SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 3018 3019 3020 3021 3022 3023 3024 3025 3026 3027 3028 3029 3030 3031 3032 3033 3034 3035 3036 3037 3038 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    605401 7b01:A (2.8) BS02 GLC 3.4.24.87 GO:0005515 ... P0AEX9
    Q76LX8
    33863735
    605402 7b02:A (1.45) BS01 FAD 1.8.1.9 GO:0000166 ... A0A3Q0KFL1 33950676
    605403 7b02:A (1.45) BS02 SJN 1.8.1.9 GO:0000166 ... A0A3Q0KFL1 33950676
    605404 7b03:A (2.93) BS01 RET ? GO:0005216 ... Q6J4G7 N/A
    605405 7b03:B (2.93) BS01 RET ? GO:0005216 ... Q6J4G7 N/A
    605406 7b03:C (2.93) BS01 RET ? GO:0005216 ... Q6J4G7 N/A
    605407 7b03:D (2.93) BS01 RET ? GO:0005216 ... Q6J4G7 N/A
    605408 7b03:E (2.93) BS01 RET ? GO:0005216 ... Q6J4G7 N/A
    605409 7b04:A (2.97) BS01 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605410 7b04:A (2.97) BS02 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605411 7b04:A (2.97) BS03 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605412 7b04:A (2.97) BS04 F3S 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605413 7b04:A (2.97) BS05 HEM 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605414 7b04:B (2.97) BS01 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605415 7b04:B (2.97) BS02 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605416 7b04:B (2.97) BS03 SF4 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605417 7b04:C (2.97) BS01 HEM ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605418 7b04:C (2.97) BS02 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605419 7b04:C (2.97) BS03 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605420 7b04:D (2.97) BS01 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605421 7b04:D (2.97) BS02 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605422 7b04:D (2.97) BS03 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605423 7b04:D (2.97) BS04 F3S 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605424 7b04:D (2.97) BS05 HEM 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605425 7b04:E (2.97) BS01 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605426 7b04:E (2.97) BS02 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605427 7b04:E (2.97) BS03 MO 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605428 7b04:E (2.97) BS04 SF4 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605429 7b04:F (2.97) BS01 HEM ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605430 7b04:F (2.97) BS02 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605431 7b04:F (2.97) BS03 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605432 7b04:G (2.97) BS01 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605433 7b04:G (2.97) BS02 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605434 7b04:G (2.97) BS03 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605435 7b04:G (2.97) BS04 F3S 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605436 7b04:G (2.97) BS05 HEM 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605437 7b04:H (2.97) BS01 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605438 7b04:H (2.97) BS02 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605439 7b04:H (2.97) BS03 SF4 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605440 7b04:I (2.97) BS01 HEM ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605441 7b04:I (2.97) BS02 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605442 7b04:I (2.97) BS03 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605443 7b04:J (2.97) BS01 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605444 7b04:J (2.97) BS02 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605445 7b04:J (2.97) BS03 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605446 7b04:J (2.97) BS04 F3S 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605447 7b04:J (2.97) BS05 HEM 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605448 7b04:K (2.97) BS01 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605449 7b04:K (2.97) BS02 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605450 7b04:K (2.97) BS03 SF4 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605451 7b04:L (2.97) BS01 HEM ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605452 7b04:L (2.97) BS02 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605453 7b04:L (2.97) BS03 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605454 7b04:M (2.97) BS01 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605455 7b04:M (2.97) BS02 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605456 7b04:M (2.97) BS03 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605457 7b04:M (2.97) BS04 F3S 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605458 7b04:M (2.97) BS05 HEM 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605459 7b04:N (2.97) BS01 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605460 7b04:N (2.97) BS02 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605461 7b04:N (2.97) BS03 SF4 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605462 7b04:O (2.97) BS01 HEM ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605463 7b04:O (2.97) BS02 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605464 7b04:O (2.97) BS03 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605465 7b04:P (2.97) BS01 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605466 