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BioLiP
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    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    792001 8d6z:I (2.3) BS01 peptide N/A N/A N/A 35857439
    792002 8d71:A (2.5) BS01 rna 3.1.26.n2 GO:0000340 ... Q9UKV8 37082939
    792003 8d73:A (2.17) BS01 QCR 2.7.10.1 GO:0004672 ... P00533 35838760
    792004 8d73:B (2.17) BS01 QCR 2.7.10.1 GO:0004672 ... P00533 35838760
    792005 8d76:A (2.4) BS01 QFO 2.7.10.1 GO:0004672 ... P00533 35838760
    792006 8d76:B (2.4) BS01 QFO 2.7.10.1 GO:0004672 ... P00533 35838760
    792007 8d7m:A (2.25) BS01 peptide 2.7.11.1
    2.7.11.26
    GO:0004672 ... P48730 37207626
    792008 8d7m:B (2.25) BS01 peptide 2.7.11.1
    2.7.11.26
    GO:0004672 ... P48730 37207626
    792009 8d7n:A (1.66) BS01 peptide 2.7.11.1
    2.7.11.26
    GO:0004672 ... P48730 37207626
    792010 8d7n:B (1.66) BS01 peptide 2.7.11.1
    2.7.11.26
    GO:0004672 ... P48730 37207626
    792011 8d7o:A (1.65) BS01 peptide 2.7.11.1
    2.7.11.26
    GO:0004672 ... P48730 37207626
    792012 8d7o:B (1.65) BS01 peptide 2.7.11.1
    2.7.11.26
    GO:0004672 ... P48730 37207626
    792013 8d7p:A (2.25) BS01 peptide 2.7.11.1
    2.7.11.26
    GO:0004672 ... P48730 37207626
    792014 8d7p:B (2.25) BS01 peptide 2.7.11.1
    2.7.11.26
    GO:0004672 ... P48730 37207626
    792015 8d7u:B (3.1) BS01 ZN ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792016 8d7u:B (3.1) BS02 QFC ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792017 8d7v:B (3.2) BS01 ZN ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792018 8d7v:B (3.2) BS02 QFC ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792019 8d7w:B (3.1) BS01 ZN ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792020 8d7w:B (3.1) BS02 QFC ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792021 8d7x:B (3.4) BS01 ZN ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792022 8d7y:B (3.4) BS01 ZN ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792023 8d7z:B (3.1) BS01 peptide ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792024 8d7z:B (3.1) BS02 ZN ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792025 8d7z:B (3.1) BS03 QFC ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792026 8d80:B (3.6) BS01 peptide ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792027 8d80:B (3.6) BS02 ZN ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792028 8d80:B (3.6) BS03 8W7 ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792029 8d81:B (3.9) BS01 ZN ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792030 8d81:B (3.9) BS02 Y70 ? GO:0005515 ... Q96SW2 36378961
    792031 8d84:A (2.65) BS01 EPZ 2.5.1.7 GO:0003824 ... A0A3N3SEJ7 36649910
    792032 8d84:B (2.65) BS01 EPZ 2.5.1.7 GO:0003824 ... A0A3N3SEJ7 36649910
    792033 8d84:C (2.65) BS01 EPZ 2.5.1.7 GO:0003824 ... A0A3N3SEJ7 36649910
    792034 8d84:D (2.65) BS01 EPZ 2.5.1.7 GO:0003824 ... A0A3N3SEJ7 36649910
    792035 8d84:E (2.65) BS01 EPZ 2.5.1.7 GO:0003824 ... A0A3N3SEJ7 36649910
    792036 8d84:F (2.65) BS01 EPZ 2.5.1.7 GO:0003824 ... A0A3N3SEJ7 36649910
    792037 8d84:G (2.65) BS01 EPZ 2.5.1.7 GO:0003824 ... A0A3N3SEJ7 36649910
    792038 8d84:H (2.65) BS01 EPZ 2.5.1.7 GO:0003824 ... A0A3N3SEJ7 36649910
    792039 8d84:I (2.65) BS01 EPZ 2.5.1.7 GO:0003824 ... A0A3N3SEJ7 36649910
    792040 8d84:J (2.65) BS01 EPZ 2.5.1.7 GO:0003824 ... A0A3N3SEJ7 36649910
    792041 8d84:K (2.65) BS01 EPZ 2.5.1.7 GO:0003824 ... A0A3N3SEJ7 36649910
    792042 8d84:L (2.65) BS01 EPZ 2.5.1.7 GO:0003824 ... A0A3N3SEJ7 36649910
    792043 8d86:C (3.12) BS01 dna ? GO:0003887 ... P03856 37407546
    792044 8d86:C (3.12) BS02 dna ? GO:0003887 ... P03856 37407546
    792045 8d86:C (3.12) BS03 MG ? GO:0003887 ... P03856 37407546
    792046 8d88:A (1.41) BS01 N2P 4.1.1.116 GO:0003824 ... Q8ZNC4 36265649
    792047 8d88:A (1.41) BS02 R1O 4.1.1.116 GO:0003824 ... Q8ZNC4 36265649
    792048 8d88:B (1.41) BS01 N2P 4.1.1.116 GO:0003824 ... Q8ZNC4 36265649
