SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2800 2801 2802 2803 2804 2805 2806 2807 2808 2809 2810 2811 2812 2813 2814 2815 2816 2817 2818 2819 2820 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    561801 6uwi:k (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561802 6uwi:k (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561803 6uwi:k (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561804 6uwi:k (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561805 6uwi:k (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561806 6uwi:k (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561807 6uwi:l (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561808 6uwi:l (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561809 6uwi:l (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561810 6uwi:l (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561811 6uwi:l (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561812 6uwi:l (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561813 6uwi:m (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561814 6uwi:m (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561815 6uwi:m (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561816 6uwi:m (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561817 6uwi:m (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561818 6uwi:m (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561819 6uwi:n (3.7) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561820 6uwi:n (3.7) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561821 6uwi:n (3.7) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561822 6uwi:n (3.7) BS04 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561823 6uwi:n (3.7) BS05 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561824 6uwi:n (3.7) BS06 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561825 6uwj:A (1.852) BS01 dna N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561826 6uwj:A (1.852) BS02 dna N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561827 6uwj:A (1.852) BS03 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561828 6uwj:A (1.852) BS04 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561829 6uwj:A (1.852) BS05 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561830 6uwk:A (2.533) BS01 dna N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561831 6uwk:A (2.533) BS02 dna N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561832 6uwk:A (2.533) BS03 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561833 6uwk:A (2.533) BS04 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561834 6uwk:A (2.533) BS05 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561835 6uwk:A (2.533) BS06 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561836 6uwk:A (2.533) BS07 CA N/A GO:0004519 ... N/A 32359399
    561837 6uwl:A (3.62) BS01 ASP ? GO:0005283 ... O59010 32514183
    561838 6uwl:A (3.62) BS02 6OU ? GO:0005283 ... O59010 32514183
    561839 6uwn:A (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561840 6uwn:A (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561841 6uwn:A (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561842 6uwn:B (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561843 6uwn:B (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561844 6uwn:B (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561845 6uwn:C (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561846 6uwn:C (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561847 6uwn:C (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561848 6uwn:D (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561849 6uwn:D (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561850 6uwn:D (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561851 6uwn:E (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561852 6uwn:E (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561853 6uwn:E (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561854 6uwn:F (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561855 6uwn:F (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561856 6uwn:G (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561857 6uwn:G (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561858 6uwn:G (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561859 6uwn:H (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561860 6uwn:H (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561861 6uwp:A (1.29) BS01 QKA 3.4.23.46 GO:0004190 ... P56817 31786008 MOAD: ic50=0.028uM
    BindingDB: IC50=18nM
    561862 6uwp:B (1.29) BS01 QKA 3.4.23.46 GO:0004190 ... P56817 31786008 MOAD: ic50=0.028uM
    BindingDB: IC50=18nM
    561863 6uwq:A (1.5) BS01 NAP 1.5.1.3 GO:0000166 ... A0PQG8 N/A
    561864 6uwq:A (1.5) BS02 QKJ 1.5.1.3 GO:0000166 ... A0PQG8 N/A
