SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2357 2358 2359 2360 2361 2362 2363 2364 2365 2366 2367 2368 2369 2370 2371 2372 2373 2374 2375 2376 2377 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    473201 6gzx:N4 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY6 30301898
    473202 6gzx:O1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60490 30301898
    473203 6gzx:O1 (4.57) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60490 30301898
    473204 6gzx:O2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60490 30301898
    473205 6gzx:O2 (4.57) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60490 30301898
    473206 6gzx:O3 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 30301898
    473207 6gzx:O3 (4.57) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 30301898
    473208 6gzx:O4 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 30301898
    473209 6gzx:O4 (4.57) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 30301898
    473210 6gzx:P1 (4.57) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60491 30301898
    473211 6gzx:P2 (4.57) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60491 30301898
    473212 6gzx:P3 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJH3 30301898
    473213 6gzx:P4 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJH3 30301898
    473214 6gzx:Q1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003723 ... P60492 30301898
    473215 6gzx:Q2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003723 ... P60492 30301898
    473216 6gzx:Q3 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY7 30301898
    473217 6gzx:Q4 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY7 30301898
    473218 6gzx:R1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP3 30301898
    473219 6gzx:R2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP3 30301898
    473220 6gzx:R3 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ0 30301898
    473221 6gzx:R4 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ0 30301898
    473222 6gzx:S1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP0 30301898
    473223 6gzx:S2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP0 30301898
    473224 6gzx:S3 (4.57) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP2 30301898
    473225 6gzx:S4 (4.57) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP2 30301898
    473226 6gzx:T1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP9 30301898
    473227 6gzx:T2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP9 30301898
    473228 6gzx:T3 (4.57) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80380 30301898
    473229 6gzx:T4 (4.57) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80380 30301898
    473230 6gzx:U1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHZ1 30301898
    473231 6gzx:U1 (4.57) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHZ1 30301898
    473232 6gzx:U2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHZ1 30301898
    473233 6gzx:U2 (4.57) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHZ1 30301898
    473234 6gzx:V1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60493 30301898
    473235 6gzx:V2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60493 30301898
    473236 6gzx:V2 (4.57) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60493 30301898
    473237 6gzx:V3 (4.57) BS01 rna ? GO:0044238 ... Q5SIS0 30301898
    473238 6gzx:V4 (4.57) BS01 rna ? GO:0044238 ... Q5SIS0 30301898
    473239 6gzx:W1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60494 30301898
    473240 6gzx:W2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60494 30301898
    473241 6gzx:X1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP6 30301898
    473242 6gzx:X2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP6 30301898
    473243 6gzx:Y1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 30301898
    473244 6gzx:Y2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 30301898
    473245 6gzx:Z1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJE1 30301898
    473246 6gzx:Z2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJE1 30301898
    473247 6gzx:a1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80339 30301898
    473248 6gzx:a2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80339 30301898
    473249 6gzx:b1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P35871 30301898
    473250 6gzx:b2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P35871 30301898
    473251 6gzx:c1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80340 30301898
    473252 6gzx:c2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80340 30301898
    473253 6gzx:d1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SKU1 30301898
    473254 6gzx:d2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SKU1 30301898
    473255 6gzx:e1 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHR2 30301898
    473256 6gzx:e2 (4.57) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHR2 30301898
    473257 6gzy:A (2.15) BS01 FHH 2.3.2.31 GO:0004842 ... Q96EP0 30657686
    473258 6gzy:A (2.15) BS02 ZN 2.3.2.31 GO:0004842 ... Q96EP0 30657686
    473259 6gzy:A (2.15) BS03 ZN 2.3.2.31 GO:0004842 ... Q96EP0 30657686
    473260 6gzy:A (2.15) BS04 ZN 2.3.2.31 GO:0004842 ... Q96EP0 30657686
    473261 6gzy:A (2.15) BS05 ZN 2.3.2.31 GO:0004842 ... Q96EP0 30657686
    473262 6gzy:B (2.15) BS01 FHH 2.3.2.31 GO:0004842 ... Q96EP0 30657686
    473263 6gzy:B (2.15) BS02 ZN 2.3.2.31 GO:0004842 ... Q96EP0 30657686
    473264 6gzy:B (2.15) BS03 ZN 2.3.2.31 GO:0004842 ... Q96EP0 30657686
