SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 1072681 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 4000 4001 4002 4003 4004 4005 4006 4007 4008 4009 4010 4011 4012 4013 4014 4015 4016 4017 4018 4019 4020 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    801801 8evr:AZ (2.87) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C2H6 37595043
    801802 8evr:Aa (2.87) BS01 rna ? GO:0002181 ... P02406 37595043
    801803 8evr:Ab (2.87) BS01 rna ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801804 8evr:Ac (2.87) BS01 rna ? GO:0002181 ... P14120 37595043
    801805 8evr:Ad (2.87) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0C2H8 37595043
    801806 8evr:Ae (2.87) BS01 rna ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801807 8evr:Af (2.87) BS01 rna ? GO:0000027 ... P05744 37595043
    801808 8evr:Ag (2.87) BS01 rna ? GO:0002181 ... P87262 37595043
    801809 8evr:Ah (2.87) BS01 rna ? GO:0000463 ... P0CX84 37595043
    801810 8evr:Ah (2.87) BS02 rna ? GO:0000463 ... P0CX84 37595043
    801811 8evr:Ai (2.87) BS01 rna ? GO:0000470 ... P05745 37595043
    801812 8evr:Aj (2.87) BS01 rna ? GO:0000448 ... P49166 37595043
    801813 8evr:Aj (2.87) BS02 rna ? GO:0000448 ... P49166 37595043
    801814 8evr:Ak (2.87) BS01 rna ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801815 8evr:Al (2.87) BS01 rna ? GO:0002181 ... P04650 37595043
    801816 8evr:Al (2.87) BS02 rna ? GO:0002181 ... P04650 37595043
    801817 8evr:Am (2.87) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0CH08 37595043
    801818 8evr:Ao (2.87) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX27 37595043
    801819 8evr:Ao (2.87) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P0CX27 37595043
    801820 8evr:Ap (2.87) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX25 37595043
    801821 8evr:BA (2.87) BS01 G ? GO:0000028 ... P32905 37595043
    801822 8evr:BA (2.87) BS02 A ? GO:0000028 ... P32905 37595043
    801823 8evr:BB (2.87) BS01 rna ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801824 8evr:BB (2.87) BS02 rna ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801825 8evr:BB (2.87) BS03 U ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801826 8evr:BC (2.87) BS01 rna ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801827 8evr:BC (2.87) BS02 U ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801828 8evr:BD (2.87) BS01 rna ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801829 8evr:BD (2.87) BS02 A ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801830 8evr:BD (2.87) BS03 U ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801831 8evr:BD (2.87) BS04 G ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801832 8evr:BD (2.87) BS05 G ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801833 8evr:BD (2.87) BS06 C ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801834 8evr:BD (2.87) BS07 G ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801835 8evr:BD (2.87) BS08 C ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801836 8evr:BD (2.87) BS09 U ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801837 8evr:BD (2.87) BS10 A ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801838 8evr:BE (2.87) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX35 37595043
    801839 8evr:BF (2.87) BS01 rna ? GO:0003723 ... A0A1L4AA68 37595043
    801840 8evr:BF (2.87) BS02 rna ? GO:0003723 ... A0A1L4AA68 37595043
    801841 8evr:BF (2.87) BS03 A ? GO:0003723 ... A0A1L4AA68 37595043
    801842 8evr:BF (2.87) BS04 U ? GO:0003723 ... A0A1L4AA68 37595043
    801843 8evr:BF (2.87) BS05 C ? GO:0003723 ... A0A1L4AA68 37595043
    801844 8evr:BF (2.87) BS06 U ? GO:0003723 ... A0A1L4AA68 37595043
    801845 8evr:BF (2.87) BS07 U ? GO:0003723 ... A0A1L4AA68 37595043
    801846 8evr:BF (2.87) BS08 G ? GO:0003723 ... A0A1L4AA68 37595043
    801847 8evr:BF (2.87) BS09 U ? GO:0003723 ... A0A1L4AA68 37595043
    801848 8evr:BF (2.87) BS10 A ? GO:0003723 ... A0A1L4AA68 37595043
    801849 8evr:BF (2.87) BS11 U ? GO:0003723 ... A0A1L4AA68 37595043
    801850 8evr:BG (2.87) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX37 37595043
    801851 8evr:BG (2.87) BS02 A ? GO:0000462 ... P0CX37 37595043
    801852 8evr:BG (2.87) BS03 U ? GO:0000462 ... P0CX37 37595043
    801853 8evr:BH (2.87) BS01 rna ? GO:0002181 ... P26786 37595043
    801854 8evr:BI (2.87) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX39 37595043
    801855 8evr:BI (2.87) BS02 rna ? GO:0000462 ... P0CX39 37595043
    801856 8evr:BI (2.87) BS03 U ? GO:0000462 ... P0CX39 37595043
    801857 8evr:BI (2.87) BS04 A ? GO:0000462 ... P0CX39 37595043
    801858 8evr:BI (2.87) BS05 C ? GO:0000462 ... P0CX39 37595043
    801859 8evr:BJ (2.87) BS01 rna ? GO:0000462 ... O13516 37595043
    801860 8evr:BK (2.87) BS01 A ? GO:0000054 ... Q08745 37595043
    801861 8evr:BK (2.87) BS02 A ? GO:0000054 ... Q08745 37595043
    801862 8evr:BK (2.87) BS03 U ? GO:0000054 ... Q08745 37595043
    801863 8evr:BK (2.87) BS04 G ? GO:0000054 ... Q08745 37595043
    801864 8evr:BL (2.87) BS01 rna ? GO:0000028 ... P0CX47 37595043
