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BioLiP
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    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    765001 8a7l:A (1.85) BS04 GPP 2.5.1.1 GO:0004659 ... M1JS91 37308711
    765002 8a7n:A (1.9) BS01 L9E ? GO:0000978 ... O15178 N/A
    765003 8a7r:A (2.0) BS01 MG 2.5.1.1 GO:0004659 ... M1JS91 37308711
    765004 8a7r:A (2.0) BS02 MG 2.5.1.1 GO:0004659 ... M1JS91 37308711
    765005 8a7r:A (2.0) BS03 GPP 2.5.1.1 GO:0004659 ... M1JS91 37308711
    765006 8a7s:A (1.542) BS01 NAP ? N/A A9WIU3 37952891
    765007 8a7s:A (1.542) BS02 MG ? N/A A9WIU3 37952891
    765008 8a7u:A (1.55) BS01 MG 2.5.1.1 GO:0004659 ... M1JS91 37308711
    765009 8a7u:A (1.55) BS02 MG 2.5.1.1 GO:0004659 ... M1JS91 37308711
    765010 8a7u:A (1.55) BS03 GPP 2.5.1.1 GO:0004659 ... M1JS91 37308711
    765011 8a82:A (2.05) BS01 FE ? GO:0046872 ... K7WEY7 36917986
    765012 8a8c:A (3.1) BS01 LU9 ? GO:0005506 ... P06971 36215462
    765013 8a8d:A (2.1) BS01 ZN N/A GO:0000103 ... N/A 37277534
    765014 8a8d:A (2.1) BS02 CA N/A GO:0000103 ... N/A 37277534
    765015 8a8d:B (2.1) BS01 ZN N/A GO:0000103 ... N/A 37277534
    765016 8a8d:B (2.1) BS02 CA N/A GO:0000103 ... N/A 37277534
    765017 8a8f:A (1.85) BS01 MN 3.1.3.16 GO:0000076 ... P32598 38029752
    765018 8a8f:A (1.85) BS02 MN 3.1.3.16 GO:0000076 ... P32598 38029752
    765019 8a8g:A (1.97) BS01 ZN N/A GO:0000103 ... N/A 37277534
    765020 8a8h:B (1.77) BS01 PO4 N/A GO:0000103 ... N/A 37277534
    765021 8a8i:B (1.88) BS01 FMN ? GO:0000166 ... Q9R9V9 36846821
    765022 8a8i:B (1.88) BS02 L9I ? GO:0000166 ... Q9R9V9 36846821
    765023 8a8i:D (1.88) BS01 FMN ? GO:0000166 ... Q9R9V9 36846821
    765024 8a8i:D (1.88) BS02 L9I ? GO:0000166 ... Q9R9V9 36846821
    765025 8a8j:A (3.1) BS01 dna ? GO:0000731 ... Q5SLM9 37081315
    765026 8a8j:A (3.1) BS02 ANP ? GO:0000731 ... Q5SLM9 37081315
    765027 8a8j:B (3.1) BS01 dna ? GO:0000731 ... Q5SLM9 37081315
    765028 8a8j:B (3.1) BS02 ANP ? GO:0000731 ... Q5SLM9 37081315
    765029 8a8k:A (3.1) BS01 AMP N/A N/A N/A 37277534
    765030 8a8k:B (3.1) BS01 AMP N/A N/A N/A 37277534
    765031 8a8k:C (3.1) BS01 AMP N/A N/A N/A 37277534
    765032 8a8k:D (3.1) BS01 AMP N/A N/A N/A 37277534
    765033 8a8k:D (3.1) BS02 MN N/A N/A N/A 37277534
    765034 8a8k:E (3.1) BS01 AMP N/A N/A N/A 37277534
    765035 8a8k:E (3.1) BS02 MN N/A N/A N/A 37277534
    765036 8a8k:F (3.1) BS01 AMP N/A N/A N/A 37277534
    765037 8a8k:F (3.1) BS02 MN N/A N/A N/A 37277534
    765038 8a8l:A (1.88) BS01 HEM 1.14.-.- GO:0004497 ... A0A380DQV1 N/A
    765039 8a8l:A (1.88) BS02 LBJ 1.14.-.- GO:0004497 ... A0A380DQV1 N/A
    765040 8a8m:A (4.0) BS01 AP2 2.7.11.24 GO:0000077 ... Q16539 37708276
    765041 8a8m:A (4.0) BS02 MG 2.7.11.24 GO:0000077 ... Q16539 37708276
    765042 8a8m:B (4.0) BS01 AP2 2.7.12.2 GO:0000165 ... P52564 37708276
    765043 8a8m:B (4.0) BS02 MG 2.7.12.2 GO:0000165 ... P52564 37708276
    765044 8a8o:A (1.45) BS01 FAD N/A GO:0016491 ... N/A 37277534
    765045 8a8o:A (1.45) BS02 CA N/A GO:0016491 ... N/A 37277534
    765046 8a8o:B (1.45) BS01 FAD N/A GO:0016491 ... N/A 37277534
    765047 8a8o:B (1.45) BS02 CA N/A GO:0016491 ... N/A 37277534
    765048 8a8o:C (1.45) BS01 SF4 N/A N/A N/A 37277534
    765049 8a8o:C (1.45) BS02 SF4 N/A N/A N/A 37277534
    765050 8a8o:D (1.45) BS01 SF4 N/A N/A N/A 37277534