7b04:P (2.97) BS02 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605467 7b04:P (2.97) BS03 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605468 7b04:P (2.97) BS04 F3S 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605469 7b04:P (2.97) BS05 HEM 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605470 7b04:Q (2.97) BS01 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605471 7b04:Q (2.97) BS02 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605472 7b04:Q (2.97) BS03 SF4 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605473 7b04:R (2.97) BS01 HEM ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605474 7b04:R (2.97) BS02 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605475 7b04:R (2.97) BS03 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605476 7b04:S (2.97) BS01 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605477 7b04:S (2.97) BS02 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605478 7b04:S (2.97) BS03 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605479 7b04:S (2.97) BS04 F3S 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605480 7b04:S (2.97) BS05 HEM 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605481 7b04:T (2.97) BS01 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605482 7b04:T (2.97) BS02 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605483 7b04:T (2.97) BS03 SF4 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605484 7b04:U (2.97) BS01 HEM ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605485 7b04:U (2.97) BS02 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605486 7b04:U (2.97) BS03 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605487 7b04:V (2.97) BS01 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605488 7b04:V (2.97) BS02 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605489 7b04:V (2.97) BS03 SF4 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605490 7b04:V (2.97) BS04 F3S 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605491 7b04:V (2.97) BS05 HEM 1.7.99.4 GO:0009055 ... Q1PZD5 N/A
    605492 7b04:W (2.97) BS01 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605493 7b04:W (2.97) BS02 MD1 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605494 7b04:W (2.97) BS03 SF4 1.7.99.4 GO:0016491 ... Q1PZD8 N/A
    605495 7b04:X (2.97) BS01 HEM ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605496 7b04:X (2.97) BS02 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605497 7b04:X (2.97) BS03 CA ? GO:0020037 ... Q1PZD4 N/A
    605498 7b05:A (3.8) BS01 SJQ ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605499 7b05:A (3.8) BS02 CA ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605500 7b05:A (3.8) BS03 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605501 7b05:A (3.8) BS04 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605502 7b05:B (3.8) BS01 SJQ ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605503 7b05:B (3.8) BS02 CA ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605504 7b05:B (3.8) BS03 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605505 7b05:B (3.8) BS04 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605506 7b05:C (3.8) BS01 SJQ ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605507 7b05:C (3.8) BS02 CA ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605508 7b05:C (3.8) BS03 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605509 7b05:C (3.8) BS04 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605510 7b05:D (3.8) BS01 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605511 7b05:D (3.8) BS02 SJQ ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605512 7b05:D (3.8) BS03 CA ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605513 7b05:D (3.8) BS04 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605514 7b07:A (3.099) BS01 CA 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605515 7b07:A (3.099) BS02 CA 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605516 7b08:A (2.394) BS01 TTP 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605517 7b0c:A (3.0) BS01 dna ? GO:0003677 ... Q9L132 35908109
    605518 7b0c:A (3.0) BS02 dna ? GO:0003677 ... Q9L132 35908109
    605519 7b0c:A (3.0) BS03 SF4 ? GO:0003677 ... Q9L132 35908109
    605520 7b0c:A (3.0) BS04 SF4 ? GO:0003677 ... Q9L132 35908109
    605521 7b0c:B (3.0) BS01 dna ? GO:0003677 ... Q9L132 35908109
    605522 7b0c:B (3.0) BS02 dna ? GO:0003677 ... Q9L132 35908109
    605523 7b0c:B (3.0) BS03 SF4 ? GO:0003677 ... Q9L132 35908109
    605524 7b0c:B (3.0) BS04 SF4 ? GO:0003677 ... Q9L132 35908109
    605525 7b0e:A (1.4) BS01 C2E ? GO:0000166 ... Q9A5E6 N/A
    605526 7b0e:A (1.4) BS02 CA ? GO:0000166 ... Q9A5E6 N/A
    605527 7b0e:A (1.4) BS03 CA ? GO:0000166 ... Q9A5E6 N/A
