SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2352 2353 2354 2355 2356 2357 2358 2359 2360 2361 2362 2363 2364 2365 2366 2367 2368 2369 2370 2371 2372 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    472201 6gx0:A (1.25) BS01 GDU 2.4.1.37
    2.4.1.40
    GO:0005975 ... P16442 N/A
    472202 6gx1:A (1.6) BS01 UD2 2.4.1.37
    2.4.1.40
    GO:0005975 ... P16442 N/A
    472203 6gx1:A (1.6) BS02 UDP 2.4.1.37
    2.4.1.40
    GO:0005975 ... P16442 N/A
    472204 6gx2:A (1.07) BS01 MN 2.4.1.37
    2.4.1.40
    GO:0005975 ... P16442 N/A
    472205 6gx2:A (1.07) BS02 UDP 2.4.1.37
    2.4.1.40
    GO:0005975 ... P16442 N/A
    472206 6gx3:A (2.1) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472207 6gx3:A (2.1) BS02 FF2 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=250nM
    472208 6gx3:A (2.1) BS03 FF2 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=250nM
    472209 6gx3:B (2.1) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472210 6gx3:B (2.1) BS02 FF2 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=250nM
    472211 6gx3:B (2.1) BS03 FF2 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=250nM
    472212 6gx3:C (2.1) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472213 6gx3:C (2.1) BS02 FF2 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=250nM
    472214 6gx3:C (2.1) BS03 FF2 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=250nM
    472215 6gx3:D (2.1) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472216 6gx3:D (2.1) BS02 FF2 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=250nM
    472217 6gx3:D (2.1) BS03 FF2 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=250nM
    472218 6gx4:A (1.9) BS01 FUQ ? GO:0005737 ... P84308 30367742
    472219 6gx4:A (1.9) BS02 ATP ? GO:0005737 ... P84308 30367742
    472220 6gx4:A (1.9) BS03 MN ? GO:0005737 ... P84308 30367742
    472221 6gx4:A (1.9) BS04 FV2 ? GO:0005737 ... P84308 30367742
    472222 6gx4:B (1.9) BS01 ATP ? GO:0005737 ... P84253 30367742
    472223 6gx4:B (1.9) BS02 FUQ ? GO:0005737 ... P84253 30367742
    472224 6gx4:B (1.9) BS03 FUQ ? GO:0005737 ... P84253 30367742
    472225 6gx4:B (1.9) BS04 PO4 ? GO:0005737 ... P84253 30367742
    472226 6gx6:A (2.0) BS01 rna ? GO:0003676 ... O00425 30135093
    472227 6gx7:A (3.19) BS01 GTP ? GO:0000226 ... D0VWZ0 31036638
    472228 6gx7:B (3.19) BS01 GTP ? GO:0003924 ... D0VWY9 31036638
    472229 6gx7:C (3.19) BS01 GTP ? GO:0000226 ... D0VWZ0 31036638
    472230 6gx7:D (3.19) BS01 GTP ? GO:0003924 ... D0VWY9 31036638
    472231 6gx7:D (3.19) BS02 MG ? GO:0003924 ... D0VWY9 31036638
    472232 6gx8:A (1.42) BS01 FH2 3.2.1.22 GO:0003824 ... G4FEF4 30104598
    472233 6gx8:A (1.42) BS02 MG 3.2.1.22 GO:0003824 ... G4FEF4 30104598
    472234 6gx9:A (2.7) BS01 peptide ? GO:0005515 ... Q9Y5L0 30916345
    472235 6gx9:A (2.7) BS02 MG ? GO:0005515 ... Q9Y5L0 30916345
    472236 6gx9:A (2.7) BS03 MG ? GO:0005515 ... Q9Y5L0 30916345
    472237 6gx9:B (2.7) BS01 peptide ? GO:0005515 ... Q9Y5L0 30916345
    472238 6gx9:B (2.7) BS02 MG ? GO:0005515 ... Q9Y5L0 30916345
    472239 6gx9:B (2.7) BS03 MG ? GO:0005515 ... Q9Y5L0 30916345
    472240 6gxa:A (2.1) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472241 6gxa:A (2.1) BS02 TB8 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=60nM
    472242 6gxa:B (2.1) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472243 6gxa:B (2.1) BS02 TB8 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=60nM
    472244 6gxa:C (2.1) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472245 6gxa:C (2.1) BS02 TB8 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=60nM
    472246 6gxa:D (2.1) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472247 6gxa:D (2.1) BS02 TB8 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=60nM
    472248 6gxb:A (1.35) BS01 ZN 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 N/A
    472249 6gxb:A (1.35) BS02 FF5 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 N/A
    472250 6gxc:A (3.401) BS01 peptide 2.4.99.19 GO:0000287 ... B9KDD4 30389987
    472251 6gxc:A (3.401) BS02 MN 2.4.99.19 GO:0000287 ... B9KDD4 30389987
    472252 6gxc:A (3.401) BS03 MN 2.4.99.19 GO:0000287 ... B9KDD4 30389987
    472253 6gxc:A (3.401) BS04 FFK 2.4.99.19 GO:0000287 ... B9KDD4 30389987
    472254 6gxd:A (1.8) BS01 FAH 3.8.1.3 GO:0003824 ... Q6NAM1 30377366
    472255 6gxe:A (1.3) BS01 ZN 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 N/A
    472256 6gxe:A (1.3) BS02 FFH 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 N/A
    472257 6gxe:A (1.3) BS03 FFH 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 N/A
    472258 6gxg:A (1.6) BS01 FFN ? GO:0004791 ... O77404 30605929
    472259 6gxg:B (1.6) BS01 FFN ? GO:0004791 ... O77404 30605929
    472260 6gxg:C (1.6) BS01 FFN ? GO:0004791 ... O77404 30605929
    472261 6gxk:A (1.7) BS01 NAP 1.1.1.-
    1.1.1.188
    1.1.1.210
    1.1.1.239
    1.1.1.357
    1.1.1.53
    1.1.1.62
    1.1.1.64
    GO:0001523 ... P42330 30996776
    472262 6gxk:A (1.7) BS02 FFW 1.1.1.-
    1.1.1.188
    1.1.1.210
    1.1.1.239
    1.1.1.357
    1.1.1.53
    1.1.1.62
    1.1.1.64
    GO:0001523 ... P42330 30996776
    472263 6gxk:B (1.7) BS01 NAP 1.1.1.-
    1.1.1.188
    1.1.1.210
    1.1.1.239
    1.1.1.357
    1.1.1.53
    1.1.1.62
    1.1.1.64
    GO:0001523 ... P42330 30996776
    472264 6gxk:B (1.7) BS02 FFW 1.1.1.-
    1.1.1.188
    1.1.1.210
    1.1.1.239
    1.1.1.357
    1.1.1.53
    1.1.1.62
    1.1.1.64
    GO:0001523 ... P42330 30996776
    472265 6gxm:0 (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N4 30076302
