SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2354 2355 2356 2357 2358 2359 2360 2361 2362 2363 2364 2365 2366 2367 2368 2369 2370 2371 2372 2373 2374 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    472601 6gya:C (2.95) BS04 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472602 6gya:C (2.95) BS05 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472603 6gya:D (2.95) BS01 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472604 6gya:D (2.95) BS02 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472605 6gya:D (2.95) BS03 GLC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472606 6gya:D (2.95) BS04 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472607 6gya:D (2.95) BS05 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472608 6gya:D (2.95) BS06 CA ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472609 6gya:D (2.95) BS07 BGC ? GO:0004553 ... A0A3P8MUS3 30644839
    472610 6gye:A (2.3) BS01 NNR N/A GO:0000309 ... N/A 32331317
    472611 6gye:B (2.3) BS01 NNR N/A GO:0000309 ... N/A 32331317
    472612 6gyf:A (2.7) BS01 NMN N/A GO:0000309 ... N/A 32331317
    472613 6gyf:A (2.7) BS02 MG N/A GO:0000309 ... N/A 32331317
    472614 6gyf:B (2.7) BS01 NMN N/A GO:0000309 ... N/A 32331317
    472615 6gyf:B (2.7) BS02 MG N/A GO:0000309 ... N/A 32331317
    472616 6gyh:A (2.0) BS01 RET ? GO:0005216 ... I0YUS5 30890657
    472617 6gyh:A (2.0) BS02 CLR ? GO:0005216 ... I0YUS5 30890657
    472618 6gyi:A (1.6) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    472619 6gyi:B (1.6) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    472620 6gyi:B (1.6) BS02 CA ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    472621 6gyi:C (1.6) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    472622 6gyi:C (1.6) BS02 CA ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    472623 6gyi:D (1.6) BS01 CU ? GO:0005507 ... P00282 N/A
    472624 6gyj:A (1.75) BS01 FGT 2.1.1.45 GO:0000900 ... P07607 N/A
    472625 6gyk:A (5.1) BS01 ZN 2.7.7.6 GO:0000428 ... P04050 30472190
    472626 6gyk:A (5.1) BS02 ZN 2.7.7.6 GO:0000428 ... P04050 30472190
    472627 6gyk:A (5.1) BS03 MG 2.7.7.6 GO:0000428 ... P04050 30472190
    472628 6gyk:B (5.1) BS01 ZN 2.7.7.6 GO:0000428 ... P08518 30472190
    472629 6gyk:C (5.1) BS01 ZN ? GO:0000428 ... P16370 30472190
    472630 6gyk:I (5.1) BS01 ZN ? GO:0000428 ... P27999 30472190
    472631 6gyk:I (5.1) BS02 ZN ? GO:0000428 ... P27999 30472190
    472632 6gyk:J (5.1) BS01 ZN ? GO:0000428 ... P22139 30472190
    472633 6gyk:M (5.1) BS01 dna ? GO:0000993 ... P29055 30472190
    472634 6gyk:M (5.1) BS02 ZN ? GO:0000993 ... P29055 30472190
    472635 6gyk:O (5.1) BS01 dna ? GO:0000126 ... P13393 30472190
    472636 6gyk:O (5.1) BS02 dna ? GO:0000126 ... P13393 30472190
    472637 6gyl:A (4.8) BS01 ZN 2.7.7.6 GO:0000428 ... P04050 30472190
    472638 6gyl:A (4.8) BS02 ZN 2.7.7.6 GO:0000428 ... P04050 30472190
    472639 6gyl:A (4.8) BS03 MG 2.7.7.6 GO:0000428 ... P04050 30472190
    472640 6gyl:B (4.8) BS01 ZN 2.7.7.6 GO:0000428 ... P08518 30472190
    472641 6gyl:C (4.8) BS01 ZN ? GO:0000428 ... P16370 30472190
    472642 6gyl:I (4.8) BS01 ZN ? GO:0000428 ... P27999 30472190
    472643 6gyl:I (4.8) BS02 ZN ? GO:0000428 ... P27999 30472190
    472644 6gyl:J (4.8) BS01 ZN ? GO:0000428 ... P22139 30472190
    472645 6gyl:M (4.8) BS01 dna ? GO:0000993 ... P29055 30472190
    472646 6gyl:M (4.8) BS02 dna ? GO:0000993 ... P29055 30472190
    472647 6gyl:M (4.8) BS03 ZN ? GO:0000993 ... P29055 30472190
    472648 6gyl:O (4.8) BS01 dna ? GO:0000126 ... P13393 30472190
    472649 6gyl:O (4.8) BS02 dna ? GO:0000126 ... P13393 30472190
    472650 6gyl:U (4.8) BS01 dna ? GO:0005672 ... P32773 30472190