    561865 6uwr:A (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561866 6uwr:A (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561867 6uwr:A (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561868 6uwr:B (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561869 6uwr:B (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561870 6uwr:B (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561871 6uwr:C (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561872 6uwr:C (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561873 6uwr:C (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561874 6uwr:D (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561875 6uwr:D (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561876 6uwr:D (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561877 6uwr:E (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561878 6uwr:E (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561879 6uwr:E (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561880 6uwr:F (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561881 6uwr:F (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561882 6uwr:F (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561883 6uwr:G (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561884 6uwr:G (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561885 6uwr:G (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561886 6uwr:H (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561887 6uwr:H (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561888 6uwr:H (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561889 6uwr:I (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561890 6uwr:I (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561891 6uwr:I (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561892 6uwr:J (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561893 6uwr:J (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561894 6uwr:J (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561895 6uwr:K (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561896 6uwr:K (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561897 6uwr:K (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561898 6uwr:L (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561899 6uwr:L (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561900 6uwr:L (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561901 6uwr:M (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561902 6uwr:M (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561903 6uwr:M (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561904 6uwr:N (2.8) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561905 6uwr:N (2.8) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561906 6uwr:N (2.8) BS03 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561907 6uwt:A (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561908 6uwt:A (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561909 6uwt:B (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561910 6uwt:B (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561911 6uwt:C (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561912 6uwt:C (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561913 6uwt:D (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561914 6uwt:D (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561915 6uwt:E (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561916 6uwt:E (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561917 6uwt:F (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561918 6uwt:F (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561919 6uwt:G (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561920 6uwt:G (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561921 6uwt:H (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561922 6uwt:H (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561923 6uwt:I (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561924 6uwt:I (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561925 6uwt:J (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561926 6uwt:J (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561927 6uwt:K (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561928 6uwt:K (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561929 6uwt:L (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561930 6uwt:L (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561931 6uwt:M (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561932 6uwt:M (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561933 6uwt:N (3.1) BS01 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561934 6uwt:N (3.1) BS02 CA ? GO:0005576 ... O32739 31896582
    561935 6uwu:A (2.0) BS01 QKP ? N/A O60885 32255647 MOAD: ic50~70nM
    BindingDB: Kd=718nM, IC50=280nM
    561936 6uwv:A (1.47) BS01 QK7 3.4.23.46 GO:0004190 ... P56817 31786008 MOAD: ic50=0.01uM
    BindingDB: IC50=10.0nM
    561937 6uwv:B (1.47) BS01 QK7 3.4.23.46 GO:0004190 ... P56817 31786008 MOAD: ic50=0.01uM
    BindingDB: IC50=10.0nM
    561938 6uww:A (0.92) BS01 MMV 1.5.1.3 GO:0000166 ... A0PQG8 N/A
