 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 29931292
    471534 6gsk:78 (3.36) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 29931292
    471535 6gsk:7A (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJH3 29931292
    471536 6gsk:7E (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY9 29931292
    471537 6gsk:7I (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJH3 29931292
    471538 6gsk:82 (3.36) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80374 29931292
    471539 6gsk:85 (3.36) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60491 29931292
    471540 6gsk:88 (3.36) BS01 rna ? GO:0000049 ... P60489 29931292
    471541 6gsk:88 (3.36) BS02 rna ? GO:0000049 ... P60489 29931292
    471542 6gsk:8A (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY7 29931292
    471543 6gsk:8E (3.36) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80374 29931292
    471544 6gsk:8E (3.36) BS02 rna ? GO:0000049 ... P80374 29931292
    471545 6gsk:8I (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY7 29931292
    471546 6gsk:95 (3.36) BS01 rna ? GO:0003723 ... P60492 29931292
    471547 6gsk:98 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q9Z9H5 29931292
    471548 6gsk:9A (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ0 29931292
    471549 6gsk:9I (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ0 29931292
    471550 6gsk:A5 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP3 29931292
    471551 6gsk:A8 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 29931292
    471552 6gsk:A8 (3.36) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 29931292
    471553 6gsk:AA (3.36) BS01 rna ? GO:0000028 ... Q5SHP2 29931292
    471554 6gsk:AI (3.36) BS01 rna ? GO:0000028 ... Q5SHP2 29931292
    471555 6gsk:B5 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP0 29931292
    471556 6gsk:B5 (3.36) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHP0 29931292
    471557 6gsk:B8 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60490 29931292
    471558 6gsk:B8 (3.36) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60490 29931292
    471559 6gsk:BA (3.36) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80380 29931292
    471560 6gsk:BA (3.36) BS02 MG ? GO:0003723 ... P80380 29931292
    471561 6gsk:BI (3.36) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80380 29931292
    471562 6gsk:C5 (3.36) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP9 29931292
    471563 6gsk:C8 (3.36) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60491 29931292
    471564 6gsk:C8 (3.36) BS02 MG ? GO:0000027 ... P60491 29931292
    471565 6gsk:D5 (3.36) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHZ1 29931292
    471566 6gsk:D5 (3.36) BS02 rna ? GO:0003723 ... Q5SHZ1 29931292
    471567 6gsk:D8 (3.36) BS01 rna ? GO:0003723 ... P60492 29931292
    471568 6gsk:D8 (3.36) BS02 MG ? GO:0003723 ... P60492 29931292
    471569 6gsk:E5 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60493 29931292
    471570 6gsk:E5 (3.36) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60493 29931292
    471571 6gsk:E5 (3.36) BS03 rna ? GO:0003735 ... P60493 29931292
    471572 6gsk:E8 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP3 29931292
    471573 6gsk:F5 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60494 29931292
    471574 6gsk:F8 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP0 29931292
    471575 6gsk:G5 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP6 29931292
    471576 6gsk:G8 (3.36) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP9 29931292
    471577 6gsk:H5 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 29931292
    471578 6gsk:H5 (3.36) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 29931292
    471579 6gsk:H8 (3.36) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHZ1 29931292
    471580 6gsk:I8 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60493 29931292
    471581 6gsk:I8 (3.36) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60493 29931292
    471582 6gsk:J5 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80339 29931292
    471583 6gsk:J8 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60494 29931292
    471584 6gsk:J8 (3.36) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60494 29931292
    471585 6gsk:K8 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP6 29931292
    471586 6gsk:L5 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80340 29931292
    471587 6gsk:L8 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 29931292
    471588 6gsk:L8 (3.36) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 29931292
    471589 6gsk:M5 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SKU1 29931292
    471590 6gsk:M8 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJE1 29931292
    471591 6gsk:N8 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80339 29931292
    471592 6gsk:P8 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80340 29931292
    471593 6gsk:Q8 (3.36) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SKU1 29931292
    471594 6gsl:11 (3.16) BS01 rna ? GO:0002181 ... P60405 29931292
    471595 6gsl:12 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80371 29931292
    471596 6gsl:15 (3.16) BS01 rna ? GO:0003729 ... P60488 29931292
    471597 6gsl:19 (3.16) BS01 rna ? GO:0002181 ... P60405 29931292
    471598 6gsl:19 (3.16) BS02 MG ? GO:0002181 ... P60405 29931292
    471599 6gsl:1A (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN7 29931292
    471600 6gsl:1E (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80371 29931292

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).