    792049 8d88:B (1.41) BS02 R1O 4.1.1.116 GO:0003824 ... Q8ZNC4 36265649
    792050 8d88:B (1.41) BS03 R1O 4.1.1.116 GO:0003824 ... Q8ZNC4 36265649
    792051 8d8i:A (2.504) BS01 peptide ? GO:0003677 ... P20393 36414641
    792052 8d8i:A (2.504) BS02 QFX ? GO:0003677 ... P20393 36414641
    792053 8d8j:0 (3.8) BS01 rna 2.1.1.- GO:0003735 ... P36056 36482135
    792054 8d8j:0 (3.8) BS02 SF4 2.1.1.- GO:0003735 ... P36056 36482135
    792055 8d8j:2 (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P38783 36482135
    792056 8d8j:5 (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P12686 36482135
    792057 8d8j:6 (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P53292 36482135
    792058 8d8j:D (3.8) BS01 rna ? GO:0003723 ... P27929 36482135
    792059 8d8j:E (3.8) BS01 rna ? GO:0003723 ... P33759 36482135
    792060 8d8j:F (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P28778 36482135
    792061 8d8j:H (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q03799 36482135
    792062 8d8j:L (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P53732 36482135
    792063 8d8j:O (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P21771 36482135
    792064 8d8j:P (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q02608 36482135
    792065 8d8j:Q (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q03246 36482135
    792066 8d8j:R (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P40033 36482135
    792067 8d8j:V (3.8) BS01 rna ? GO:0003735 ... P17558 36482135
    792068 8d8j:d (3.8) BS01 rna ? GO:0000963 ... P48237 36482135
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    792070 8d8k:0 (3.13) BS02 SF4 2.1.1.- GO:0003735 ... P36056 36482135
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    792072 8d8k:3 (3.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P47141 36482135
    792073 8d8k:5 (3.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P12686 36482135
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    792077 8d8k:B (3.13) BS02 MG ? GO:0003735 ... P32902 36482135
    792078 8d8k:C (3.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P02381 36482135
    792079 8d8k:D (3.13) BS01 rna ? GO:0003723 ... P27929 36482135
    792080 8d8k:E (3.13) BS01 rna ? GO:0003723 ... P33759 36482135
    792081 8d8k:F (3.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P28778 36482135
    792082 8d8k:G (3.13) BS01 rna ? GO:0003723 ... P47150 36482135
    792083 8d8k:H (3.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q03799 36482135
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    792086 8d8k:K (3.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P42847 36482135
    792087 8d8k:L (3.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P53732 36482135
    792088 8d8k:M (3.13) BS01 rna ? GO:0003676 ... P53937 36482135
    792089 8d8k:N (3.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P10663 36482135
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    792093 8d8k:R (3.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P40033 36482135
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    792095 8d8k:T (3.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P38175 36482135
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    792097 8d8k:V (3.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P17558 36482135
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    792099 8d8k:W (3.13) BS02 ATP ? GO:0003735 ... Q01163 36482135
    792100 8d8k:X (3.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... P53305 36482135
    792101 8d8k:Y (3.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q03976 36482135
    792102 8d8k:Z (3.13) BS01 rna ? GO:0003735 ... O75012 36482135
    792103 8d8k:d (3.13) BS01 rna ? GO:0000963 ... P48237 36482135
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    792200 8d9c:B (1.82) BS01 QI5 ? N/A F8W4B7 36073962

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  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
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