    765051 8a8o:D (1.45) BS02 SF4 N/A N/A N/A 37277534
    765052 8a8t:A (2.11) BS01 NAP ? N/A A9WIU3 37952891
    765053 8a8t:A (2.11) BS02 MLI ? N/A A9WIU3 37952891
    765054 8a8u:A (3.62) BS01 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765055 8a8u:A (3.62) BS02 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765056 8a8u:B (3.62) BS01 peptide 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765057 8a8u:B (3.62) BS02 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765058 8a8u:B (3.62) BS03 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765059 8a8u:B (3.62) BS04 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765060 8a8u:C (3.62) BS01 peptide 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765061 8a8u:C (3.62) BS02 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765062 8a8u:C (3.62) BS03 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765063 8a8u:D (3.62) BS01 peptide 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765064 8a8u:D (3.62) BS02 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765065 8a8u:D (3.62) BS03 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765066 8a8u:D (3.62) BS04 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765067 8a8u:E (3.62) BS01 peptide 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765068 8a8u:E (3.62) BS02 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765069 8a8u:E (3.62) BS03 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765070 8a8u:F (3.62) BS01 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765071 8a8v:A (3.34) BS01 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765072 8a8v:A (3.34) BS02 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765073 8a8v:B (3.34) BS01 peptide 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765074 8a8v:B (3.34) BS02 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765075 8a8v:B (3.34) BS03 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765076 8a8v:B (3.34) BS04 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765077 8a8v:C (3.34) BS01 peptide 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765078 8a8v:C (3.34) BS02 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765079 8a8v:C (3.34) BS03 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765080 8a8v:C (3.34) BS04 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765081 8a8v:D (3.34) BS01 peptide 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765082 8a8v:D (3.34) BS02 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765083 8a8v:D (3.34) BS03 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765084 8a8v:D (3.34) BS04 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765085 8a8v:E (3.34) BS01 peptide 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765086 8a8v:E (3.34) BS02 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765087 8a8v:E (3.34) BS03 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765088 8a8v:F (3.34) BS01 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765089 8a8w:A (4.29) BS01 peptide 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765090 8a8w:A (4.29) BS02 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765091 8a8w:A (4.29) BS03 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765092 8a8w:B (4.29) BS01 peptide 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765093 8a8w:B (4.29) BS02 