SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2356 2357 2358 2359 2360 2361 2362 2363 2364 2365 2366 2367 2368 2369 2370 2371 2372 2373 2374 2375 2376 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    473001 6gz5:Ai (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473002 6gz5:Aj (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473003 6gz5:Aj (3.5) BS02 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473004 6gz5:Aj (3.5) BS03 ZN N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473005 6gz5:Ak (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473006 6gz5:Al (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473007 6gz5:Al (3.5) BS02 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473008 6gz5:Am (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473009 6gz5:Ao (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473010 6gz5:Ao (3.5) BS02 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473011 6gz5:Ao (3.5) BS03 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473012 6gz5:Ao (3.5) BS04 ZN N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473013 6gz5:Ap (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473014 6gz5:Ap (3.5) BS02 ZN N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473015 6gz5:Aq (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473016 6gz5:At (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473017 6gz5:Au (3.5) BS01 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    473018 6gz5:BA (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473019 6gz5:BB (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473020 6gz5:BC (3.5) BS01 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    473021 6gz5:BD (3.5) BS01 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    473022 6gz5:BE (3.5) BS01 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    473023 6gz5:BF (3.5) BS01 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    473024 6gz5:BF (3.5) BS02 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    473025 6gz5:BG (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473026 6gz5:BH (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473027 6gz5:BI (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473028 6gz5:BI (3.5) BS02 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473029 6gz5:BJ (3.5) BS01 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    473030 6gz5:BK (3.5) BS01 rna N/A N/A N/A 30517857
    473031 6gz5:BL (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473032 6gz5:BM (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473033 6gz5:BN (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473034 6gz5:BN (3.5) BS02 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473035 6gz5:BO (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473036 6gz5:BP (3.5) BS01 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    473037 6gz5:BQ (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473038 6gz5:BR (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473039 6gz5:BS (3.5) BS01 rna N/A GO:0003676 ... N/A 30517857
    473040 6gz5:BS (3.5) BS02 rna N/A GO:0003676 ... N/A 30517857
    473041 6gz5:BT (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473042 6gz5:BU (3.5) BS01 rna N/A GO:0003723 ... N/A 30517857
    473043 6gz5:BW (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473044 6gz5:BX (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473045 6gz5:BY (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473046 6gz5:BZ (3.5) BS01 rna N/A N/A N/A 30517857
    473047 6gz5:Ba (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473048 6gz5:Ba (3.5) BS02 ZN N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473049 6gz5:Bb (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473050 6gz5:Bc (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473051 6gz5:Bd (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473052 6gz5:Bd (3.5) BS02 ZN N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473053 6gz5:Be (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473054 6gz5:Bf (3.5) BS01 rna N/A GO:0003735 ... N/A 30517857
    473055 6gz5:Bg (3.5) BS01 rna N/A GO:0043022 ... N/A 30517857
    473056 6gz5:Ct (3.5) BS01 rna N/A GO:0003924 ... N/A 30517857
    473057 6gz5:Ct (3.5) BS02 rna N/A GO:0003924 ... N/A 30517857
    473058 6gz5:Ct (3.5) BS03 GNP N/A GO:0003924 ... N/A 30517857
    473059 6gz9:A (3.1) BS01 TXC N/A GO:0006857 ... N/A 30602453
    473060 6gza:A (1.89) BS01 CO 2.7.7.-
    2.7.7.49
    2.7.7.7
    3.1.-.-
    3.1.26.4
    3.4.23.-
    GO:0019068 ... P03355 30478053
    473061 6gzd:A (2.28) BS01 TCE 2.7.11.1 GO:0000775 ... P48729 30146162
    473062 6gzd:A (2.28) BS02 LCI 2.7.11.1 GO:0000775 ... P48729 30146162 MOAD: Kd=9.8nM
    473063 6gze:A (2.49) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... P81947 32151315
    473064 6gze:A (2.49) BS02 CA 3.6.5.- GO:0000226 ... P81947 32151315
    473065 6gze:B (2.49) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q6B856 32151315
    473066 6gze:C (2.49) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... P81947 32151315
    473067 6gze:C (2.49) BS02 CA 3.6.5.- GO:0000226 ... P81947 32151315
    473068 6gze:D (2.49) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q6B856 32151315
    473069 6gze:D (2.49) BS02 BEF ? GO:0000226 ... Q6B856 32151315
    473070 6gze:F (2.49) BS01 ACP N/A GO:0036211 ... N/A 32151315
    473071 6gzh:A (3.17) BS01 LCI 2.7.11.22
