SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 1072681 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 3866 3867 3868 3869 3870 3871 3872 3873 3874 3875 3876 3877 3878 3879 3880 3881 3882 3883 3884 3885 3886 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    775001 8b5l:N (2.86) BS02 rna ? GO:0002181 ... G1T0C1 36867692
    775002 8b5l:O (2.86) BS01 rna ? GO:0003729 ... G1TVS8 36867692
    775003 8b5l:P (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1SCJ6 36867692
    775004 8b5l:P (2.86) BS02 rna ? GO:0003735 ... G1SCJ6 36867692
    775005 8b5l:Q (2.86) BS01 rna ? GO:0003723 ... G1TFE0 36867692
    775006 8b5l:R (2.86) BS01 rna ? GO:0003723 ... G1TYL6 36867692
    775007 8b5l:S (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1TTY7 36867692
    775008 8b5l:S (2.86) BS02 rna ? GO:0003735 ... G1TTY7 36867692
    775009 8b5l:T (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1SHQ2 36867692
    775010 8b5l:T (2.86) BS02 rna ? GO:0003735 ... G1SHQ2 36867692
    775011 8b5l:U (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1TSG1 36867692
    775012 8b5l:V (2.86) BS01 rna ? GO:0000122 ... G1T6D1 36867692
    775013 8b5l:W (2.86) BS01 rna ? GO:0002181 ... G1SE28 36867692
    775014 8b5l:X (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1SE76 36867692
    775015 8b5l:X (2.86) BS02 rna ? GO:0003735 ... G1SE76 36867692
    775016 8b5l:Y (2.86) BS01 rna ? GO:0003723 ... G1SQH0 36867692
    775017 8b5l:Y (2.86) BS02 rna ? GO:0003723 ... G1SQH0 36867692
    775018 8b5l:Z (2.86) BS01 rna ? GO:0002181 ... G1TXF6 36867692
    775019 8b5l:a (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1SNY0 36867692
    775020 8b5l:b (2.86) BS01 rna ? GO:0002181 ... G1SGR6 36867692
    775021 8b5l:c (2.86) BS01 rna ? GO:0003723 ... G1TDL2 36867692
    775022 8b5l:d (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1SHG0 36867692
    775023 8b5l:e (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1TUN8 36867692
    775024 8b5l:f (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1SF08 36867692
    775025 8b5l:g (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1TXG5 36867692
    775026 8b5l:g (2.86) BS02 ZN ? GO:0003735 ... G1TXG5 36867692
    775027 8b5l:h (2.86) BS01 rna ? GO:0000463 ... G1SIT5 36867692
    775028 8b5l:h (2.86) BS02 rna ? GO:0000463 ... G1SIT5 36867692
    775029 8b5l:i (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1TTQ5 36867692
    775030 8b5l:j (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... U3KPD5 36867692
    775031 8b5l:j (2.86) BS02 rna ? GO:0003735 ... U3KPD5 36867692
    775032 8b5l:j (2.86) BS03 ZN ? GO:0003735 ... U3KPD5 36867692
    775033 8b5l:k (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1U001 36867692
    775034 8b5l:l (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1SYU7 36867692
    775035 8b5l:l (2.86) BS02 rna ? GO:0003735 ... G1SYU7 36867692
    775036 8b5l:m (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DXC2 36867692
    775037 8b5l:m (2.86) BS02 ZN ? GO:0003735 ... P0DXC2 36867692
    775038 8b5l:o (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1T040 36867692
    775039 8b5l:o (2.86) BS02 ZN ? GO:0003735 ... G1T040 36867692
    775040 8b5l:p (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1SY53 36867692
    775041 8b5l:p (2.86) BS02 ZN ? GO:0003735 ... G1SY53 36867692
    775042 8b5l:r (2.86) BS01 rna ? GO:0003735 ... G1U7L1 36867692
    775043 8b5l:s (2.86) BS01 rna ? GO:0005262 ... A0A5F9CHB7 36867692
    775044 8b5m:A (0.97) BS01 5OV 3.2.1.113 GO:0004571 ... B0SWV2 N/A
    775045 8b5p:A (1.4) BS01 peptide ? GO:0001836 ... P31947 36926879
    775046 8b5p:A (1.4) BS02 MG ? GO:0001836 ... P31947 36926879
    775047 8b5p:A (1.4) BS03 OQ3 ? GO:0001836 ... P31947 36926879
    775048 8b5q:A (2.0) BS01 U ? GO:0009103 ... Q9HUF6 37716703
    775049 8b5q:B (2.0) BS01 U ? GO:0009103 ... Q9HUF6 37716703
    775050 8b5r:A (6.1) BS01 peptide 3.6.4.6 GO:0000153 ... P55072 37264685
    775051 8b5r:B (6.1) BS01 peptide 3.6.4.6 GO:0000153 ... P55072 37264685
    775052 8b5r:B (6.1) BS02 peptide 3.6.4.6 GO:0000153 ... P55072 37264685
    775053 8b5r:C (6.1) BS01 peptide 3.6.4.6 GO:0000153 ... P55072 37264685
    775054 8b5s:A (1.95) BS01 UDP ? GO:0009103 ... Q9HUF6 37716703
    775055 8b5s:B (1.95) BS01 UPG ? GO:0009103 ... Q9HUF6 37716703
    775056 8b5v:A (1.6) BS01 MG 5.4.2.8 GO:0004615 ... Q4E4A3 N/A
    775057 8b5v:B (1.6) BS01 MG 5.4.2.8 GO:0004615 ... Q4E4A3 N/A
    775058 8b5w:A (1.8) BS01 ZN 2.3.2.27 N/A Q5T4S7 38182926
    775059 8b5x:A (1.98) BS01 peptide ? N/A O94901 38291267
    775060 8b5x:B (1.98) BS01 peptide ? N/A O94901 38291267
    775061 8b5x:C (1.98) BS01 peptide ? N/A O94901 38291267
    775062 8b5y:A (1.83) BS01 P8O 3.1.3.48 GO:0004725 ... Q06124 36793438
    775063 8b5y:B (1.83) BS01 P8O 3.1.3.48 GO:0004725 ... Q06124 36793438
    775064 8b61:A (1.81) BS01 P7W ? N/A Q5LDF1 37246607
    775065 8b61:B (1.81) BS01 P7W ? N/A Q5LDF1 37246607