    472651 6gyl:W (4.8) BS01 dna ? GO:0006367 ... P36100 30472190
    472652 6gyl:W (4.8) BS02 ZN ? GO:0006367 ... P36100 30472190
    472653 6gym:0 (6.7) BS01 SF4 3.6.4.12 GO:0000019 ... P06839 30472190
    472654 6gym:3 (6.7) BS01 ZN ? GO:0000993 ... Q03290 30472190
    472655 6gym:3 (6.7) BS02 ZN ? GO:0000993 ... Q03290 30472190
    472656 6gym:6 (6.7) BS01 ZN ? GO:0000112 ... Q04673 30472190
    472657 6gym:7 (6.7) BS01 dna 5.6.2.4 GO:0000019 ... Q00578 30472190
    472658 6gym:7 (6.7) BS02 dna 5.6.2.4 GO:0000019 ... Q00578 30472190
    472659 6gym:A (6.7) BS01 ZN 2.7.7.6 GO:0000428 ... P04050 30472190
    472660 6gym:A (6.7) BS02 ZN 2.7.7.6 GO:0000428 ... P04050 30472190
    472661 6gym:A (6.7) BS03 MG 2.7.7.6 GO:0000428 ... P04050 30472190
    472662 6gym:B (6.7) BS01 ZN 2.7.7.6 GO:0000428 ... P08518 30472190
    472663 6gym:C (6.7) BS01 ZN ? GO:0000428 ... P16370 30472190
    472664 6gym:I (6.7) BS01 ZN ? GO:0000428 ... P27999 30472190
    472665 6gym:I (6.7) BS02 ZN ? GO:0000428 ... P27999 30472190
    472666 6gym:J (6.7) BS01 ZN ? GO:0000428 ... P22139 30472190
    472667 6gym:M (6.7) BS01 dna ? GO:0000993 ... P29055 30472190
    472668 6gym:M (6.7) BS02 dna ? GO:0000993 ... P29055 30472190
    472669 6gym:M (6.7) BS03 ZN ? GO:0000993 ... P29055 30472190
    472670 6gym:O (6.7) BS01 dna ? GO:0000126 ... P13393 30472190
    472671 6gym:O (6.7) BS02 dna ? GO:0000126 ... P13393 30472190
    472672 6gym:U (6.7) BS01 dna ? GO:0005672 ... P32773 30472190
    472673 6gym:W (6.7) BS01 dna ? GO:0006367 ... P36100 30472190
    472674 6gym:W (6.7) BS02 ZN ? GO:0006367 ... P36100 30472190
    472675 6gyo:A (3.4) BS01 CMP ? GO:0005216 ... Q9Y3Q4 N/A
    472676 6gyo:A (3.4) BS02 PIE ? GO:0005216 ... Q9Y3Q4 N/A
    472677 6gyo:B (3.4) BS01 CMP ? GO:0005216 ... Q9Y3Q4 N/A
    472678 6gyo:B (3.4) BS02 PIE ? GO:0005216 ... Q9Y3Q4 N/A
    472679 6gyo:C (3.4) BS01 CMP ? GO:0005216 ... Q9Y3Q4 N/A
    472680 6gyo:C (3.4) BS02 PIE ? GO:0005216 ... Q9Y3Q4 N/A
    472681 6gyo:D (3.4) BS01 CMP ? GO:0005216 ... Q9Y3Q4 N/A
    472682 6gyo:D (3.4) BS02 PIE ? GO:0005216 ... Q9Y3Q4 N/A
    472683 6gyp:B (3.6) BS01 MET ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472684 6gyp:B (3.6) BS02 PHE ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472685 6gyp:B (3.6) BS03 ASN ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472686 6gyp:B (3.6) BS04 ARG ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472687 6gyp:B (3.6) BS05 THR ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472688 6gyr:A (3.1) BS01 ZN 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472689 6gyr:A (3.1) BS02 ZN 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472690 6gyr:A (3.1) BS03 ZN 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472691 6gyr:A (3.1) BS04 01K 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472692 6gyr:A (3.1) BS05 ZN 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472693 6gyr:B (3.1) BS01 ZN 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472694 6gyr:B (3.1) BS02 ZN 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472695 6gyr:B (3.1) BS03 01K 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472696 6gyr:C (3.1) BS01 ZN 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472697 6gyr:C (3.1) BS02 ZN 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472698 6gyr:C (3.1) BS03 01K 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472699 6gyr:D (3.1) BS01 ZN 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472700 6gyr:D (3.1) BS02 ZN 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472701 6gyr:D (3.1) BS03 ZN 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472702 6gyr:D (3.1) BS04 01K 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472703 6gys:A (4.4) BS01 dna ? GO:0000775 ... P35203 30478265
