SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2349 2350 2351 2352 2353 2354 2355 2356 2357 2358 2359 2360 2361 2362 2363 2364 2365 2366 2367 2368 2369 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    471601 6gsl:1I (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN7 29931292
    471602 6gsl:21 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN8 29931292
    471603 6gsl:21 (3.16) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHN8 29931292
    471604 6gsl:22 (3.16) BS01 rna ? GO:0003676 ... P80372 29931292
    471605 6gsl:25 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 29931292
    471606 6gsl:25 (3.16) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 29931292
    471607 6gsl:29 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN8 29931292
    471608 6gsl:29 (3.16) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHN8 29931292
    471609 6gsl:2A (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80376 29931292
    471610 6gsl:2A (3.16) BS02 MG ? GO:0003735 ... P80376 29931292
    471611 6gsl:2E (3.16) BS01 rna ? GO:0003676 ... P80372 29931292
    471612 6gsl:2I (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80376 29931292
    471613 6gsl:2I (3.16) BS02 MG ? GO:0003735 ... P80376 29931292
    471614 6gsl:31 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN9 29931292
    471615 6gsl:32 (3.16) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80373 29931292
    471616 6gsl:32 (3.16) BS02 SF4 ? GO:0003723 ... P80373 29931292
    471617 6gsl:35 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 29931292
    471618 6gsl:38 (3.16) BS01 rna ? GO:0005840 ... Q8VVE3 29931292
    471619 6gsl:39 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN9 29931292
    471620 6gsl:39 (3.16) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHN9 29931292
    471621 6gsl:3A (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN3 29931292
    471622 6gsl:3E (3.16) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80373 29931292
    471623 6gsl:3E (3.16) BS02 MG ? GO:0003723 ... P80373 29931292
    471624 6gsl:3E (3.16) BS03 SF4 ? GO:0003723 ... P80373 29931292
    471625 6gsl:3I (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN3 29931292
    471626 6gsl:3I (3.16) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN3 29931292
    471627 6gsl:41 (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 29931292
    471628 6gsl:41 (3.16) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 29931292
    471629 6gsl:41 (3.16) BS03 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 29931292
    471630 6gsl:41 (3.16) BS04 MG ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 29931292
    471631 6gsl:42 (3.16) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 29931292
    471632 6gsl:45 (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... P60489 29931292
    471633 6gsl:45 (3.16) BS02 rna ? GO:0000049 ... P60489 29931292
    471634 6gsl:45 (3.16) BS03 rna ? GO:0000049 ... P60489 29931292
    471635 6gsl:45 (3.16) BS04 rna ? GO:0000049 ... P60489 29931292
    471636 6gsl:45 (3.16) BS05 MG ? GO:0000049 ... P60489 29931292
    471637 6gsl:48 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLP6 29931292
    471638 6gsl:49 (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 29931292
    471639 6gsl:49 (3.16) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 29931292
    471640 6gsl:49 (3.16) BS03 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 29931292
    471641 6gsl:4A (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80377 29931292
    471642 6gsl:4E (3.16) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 29931292
    471643 6gsl:4I (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80377 29931292
    471644 6gsl:4I (3.16) BS02 rna ? GO:0000049 ... P80377 29931292
    471645 6gsl:51 (3.16) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0DOY8 29931292
    471646 6gsl:52 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLP8 29931292
    471647 6gsl:55 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q9Z9H5 29931292
    471648 6gsl:58 (3.16) BS01 rna ? GO:0003729 ... P60488 29931292
    471649 6gsl:59 (3.16) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0DOY8 29931292
    471650 6gsl:5A (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY6 29931292
    471651 6gsl:5A (3.16) BS02 ZN ? GO:0003735 ... P0DOY6 29931292
    471652 6gsl:5E (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLP8 29931292
    471653 6gsl:5E (3.16) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SLP8 29931292
    471654 6gsl:5I (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY6 29931292
    471655 6gsl:5I (3.16) BS02 ZN ? GO:0003735 ... P0DOY6 29931292
    471656 6gsl:61 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ1 29931292
    471657 6gsl:62 (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... P17291 29931292
    471658 6gsl:65 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 29931292
    471659 6gsl:65 (3.16) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 29931292
    471660 6gsl:68 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 29931292
    471661 6gsl:68 (3.16) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 29931292
    471662 6gsl:69 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ1 29931292
    471663 6gsl:69 (3.16) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ1 29931292
    471664 6gsl:6A (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 29931292
    471665 6gsl:6A (3.16) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 29931292
    471666 6gsl:6E (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... P17291 29931292
