SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2351 2352 2353 2354 2355 2356 2357 2358 2359 2360 2361 2362 2363 2364 2365 2366 2367 2368 2369 2370 2371 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    472001 6guj:A (2.102) BS04 8M0 ? GO:0005737 ... P84308 30367742
    472002 6guj:B (2.102) BS01 ATP ? GO:0005737 ... P84253 30367742
    472003 6guj:B (2.102) BS02 8M0 ? GO:0005737 ... P84253 30367742
    472004 6guk:A (1.3) BS01 FC8 2.7.11.22 GO:0000082 ... P24941 30472117 MOAD: Kd=715nM
    BindingDB: IC50=26nM
    472005 6guq:A (2.385) BS01 BGC ? GO:0030246 ... W8QN64 N/A
    472006 6gur:A (2.1) BS01 FN8 3.1.-.- GO:0005737 ... Q4WF29 30070018
    472007 6gur:B (2.1) BS01 FN8 3.1.-.- GO:0005737 ... Q4WF29 30070018
    472008 6guu:A (2.95) BS01 ZN 3.6.4.12 N/A Q8TDI0 N/A
    472009 6guu:A (2.95) BS02 ZN 3.6.4.12 N/A Q8TDI0 N/A
    472010 6guu:B (2.95) BS01 ZN 3.6.4.12 N/A Q8TDI0 N/A
    472011 6guu:B (2.95) BS02 ZN 3.6.4.12 N/A Q8TDI0 N/A
    472012 6gux:A (1.3) BS01 RET ? GO:0005216 ... P96787 33504778
    472013 6gux:A (1.3) BS02 CA ? GO:0005216 ... P96787 33504778
    472014 6guy:A (2.2) BS01 RET ? GO:0005216 ... P96787 N/A
    472015 6guy:A (2.2) BS02 CA ? GO:0005216 ... P96787 N/A
    472016 6guz:A (1.9) BS01 RET ? GO:0005216 ... P96787 N/A
    472017 6guz:A (1.9) BS02 CA ? GO:0005216 ... P96787 N/A
    472018 6gv2:A (2.101) BS01 SSH 4.1.2.55 GO:0008674 ... O54288 N/A
    472019 6gv2:B (2.101) BS01 SSH 4.1.2.55 GO:0008674 ... O54288 N/A
    472020 6gv2:B (2.101) BS02 GXV 4.1.2.55 GO:0008674 ... O54288 N/A
    472021 6gv4:C (2.8) BS01 rna ? N/A A0A291FGQ4 30463974
    472022 6gv6:A (-1.00) BS01 CD ? GO:0046872 ... J2EKT7 30191219
    472023 6gv6:A (-1.00) BS02 CD ? GO:0046872 ... J2EKT7 30191219
    472024 6gv6:A (-1.00) BS03 CD ? GO:0046872 ... J2EKT7 30191219
    472025 6gv6:A (-1.00) BS04 CD ? GO:0046872 ... J2EKT7 30191219
    472026 6gv7:A (-1.00) BS01 CD ? GO:0046872 ... J2EKT7 30191219
    472027 6gv7:A (-1.00) BS02 CD ? GO:0046872 ... J2EKT7 30191219
    472028 6gv7:A (-1.00) BS03 CD ? GO:0046872 ... J2EKT7 30191219
    472029 6gv7:A (-1.00) BS04 CD ? GO:0046872 ... J2EKT7 30191219
    472030 6gva:A (2.15) BS01 FCQ 2.7.11.22 GO:0000082 ... P24941 30943029 MOAD: ic50=5nM
    472031 6gvc:A (2.6) BS01 LAB 3.6.4.- GO:0000287 ... P68135 31209295 BindingDB: IC50=8470nM
    472032 6gvc:A (2.6) BS02 ATP 3.6.4.- GO:0000287 ... P68135 31209295
    472033 6gvc:B (2.6) BS01 LAB 3.6.4.- GO:0000287 ... P68135 31209295 BindingDB: IC50=8470nM
    472034 6gvc:B (2.6) BS02 ATP 3.6.4.- GO:0000287 ... P68135 31209295
    472035 6gvc:C (2.6) BS01 LAB 3.6.4.- GO:0000287 ... P68135 31209295 BindingDB: IC50=8470nM
    472036 6gvc:C (2.6) BS02 ATP 3.6.4.- GO:0000287 ... P68135 31209295
    472037 6gvc:D (2.6) BS01 LAB 3.6.4.- GO:0000287 ... P68135 31209295 BindingDB: IC50=8470nM
    472038 6gvc:D (2.6) BS02 ATP 3.6.4.- GO:0000287 ... P68135 31209295
    472039 6gvd:A (1.22) BS01 MG 3.2.1.22 GO:0003824 ... G4FEF4 30104598
    472040 6gvd:A (1.22) BS02 MG 3.2.1.22 GO:0003824 ... G4FEF4 30104598
    472041 6gvd:A (1.22) BS03 FDK 3.2.1.22 GO:0003824 ... G4FEF4 30104598