    2.7.11.23
    GO:0004672 ... P50750 30146162
    473072 6gzj:A (1.977) BS01 peptide ? GO:0000776 ... P63167 30261098
    473073 6gzl:A (1.953) BS01 peptide ? GO:0000776 ... P63167 30261098
    473074 6gzm:A (1.59) BS01 LCI 2.7.11.1
    2.7.11.26
    GO:0004672 ... P48730 30146162
    473075 6gzm:B (1.59) BS01 LCI 2.7.11.1
    2.7.11.26
    GO:0004672 ... P48730 30146162
    473076 6gzm:B (1.59) BS02 LCI 2.7.11.1
    2.7.11.26
    GO:0004672 ... P48730 30146162
    473077 6gzo:A (3.0) BS01 ANP N/A GO:0000309 ... N/A 32331317
    473078 6gzo:A (3.0) BS02 NAD N/A GO:0000309 ... N/A 32331317
    473079 6gzo:B (3.0) BS01 ANP N/A GO:0000309 ... N/A 32331317
    473080 6gzo:B (3.0) BS02 NAD N/A GO:0000309 ... N/A 32331317
    473081 6gzq:B2 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80371 30301898
    473082 6gzq:C1 (3.28) BS01 rna ? GO:0002181 ... P60405 30301898
    473083 6gzq:C2 (3.28) BS01 rna ? GO:0003676 ... P80372 30301898
    473084 6gzq:D1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN8 30301898
    473085 6gzq:D2 (3.28) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80373 30301898
    473086 6gzq:E1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN9 30301898
    473087 6gzq:E2 (3.28) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 30301898
    473088 6gzq:F1 (3.28) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 30301898
    473089 6gzq:F1 (3.28) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 30301898
    473090 6gzq:F2 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLP8 30301898
    473091 6gzq:G1 (3.28) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0DOY8 30301898
    473092 6gzq:G2 (3.28) BS01 rna ? GO:0000049 ... P17291 30301898
    473093 6gzq:H1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ1 30301898
    473094 6gzq:H2 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY9 30301898
    473095 6gzq:I1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003729 ... P60488 30301898
    473096 6gzq:I2 (3.28) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80374 30301898
    473097 6gzq:J1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 30301898
    473098 6gzq:J1 (3.28) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 30301898
    473099 6gzq:J2 (3.28) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN7 30301898
    473100 6gzq:K1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 30301898
    473101 6gzq:K2 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80376 30301898
    473102 6gzq:L1 (3.28) BS01 rna ? GO:0000049 ... P60489 30301898
    473103 6gzq:L1 (3.28) BS02 rna ? GO:0000049 ... P60489 30301898
    473104 6gzq:L2 (3.28) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN3 30301898
    473105 6gzq:M1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q9Z9H5 30301898
    473106 6gzq:M2 (3.28) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80377 30301898
    473107 6gzq:N1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 30301898
    473108 6gzq:N1 (3.28) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 30301898
    473109 6gzq:N2 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY6 30301898
    473110 6gzq:O1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60490 30301898
    473111 6gzq:O1 (3.28) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60490 30301898
    473112 6gzq:O2 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 30301898
    473113 6gzq:P1 (3.28) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60491 30301898
    473114 6gzq:P2 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJH3 30301898
    473115 6gzq:Q1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003723 ... P60492 30301898
    473116 6gzq:Q2 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY7 30301898
    473117 6gzq:R1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP3 30301898
    473118 6gzq:R2 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ0 30301898
    473119 6gzq:S1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP0 30301898
    473120 6gzq:S2 (3.28) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP2 30301898
    473121 6gzq:T1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP9 30301898
    473122 6gzq:T2 (3.28) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80380 30301898
    473123 6gzq:U1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHZ1 30301898
    473124 6gzq:U1 (3.28) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHZ1 30301898
    473125 6gzq:V1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60493 30301898
    473126 6gzq:V2 (3.28) BS01 rna ? GO:0044238 ... Q5SIS0 30301898
    473127 6gzq:W1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60494 30301898
    473128 6gzq:X1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP6 30301898
    473129 6gzq:Y1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 30301898
    473130 6gzq:Z1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJE1 30301898
    473131 6gzq:a1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80339 30301898
    473132 6gzq:b1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... P35871 30301898
    473133 6gzq:c1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80340 30301898
    473134 6gzq:d1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SKU1 30301898
    473135 6gzq:e1 (3.28) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHR2 30301898
