SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2799 2800 2801 2802 2803 2804 2805 2806 2807 2808 2809 2810 2811 2812 2813 2814 2815 2816 2817 2818 2819 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    561601 6uw6:A (3.66) BS01 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561602 6uw6:A (3.66) BS02 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561603 6uw6:A (3.66) BS03 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561604 6uw6:A (3.66) BS04 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561605 6uw6:B (3.66) BS01 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561606 6uw6:B (3.66) BS02 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561607 6uw6:B (3.66) BS03 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561608 6uw6:B (3.66) BS04 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561609 6uw6:C (3.66) BS01 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561610 6uw6:C (3.66) BS02 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561611 6uw6:C (3.66) BS03 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561612 6uw6:C (3.66) BS04 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561613 6uw6:D (3.66) BS01 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561614 6uw6:D (3.66) BS02 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561615 6uw6:D (3.66) BS03 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561616 6uw6:D (3.66) BS04 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561617 6uw6:D (3.66) BS05 6OU ? GO:0005216 ... Q8NET8 32572252
    561618 6uw7:B (2.342) BS01 QMD 2.7.8.28 GO:0000287 ... A0QTG2 32430409
    561619 6uw7:B (2.342) BS02 CA 2.7.8.28 GO:0000287 ... A0QTG2 32430409
    561620 6uwa:A (1.2) BS01 ZN 2.7.11.13 N/A Q4VA93 N/A
    561621 6uwa:A (1.2) BS02 ZN 2.7.11.13 N/A Q4VA93 N/A
    561622 6uwb:A (1.95) BS01 QJY 2.7.7.-
    2.7.7.49
    2.7.7.7
    3.1.-.-
    3.1.13.2
    3.1.26.13
    3.4.23.16
    GO:0004190 ... P03367 34978889
    561623 6uwb:B (1.95) BS01 QJY 2.7.7.-
    2.7.7.49
    2.7.7.7
    3.1.-.-
    3.1.13.2
    3.1.26.13
    3.4.23.16
    GO:0004190 ... P03367 34978889
    561624 6uwc:A (1.95) BS01 QK1 2.7.7.-
    2.7.7.49
    2.7.7.7
    3.1.-.-
    3.1.13.2
    3.1.26.13
    3.4.23.16
    GO:0004190 ... P03367 34978889
    561625 6uwc:B (1.95) BS01 QK1 2.7.7.-
    2.7.7.49
    2.7.7.7
    3.1.-.-
    3.1.13.2
    3.1.26.13
    3.4.23.16
    GO:0004190 ... P03367 34978889
    561626 6uwe:A (1.6) BS01 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561627 6uwe:A (1.6) BS02 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561628 6uwe:A (1.6) BS03 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561629 6uwe:A (1.6) BS04 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561630 6uwe:B (1.6) BS01 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561631 6uwe:B (1.6) BS02 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561632 6uwe:B (1.6) BS03 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561633 6uwe:B (1.6) BS04 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561634 6uwe:C (1.6) BS01 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561635 6uwe:C (1.6) BS02 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561636 6uwe:C (1.6) BS03 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561637 6uwe:C (1.6) BS04 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561638 6uwe:D (1.6) BS01 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561639 6uwe:D (1.6) BS02 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561640 6uwe:D (1.6) BS03 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561641 6uwe:D (1.6) BS04 CU ? N/A W0DP94 32094184
    561642 6uwf:A (3.08) BS01 ASP ? GO:0005283 ... O59010 32514183
    561643 6uwf:A (3.08) BS02 6OU ? GO:0005283 ... O59010 32514183
    561644 6uwf:A (3.08) BS03 6OU ? GO:0005283 ... O59010 32514183
    561645 6uwg:A (2.22) BS01 dna N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561646 6uwg:A (2.22) BS02 dna N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561647 6uwg:A (2.22) BS03 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561648 6uwg:A (2.22) BS04 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561649 6uwg:A (2.22) BS05 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561650 6uwg:A (2.22) BS06 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561651 6uwh:A (2.299) BS01 dna N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561652 6uwh:A (2.299) BS02 dna N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561653 6uwh:A (2.299) BS03 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561654 6uwh:A (2.299) BS04 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561655 6uwh:A (2.299) BS05 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561656 6uwh:A (2.299) BS06 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561657 6uwi:A (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561658 6uwi:A (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561659 6uwi:A (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561660 6uwi:A (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561661 6uwi:A (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561662 6uwi:A (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561663 6uwi:B (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561664 6uwi:B (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561665 6uwi:B (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561666 6uwi:B (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561667 6uwi:B (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561668 6uwi:B (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561669 6uwi:C (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561670 6uwi:C (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561671 6uwi:C (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561672 6uwi:C (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561673 6uwi:C (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561674 6uwi:C (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561675 6uwi:D (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561676 6uwi:D (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561677 6uwi:D (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561678 6uwi:D (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561679 6uwi:D (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561680 6uwi:D (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561681 6uwi:E (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561682 6uwi:E (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561683 6uwi:E (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561684 6uwi:E (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561685 6uwi:E (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561686 6uwi:E (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561687 6uwi:F (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561688 6uwi:F (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561689 6uwi:F (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561690 6uwi:F (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561691 6uwi:F (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561692 6uwi:F (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561693 6uwi:G (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561694 6uwi:G (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561695 6uwi:G (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561696 6uwi:G (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561697 6uwi:G (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561698 6uwi:G (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561699 6uwi:H (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561700 6uwi:H (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561701 6uwi:H (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561702 6uwi:H (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561703 6uwi:H (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561704 6uwi:H (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561705 6uwi:I (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561706 6uwi:I (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561707 6uwi:I (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561708 6uwi:I (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561709 6uwi:I (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561710 6uwi:I (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561711 6uwi:J (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561712 6uwi:J (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561713 6uwi:J (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561714 6uwi:J (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561715 6uwi:J (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561716 6uwi:J (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561717 6uwi:K (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561718 6uwi:K (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561719 6uwi:K (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561720 6uwi:K (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561721 6uwi:K (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561722 6uwi:K (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561723 6uwi:L (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561724 6uwi:L (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561725 6uwi:L (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561726 6uwi:L (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561727 6uwi:L (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561728 6uwi:L (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561729 6uwi:M (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561730 6uwi:M (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561731 6uwi:M (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561732 6uwi:M (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561733 6uwi:M (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561734 6uwi:M (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561735 6uwi:N (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561736 6uwi:N (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561737 6uwi:N (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561738 6uwi:N (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561739 6uwi:N (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561740 6uwi:N (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561741 6uwi:a (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561742 6uwi:a (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561743 6uwi:a (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561744 6uwi:a (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561745 6uwi:a (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561746 6uwi:a (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561747 6uwi:b (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561748 6uwi:b (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561749 6uwi:b (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561750 6uwi:b (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561751 6uwi:b (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561752 6uwi:b (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561753 6uwi:c (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561754 6uwi:c (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561755 6uwi:c (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561756 6uwi:c (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561757 6uwi:c (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561758 6uwi:c (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561759 6uwi:d (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561760 6uwi:d (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561761 6uwi:d (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561762 6uwi:d (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561763 6uwi:d (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561764 6uwi:d (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561765 6uwi:e (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561766 6uwi:e (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561767 6uwi:e (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561768 6uwi:e (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561769 6uwi:e (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561770 6uwi:e (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561771 6uwi:f (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561772 6uwi:f (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561773 6uwi:f (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561774 6uwi:f (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561775 6uwi:f (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561776 6uwi:f (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561777 6uwi:g (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561778 6uwi:g (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561779 6uwi:g (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561780 6uwi:g (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561781 6uwi:g (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561782 6uwi:g (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561783 6uwi:h (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561784 6uwi:h (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561785 6uwi:h (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561786 6uwi:h (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561787 6uwi:h (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561788 6uwi:h (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561789 6uwi:i (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561790 6uwi:i (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561791 6uwi:i (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561792 6uwi:i (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561793 6uwi:i (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561794 6uwi:i (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561795 6uwi:j (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561796 6uwi:j (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561797 6uwi:j (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561798 6uwi:j (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561799 6uwi:j (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561800 6uwi:j (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).