    472042 6gve:A (3.9) BS01 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    472043 6gve:C (3.9) BS01 NAD ? GO:0080153 ... Q8DHX3 31570616
    472044 6gve:D (3.9) BS01 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    472045 6gve:E (3.9) BS01 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    472046 6gve:F (3.9) BS01 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    472047 6gve:H (3.9) BS01 NAD ? GO:0080153 ... Q8DHX3 31570616
    472048 6gve:I (3.9) BS01 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    472049 6gve:K (3.9) BS01 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    472050 6gve:M (3.9) BS01 NAD ? GO:0080153 ... Q8DHX3 31570616
    472051 6gve:N (3.9) BS01 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    472052 6gve:O (3.9) BS01 NAD 1.2.1.- GO:0000166 ... Q8DIW5 31570616
    472053 6gve:P (3.9) BS01 NAD ? GO:0080153 ... Q8DHX3 31570616
    472054 6gvf:A (2.5) BS01 FE5 2.7.11.1
    2.7.1.137
    2.7.1.153
    GO:0016301 ... P42336 31749911 MOAD: Ki=28nM
    BindingDB: Kd=15nM, Ki=28nM
    472055 6gvg:A (3.0) BS01 FCZ 2.7.11.1
    2.7.1.137
    2.7.1.153
    GO:0001525 ... P42336 31749911 BindingDB: Ki=990nM
    472056 6gvh:A (2.74) BS01 FDH 2.7.11.1
    2.7.1.137
    2.7.1.153
    GO:0001525 ... P42336 31749911 BindingDB: Ki=920nM
    472057 6gvi:A (2.9) BS01 FDW 2.7.11.1
    2.7.1.137
    2.7.1.153
    GO:0001525 ... P42336 31749911 BindingDB: Ki=150nM
    472058 6gvk:A (1.55) BS01 peptide ? N/A P16144 31006587
    472059 6gvl:A (2.05) BS01 peptide ? N/A P16144 31006587
    472060 6gvm:A (3.5) BS01 GTP ? GO:0000226 ... D0VWZ0 31036638
    472061 6gvm:B (3.5) BS01 GDP ? GO:0003924 ... D0VWY9 31036638
    472062 6gvn:A (2.69) BS01 GTP ? GO:0000226 ... D0VWZ0 31036638
    472063 6gvn:B (2.69) BS01 GTP ? GO:0003924 ... D0VWY9 31036638
    472064 6gvp:A (1.71) BS01 RAM ? N/A Q9AYY6 30044908
    472065 6gvp:A (1.71) BS02 GLC ? N/A Q9AYY6 30044908
    472066 6gvq:B (-1.00) BS01 dna ? N/A Q54324 30595448
    472067 6gvs:A (2.579) BS01 NAP ? GO:0000166 ... Q21A49 30459276
    472068 6gvs:B (2.579) BS01 NAP ? GO:0000166 ... Q21A49 30459276
    472069 6gvs:C (2.579) BS01 NAP ? GO:0000166 ... Q21A49 30459276
    472070 6gvs:D (2.579) BS01 NAP ? GO:0000166 ... Q21A49 30459276
    472071 6gvs:E (2.579) BS01 NAP ? GO:0000166 ... Q21A49 30459276
    472072 6gvs:F (2.579) BS01 NAP ? GO:0000166 ... Q21A49 30459276
    472073 6gvs:G (2.579) BS01 NAP ? GO:0000166 ... Q21A49 30459276
    472074 6gvs:H (2.579) BS01 NAP ? GO:0000166 ... Q21A49 30459276
    472075 6gvs:I (2.579) BS01 NAP ? GO:0000166 ... Q21A49 30459276
    472076 6gvs:J (2.579) BS01 NAP ? GO:0000166 ... Q21A49 30459276
    472077 6gvt:B (-1.00) BS01 dna ? N/A Q54324 30595448
    472078 6gvt:B (-1.00) BS02 ATP ? N/A Q54324 30595448
    472079 6gvt:B (-1.00) BS03 ATP ? N/A Q54324 30595448
    472080 6gvt:B (-1.00) BS04 MG ? N/A Q54324 30595448
    472081 6gvu:B (-1.00) BS01 dna ? N/A Q54324 30595448
    472082 6gvw:B (3.75) BS01 ZN 3.4.19.- GO:0000151 ... P46737 31253574
    472083 6gvw:G (3.75) BS01 ZN 3.4.19.- GO:0000151 ... P46737 31253574
    472084 6gvx:A (2.24) BS01 TAK 2.7.10.2
    2.7.11.1
    GO:0004672 ... Q14680 31108049 MOAD: Ki=24nM