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765094 8a8w:B (4.29) BS03 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765095 8a8w:B (4.29) BS04 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765096 8a8w:C (4.29) BS01 peptide 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765097 8a8w:C (4.29) BS02 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765098 8a8w:C (4.29) BS03 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765099 8a8w:C (4.29) BS04 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765100 8a8w:D (4.29) BS01 peptide 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765101 8a8w:D (4.29) BS02 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765102 8a8w:D (4.29) BS03 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765103 8a8w:D (4.29) BS04 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765104 8a8w:E (4.29) BS01 peptide 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765105 8a8w:E (4.29) BS02 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765106 8a8w:E (4.29) BS03 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765107 8a8w:F (4.29) BS01 ADP 3.4.-.- GO:0005515 ... P9WPC9 36208775
    765108 8a8x:A (2.37) BS01 peptide 2.3.2.27 N/A Q9C029 35893676
    765109 8a8x:C (2.37) BS01 peptide 2.3.2.27 N/A Q9C029 35893676
    765110 8a8z:A (1.6) BS01 LDL ? N/A F8W4B7 36528061
    765111 8a8z:A (1.6) BS02 ZN ? N/A F8W4B7 36528061
    765112 8a8z:B (1.6) BS01 LDL ? N/A F8W4B7 36528061
    765113 8a8z:B (1.6) BS02 ZN ? N/A F8W4B7 36528061
    765114 8a90:A (2.574) BS01 FE ? GO:0004497 ... A0A7S9SWM2 37366538
    765115 8a90:A (2.574) BS02 FE ? GO:0004497 ... A0A7S9SWM2 37366538
    765116 8a90:B (2.574) BS01 FE ? GO:0004497 ... A0A7S9SWM2 37366538
    765117 8a90:B (2.574) BS02 FE ? GO:0004497 ... A0A7S9SWM2 37366538
    765118 8a91:A (1.85) BS01 HEM 1.14.-.- GO:0004497 ... A0A380DQV1 N/A
    765119 8a92:A (1.37) BS01 LE9 ? GO:0000976 ... P04637 36561072
    765120 8a92:A (1.37) BS02 ZN ? GO:0000976 ... P04637 36561072
    765121 8a92:B (1.37) BS01 ZN ? GO:0000976 ... P04637 36561072
    765122 8a92:B (1.37) BS02 LE9 ? GO:0000976 ... P04637 36561072
    765123 8a93:A (3.05) BS01 dna ? GO:0000731 ... Q5SLM9 37081315
    765124 8a93:A (3.05) BS02 ANP ? GO:0000731 ... Q5SLM9 37081315
    765125 8a93:A (3.05) BS03 ANP ? GO:0000731 ... Q5SLM9 37081315
    765126 8a93:B (3.05) BS01 ANP ? GO:0000731 ... Q5SLM9 37081315
    765127 8a98:A (2.46) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q4FWX5 38722744
    765128 8a98:A (2.46) BS02 rna ? GO:0002181 ... Q4FWX5 38722744
    765129 8a98:A (2.46) BS03 rna ? GO:0002181 ... Q4FWX5 38722744
    765130 8a98:B (2.46) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q4Q2Q6 38722744
    765131 8a98:B (2.46) BS02 rna ? GO:0003723 ... Q4Q2Q6 38722744
    765132 8a98:B (2.46) BS03 rna ? GO:0003723 ... Q4Q2Q6 38722744
    765133 8a98:B (2.46) BS04 rna ? GO:0003723 ... Q4Q2Q6 38722744
    765134 8a98:C (2.46) BS01 rna ? GO:0003723 ... E9ADW5 38722744
    765135 8a98:C (2.46) BS02 rna ? GO:0003723 ... E9ADW5 38722744
    765136 8a98:C (2.46) BS03 rna ? GO:0003723 ... E9ADW5 38722744
    765137 8a98:D (2.46) BS01 rna ? GO:0003723 ... P48157 38722744
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    765200 8a98:SW (2.46) BS01 rna ? GO:0000028 ... Q4QBV0 38722744

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).