    561939 6uww:A (0.92) BS02 NAP 1.5.1.3 GO:0000166 ... A0PQG8 N/A
    561940 6uwx:A (1.307) BS01 QKD ? N/A O60885 31857841 MOAD: Kd=290uM
    BindingDB: Kd=290000nM
    561941 6uwy:A (2.95) BS01 QKG 2.7.11.23
    2.7.12.1
    GO:0004672 ... Q13627 32003560 BindingDB: IC50=25nM
    561942 6uwy:B (2.95) BS01 QKG 2.7.11.23
    2.7.12.1
    GO:0004672 ... Q13627 32003560 BindingDB: IC50=25nM
    561943 6uwy:C (2.95) BS01 QKG 2.7.11.23
    2.7.12.1
    GO:0004672 ... Q13627 32003560 BindingDB: IC50=25nM
    561944 6uwy:D (2.95) BS01 QKG 2.7.11.23
    2.7.12.1
    GO:0004672 ... Q13627 32003560 BindingDB: IC50=25nM
    561945 6uwz:A (2.69) BS01 MAN ? GO:0004888 ... P02710 32275860
    561946 6uwz:D (2.69) BS01 MAN ? GO:0004888 ... P02710 32275860
    561947 6uwz:G (2.69) BS01 MAN ? GO:0005515 ... P60615 32275860
    561948 6ux0:A (2.93) BS01 HEM ? GO:0004497 ... L8GJB3 33008918
    561949 6ux0:A (2.93) BS02 QKM ? GO:0004497 ... L8GJB3 33008918
    561950 6ux0:B (2.93) BS01 HEM ? GO:0004497 ... L8GJB3 33008918
    561951 6ux0:B (2.93) BS02 QKM ? GO:0004497 ... L8GJB3 33008918
    561952 6ux0:C (2.93) BS01 HEM ? GO:0004497 ... L8GJB3 33008918
    561953 6ux0:C (2.93) BS02 QKM ? GO:0004497 ... L8GJB3 33008918
    561954 6ux0:D (2.93) BS01 HEM ? GO:0004497 ... L8GJB3 33008918
    561955 6ux0:D (2.93) BS02 QKM ? GO:0004497 ... L8GJB3 33008918
    561956 6ux0:E (2.93) BS01 HEM ? GO:0004497 ... L8GJB3 33008918
    561957 6ux0:E (2.93) BS02 QKM ? GO:0004497 ... L8GJB3 33008918
    561958 6ux0:F (2.93) BS01 HEM ? GO:0004497 ... L8GJB3 33008918
    561959 6ux0:F (2.93) BS02 QKM ? GO:0004497 ... L8GJB3 33008918
    561960 6ux1:A (1.36) BS01 ZN 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 32244293
    561961 6ux1:A (1.36) BS02 SAL 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 32244293 MOAD: ic50=6.6mM
    BindingDB: Ki=7100nM, IC50=680000nM
    561962 6ux1:A (1.36) BS03 SAL 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 32244293 MOAD: ic50=6.6mM
    BindingDB: Ki=7100nM, IC50=680000nM
    561963 6ux1:A (1.36) BS04 SAL 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 32244293 MOAD: ic50=6.6mM
    BindingDB: Ki=7100nM, IC50=680000nM
    561964 6ux2:B (3.01) BS01 ZN 2.1.1.56
    2.1.1.57
    2.7.7.48
    3.4.21.91
    3.6.1.15
    3.6.4.13
    GO:0003968 ... Q32ZE1 32778820
    561965 6ux2:B (3.01) BS02 ZN 2.1.1.56
    2.1.1.57
    2.7.7.48
    3.4.21.91
    3.6.1.15
    3.6.4.13
    GO:0003968 ... Q32ZE1 32778820
    561966 6ux4:A (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561967 6ux4:A (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561968 6ux4:A (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561969 6ux4:B (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561970 6ux4:B (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561971 6ux4:C (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561972 6ux4:C (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561973 6ux4:C (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561974 6ux4:D (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561975 6ux4:D (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561976 6ux4:D (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561977 6ux4:E (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561978 6ux4:E (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561979 6ux4:E (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561980 6ux4:F (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561981 6ux4:F (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561982 6ux4:F (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561983 6ux4:G (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561984 6ux4:G (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561985 6ux4:G (3.5) BS03 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561986 6ux4:H (3.5) BS01 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561987 6ux4:H (3.5) BS02 CA ? GO:0005886 ... O27564 32269335
    561988 6ux6:A (1.94) BS01 TM8 3.4.22.51 GO:0006508 ... P25779 N/A
    561989 6ux8:A (2.5) BS01 ZN ? GO:0007166 ... Q8NB16 32234780
    561990 6ux8:A (2.5) BS02 ZN ? GO:0007166 ... Q8NB16 32234780
    561991 6ux8:B (2.5) BS01 ZN N/A N/A N/A 32234780
    561992 6ux9:A (1.71) BS01 UHJ 2.7.1.149 GO:0046488 ... P48426 32298120 BindingDB: IC50=270nM
    561993 6ux9:B (1.71) BS01 UHJ 2.7.1.149 GO:0046488 ... P48426 32298120 BindingDB: IC50=270nM
    561994 6uxe:A (1.57) BS01 PLP 2.8.1.7 GO:0030170 ... Q9Y697 N/A
    561995 6uxe:B (1.57) BS01 EDT ? GO:0005515 ... Q9HD34 N/A
    561996 6uxe:B (1.57) BS02 8Q1 ? GO:0005515 ... Q9HD34 N/A
    561997 6uxi:A (2.1) BS01 PLG 2.1.2.1 GO:0004372 ... A0A0R0IK90 32014996
    561998 6uxi:A (2.1) BS02 PLG 2.1.2.1 GO:0004372 ... A0A0R0IK90 32014996
    561999 6uxi:B (2.1) BS01 PLG 2.1.2.1 GO:0004372 ... A0A0R0IK90 32014996
    562000 6uxi:B (2.1) BS02 PLG 2.1.2.1 GO:0004372 ... A0A0R0IK90 32014996

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).