    472085 6gvx:B (2.24) BS01 TAK 2.7.10.2
    2.7.11.1
    GO:0004672 ... Q14680 31108049 MOAD: Ki=24nM
    472086 6gvy:A (2.2) BS01 rna 2.7.7.48
    3.4.22.28
    3.4.22.46
    3.6.1.15
    GO:0003723 ... P03311 30068642
    472087 6gvy:A (2.2) BS02 rna 2.7.7.48
    3.4.22.28
    3.4.22.46
    3.6.1.15
    GO:0003723 ... P03311 30068642
    472088 6gvz:A (1.54) BS01 CHO ? N/A J9XXB7 30355683 MOAD: Kd=0.4uM
    472089 6gw0:A (1.4) BS01 TUD ? N/A J9XXB7 30355683 MOAD: Kd=0.000000064M
    472090 6gw1:A (1.9) BS01 CHO ? N/A Q5F4T5 30355683 MOAD: Kd=0.000000064M
    472091 6gw1:B (1.9) BS01 CHO ? N/A Q5F4T5 30355683 MOAD: Kd=0.000000064M
    472092 6gw2:A (2.05) BS01 TUD ? N/A Q5F4T5 30355683 MOAD: Kd=0.0000123M
    472093 6gw2:B (2.05) BS01 TUD ? N/A Q5F4T5 30355683 MOAD: Kd=0.0000123M
    472094 6gw3:A (1.39) BS01 COA 2.3.1.206
    4.4.1.-
    GO:0009058 ... B1Q2B6 N/A
    472095 6gw3:B (1.39) BS01 COA 2.3.1.206
    4.4.1.-
    GO:0009058 ... B1Q2B6 N/A
    472096 6gw3:C (1.39) BS01 COA 2.3.1.206
    4.4.1.-
    GO:0009058 ... B1Q2B6 N/A
    472097 6gw3:D (1.39) BS01 COA 2.3.1.206
    4.4.1.-
    GO:0009058 ... B1Q2B6 N/A
    472098 6gw4:A (2.295) BS01 CHO ? N/A A0ZNP3 30355683 MOAD: Kd=0.000000064M
    472099 6gw8:A (-1.00) BS01 ZN ? GO:0046872 ... J2EKT7 30191219
    472100 6gw8:A (-1.00) BS02 ZN ? GO:0046872 ... J2EKT7 30191219
    472101 6gw9:A (2.1) BS01 MG ? GO:0005509 ... C0HJY1 30154468
    472102 6gw9:A (2.1) BS02 CA ? GO:0005509 ... C0HJY1 30154468
    472103 6gwb:A (1.9) BS01 ATP ? GO:0005737 ... P84308 30278367
    472104 6gwb:A (1.9) BS02 MG ? GO:0005737 ... P84308 30278367
    472105 6gwc:A (2.6) BS01 GTP N/A GO:0005200 ... N/A 30661854
    472106 6gwc:B (2.6) BS01 GTP ? GO:0003924 ... D0VWY9 30661854
    472107 6gwd:A (3.2) BS01 GTP N/A GO:0005200 ... N/A 30661854
    472108 6gwd:B (3.2) BS01 GDP ? GO:0003924 ... D0VWY9 30661854
    472109 6gwd:C (3.2) BS01 GTP N/A GO:0005200 ... N/A 30661854
    472110 6gwd:D (3.2) BS01 GDP ? GO:0003924 ... D0VWY9 30661854
    472111 6gwd:E (3.2) BS01 GTP N/A GO:0005200 ... N/A 30661854
    472112 6gwd:F (3.2) BS01 GDP ? GO:0003924 ... D0VWY9 30661854
    472113 6gwe:A (2.3) BS01 ODB 3.4.21.5 GO:0004252 ... P00734 31457083 MOAD: Ki=42nM
    472114 6gwe:H (2.3) BS01 ODB 3.4.21.5 GO:0004252 ... P00734 31457083 MOAD: Ki=42nM
    472115 6gwf:A (1.72) BS01 FEQ 3.2.1.22 GO:0003824 ... G4FEF4 30104598
    472116 6gwf:A (1.72) BS02 MG 3.2.1.22 GO:0003824 ... G4FEF4 30104598
    472117 6gwg:A (1.77) BS01 FEK 3.2.1.22 GO:0003824 ... G4FEF4 30104598
    472118 6gwg:A (1.77) BS02 MG 3.2.1.22 GO:0003824 ... G4FEF4 30104598
    472119 6gwi:A (2.0) BS01 PLP 2.6.1.- GO:0005829 ... E1V913 31360401
    472120 6gwi:A (2.0) BS02 PLP 2.6.1.- GO:0005829 ... E1V913 31360401
    472121 6gwi:B (2.0) BS01 PLP 2.6.1.- GO:0005829 ... E1V913 31360401
    472122 6gwj:K (1.95) BS01 MG 2.3.1.234 GO:0000408 ... Q9NPF4 31481669
    472123 6gwr:A (2.07) BS01 FEW 2.7.10.1 GO:0004672 ... Q08345 30075624 MOAD: Kd=7.9nM
    BindingDB: Kd=7.9nM, IC50=9.4nM
    472124 6gwr:B (2.07) BS01 FEW 2.7.10.1 GO:0004672 ... Q08345 30075624 MOAD: Kd=7.9nM
    BindingDB: Kd=7.9nM, IC50=9.4nM