    775066 8b62:A (2.02) BS01 GDU ? GO:0009103 ... Q9HUF6 37716703
    775067 8b62:B (2.02) BS01 GDU ? GO:0009103 ... Q9HUF6 37716703
    775068 8b63:A (2.2) BS01 UD2 ? GO:0009103 ... Q9HUF6 37716703
    775069 8b63:B (2.2) BS01 UDP ? GO:0009103 ... Q9HUF6 37716703
    775070 8b64:A (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775071 8b64:A (2.589) BS02 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775072 8b64:A (2.589) BS03 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775073 8b64:B (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775074 8b64:B (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775075 8b64:B (2.589) BS03 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775076 8b64:B (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775077 8b64:D (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775078 8b64:D (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775079 8b64:D (2.589) BS03 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775080 8b64:D (2.589) BS04 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775081 8b64:D (2.589) BS05 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775082 8b64:E (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775083 8b64:E (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775084 8b64:E (2.589) BS03 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775085 8b64:E (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775086 8b64:F (2.589) BS01 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775087 8b64:F (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775088 8b64:F (2.589) BS03 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775089 8b64:F (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775090 8b64:G (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775091 8b64:G (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775092 8b64:G (2.589) BS03 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775093 8b64:G (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775094 8b64:I (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775095 8b64:I (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775096 8b64:I (2.589) BS03 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775097 8b64:I (2.589) BS04 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775098 8b64:I (2.589) BS05 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775099 8b64:J (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775100 8b64:J (2.589) BS02 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775101 8b64:J (2.589) BS03 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775102 8b64:J (2.589) BS04 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775103 8b64:K (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775104 8b64:K (2.589) BS02 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775105 8b64:K (2.589) BS03 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775106 8b64:K (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775107 8b64:L (2.589) BS01 BCL ? GO:0009772 ... P19057 36738736
    775108 8b64:L (2.589) BS02 BPH ? GO:0009772 ... P19057 36738736
    775109 8b64:L (2.589) BS03 U10 ? GO:0009772 ... P19057 36738736
    775110 8b64:L (2.589) BS04 U10 ? GO:0009772 ... P19057 36738736
    775111 8b64:L (2.589) BS05 BCL ? GO:0009772 ... P19057 36738736
    775112 8b64:L (2.589) BS06 FE ? GO:0009772 ... P19057 36738736
    775113 8b64:L (2.589) BS07 U10 ? GO:0009772 ... P19057 36738736
    775114 8b64:L (2.589) BS08 BCL ? GO:0009772 ... P19057 36738736
    775115 8b64:L (2.589) BS09 BPH ? GO:0009772 ... P19057 36738736
    775116 8b64:M (2.589) BS01 BPH ? GO:0009772 ... P11847 36738736
    775117 8b64:M (2.589) BS02 U10 ? GO:0009772 ... P11847 36738736
    775118 8b64:M (2.589) BS03 BCL ? GO:0009772 ... P11847 36738736
    775119 8b64:M (2.589) BS04 FE ? GO:0009772 ... P11847 36738736
    775120 8b64:M (2.589) BS05 U10 ? GO:0009772 ... P11847 36738736
    775121 8b64:M (2.589) BS06 SPO ? GO:0009772 ... P11847 36738736
    775122 8b64:M (2.589) BS07 BCL ? GO:0009772 ... P11847 36738736
    775123 8b64:M (2.589) BS08 BCL ? GO:0009772 ... P11847 36738736
    775124 8b64:M (2.589) BS09 BPH ? GO:0009772 ... P11847 36738736
    775125 8b64:N (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775126 8b64:N (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775127 8b64:N (2.589) BS03 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775128 8b64:N (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775129 8b64:O (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775130 8b64:O (2.589) BS02 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775131 8b64:O (2.589) BS03 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775132 8b64:O (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775133 8b64:R (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775134 8b64:R (2.589) BS02 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775135 8b64:R (2.589) BS03 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775136 8b64:R (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775137 8b64:S (2.589) BS01 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775138 8b64:S (2.589) BS02 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775139 8b64:S (2.589) BS03 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775140 8b64:S (2.589) BS04 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775141 8b64:T (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775142 8b64:T (2.589) BS02 SPO ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775143 8b64:T (2.589) BS03 BCL ? GO:0005886 ... P02950 36738736