    471667 6gsl:6E (3.16) BS02 rna ? GO:0000049 ... P17291 29931292
    471668 6gsl:6I (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 29931292
    471669 6gsl:6I (3.16) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 29931292
    471670 6gsl:71 (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SLP7 29931292
    471671 6gsl:71 (3.16) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q5SLP7 29931292
    471672 6gsl:72 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY9 29931292
    471673 6gsl:75 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60490 29931292
    471674 6gsl:75 (3.16) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60490 29931292
    471675 6gsl:78 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 29931292
    471676 6gsl:78 (3.16) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 29931292
    471677 6gsl:79 (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SLP7 29931292
    471678 6gsl:7A (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJH3 29931292
    471679 6gsl:7E (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY9 29931292
    471680 6gsl:7I (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJH3 29931292
    471681 6gsl:82 (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80374 29931292
    471682 6gsl:85 (3.16) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60491 29931292
    471683 6gsl:88 (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... P60489 29931292
    471684 6gsl:88 (3.16) BS02 rna ? GO:0000049 ... P60489 29931292
    471685 6gsl:88 (3.16) BS03 rna ? GO:0000049 ... P60489 29931292
    471686 6gsl:8A (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY7 29931292
    471687 6gsl:8E (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80374 29931292
    471688 6gsl:8E (3.16) BS02 rna ? GO:0000049 ... P80374 29931292
    471689 6gsl:8I (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY7 29931292
    471690 6gsl:95 (3.16) BS01 rna ? GO:0003723 ... P60492 29931292
    471691 6gsl:98 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q9Z9H5 29931292
    471692 6gsl:9A (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ0 29931292
    471693 6gsl:9I (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ0 29931292
    471694 6gsl:A5 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP3 29931292
    471695 6gsl:A8 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 29931292
    471696 6gsl:A8 (3.16) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 29931292
    471697 6gsl:AA (3.16) BS01 rna ? GO:0000028 ... Q5SHP2 29931292
    471698 6gsl:AI (3.16) BS01 rna ? GO:0000028 ... Q5SHP2 29931292
    471699 6gsl:B5 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP0 29931292
    471700 6gsl:B8 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60490 29931292
    471701 6gsl:B8 (3.16) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60490 29931292
    471702 6gsl:BA (3.16) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80380 29931292
    471703 6gsl:BI (3.16) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80380 29931292
    471704 6gsl:C5 (3.16) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP9 29931292
    471705 6gsl:C8 (3.16) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60491 29931292
    471706 6gsl:D5 (3.16) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHZ1 29931292
    471707 6gsl:D5 (3.16) BS02 rna ? GO:0003723 ... Q5SHZ1 29931292
    471708 6gsl:D5 (3.16) BS03 rna ? GO:0003723 ... Q5SHZ1 29931292
    471709 6gsl:D8 (3.16) BS01 rna ? GO:0003723 ... P60492 29931292
    471710 6gsl:E5 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60493 29931292
    471711 6gsl:E5 (3.16) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60493 29931292
    471712 6gsl:E5 (3.16) BS03 rna ? GO:0003735 ... P60493 29931292
    471713 6gsl:E8 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP3 29931292
    471714 6gsl:F5 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60494 29931292
    471715 6gsl:F8 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP0 29931292
    471716 6gsl:G5 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP6 29931292
    471717 6gsl:G8 (3.16) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP9 29931292
    471718 6gsl:H5 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 29931292
    471719 6gsl:H5 (3.16) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 29931292
    471720 6gsl:H8 (3.16) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHZ1 29931292
    471721 6gsl:I8 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60493 29931292
    471722 6gsl:I8 (3.16) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60493 29931292
    471723 6gsl:I8 (3.16) BS03 rna ? GO:0003735 ... P60493 29931292
    471724 6gsl:J5 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80339 29931292
    471725 6gsl:J8 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60494 29931292
    471726 6gsl:K8 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP6 29931292
    471727 6gsl:L5 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80340 29931292
    471728 6gsl:L8 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 29931292
    471729 6gsl:L8 (3.16) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 29931292
    471730 6gsl:M5 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SKU1 29931292
    471731 6gsl:M8 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJE1 29931292
    471732 6gsl:N8 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80339 29931292
    471733 6gsl:O8 (3.16) BS01 rna ? GO:0000049 ... P35871 29931292