    473265 6gzy:B (2.15) BS04 ZN 2.3.2.31 GO:0004842 ... Q96EP0 30657686
    473266 6gzy:B (2.15) BS05 ZN 2.3.2.31 GO:0004842 ... Q96EP0 30657686
    473267 6gzz:B3 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80371 30301898
    473268 6gzz:B4 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80371 30301898
    473269 6gzz:C1 (4.13) BS01 rna ? GO:0002181 ... P60405 30301898
    473270 6gzz:C2 (4.13) BS01 rna ? GO:0002181 ... P60405 30301898
    473271 6gzz:C3 (4.13) BS01 rna ? GO:0003676 ... P80372 30301898
    473272 6gzz:C4 (4.13) BS01 rna ? GO:0003676 ... P80372 30301898
    473273 6gzz:D1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN8 30301898
    473274 6gzz:D2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN8 30301898
    473275 6gzz:D3 (4.13) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80373 30301898
    473276 6gzz:D4 (4.13) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80373 30301898
    473277 6gzz:E1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN9 30301898
    473278 6gzz:E2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN9 30301898
    473279 6gzz:E3 (4.13) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 30301898
    473280 6gzz:E4 (4.13) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 30301898
    473281 6gzz:F1 (4.13) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 30301898
    473282 6gzz:F1 (4.13) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 30301898
    473283 6gzz:F2 (4.13) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 30301898
    473284 6gzz:F2 (4.13) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 30301898
    473285 6gzz:F3 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLP8 30301898
    473286 6gzz:F4 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLP8 30301898
    473287 6gzz:G1 (4.13) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0DOY8 30301898
    473288 6gzz:G2 (4.13) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0DOY8 30301898
    473289 6gzz:G3 (4.13) BS01 rna ? GO:0000049 ... P17291 30301898
    473290 6gzz:G4 (4.13) BS01 rna ? GO:0000049 ... P17291 30301898
    473291 6gzz:H1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ1 30301898
    473292 6gzz:H2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ1 30301898
    473293 6gzz:H3 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY9 30301898
    473294 6gzz:H4 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY9 30301898
    473295 6gzz:I1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003729 ... P60488 30301898
    473296 6gzz:I2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003729 ... P60488 30301898
    473297 6gzz:I3 (4.13) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80374 30301898
    473298 6gzz:I4 (4.13) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80374 30301898
    473299 6gzz:J1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 30301898
    473300 6gzz:J1 (4.13) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 30301898
    473301 6gzz:J2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 30301898
    473302 6gzz:J2 (4.13) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 30301898
    473303 6gzz:J3 (4.13) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN7 30301898
    473304 6gzz:J4 (4.13) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN7 30301898
    473305 6gzz:J4 (4.13) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN7 30301898
    473306 6gzz:K1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 30301898
    473307 6gzz:K2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 30301898
    473308 6gzz:K3 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80376 30301898
    473309 6gzz:K4 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80376 30301898
    473310 6gzz:L1 (4.13) BS01 rna ? GO:0000049 ... P60489 30301898
    473311 6gzz:L1 (4.13) BS02 rna ? GO:0000049 ... P60489 30301898
    473312 6gzz:L2 (4.13) BS01 rna ? GO:0000049 ... P60489 30301898
    473313 6gzz:L2 (4.13) BS02 rna ? GO:0000049 ... P60489 30301898
    473314 6gzz:L3 (4.13) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN3 30301898
    473315 6gzz:L4 (4.13) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN3 30301898
    473316 6gzz:M1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q9Z9H5 30301898
    473317 6gzz:M2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q9Z9H5 30301898
    473318 6gzz:M3 (4.13) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80377 30301898
    473319 6gzz:M4 (4.13) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80377 30301898
    473320 6gzz:N1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 30301898
    473321 6gzz:N1 (4.13) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 30301898
    473322 6gzz:N2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 30301898
    473323 6gzz:N2 (4.13) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 30301898
    473324 6gzz:N3 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY6 30301898
    473325 6gzz:N4 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY6 30301898
    473326 6gzz:O1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60490 30301898
    473327 6gzz:O1 (4.13) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60490 30301898
    473328 6gzz:O2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60490 30301898
    473329 6gzz:O2 (4.13) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60490 30301898
    473330 6gzz:O3 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 30301898
    473331 6gzz:O4 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 30301898
