SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2353 2354 2355 2356 2357 2358 2359 2360 2361 2362 2363 2364 2365 2366 2367 2368 2369 2370 2371 2372 2373 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    472401 6gxo:C (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60422 30076302
    472402 6gxo:C (3.9) BS02 rna ? GO:0000027 ... P60422 30076302
    472403 6gxo:D (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60438 30076302
    472404 6gxo:E (3.9) BS01 rna ? GO:0001070 ... P60723 30076302
    472405 6gxo:F (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P62399 30076302
    472406 6gxo:F (3.9) BS02 rna ? GO:0000027 ... P62399 30076302
    472407 6gxo:G (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG55 30076302
    472408 6gxo:H (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7R1 30076302
    472409 6gxo:I (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7J7 30076302
    472410 6gxo:J (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AA10 30076302
    472411 6gxo:K (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 30076302
    472412 6gxo:K (3.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 30076302
    472413 6gxo:L (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P02413 30076302
    472414 6gxo:M (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADY7 30076302
    472415 6gxo:M (3.9) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0ADY7 30076302
    472416 6gxo:N (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG44 30076302
    472417 6gxo:O (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C018 30076302
    472418 6gxo:O (3.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0C018 30076302
    472419 6gxo:P (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 30076302
    472420 6gxo:P (3.9) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 30076302
    472421 6gxo:Q (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7L3 30076302
    472422 6gxo:R (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AG48 30076302
    472423 6gxo:S (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61175 30076302
    472424 6gxo:T (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADZ0 30076302
    472425 6gxo:U (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60624 30076302
    472426 6gxo:V (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P68919 30076302
    472427 6gxo:W (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 30076302
    472428 6gxo:W (3.9) BS02 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 30076302
    472429 6gxo:X (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M2 30076302
    472430 6gxo:Y (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M6 30076302
    472431 6gxo:Z (3.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 30076302
    472432 6gxo:Z (3.9) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 30076302
    472433 6gxo:b (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7V0 30076302
    472434 6gxo:c (3.9) BS01 rna ? GO:0003676 ... P0A7V3 30076302
    472435 6gxo:d (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7V8 30076302
    472436 6gxo:e (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7W1 30076302
    472437 6gxo:f (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P02358 30076302
    472438 6gxo:g (3.9) BS01 rna ? GO:0003723 ... P02359 30076302
    472439 6gxo:h (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7W7 30076302
    472440 6gxo:i (3.9) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7X3 30076302
    472441 6gxo:j (3.9) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7R5 30076302
    472442 6gxo:k (3.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7R9 30076302
    472443 6gxo:l (3.9) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7S3 30076302
    472444 6gxo:m (3.9) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7S9 30076302
    472445 6gxo:n (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0AG59 30076302
    472446 6gxo:o (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0ADZ4 30076302
    472447 6gxo:o (3.9) BS02 rna ? GO:0000028 ... P0ADZ4 30076302
    472448 6gxo:p (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7T3 30076302
    472449 6gxo:q (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0AG63 30076302
    472450 6gxo:r (3.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7T7 30076302
    472451 6gxo:s (3.9) BS01 rna ? GO:0003723 ... P0A7U3 30076302
    472452 6gxo:t (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7U7 30076302
    472453 6gxo:u (3.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P68679 30076302
    472454 6gxo:v (3.9) BS01 rna ? GO:0003747 ... P0A7I0 30076302
    472455 6gxo:v (3.9) BS02 rna ? GO:0003747 ... P0A7I0 30076302
    472456 6gxo:v (3.9) BS03 rna ? GO:0003747 ... P0A7I0 30076302
    472457 6gxo:w (3.9) BS01 rna ? GO:0003924 ... P0A7I4 30076302
    472458 6gxo:w (3.9) BS02 rna ? GO:0003924 ... P0A7I4 30076302
    472459 6gxp:0 (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N4 30076302
    472460 6gxp:1 (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N9 30076302
    472461 6gxp:2 (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7P5 30076302
    472462 6gxp:3 (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7Q1 30076302
    472463 6gxp:4 (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7Q6 30076302
    472464 6gxp:5 (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7J3 30076302