    472266 6gxm:1 (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N9 30076302
    472267 6gxm:2 (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7P5 30076302
    472268 6gxm:3 (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7Q1 30076302
    472269 6gxm:4 (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7Q6 30076302
    472270 6gxm:5 (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7J3 30076302
    472271 6gxm:C (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60422 30076302
    472272 6gxm:C (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P60422 30076302
    472273 6gxm:D (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60438 30076302
    472274 6gxm:E (3.8) BS01 rna ? GO:0001070 ... P60723 30076302
    472275 6gxm:E (3.8) BS02 peptide ? GO:0001070 ... P60723 30076302
    472276 6gxm:F (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P62399 30076302
    472277 6gxm:F (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P62399 30076302
    472278 6gxm:F (3.8) BS03 rna ? GO:0000027 ... P62399 30076302
    472279 6gxm:G (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG55 30076302
    472280 6gxm:H (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7R1 30076302
    472281 6gxm:I (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7J7 30076302
    472282 6gxm:J (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AA10 30076302
    472283 6gxm:K (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 30076302
    472284 6gxm:K (3.8) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 30076302
    472285 6gxm:L (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P02413 30076302
    472286 6gxm:M (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADY7 30076302
    472287 6gxm:M (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0ADY7 30076302
    472288 6gxm:N (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG44 30076302
    472289 6gxm:O (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C018 30076302
    472290 6gxm:O (3.8) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0C018 30076302
    472291 6gxm:P (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 30076302
    472292 6gxm:P (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 30076302
    472293 6gxm:Q (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7L3 30076302
    472294 6gxm:R (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AG48 30076302
    472295 6gxm:S (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61175 30076302
    472296 6gxm:T (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADZ0 30076302
    472297 6gxm:U (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60624 30076302
    472298 6gxm:V (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P68919 30076302
    472299 6gxm:W (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 30076302
    472300 6gxm:W (3.8) BS02 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 30076302
    472301 6gxm:X (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M2 30076302
    472302 6gxm:Y (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M6 30076302
    472303 6gxm:Z (3.8) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 30076302
    472304 6gxm:Z (3.8) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 30076302
    472305 6gxm:b (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7V0 30076302
    472306 6gxm:c (3.8) BS01 rna ? GO:0003676 ... P0A7V3 30076302
    472307 6gxm:d (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7V8 30076302
    472308 6gxm:e (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7W1 30076302
    472309 6gxm:f (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P02358 30076302
    472310 6gxm:g (3.8) BS01 rna ? GO:0003723 ... P02359 30076302
    472311 6gxm:h (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7W7 30076302
    472312 6gxm:i (3.8) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7X3 30076302
    472313 6gxm:j (3.8) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7R5 30076302
    472314 6gxm:k (3.8) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7R9 30076302
    472315 6gxm:l (3.8) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7S3 30076302
    472316 6gxm:m (3.8) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7S9 30076302
    472317 6gxm:n (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0AG59 30076302
    472318 6gxm:o (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0ADZ4 30076302
    472319 6gxm:o (3.8) BS02 rna ? GO:0000028 ... P0ADZ4 30076302
    472320 6gxm:p (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7T3 30076302
    472321 6gxm:q (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0AG63 30076302
    472322 6gxm:r (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7T7 30076302
    472323 6gxm:s (3.8) BS01 rna ? GO:0003723 ... P0A7U3 30076302
    472324 6gxm:t (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7U7 30076302
    472325 6gxm:u (3.8) BS01 rna ? GO:0000028 ... P68679 30076302
    472326 6gxm:v (3.8) BS01 rna ? GO:0003747 ... P0A7I0 30076302
    472327 6gxm:v (3.8) BS02 rna ? GO:0003747 ... P0A7I0 30076302
    472328 6gxm:v (3.8) BS03 rna ? GO:0003747 ... P0A7I0 30076302
    472329 6gxm:v (3.8) BS04 rna ? GO:0003747 ... P0A7I0 30076302
    472330 6gxm:w (3.8) BS01 rna ? GO:0003924 ... P0A7I4 30076302
    472331 6gxn:0 (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N4 30076302
    472332 6gxn:1 (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N9 30076302
    472333 6gxn:2 (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7P5 30076302