    471734 6gsl:P8 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80340 29931292
    471735 6gsl:Q8 (3.16) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SKU1 29931292
    471736 6gsm:A (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CN12 34648019
    471737 6gsm:B (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CWD0 34648019
    471738 6gsm:C (5.15) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q6CKL3 34648019
    471739 6gsm:D (5.15) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q6CRK7 34648019
    471740 6gsm:E (5.15) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q6CWJ2 34648019
    471741 6gsm:F (5.15) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q6CRA3 34648019
    471742 6gsm:G (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CM04 34648019
    471743 6gsm:H (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CTD6 34648019
    471744 6gsm:I (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CMG3 34648019
    471745 6gsm:J (5.15) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q6CM18 34648019
    471746 6gsm:K (5.15) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q6CVZ5 34648019
    471747 6gsm:L (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CX80 34648019
    471748 6gsm:M (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CLU4 34648019
    471749 6gsm:N (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CJK0 34648019
    471750 6gsm:O (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... P27069 34648019
    471751 6gsm:P (5.15) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q6CKV4 34648019
    471752 6gsm:Q (5.15) BS01 rna ? GO:0000462 ... Q875N2 34648019
    471753 6gsm:Q (5.15) BS02 MG ? GO:0000462 ... Q875N2 34648019
    471754 6gsm:R (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CWU3 34648019
    471755 6gsm:S (5.15) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q6CWT9 34648019
    471756 6gsm:T (5.15) BS01 rna ? GO:0000028 ... Q6CXM0 34648019
    471757 6gsm:U (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CIM1 34648019
    471758 6gsm:V (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CXT6 34648019
    471759 6gsm:W (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CW21 34648019
    471760 6gsm:X (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... F2Z602 34648019
    471761 6gsm:Y (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CU44 34648019
    471762 6gsm:Z (5.15) BS01 rna ? N/A Q6CW78 34648019
    471763 6gsm:a (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CS01 34648019
    471764 6gsm:b (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CNL2 34648019
    471765 6gsm:c (5.15) BS01 rna ? GO:0000028 ... P33285 34648019
    471766 6gsm:d (5.15) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q6CPG3 34648019
    471767 6gsm:e (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CUH5 34648019
    471768 6gsm:f (5.15) BS01 rna ? GO:0003735 ... P69061 34648019
    471769 6gsm:g (5.15) BS01 rna ? GO:0006417 ... Q6CNI7 34648019
    471770 6gsm:i (5.15) BS01 rna ? GO:0003723 ... P38912 34648019
    471771 6gsm:j (5.15) BS01 rna ? GO:0003676 ... P20459 34648019
    471772 6gsm:k (5.15) BS01 rna 3.6.5.3 GO:0000049 ... P32481 34648019
    471773 6gsm:k (5.15) BS02 7NO 3.6.5.3 GO:0000049 ... P32481 34648019
    471774 6gsm:l (5.15) BS01 rna ? GO:0003743 ... P09064 34648019
    471775 6gsm:l (5.15) BS02 ZN ? GO:0003743 ... P09064 34648019
    471776 6gsm:m (5.15) BS01 rna ? GO:0003743 ... P32911 34648019
    471777 6gsm:p (5.15) BS01 rna ? GO:0003676 ... P06103 34648019
    471778 6gsm:q (5.15) BS01 rna ? GO:0003723 ... P32497 34648019
    471779 6gsn:A (5.75) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CN12 34648019
    471780 6gsn:B (5.75) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CWD0 34648019
    471781 6gsn:C (5.75) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q6CKL3 34648019
    471782 6gsn:D (5.75) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q6CRK7 34648019
    471783 6gsn:E (5.75) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q6CWJ2 34648019
    471784 6gsn:F (5.75) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q6CRA3 34648019
    471785 6gsn:G (5.75) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CM04 34648019
    471786 6gsn:H (5.75) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CTD6 34648019
    471787 6gsn:I (5.75) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CMG3 34648019
    471788 6gsn:J (5.75) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q6CM18 34648019
    471789 6gsn:K (5.75) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q6CVZ5 34648019
    471790 6gsn:L (5.75) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CX80 34648019
    471791 6gsn:M (5.75) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CLU4 34648019
    471792 6gsn:N (5.75) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CJK0 34648019
    471793 6gsn:O (5.75) BS01 rna ? GO:0003735 ... P27069 34648019
    471794 6gsn:P (5.75) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q6CKV4 34648019
    471795 6gsn:Q (5.75) BS01 rna ? GO:0000462 ... Q875N2 34648019
    471796 6gsn:R (5.75) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CWU3 34648019
    471797 6gsn:S (5.75) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q6CWT9 34648019
    471798 6gsn:T (5.75) BS01 rna ? GO:0000028 ... Q6CXM0 34648019
    471799 6gsn:U (5.75) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CIM1 34648019
    471800 6gsn:V (5.75) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q6CXT6 34648019

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).