    472465 6gxp:C (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60422 30076302
    472466 6gxp:D (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60438 30076302
    472467 6gxp:E (4.4) BS01 rna ? GO:0001070 ... P60723 30076302
    472468 6gxp:F (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P62399 30076302
    472469 6gxp:F (4.4) BS02 rna ? GO:0000027 ... P62399 30076302
    472470 6gxp:G (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG55 30076302
    472471 6gxp:H (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0A7R1 30076302
    472472 6gxp:I (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7J7 30076302
    472473 6gxp:J (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AA10 30076302
    472474 6gxp:K (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 30076302
    472475 6gxp:K (4.4) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0ADY3 30076302
    472476 6gxp:L (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P02413 30076302
    472477 6gxp:M (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADY7 30076302
    472478 6gxp:M (4.4) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0ADY7 30076302
    472479 6gxp:N (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG44 30076302
    472480 6gxp:O (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C018 30076302
    472481 6gxp:O (4.4) BS02 rna ? GO:0002181 ... P0C018 30076302
    472482 6gxp:P (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 30076302
    472483 6gxp:P (4.4) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0A7K6 30076302
    472484 6gxp:Q (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7L3 30076302
    472485 6gxp:R (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AG48 30076302
    472486 6gxp:S (4.4) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61175 30076302
    472487 6gxp:T (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0ADZ0 30076302
    472488 6gxp:U (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60624 30076302
    472489 6gxp:V (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P68919 30076302
    472490 6gxp:W (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 30076302
    472491 6gxp:W (4.4) BS02 rna ? GO:0003735 ... P0A7L8 30076302
    472492 6gxp:X (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M2 30076302
    472493 6gxp:Y (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M6 30076302
    472494 6gxp:Z (4.4) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 30076302
    472495 6gxp:Z (4.4) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 30076302
    472496 6gxp:b (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7V0 30076302
    472497 6gxp:c (4.4) BS01 rna ? GO:0003676 ... P0A7V3 30076302
    472498 6gxp:d (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7V8 30076302
    472499 6gxp:e (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7W1 30076302
    472500 6gxp:f (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P02358 30076302
    472501 6gxp:g (4.4) BS01 rna ? GO:0003723 ... P02359 30076302
    472502 6gxp:h (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7W7 30076302
    472503 6gxp:i (4.4) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7X3 30076302
    472504 6gxp:j (4.4) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7R5 30076302
    472505 6gxp:k (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7R9 30076302
    472506 6gxp:l (4.4) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7S3 30076302
    472507 6gxp:m (4.4) BS01 rna ? GO:0000049 ... P0A7S9 30076302
    472508 6gxp:n (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0AG59 30076302
    472509 6gxp:o (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0ADZ4 30076302
    472510 6gxp:o (4.4) BS02 rna ? GO:0000028 ... P0ADZ4 30076302
    472511 6gxp:p (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7T3 30076302
    472512 6gxp:q (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0AG63 30076302
    472513 6gxp:r (4.4) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0A7T7 30076302
    472514 6gxp:s (4.4) BS01 rna ? GO:0003723 ... P0A7U3 30076302
    472515 6gxp:t (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0A7U7 30076302
    472516 6gxp:u (4.4) BS01 rna ? GO:0000028 ... P68679 30076302
    472517 6gxp:w (4.4) BS01 rna ? GO:0003924 ... P0A7I4 30076302
    472518 6gxp:w (4.4) BS02 rna ? GO:0003924 ... P0A7I4 30076302
    472519 6gxq:A (1.96) BS01 ZN 3.1.4.- GO:0004114 ... Q8WQX9 31378593
    472520 6gxq:A (1.96) BS02 FFZ 3.1.4.- GO:0004114 ... Q8WQX9 31378593 MOAD: Ki=0.00000079M
    BindingDB: Kd=79nM, Ki=158nM
    472521 6gxq:B (1.96) BS01 ZN 3.1.4.- GO:0004114 ... Q8WQX9 31378593
    472522 6gxt:A (1.95) BS01 FAH 3.8.1.3 GO:0003824 ... Q6NAM1 30377366
    472523 6gxu:A (1.917) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472524 6gxu:A (1.917) BS02 FG8 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=180nM
    472525 6gxu:B (1.917) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472526 6gxu:B (1.917) BS02 FG8 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=180nM
    472527 6gxu:C (1.917) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472528 6gxu:C (1.917) BS02 FG8 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=180nM
    472529 6gxu:D (1.917) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472530 6gxu:D (1.917) BS02 FG8 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=180nM