    472704 6gys:B (4.4) BS01 ZN ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472705 6gys:B (4.4) BS02 ZN ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472706 6gys:C (4.4) BS01 dna ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472707 6gys:C (4.4) BS02 dna ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472708 6gys:C (4.4) BS03 ZN ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472709 6gys:C (4.4) BS04 ZN ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472710 6gys:E (4.4) BS01 dna ? GO:0000022 ... P32504 30478265
    472711 6gys:E (4.4) BS02 dna ? GO:0000022 ... P32504 30478265
    472712 6gys:I (4.4) BS01 ZN ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472713 6gys:I (4.4) BS02 ZN ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472714 6gys:J (4.4) BS01 dna ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472715 6gys:J (4.4) BS02 ZN ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472716 6gys:L (4.4) BS01 dna ? GO:0000022 ... P32504 30478265
    472717 6gyt:A (2.5) BS01 peptide 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472718 6gyt:A (2.5) BS02 ZN 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472719 6gyt:A (2.5) BS03 ZN 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472720 6gyt:B (2.5) BS01 ZN 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472721 6gyt:B (2.5) BS02 ZN 2.3.1.-
    2.3.1.48
    GO:0004402 ... Q09472 30323286
    472722 6gyu:B (3.0) BS01 ZN ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472723 6gyu:B (3.0) BS02 ZN ? GO:0000775 ... P40969 30478265
    472724 6gyx:A (2.6) BS01 APC N/A GO:0004016 ... N/A 30668586
    472725 6gyx:B (2.6) BS01 APC N/A GO:0004016 ... N/A 30668586
    472726 6gz3:AA (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... G1TT27 30517857
    472727 6gz3:AB (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472728 6gz3:AC (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472729 6gz3:AC (3.6) BS02 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472730 6gz3:AD (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472731 6gz3:AD (3.6) BS02 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472732 6gz3:AE (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472733 6gz3:AF (3.6) BS01 rna N/A GO:0000463 ... N/A 30517857
    472734 6gz3:AF (3.6) BS02 rna N/A GO:0000463 ... N/A 30517857
    472735 6gz3:AG (3.6) BS01 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    472736 6gz3:AG (3.6) BS02 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    472737 6gz3:AH (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472738 6gz3:AI (3.6) BS01 rna ? GO:0003735 ... B7NZQ2 30517857
    472739 6gz3:AI (3.6) BS02 rna ? GO:0003735 ... B7NZQ2 30517857
    472740 6gz3:AI (3.6) BS03 rna ? GO:0003735 ... B7NZQ2 30517857
    472741 6gz3:AJ (3.6) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1TUB8 30517857
    472742 6gz3:AJ (3.6) BS02 rna ? GO:0003735 ... G1TUB8 30517857
    472743 6gz3:AK (3.6) BS01 rna N/A N/A N/A 30517857
    472744 6gz3:AL (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472745 6gz3:AL (3.6) BS02 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472746 6gz3:AM (3.6) BS01 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    472747 6gz3:AN (3.6) BS01 rna ? GO:0002181 ... G1T0C1 30517857
    472748 6gz3:AN (3.6) BS02 rna ? GO:0002181 ... G1T0C1 30517857