    473332 6gzz:P1 (4.13) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60491 30301898
    473333 6gzz:P2 (4.13) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60491 30301898
    473334 6gzz:P3 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJH3 30301898
    473335 6gzz:P4 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJH3 30301898
    473336 6gzz:Q1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003723 ... P60492 30301898
    473337 6gzz:Q2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003723 ... P60492 30301898
    473338 6gzz:Q3 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY7 30301898
    473339 6gzz:Q4 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY7 30301898
    473340 6gzz:R1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP3 30301898
    473341 6gzz:R2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP3 30301898
    473342 6gzz:R3 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ0 30301898
    473343 6gzz:R4 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ0 30301898
    473344 6gzz:S1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP0 30301898
    473345 6gzz:S2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP0 30301898
    473346 6gzz:S3 (4.13) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP2 30301898
    473347 6gzz:S4 (4.13) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP2 30301898
    473348 6gzz:T1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP9 30301898
    473349 6gzz:T2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP9 30301898
    473350 6gzz:T3 (4.13) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80380 30301898
    473351 6gzz:T4 (4.13) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80380 30301898
    473352 6gzz:U1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHZ1 30301898
    473353 6gzz:U1 (4.13) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHZ1 30301898
    473354 6gzz:U2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHZ1 30301898
    473355 6gzz:U2 (4.13) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHZ1 30301898
    473356 6gzz:V1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60493 30301898
    473357 6gzz:V1 (4.13) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60493 30301898
    473358 6gzz:V2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60493 30301898
    473359 6gzz:V2 (4.13) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60493 30301898
    473360 6gzz:V3 (4.13) BS01 rna ? GO:0044238 ... Q5SIS0 30301898
    473361 6gzz:V4 (4.13) BS01 rna ? GO:0044238 ... Q5SIS0 30301898
    473362 6gzz:W1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60494 30301898
    473363 6gzz:W2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60494 30301898
    473364 6gzz:X1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP6 30301898
    473365 6gzz:X2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP6 30301898
    473366 6gzz:Y1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 30301898
    473367 6gzz:Y1 (4.13) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 30301898
    473368 6gzz:Y2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 30301898
    473369 6gzz:Y2 (4.13) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 30301898
    473370 6gzz:Z1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJE1 30301898
    473371 6gzz:Z2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJE1 30301898
    473372 6gzz:Z2 (4.13) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SJE1 30301898
    473373 6gzz:a1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80339 30301898
    473374 6gzz:a2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80339 30301898
    473375 6gzz:b1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P35871 30301898
    473376 6gzz:b2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P35871 30301898
    473377 6gzz:c1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80340 30301898
    473378 6gzz:c2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80340 30301898
    473379 6gzz:d1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SKU1 30301898
    473380 6gzz:d2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SKU1 30301898
    473381 6gzz:e1 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHR2 30301898
    473382 6gzz:e2 (4.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHR2 30301898
    473383 6h00:A (1.66) BS01 FMN 1.4.3.5 GO:0004733 ... Q9NVS9 N/A
    473384 6h06:A (2.63) BS01 peptide N/A N/A N/A 30001207
    473385 6h06:A (2.63) BS02 peptide N/A N/A N/A 30001207
    473386 6h06:B (2.63) BS01 peptide N/A N/A N/A 30001207
    473387 6h06:C (2.63) BS01 peptide N/A N/A N/A 30001207
    473388 6h06:D (2.63) BS01 peptide N/A N/A N/A 30001207
    473389 6h06:E (2.63) BS01 peptide N/A N/A N/A 30001207
    473390 6h06:F (2.63) BS01 peptide N/A N/A N/A 30001207
    473391 6h06:H (2.63) BS01 peptide N/A N/A N/A 30001207
    473392 6h06:L (2.63) BS01 peptide N/A N/A N/A 30001207
    473393 6h08:A (1.9) BS01 HEM 1.11.1.5 GO:0004601 ... P00431 32550044
    473394 6h08:A (1.9) BS02 CO 1.11.1.5 GO:0004601 ... P00431 32550044
    473395 6h08:A (1.9) BS03 MN 1.11.1.5 GO:0004601 ... P00431 32550044
    473396 6h08:B (1.9) BS01 HEM 1.11.1.5 GO:0004601 ... P00431 32550044
    473397 6h08:B (1.9) BS02 CO 1.11.1.5 GO:0004601 ... P00431 32550044
    473398 6h08:B (1.9) BS03 CO 1.11.1.5 GO:0004601 ... P00431 32550044
    473399 6h08:C (1.9) BS01 HEM 1.11.1.5 GO:0004601 ... P00431 32550044
    473400 6h08:C (1.9) BS02 CO 1.11.1.5 GO:0004601 ... P00431 32550044

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).