    472125 6gws:A (2.9) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P12004 30102405
    472126 6gws:A (2.9) BS02 peptide ? GO:0000122 ... P12004 30102405
    472127 6gws:B (2.9) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P12004 30102405
    472128 6gws:C (2.9) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P12004 30102405
    472129 6gws:C (2.9) BS02 peptide ? GO:0000122 ... P12004 30102405
    472130 6gwt:0 (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N4 30076302
    472131 6gwt:1 (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N9 30076302
    472132 6gwt:2 (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7P5 30076302
    472133 6gwt:3 (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7Q1 30076302
    472134 6gwt:4 (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7Q6 30076302
    472135 6gwt:5 (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7J3 30076302
    472136 6gwt:C (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60422 30076302
    472137 6gwt:D (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60438 30076302
    472138 6gwt:E (3.8) BS01 rna ? GO:0001070 ... P60723 30076302
    472139 6gwt:E (3.8) BS02 peptide ? GO:0001070 ... P60723 30076302
    472140 6gwt:F (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P62399 30076302
    472141 6gwt:F (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P62399 30076302
    472142 6gwt:F (3.8) BS03 rna ? GO:0000027 ... P62399 30076302
    472143 6gwt:G (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG55 30076302
    472144 6gwt:H (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7R1 30076302
    472145 6gwt:I (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7J7 30076302
    472146 6gwt:J (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AA10 30076302
    472147 6gwt:K (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 30076302
    472148 6gwt:K (3.8) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 30076302
    472149 6gwt:L (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P02413 30076302
    472150 6gwt:M (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADY7 30076302
    472151 6gwt:M (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0ADY7 30076302
    472152 6gwt:N (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG44 30076302
    472153 6gwt:O (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C018 30076302
    472154 6gwt:O (3.8) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0C018 30076302
    472155 6gwt:P (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 30076302
    472156 6gwt:P (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 30076302
    472157 6gwt:Q (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7L3 30076302
    472158 6gwt:R (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AG48 30076302
    472159 6gwt:S (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61175 30076302
    472160 6gwt:T (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADZ0 30076302
    472161 6gwt:U (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60624 30076302
    472162 6gwt:V (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P68919 30076302