    472749 6gz3:AO (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472750 6gz3:AP (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472751 6gz3:AP (3.6) BS02 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472752 6gz3:AQ (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472753 6gz3:AR (3.6) BS01 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    472754 6gz3:AS (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472755 6gz3:AS (3.6) BS02 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472756 6gz3:AT (3.6) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1SHQ2 30517857
    472757 6gz3:AT (3.6) BS02 rna ? GO:0003735 ... G1SHQ2 30517857
    472758 6gz3:AU (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472759 6gz3:AV (3.6) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1T6D1 30517857
    472760 6gz3:AW (3.6) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1SE28 30517857
    472761 6gz3:AW (3.6) BS02 rna ? GO:0003735 ... G1SE28 30517857
    472762 6gz3:AX (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472763 6gz3:AX (3.6) BS02 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472764 6gz3:AY (3.6) BS01 rna ? GO:0003723 ... G1SQH0 30517857
    472765 6gz3:AY (3.6) BS02 rna ? GO:0003723 ... G1SQH0 30517857
    472766 6gz3:AZ (3.6) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1TXF6 30517857
    472767 6gz3:Aa (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472768 6gz3:Ab (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472769 6gz3:Ac (3.6) BS01 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    472770 6gz3:Ad (3.6) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1SHG0 30517857
    472771 6gz3:Ae (3.6) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1TUN8 30517857
    472772 6gz3:Af (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472773 6gz3:Ag (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472774 6gz3:Ah (3.6) BS01 rna N/A GO:0000463 ... N/A 30517857
    472775 6gz3:Ah (3.6) BS02 rna N/A GO:0000463 ... N/A 30517857
    472776 6gz3:Ai (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472777 6gz3:Aj (3.6) BS01 rna ? GO:0003735 ... U3KPD5 30517857
    472778 6gz3:Aj (3.6) BS02 rna ? GO:0003735 ... U3KPD5 30517857
    472779 6gz3:Aj (3.6) BS03 ZN ? GO:0003735 ... U3KPD5 30517857
    472780 6gz3:Ak (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472781 6gz3:Al (3.6) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1SYU7 30517857
    472782 6gz3:Al (3.6) BS02 rna ? GO:0003735 ... G1SYU7 30517857
    472783 6gz3:Am (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472784 6gz3:Ao (3.6) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1T040 30517857
    472785 6gz3:Ao (3.6) BS02 rna ? GO:0003735 ... G1T040 30517857
    472786 6gz3:Ap (3.6) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1SY53 30517857
    472787 6gz3:Ap (3.6) BS02 ZN ? GO:0003735 ... G1SY53 30517857
    472788 6gz3:Aq (3.6) BS01 rna ? GO:0003723 ... G1SMR7 30517857
    472789 6gz3:At (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472790 6gz3:Au (3.6) BS01 rna ? GO:0003723 ... G1SKZ8 30517857
    472791 6gz3:BA (3.6) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    472792 6gz3:BB (3.6) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1SS70 30517857
    472793 6gz3:BC (3.6) BS01 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    472794 6gz3:BD (3.6) BS01 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    472795 6gz3:BD (3.6) BS02 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    472796 6gz3:BD (3.6) BS03 MG N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    472797 6gz3:BD (3.6) BS04 MG N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    472798 6gz3:BD (3.6) BS05 MG N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    472799 6gz3:BE (3.6) BS01 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    472800 6gz3:BF (3.6) BS01 rna ? GO:0003723 ... G1TFM5 30517857

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).