    801865 8evr:BM (2.87) BS01 A ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801866 8evr:BM (2.87) BS02 G ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801867 8evr:BM (2.87) BS03 G ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801868 8evr:BM (2.87) BS04 G ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801869 8evr:BN (2.87) BS01 rna ? GO:0000462 ... P05756 37595043
    801870 8evr:BO (2.87) BS01 rna ? GO:0000028 ... P06367 37595043
    801871 8evr:BO (2.87) BS02 U ? GO:0000028 ... P06367 37595043
    801872 8evr:BO (2.87) BS03 C ? GO:0000028 ... P06367 37595043
    801873 8evr:BO (2.87) BS04 G ? GO:0000028 ... P06367 37595043
    801874 8evr:BO (2.87) BS05 U ? GO:0000028 ... P06367 37595043
    801875 8evr:BO (2.87) BS06 G ? GO:0000028 ... P06367 37595043
    801876 8evr:BP (2.87) BS01 rna ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801877 8evr:BP (2.87) BS02 A ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801878 8evr:BP (2.87) BS03 G ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801879 8evr:BP (2.87) BS04 G ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801880 8evr:BP (2.87) BS05 C ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801881 8evr:BP (2.87) BS06 U ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801882 8evr:BP (2.87) BS07 U ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801883 8evr:BP (2.87) BS08 G ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801884 8evr:BP (2.87) BS09 A ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801885 8evr:BP (2.87) BS10 A ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801886 8evr:BP (2.87) BS11 U ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801887 8evr:BP (2.87) BS12 U ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801888 8evr:BQ (2.87) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801889 8evr:BQ (2.87) BS02 U ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801890 8evr:BQ (2.87) BS03 U ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801891 8evr:BQ (2.87) BS04 C ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801892 8evr:BQ (2.87) BS05 A ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801893 8evr:BQ (2.87) BS06 A ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801894 8evr:BQ (2.87) BS07 C ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801895 8evr:BQ (2.87) BS08 A ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801896 8evr:BQ (2.87) BS09 G ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801897 8evr:BQ (2.87) BS10 U ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801898 8evr:BQ (2.87) BS11 A ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801899 8evr:BQ (2.87) BS12 G ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801900 8evr:BQ (2.87) BS13 C ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801901 8evr:BQ (2.87) BS14 U ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801902 8evr:BQ (2.87) BS15 U ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801903 8evr:BQ (2.87) BS16 U ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801904 8evr:BQ (2.87) BS17 C ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801905 8evr:BQ (2.87) BS18 3AU ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801906 8evr:BQ (2.87) BS19 U ? GO:0000462 ... P0CX51 37595043
    801907 8evr:BR (2.87) BS01 G ? GO:0000028 ... P02407 37595043
    801908 8evr:BR (2.87) BS02 G ? GO:0000028 ... P02407 37595043
    801909 8evr:BR (2.87) BS03 C ? GO:0000028 ... P02407 37595043
    801910 8evr:BR (2.87) BS04 U ? GO:0000028 ... P02407 37595043
    801911 8evr:BR (2.87) BS05 G ? GO:0000028 ... P02407 37595043
    801912 8evr:BR (2.87) BS06 U ? GO:0000028 ... P02407 37595043
    801913 8evr:BS (2.87) BS01 rna ? GO:0000054 ... P0CX55 37595043
    801914 8evr:BS (2.87) BS02 C ? GO:0000054 ... P0CX55 37595043
    801915 8evr:BS (2.87) BS03 G ? GO:0000054 ... P0CX55 37595043
    801916 8evr:BS (2.87) BS04 A ? GO:0000054 ... P0CX55 37595043
    801917 8evr:BS (2.87) BS05 G ? GO:0000054 ... P0CX55 37595043
    801918 8evr:BS (2.87) BS06 A ? GO:0000054 ... P0CX55 37595043
    801919 8evr:BS (2.87) BS07 G ? GO:0000054 ... P0CX55 37595043
    801920 8evr:BS (2.87) BS08 A ? GO:0000054 ... P0CX55 37595043
    801921 8evr:BS (2.87) BS09 C ? GO:0000054 ... P0CX55 37595043
    801922 8evr:BS (2.87) BS10 U ? GO:0000054 ... P0CX55 37595043
    801923 8evr:BS (2.87) BS11 U ? GO:0000054 ... P0CX55 37595043
    801924 8evr:BS (2.87) BS12 G ? GO:0000054 ... P0CX55 37595043
    801925 8evr:BT (2.87) BS01 A ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801926 8evr:BT (2.87) BS02 G ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801927 8evr:BT (2.87) BS03 C ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801928 8evr:BT (2.87) BS04 A ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801929 8evr:BT (2.87) BS05 C ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801930 8evr:BT (2.87) BS06 G ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801931 8evr:BT (2.87) BS07 G ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801932 8evr:BT (2.87) BS08 A ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801933 8evr:BT (2.87) BS09 G ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801934 8evr:BT (2.87) BS10 C ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801935 8evr:BT (2.87) BS11 G ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801936 8evr:BT (2.87) BS12 G ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801937 8evr:BT (2.87) BS13 C ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801938 8evr:BT (2.87) BS14 G ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801939 8evr:BT (2.87) BS15 G ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801940 8evr:BT (2.87) BS16 G ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801941 8evr:BT (2.87) BS17 G ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801942 8evr:BT (2.87) BS18 C ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801943 8evr:BT (2.87) BS19 G ? GO:0000054 ... P07280 37595043
