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BioLiP
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    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    57001 1v5g:A (1.96) BS02 FAD N/A GO:0000287 ... N/A 18007037
    57002 1v5g:A (1.96) BS03 HTL N/A GO:0000287 ... N/A 18007037
    57003 1v5h:A (2.4) BS01 HEM 1.11.1.-
    1.14.12.-
    1.15.1.1
    1.7.-.-
    GO:0001666 ... Q8WWM9 15165856
    57004 1v5i:A (1.5) BS01 CA 3.4.21.62 GO:0004252 ... P00782 N/A
    57005 1v5n:A (-1.00) BS01 ZN 1.8.1.8 N/A O80763 N/A
    57006 1v5n:A (-1.00) BS02 ZN 1.8.1.8 N/A O80763 N/A
    57007 1v5r:A (-1.00) BS01 ZN ? GO:0008017 ... P11862 N/A
    57008 1v5y:A (1.9) BS01 FMN 1.6.99.- GO:0016491 ... P46072 N/A
    57009 1v5y:A (1.9) BS02 4HC 1.6.99.- GO:0016491 ... P46072 N/A
    57010 1v5y:A (1.9) BS03 FMN 1.6.99.- GO:0016491 ... P46072 N/A
    57011 1v5y:B (1.9) BS01 FMN 1.6.99.- GO:0016491 ... P46072 N/A
    57012 1v5y:B (1.9) BS02 FMN 1.6.99.- GO:0016491 ... P46072 N/A
    57013 1v5y:B (1.9) BS03 4HC 1.6.99.- GO:0016491 ... P46072 N/A
    57014 1v5z:A (2.0) BS01 FMN 1.6.99.- GO:0016491 ... P46072 N/A
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    57017 1v5z:A (2.0) BS04 2HC 1.6.99.- GO:0016491 ... P46072 N/A
    57018 1v5z:B (2.0) BS01 FMN 1.6.99.- GO:0016491 ... P46072 N/A
    57019 1v5z:B (2.0) BS02 2HC 1.6.99.- GO:0016491 ... P46072 N/A
    57020 1v5z:B (2.0) BS03 FMN 1.6.99.- GO:0016491 ... P46072 N/A
    57021 1v5z:B (2.0) BS04 2HC 1.6.99.- GO:0016491 ... P46072 N/A
    57022 1v67:A (2.3) BS01 ZN 4.2.1.1 N/A O59257 18931408
    57023 1v67:A (2.3) BS02 CA 4.2.1.1 N/A O59257 18931408
    57024 1v6a:A (2.3) BS01 GLC 1.1.1.27 GO:0003824 ... Q9W7K5 N/A
    57025 1v6a:A (2.3) BS02 GLC 1.1.1.27 GO:0003824 ... Q9W7K5 N/A
    57026 1v6a:A (2.3) BS03 GLC 1.1.1.27 GO:0003824 ... Q9W7K5 N/A
    57027 1v6a:B (2.3) BS01 GLC 1.1.1.27 GO:0003824 ... Q9W7K5 N/A
    57028 1v6c:A (1.8) BS01 CA 3.4.21.- GO:0004252 ... Q65Z69 N/A
    57029 1v6c:A (1.8) BS02 CA 3.4.21.- GO:0004252 ... Q65Z69 N/A
    57030 1v6c:A (1.8) BS03 CA 3.4.21.- GO:0004252 ... Q65Z69 N/A
    57031 1v6c:B (1.8) BS01 CA 3.4.21.- GO:0004252 ... Q65Z69 N/A
    57032 1v6c:B (1.8) BS02 CA 3.4.21.- GO:0004252 ... Q65Z69 N/A
    57033 1v6c:B (1.8) BS03 CA 3.4.21.- GO:0004252 ... Q65Z69 N/A
    57034 1v6d:A (1.9) BS01 peptide 3.4.21.4 GO:0004252 ... P00761 15842169
    57035 1v6d:A (1.9) BS02 CA 3.4.21.4 GO:0004252 ... P00761 15842169
    57036 1v6d:A (1.9) BS03 ACT 3.4.21.4 GO:0004252 ... P00761 15842169
    57037 1v6g:A (-1.00) BS01 ZN ? N/A Q6H8Q1 N/A
    57038 1v6g:A (-1.00) BS02 ZN ? N/A Q6H8Q1 N/A
    57039 1v6i:A (2.15) BS01 GAL ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57040 1v6i:A (2.15) BS02 CA ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57041 1v6i:A (2.15) BS03 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
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    57043 1v6i:B (2.15) BS02 GAL ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57044 1v6i:B (2.15) BS03 CA ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57045 1v6i:B (2.15) BS04 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57046 1v6i:C (2.15) BS01 GLC ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57047 1v6i:C (2.15) BS02 GAL ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57048 1v6i:C (2.15) BS03 CA ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57049 1v6i:C (2.15) BS04 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
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    57051 1v6i:D (2.15) BS02 GAL ? GO:0030246 ... P02872 14747696
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    57053 1v6i:D (2.15) BS04 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
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    57064 1v6j:C (2.9) BS04 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57065 1v6j:D (2.9) BS01 GLC ? GO:0030246 ... P02872 14747696
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    57096 1v6l:C (2.5) BS04 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
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    57100 1v6l:D (2.5) BS04 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
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    57106 1v6m:C (2.7) BS02 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57107 1v6m:D (2.7) BS01 CA ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57108 1v6m:D (2.7) BS02 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57109 1v6m:E (2.7) BS01 CA ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57110 1v6m:E (2.7) BS02 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57111 1v6m:F (2.7) BS01 CA ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57112 1v6m:F (2.7) BS02 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
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    57114 1v6m:G (2.7) BS02 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
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    57116 1v6m:H (2.7) BS02 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
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    57118 1v6n:A (3.5) BS02 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
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    57120 1v6n:B (3.5) BS02 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57121 1v6n:C (3.5) BS01 CA ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57122 1v6n:C (3.5) BS02 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57123 1v6n:D (3.5) BS01 CA ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57124 1v6n:D (3.5) BS02 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57125 1v6n:E (3.5) BS01 CA ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57126 1v6n:E (3.5) BS02 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57127 1v6n:F (3.5) BS01 CA ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57128 1v6n:F (3.5) BS02 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57129 1v6n:G (3.5) BS01 CA ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57130 1v6n:G (3.5) BS02 MN ? GO:0030246 ... P02872 14747696
    57131 1v6n:H (3.5) BS01 CA ? GO:0030246 ... P02872 14747696
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    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).