    472163 6gwt:W (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 30076302
    472164 6gwt:W (3.8) BS02 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 30076302
    472165 6gwt:X (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M2 30076302
    472166 6gwt:Y (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M6 30076302
    472167 6gwt:Z (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 30076302
    472168 6gwt:Z (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 30076302
    472169 6gwt:b (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7V0 30076302
    472170 6gwt:c (3.8) BS01 rna ? GO:0003676 ... P0A7V3 30076302
    472171 6gwt:d (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7V8 30076302
    472172 6gwt:e (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7W1 30076302
    472173 6gwt:f (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P02358 30076302
    472174 6gwt:g (3.8) BS01 rna ? GO:0003723 ... P02359 30076302
    472175 6gwt:h (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7W7 30076302
    472176 6gwt:i (3.8) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7X3 30076302
    472177 6gwt:j (3.8) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7R5 30076302
    472178 6gwt:k (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7R9 30076302
    472179 6gwt:l (3.8) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7S3 30076302
    472180 6gwt:m (3.8) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7S9 30076302
    472181 6gwt:n (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0AG59 30076302
    472182 6gwt:o (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0ADZ4 30076302
    472183 6gwt:o (3.8) BS02 rna ? GO:0000028 ... P0ADZ4 30076302
    472184 6gwt:p (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7T3 30076302
    472185 6gwt:q (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0AG63 30076302
    472186 6gwt:r (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7T7 30076302
    472187 6gwt:s (3.8) BS01 rna ? GO:0003723 ... P0A7U3 30076302
    472188 6gwt:t (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7U7 30076302
    472189 6gwt:u (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P68679 30076302
    472190 6gwt:v (3.8) BS01 rna ? GO:0003747 ... P0A7I0 30076302
    472191 6gwt:v (3.8) BS02 rna ? GO:0003747 ... P0A7I0 30076302
    472192 6gwt:v (3.8) BS03 rna ? GO:0003747 ... P0A7I0 30076302
    472193 6gwt:v (3.8) BS04 rna ? GO:0003747 ... P0A7I0 30076302
    472194 6gwt:w (3.8) BS01 rna ? GO:0003924 ... P0A7I4 30076302
    472195 6gwu:A (2.2) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q5AJ71 30367660
    472196 6gwu:B (2.2) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q5AJ71 30367660
    472197 6gwu:C (2.2) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q5AJ71 30367660
    472198 6gwu:D (2.2) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q5AJ71 30367660
    472199 6gwv:A (2.8) BS01 ATP ? GO:0005737 ... P84308 30367742
    472200 6gwv:P (2.8) BS01 ATP ? GO:0005737 ... P84308 30367742

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).