    775144 8b64:X (2.589) BS01 SPO ? GO:0005886 ... P26240 36738736
    775145 8b64:a (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775146 8b64:a (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775147 8b64:a (2.589) BS03 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775148 8b64:a (2.589) BS04 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775149 8b64:b (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775150 8b64:b (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775151 8b64:b (2.589) BS03 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775152 8b64:b (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775153 8b64:d (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775154 8b64:d (2.589) BS02 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775155 8b64:d (2.589) BS03 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775156 8b64:d (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775157 8b64:e (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775158 8b64:e (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775159 8b64:e (2.589) BS03 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775160 8b64:e (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775161 8b64:e (2.589) BS05 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775162 8b64:f (2.589) BS01 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775163 8b64:f (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775164 8b64:f (2.589) BS03 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775165 8b64:f (2.589) BS04 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775166 8b64:f (2.589) BS05 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775167 8b64:g (2.589) BS01 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775168 8b64:g (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775169 8b64:g (2.589) BS03 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775170 8b64:g (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775171 8b64:g (2.589) BS05 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775172 8b64:i (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775173 8b64:i (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775174 8b64:i (2.589) BS03 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775175 8b64:i (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775176 8b64:j (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775177 8b64:j (2.589) BS02 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775178 8b64:j (2.589) BS03 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775179 8b64:k (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775180 8b64:k (2.589) BS02 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775181 8b64:k (2.589) BS03 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775182 8b64:k (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775183 8b64:n (2.589) BS01 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775184 8b64:n (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775185 8b64:n (2.589) BS03 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775186 8b64:n (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775187 8b64:n (2.589) BS05 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775188 8b64:o (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775189 8b64:o (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775190 8b64:o (2.589) BS03 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775191 8b64:o (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775192 8b64:r (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775193 8b64:r (2.589) BS02 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775194 8b64:r (2.589) BS03 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775195 8b64:r (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775196 8b64:s (2.589) BS01 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775197 8b64:s (2.589) BS02 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775198 8b64:s (2.589) BS03 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775199 8b64:s (2.589) BS04 SPO ? GO:0005886 ... P02948 36738736
    775200 8b64:t (2.589) BS01 BCL ? GO:0005886 ... P02948 36738736

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).