    473136 6gzs:A (1.9) BS01 AYE 3.4.22.- GO:0006508 ... B0B9A0 30397340
    473137 6gzt:A (2.1) BS01 COA 3.4.22.- GO:0006508 ... B0B9A0 30397340
    473138 6gzu:A (1.47) BS01 ZN ? GO:0006508 ... Q5L5G1 30397340
    473139 6gzv:A (4.0) BS01 FHK 2.7.7.48
    3.4.22.28
    3.4.22.29
    3.6.1.15
    N/A P03313 31185007
    473140 6gzv:C (4.0) BS01 FHK 2.7.7.48
    3.4.22.28
    3.4.22.29
    3.6.1.15
    GO:0005198 ... P03313 31185007
    473141 6gzw:A (1.41) BS01 HEM N/A GO:0004601 ... N/A 30945782
    473142 6gzw:B (1.41) BS01 HEM N/A GO:0004601 ... N/A 30945782
    473143 6gzx:B3 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80371 30301898
    473144 6gzx:B4 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80371 30301898
    473145 6gzx:C1 (4.57) BS01 rna ? GO:0002181 ... P60405 30301898
    473146 6gzx:C1 (4.57) BS02 rna ? GO:0002181 ... P60405 30301898
    473147 6gzx:C2 (4.57) BS01 rna ? GO:0002181 ... P60405 30301898
    473148 6gzx:C3 (4.57) BS01 rna ? GO:0003676 ... P80372 30301898
    473149 6gzx:C4 (4.57) BS01 rna ? GO:0003676 ... P80372 30301898
    473150 6gzx:D1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN8 30301898
    473151 6gzx:D2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN8 30301898
    473152 6gzx:D3 (4.57) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80373 30301898
    473153 6gzx:D4 (4.57) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80373 30301898
    473154 6gzx:E1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN9 30301898
    473155 6gzx:E2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN9 30301898
    473156 6gzx:E3 (4.57) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 30301898
    473157 6gzx:E4 (4.57) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 30301898
    473158 6gzx:F1 (4.57) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 30301898
    473159 6gzx:F1 (4.57) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 30301898
    473160 6gzx:F2 (4.57) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 30301898
    473161 6gzx:F2 (4.57) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 30301898
    473162 6gzx:F3 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLP8 30301898
    473163 6gzx:F4 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLP8 30301898
    473164 6gzx:G1 (4.57) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0DOY8 30301898
    473165 6gzx:G2 (4.57) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0DOY8 30301898
    473166 6gzx:G3 (4.57) BS01 rna ? GO:0000049 ... P17291 30301898
    473167 6gzx:G4 (4.57) BS01 rna ? GO:0000049 ... P17291 30301898
    473168 6gzx:H1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ1 30301898
    473169 6gzx:H2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ1 30301898
    473170 6gzx:H3 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY9 30301898
    473171 6gzx:H4 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY9 30301898
    473172 6gzx:I1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003729 ... P60488 30301898
    473173 6gzx:I2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003729 ... P60488 30301898
    473174 6gzx:I3 (4.57) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80374 30301898
    473175 6gzx:I4 (4.57) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80374 30301898
    473176 6gzx:J1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 30301898
    473177 6gzx:J1 (4.57) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 30301898
    473178 6gzx:J2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 30301898
    473179 6gzx:J2 (4.57) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 30301898
    473180 6gzx:J3 (4.57) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN7 30301898
    473181 6gzx:J4 (4.57) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN7 30301898
    473182 6gzx:K1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 30301898
    473183 6gzx:K2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 30301898
    473184 6gzx:K3 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80376 30301898
    473185 6gzx:K4 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80376 30301898
    473186 6gzx:L1 (4.57) BS01 rna ? GO:0000049 ... P60489 30301898
    473187 6gzx:L1 (4.57) BS02 rna ? GO:0000049 ... P60489 30301898
    473188 6gzx:L2 (4.57) BS01 rna ? GO:0000049 ... P60489 30301898
    473189 6gzx:L2 (4.57) BS02 rna ? GO:0000049 ... P60489 30301898
    473190 6gzx:L3 (4.57) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN3 30301898
    473191 6gzx:L4 (4.57) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN3 30301898
    473192 6gzx:M1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q9Z9H5 30301898
    473193 6gzx:M2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q9Z9H5 30301898
    473194 6gzx:M3 (4.57) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80377 30301898
    473195 6gzx:M4 (4.57) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80377 30301898
    473196 6gzx:N1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 30301898
    473197 6gzx:N1 (4.57) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 30301898
    473198 6gzx:N2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 30301898
    473199 6gzx:N2 (4.57) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 30301898
    473200 6gzx:N3 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY6 30301898

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).