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BioLiP
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    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    576201 6wy5:E (2.898) BS04 UF7 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
    576202 6wy6:A (1.773) BS01 peptide ? GO:0000045 ... P38182 33207182
    576203 6wy6:B (1.773) BS01 peptide ? GO:0000045 ... P38182 33207182
    576204 6wy7:A (2.089) BS01 HEC 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
    576205 6wy7:B (2.089) BS01 MAN 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
    576206 6wy7:B (2.089) BS02 HEC 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
    576207 6wy7:B (2.089) BS03 CA 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
    576208 6wy7:B (2.089) BS04 UFD 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547 MOAD: Kd=5nM
    576209 6wy7:D (2.089) BS01 HEC 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
    576210 6wy7:E (2.089) BS01 MAN 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
    576211 6wy7:E (2.089) BS02 HEC 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
    576212 6wy7:E (2.089) BS03 CA 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
    576213 6wy7:E (2.089) BS04 UFD 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547 MOAD: Kd=5nM
    576214 6wy8:A (2.1) BS01 FAD ? GO:0000166 ... D1AB76 33040522
    576215 6wy8:B (2.1) BS01 FAD ? GO:0000166 ... D1AB78 33040522
    576216 6wy8:C (2.1) BS01 FAD ? GO:0000166 ... D1AB76 33040522
    576217 6wy8:D (2.1) BS01 FAD ? GO:0000166 ... D1AB78 33040522
    576218 6wy9:A (2.0) BS01 FDA ? GO:0000166 ... D1AB78 33040522
    576219 6wy9:B (2.0) BS01 FDA ? GO:0000166 ... D1AB76 33040522
    576220 6wya:A (2.41) BS01 dna 2.7.7.7 GO:0000166 ... D0VWU9 32817521
    576221 6wya:A (2.41) BS02 dna 2.7.7.7 GO:0000166 ... D0VWU9 32817521
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    576223 6wya:A (2.41) BS04 DZ4 2.7.7.7 GO:0000166 ... D0VWU9 32817521
    576224 6wyb:A (2.5) BS01 rna 2.7.7.7 GO:0000166 ... D0VWU9 32817521
    576225 6wyb:A (2.5) BS02 dna 2.7.7.7 GO:0000166 ... D0VWU9 32817521
    576226 6wyc:A (1.5) BS01 NAD 1.2.1.12 GO:0000166 ... P0CE13 33058314
    576227 6wyc:B (1.5) BS01 NAD 1.2.1.12 GO:0000166 ... P0CE13 33058314
    576228 6wyc:C (1.5) BS01 NAD 1.2.1.12 GO:0000166 ... P0CE13 33058314
    576229 6wyc:D (1.5) BS01 NAD 1.2.1.12 GO:0000166 ... P0CE13 33058314
    576230 6wyd:A (2.55) BS01 HEC 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
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    576234 6wyd:B (2.55) BS04 CA 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
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    576236 6wyd:E (2.55) BS01 BMA 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
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    576242 6wyd:F (2.55) BS01 HEC 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
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    576250 6wyd:I (2.55) BS01 7GD 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
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    576254 6wyd:I (2.55) BS05 HEC 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
    576255 6wyd:I (2.55) BS06 CA 1.11.2.2 GO:0004601 ... P05164 33007547
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    576258 6wye:B (2.01) BS01 LMR 2.3.1.30 GO:0005737 ... Q5F6X0 34890451
    576259 6wye:B (2.01) BS02 LMR 2.3.1.30 GO:0005737 ... Q5F6X0 34890451
    576260 6wye:C (2.01) BS01 LMR 2.3.1.30 GO:0005737 ... Q5F6X0 34890451