    801944 8evr:BU (2.87) BS01 G ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801945 8evr:BU (2.87) BS02 A ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801946 8evr:BU (2.87) BS03 U ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801947 8evr:BU (2.87) BS04 U ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801948 8evr:BU (2.87) BS05 A ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801949 8evr:BU (2.87) BS06 G ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801950 8evr:BU (2.87) BS07 G ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801951 8evr:BU (2.87) BS08 G ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801952 8evr:BU (2.87) BS09 A ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801953 8evr:BU (2.87) BS10 U ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801954 8evr:BU (2.87) BS11 G ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801955 8evr:BU (2.87) BS12 4AC ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801956 8evr:BU (2.87) BS13 A ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801957 8evr:BU (2.87) BS14 C ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801958 8evr:BU (2.87) BS15 G ? GO:0003723 ... N/A 37595043
    801959 8evr:BV (2.87) BS01 rna ? GO:0000447 ... P0C0V8 37595043
    801960 8evr:BW (2.87) BS01 rna ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801961 8evr:BX (2.87) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX29 37595043
    801962 8evr:BY (2.87) BS01 rna ? GO:0000462 ... P0CX31 37595043
    801963 8evr:BZ (2.87) BS01 rna ? N/A N/A 37595043
    801964 8evr:BZ (2.87) BS02 C ? N/A N/A 37595043
    801965 8evr:BZ (2.87) BS03 G ? N/A N/A 37595043
    801966 8evr:BZ (2.87) BS04 U ? N/A N/A 37595043
    801967 8evr:BZ (2.87) BS05 C ? N/A N/A 37595043
    801968 8evr:BZ (2.87) BS06 G ? N/A N/A 37595043
    801969 8evr:Ba (2.87) BS01 rna ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801970 8evr:Ba (2.87) BS02 A ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801971 8evr:Ba (2.87) BS03 G ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801972 8evr:Ba (2.87) BS04 A ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801973 8evr:Ba (2.87) BS05 U ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801974 8evr:Ba (2.87) BS06 C ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801975 8evr:Ba (2.87) BS07 A ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801976 8evr:Ba (2.87) BS08 U ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801977 8evr:Ba (2.87) BS09 A ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801978 8evr:Ba (2.87) BS10 G ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801979 8evr:Bb (2.87) BS01 rna ? GO:0000028 ... P35997 37595043
    801980 8evr:Bc (2.87) BS01 C ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801981 8evr:Bd (2.87) BS01 U ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801982 8evr:Bd (2.87) BS02 G ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801983 8evr:Bd (2.87) BS03 A ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801984 8evr:Bd (2.87) BS04 C ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801985 8evr:Bd (2.87) BS05 U ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801986 8evr:Bd (2.87) BS06 G ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801987 8evr:Bd (2.87) BS07 C ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801988 8evr:Bd (2.87) BS08 A ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801989 8evr:Bd (2.87) BS09 U ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801990 8evr:Bd (2.87) BS10 C ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801991 8evr:Bd (2.87) BS11 A ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801992 8evr:Be (2.87) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0CX33 37595043
    801993 8evr:Bf (2.87) BS01 U ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801994 8evr:Bf (2.87) BS02 A ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801995 8evr:Bf (2.87) BS03 U ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801996 8evr:Bf (2.87) BS04 U ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801997 8evr:Bf (2.87) BS05 C ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801998 8evr:Bf (2.87) BS06 U ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    801999 8evr:Bf (2.87) BS07 OMG ? GO:0003735 ... N/A 37595043
    802000 8evr:Bf (2.87) BS08 G ? GO:0003735 ... N/A 37595043

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).