    605528 7b0f:A (2.797) BS01 dna 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605529 7b0f:A (2.797) BS02 dna 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605530 7b0f:A (2.797) BS03 TTP 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605531 7b0g:A (3.0) BS01 dna 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605532 7b0g:A (3.0) BS02 dna 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605533 7b0g:A (3.0) BS03 CTP 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605534 7b0h:E (3.15) BS01 dna 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605535 7b0h:E (3.15) BS02 dna 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605536 7b0h:E (3.15) BS03 MN 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605537 7b0h:E (3.15) BS04 MN 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605538 7b0h:E (3.15) BS05 MG 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605539 7b0h:E (3.15) BS06 TTP 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605540 7b0h:F (3.15) BS01 dna 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605541 7b0h:F (3.15) BS02 dna 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605542 7b0h:F (3.15) BS03 dna 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605543 7b0h:F (3.15) BS04 dna 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605544 7b0h:F (3.15) BS05 MN 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605545 7b0h:F (3.15) BS06 MN 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605546 7b0h:F (3.15) BS07 MG 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605547 7b0h:F (3.15) BS08 TTP 2.7.7.7 GO:0000166 ... P56689 33302546
    605548 7b0i:C (3.0) BS01 SJT ? GO:0000245 ... O75533 34301950
    605549 7b0i:D (3.0) BS01 SJT ? GO:0000398 ... Q7RTV0 34301950
    605550 7b0i:D (3.0) BS02 ZN ? GO:0000398 ... Q7RTV0 34301950
    605551 7b0i:D (3.0) BS03 ZN ? GO:0000398 ... Q7RTV0 34301950
    605552 7b0i:D (3.0) BS04 ZN ? GO:0000398 ... Q7RTV0 34301950
    605553 7b0j:A (2.85) BS01 CA ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605554 7b0j:B (2.85) BS01 CA ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605555 7b0j:C (2.85) BS01 CA ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605556 7b0j:D (2.85) BS01 CA ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605557 7b0k:A (3.8) BS01 CHT ? GO:0016020 ... A0A0E7XN74 35235350
    605558 7b0n:E (3.7) BS01 FES 1.6.99.3 GO:0016491 ... Q9UUT9 33640456
    605559 7b0n:F (3.7) BS01 FMN 7.1.1.2 GO:0005739 ... Q9UUU2 33640456
    605560 7b0n:F (3.7) BS02 SF4 7.1.1.2 GO:0005739 ... Q9UUU2 33640456
    605561 7b0n:G (3.7) BS01 SF4 1.6.99.3 GO:0008137 ... Q9UUU3 33640456
    605562 7b0n:G (3.7) BS02 SF4 1.6.99.3 GO:0008137 ... Q9UUU3 33640456
    605563 7b0n:G (3.7) BS03 FES 1.6.99.3 GO:0008137 ... Q9UUU3 33640456
    605564 7b0n:I (3.7) BS01 SF4 1.6.99.3 GO:0016020 ... Q9UUT8 33640456
    605565 7b0n:I (3.7) BS02 SF4 1.6.99.3 GO:0016020 ... Q9UUT8 33640456
    605566 7b0n:P (3.7) BS01 NDP ? GO:0005739 ... A0A371BY45 33640456
    605567 7b0n:R (3.7) BS01 ZN ? N/A A0A1H6Q8Z5 33640456
    605568 7b0n:T (3.7) BS01 EHZ ? GO:0006633 ... A0A1H6PXT9 33640456
    605569 7b0n:U (3.7) BS01 EHZ ? GO:0006633 ... A0A1D8NG21 33640456
    605570 7b0n:W (3.7) BS01 EHZ ? GO:0005739 ... A0A1D8N3C8 33640456
    605571 7b0n:n (3.7) BS01 EHZ ? GO:0005739 ... A0A1D8NDL1 33640456
    605572 7b0s:A (3.6) BS01 S9Q ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605573 7b0s:A (3.6) BS02 CA ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605574 7b0s:A (3.6) BS03 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605575 7b0s:A (3.6) BS04 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605576 7b0s:B (3.6) BS01 S9Q ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605577 7b0s:B (3.6) BS02 CA ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605578 7b0s:B (3.6) BS03 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605579 7b0s:B (3.6) BS04 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605580 7b0s:C (3.6) BS01 S9Q ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605581 7b0s:C (3.6) BS02 CA ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605582 7b0s:C (3.6) BS03 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605583 7b0s:C (3.6) BS04 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605584 7b0s:D (3.6) BS01 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605585 7b0s:D (3.6) BS02 S9Q ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605586 7b0s:D (3.6) BS03 CA ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605587 7b0s:D (3.6) BS04 44E ? GO:0005216 ... U3N7D8 33236980
    605588 7b0t:A (2.05) BS01 GKT ? N/A Q03111 33749253
    605589 7b0v:A (2.3) BS01 FAD 1.4.3.21
    1.4.3.4
    GO:0005515 ... P27338 34262643
    605590 7b0v:A (2.3) BS02 SKB 1.4.3.21
    1.4.3.4
    GO:0005515 ... P27338 34262643
    605591 7b0v:A (2.3) BS03 C15 1.4.3.21
    1.4.3.4
    GO:0005515 ... P27338 34262643
    605592 7b0v:B (2.3) BS01 FAD 1.4.3.21
    1.4.3.4
    GO:0005515 ... P27338 34262643
    605593 7b0v:B (2.3) BS02 SKB 1.4.3.21
    1.4.3.4
    GO:0005515 ... P27338 34262643
    605594 7b0v:B (2.3) BS03 C15 1.4.3.21
    1.4.3.4
    GO:0005515 ... P27338 34262643
    605595 7b0y:A (3.6) BS01 dna 2.7.7.48
    2.7.7.6
    3.1.13.-
    GO:0000428 ... P11414 33446560
    605596 7b0y:A (3.6) BS02 rna 2.7.7.48
    2.7.7.6
    3.1.13.-
    GO:0000428 ... P11414 33446560
    605597 7b0y:A (3.6) BS03 dna 2.7.7.48
    2.7.7.6
    3.1.13.-
    GO:0000428 ... P11414 33446560
    605598 7b0y:A (3.6) BS04 ZN 2.7.7.48
    2.7.7.6
    3.1.13.-
    GO:0000428 ... P11414 33446560
    605599 7b0y:A (3.6) BS05 ZN 2.7.7.48
    2.7.7.6
    3.1.13.-
    GO:0000428 ... P11414 33446560
    605600 7b0y:A (3.6) BS06 MG 2.7.7.48
    2.7.7.6
    3.1.13.-
    GO:0000428 ... P11414 33446560

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).