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    576262 6wye:D (2.01) BS02 LMR 2.3.1.30 GO:0005737 ... Q5F6X0 34890451
    576263 6wye:E (2.01) BS01 LMR 2.3.1.30 GO:0005737 ... Q5F6X0 34890451
    576264 6wye:F (2.01) BS01 LMR 2.3.1.30 GO:0005737 ... Q5F6X0 34890451
    576265 6wye:F (2.01) BS02 LMR 2.3.1.30 GO:0005737 ... Q5F6X0 34890451
    576266 6wyf:A (1.25) BS01 CA 1.16.3.1 GO:0004322 ... P02794 33124805
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    576268 6wyf:A (1.25) BS03 CA 1.16.3.1 GO:0004322 ... P02794 33124805
    576269 6wyf:A (1.25) BS04 CA 1.16.3.1 GO:0004322 ... P02794 33124805
    576270 6wyf:A (1.25) BS05 CA 1.16.3.1 GO:0004322 ... P02794 33124805
    576271 6wyf:A (1.25) BS06 FE 1.16.3.1 GO:0004322 ... P02794 33124805
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    576291 6wyh:C (2.22) BS03 CA 1.16.3.1 GO:0004322 ... P02794 33124805
    576292 6wyh:D (2.22) BS01 FE 1.16.3.1 GO:0004322 ... P02794 33124805
    576293 6wyh:D (2.22) BS02 FE 1.16.3.1 GO:0004322 ... P02794 33124805
    576294 6wyj:A (3.7) BS01 ASP ? GO:0005283 ... O59010 33597752
    576295 6wyk:A (4.0) BS01 ASP ? GO:0005283 ... O59010 33597752
    576296 6wyl:A (3.9) BS01 ASP ? GO:0005283 ... O59010 33597752
    576297 6wyl:B (3.9) BS01 ASP ? GO:0005283 ... O59010 33597752
    576298 6wyl:C (3.9) BS01 ASP ? GO:0005283 ... O59010 33597752
    576299 6wyo:A (2.3) BS01 ZN ? N/A F8W4B7 32880591
    576300 6wyo:A (2.3) BS02 TSN ? N/A F8W4B7 32880591
    576301 6wyo:A (2.3) BS03 TSN ? N/A F8W4B7 32880591
    576302 6wyo:B (2.3) BS01 TSN ? N/A F8W4B7 32880591
    576303 6wyo:B (2.3) BS02 ZN ? N/A F8W4B7 32880591
    576304 6wyo:B (2.3) BS03 TSN ? N/A F8W4B7 32880591
    576305 6wyp:A (2.40006) BS01 ZN ? N/A F8W4B7 32880591
    576306 6wyp:A (2.40006) BS02 UFS ? N/A F8W4B7 32880591
    576307 6wyq:A (1.90001) BS01 ZN ? N/A F8W4B7 32880591
    576308 6wyq:A (1.90001) BS02 UFJ ? N/A F8W4B7 32880591
    576309 6wyq:A (1.90001) BS03 UFJ ? N/A F8W4B7 32880591
    576310 6wyq:B (1.90001) BS01 UFJ ? N/A F8W4B7 32880591
    576311 6wyq:B (1.90001) BS02 ZN ? N/A F8W4B7 32880591
    576312 6wyq:B (1.90001) BS03 UFJ ? N/A F8W4B7 32880591
    576313 6wyu:A (1.76) BS01 HEC ? GO:0005506 ... P0ABE7 32830423
    576314 6wyu:B (1.76) BS01 HEC ? GO:0005506 ... P0ABE7 32830423
    576315 6wyu:C (1.76) BS01 HEC ? GO:0005506 ... P0ABE7 32830423
    576316 6wyv:K (2.75) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60422 32968273
    576317 6wyv:L (2.75) BS01 rna ? GO:0002181 ... P02413 32968273
    576318 6wyv:M (2.75) BS01 rna ? GO:0001070 ... P60723 32968273
    576319 6wyv:N (2.75) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60438 32968273
    576320 6wyv:O (2.75) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0AA10 32968273
    576321 6wyw:A (2.13) BS01 ASP 3.5.1.38 GO:0004067 ... Q88K39 N/A
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    576323 6wyw:C (2.13) BS01 ASP 3.5.1.38 GO:0004067 ... Q88K39 N/A
    576324 6wyw:D (2.13) BS01 ASP 3.5.1.38 GO:0004067 ... Q88K39 N/A
    576325 6wyx:A (1.48) BS01 ASP 3.5.1.38 GO:0004067 ... Q88K39 N/A
    576326 6wyx:B (1.48) BS01 ASP 3.5.1.38 GO:0004067 ... Q88K39 N/A
    576327 6wyx:C (1.48) BS01 ASP 3.5.1.38 GO:0004067 ... Q88K39 N/A
    576328 6wyx:D (1.48) BS01 ASP 3.5.1.38 GO:0004067 ... Q88K39 N/A
    576329 6wyy:A (1.35) BS01 GLU 3.5.1.38 GO:0004067 ... Q88K39 N/A
    576330 6wyy:B (1.35) BS01 GLU 3.5.1.38 GO:0004067 ... Q88K39 N/A
    576331 6wyy:C (1.35) BS01 GLU 3.5.1.38 GO:0004067 ... Q88K39 N/A
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    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).