    472334 6gxn:3 (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7Q1 30076302
    472335 6gxn:4 (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7Q6 30076302
    472336 6gxn:5 (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7J3 30076302
    472337 6gxn:C (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60422 30076302
    472338 6gxn:D (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60438 30076302
    472339 6gxn:E (3.9) BS01 rna ? GO:0001070 ... P60723 30076302
    472340 6gxn:E (3.9) BS02 peptide ? GO:0001070 ... P60723 30076302
    472341 6gxn:F (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P62399 30076302
    472342 6gxn:F (3.9) BS02 rna ? GO:0000027 ... P62399 30076302
    472343 6gxn:F (3.9) BS03 rna ? GO:0000027 ... P62399 30076302
    472344 6gxn:G (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG55 30076302
    472345 6gxn:H (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7R1 30076302
    472346 6gxn:I (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7J7 30076302
    472347 6gxn:J (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AA10 30076302
    472348 6gxn:K (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 30076302
    472349 6gxn:K (3.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 30076302
    472350 6gxn:L (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P02413 30076302
    472351 6gxn:M (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADY7 30076302
    472352 6gxn:M (3.9) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0ADY7 30076302
    472353 6gxn:N (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG44 30076302
    472354 6gxn:O (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C018 30076302
    472355 6gxn:O (3.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0C018 30076302
    472356 6gxn:P (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 30076302
    472357 6gxn:P (3.9) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 30076302
    472358 6gxn:Q (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7L3 30076302
    472359 6gxn:R (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AG48 30076302
    472360 6gxn:S (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61175 30076302
    472361 6gxn:T (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADZ0 30076302
    472362 6gxn:U (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60624 30076302
    472363 6gxn:V (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P68919 30076302
    472364 6gxn:W (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 30076302
    472365 6gxn:W (3.9) BS02 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 30076302
    472366 6gxn:X (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M2 30076302
    472367 6gxn:Y (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M6 30076302
    472368 6gxn:Z (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 30076302
    472369 6gxn:b (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7V0 30076302
    472370 6gxn:c (3.9) BS01 rna ? GO:0003676 ... P0A7V3 30076302
    472371 6gxn:d (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7V8 30076302
    472372 6gxn:e (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7W1 30076302
    472373 6gxn:f (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P02358 30076302
    472374 6gxn:g (3.9) BS01 rna ? GO:0003723 ... P02359 30076302
    472375 6gxn:h (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7W7 30076302
    472376 6gxn:i (3.9) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7X3 30076302
    472377 6gxn:j (3.9) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7R5 30076302
    472378 6gxn:k (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7R9 30076302
    472379 6gxn:l (3.9) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7S3 30076302
    472380 6gxn:m (3.9) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7S9 30076302
    472381 6gxn:n (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0AG59 30076302
    472382 6gxn:o (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0ADZ4 30076302
    472383 6gxn:o (3.9) BS02 rna ? GO:0000028 ... P0ADZ4 30076302
    472384 6gxn:p (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7T3 30076302
    472385 6gxn:q (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0AG63 30076302
    472386 6gxn:r (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7T7 30076302
    472387 6gxn:s (3.9) BS01 rna ? GO:0003723 ... P0A7U3 30076302
    472388 6gxn:t (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7U7 30076302
    472389 6gxn:u (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P68679 30076302
    472390 6gxn:v (3.9) BS01 rna ? GO:0003747 ... P0A7I0 30076302
    472391 6gxn:v (3.9) BS02 rna ? GO:0003747 ... P0A7I0 30076302
    472392 6gxn:v (3.9) BS03 rna ? GO:0003747 ... P0A7I0 30076302
    472393 6gxn:v (3.9) BS04 rna ? GO:0003747 ... P0A7I0 30076302
    472394 6gxn:w (3.9) BS01 rna ? GO:0003924 ... P0A7I4 30076302
    472395 6gxo:0 (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N4 30076302
    472396 6gxo:1 (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N9 30076302
    472397 6gxo:2 (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7P5 30076302
    472398 6gxo:3 (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7Q1 30076302
    472399 6gxo:4 (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7Q6 30076302
    472400 6gxo:5 (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7J3 30076302

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).