    472531 6gxv:A (2.07) BS01 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472532 6gxv:A (2.07) BS02 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472533 6gxv:A (2.07) BS03 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472534 6gxv:A (2.07) BS04 AC1 ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472535 6gxv:A (2.07) BS05 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472536 6gxv:A (2.07) BS06 AC1 ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472537 6gxv:A (2.07) BS07 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472538 6gxv:A (2.07) BS08 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472539 6gxv:A (2.07) BS09 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472540 6gxv:A (2.07) BS10 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472541 6gxv:A (2.07) BS11 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472542 6gxv:A (2.07) BS12 BGC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472543 6gxv:A (2.07) BS13 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472544 6gxv:A (2.07) BS14 BGC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472545 6gxv:B (2.07) BS01 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472546 6gxv:B (2.07) BS02 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472547 6gxv:B (2.07) BS03 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472548 6gxv:B (2.07) BS04 AC1 ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472549 6gxv:B (2.07) BS05 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472550 6gxv:B (2.07) BS06 AC1 ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472551 6gxv:B (2.07) BS07 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472552 6gxv:B (2.07) BS08 BGC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472553 6gxv:B (2.07) BS09 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472554 6gxv:B (2.07) BS10 BGC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472555 6gxv:B (2.07) BS11 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472556 6gxv:B (2.07) BS12 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472557 6gxv:B (2.07) BS13 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472558 6gxv:B (2.07) BS14 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472559 6gxw:A (2.071) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472560 6gxw:A (2.071) BS02 FGN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=440nM
    472561 6gxw:B (2.071) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472562 6gxw:B (2.071) BS02 FGN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=440nM
    472563 6gxw:C (2.071) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472564 6gxw:C (2.071) BS02 FGN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=440nM
    472565 6gxw:D (2.071) BS01 ZN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110
    472566 6gxw:D (2.071) BS02 FGN 3.5.1.98 GO:0004407 ... A5H660 29806110 MOAD: ic50=440nM
    472567 6gxx:L (1.85) BS01 MG N/A N/A N/A N/A
    472568 6gxy:A (1.8) BS01 FFN ? GO:0004791 ... O77404 30605929
    472569 6gxy:B (1.8) BS01 FFN ? GO:0004791 ... O77404 30605929
    472570 6gxy:C (1.8) BS01 FFN ? GO:0004791 ... O77404 30605929
    472571 6gy0:A (2.55) BS01 FGE 2.7.1.137
    2.7.1.153
    GO:0001782 ... O35904 30718815
    472572 6gy1:A (2.1) BS01 MG 2.1.1.6 GO:0000287 ... P22734 30272964
    472573 6gy1:A (2.1) BS02 SAH 2.1.1.6 GO:0000287 ... P22734 30272964
    472574 6gy1:A (2.1) BS03 FGQ 2.1.1.6 GO:0000287 ... P22734 30272964 MOAD: ic50=0.501uM
    472575 6gy2:A (3.11) BS01 peptide 2.7.11.21 N/A P53350 32286328
    472576 6gy2:B (3.11) BS01 peptide 2.7.11.21 N/A P53350 32286328
    472577 6gy3:A (2.68) BS01 dna ? GO:0000976 ... Q79VH8 N/A
    472578 6gy3:A (2.68) BS02 dna ? GO:0000976 ... Q79VH8 N/A
    472579 6gy3:B (2.68) BS01 dna ? GO:0000976 ... Q79VH8 N/A
    472580 6gy3:B (2.68) BS02 dna ? GO:0000976 ... Q79VH8 N/A
    472581 6gy5:A (1.086) BS01 peptide ? N/A Q9Y2M5 31279627
    472582 6gy9:A (1.83) BS01 KBA ? N/A Q5F4T5 30071731
    472583 6gy9:B (1.83) BS01 KBA ? N/A Q5F4T5 30071731
    472584 6gya:A (2.95) BS01 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472585 6gya:A (2.95) BS02 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472586 6gya:A (2.95) BS03 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472587 6gya:A (2.95) BS04 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472588 6gya:A (2.95) BS05 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472589 6gya:A (2.95) BS06 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472590 6gya:A (2.95) BS07 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472591 6gya:B (2.95) BS01 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472592 6gya:B (2.95) BS02 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472593 6gya:B (2.95) BS03 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472594 6gya:B (2.95) BS04 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472595 6gya:B (2.95) BS05 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472596 6gya:B (2.95) BS06 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472597 6gya:B (2.95) BS07 BGC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472598 6gya:C (2.95) BS01 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472599 6gya:C (2.95) BS02 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472600 6gya:C (2.95) BS03 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).