SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 4041 4042 4043 4044 4045 4046 4047 4048 4049 4050 4051 4052 4053 4054 4055 4056 4057 4058 4059 4060 4061 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    810001 8g2a:1O (2.45) BS03 MG ? GO:0003735 ... Q5SHP8 38238495
    810002 8g2a:1O (2.45) BS04 MG ? GO:0003735 ... Q5SHP8 38238495
    810003 8g2a:1P (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 38238495
    810004 8g2a:1P (2.45) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 38238495
    810005 8g2a:1P (2.45) BS03 MG ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 38238495
    810006 8g2a:1P (2.45) BS04 MG ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 38238495
    810007 8g2a:1P (2.45) BS05 MG ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 38238495
    810008 8g2a:1Q (2.45) BS01 rna ? GO:0000049 ... P60489 38238495
    810009 8g2a:1Q (2.45) BS02 rna ? GO:0000049 ... P60489 38238495
    810010 8g2a:1Q (2.45) BS03 rna ? GO:0000049 ... P60489 38238495
    810011 8g2a:1Q (2.45) BS04 rna ? GO:0000049 ... P60489 38238495
    810012 8g2a:1Q (2.45) BS05 MG ? GO:0000049 ... P60489 38238495
    810013 8g2a:1Q (2.45) BS06 MG ? GO:0000049 ... P60489 38238495
    810014 8g2a:1Q (2.45) BS07 MG ? GO:0000049 ... P60489 38238495
    810015 8g2a:1Q (2.45) BS08 MG ? GO:0000049 ... P60489 38238495
    810016 8g2a:1Q (2.45) BS09 MG ? GO:0000049 ... P60489 38238495
    810017 8g2a:1R (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q9Z9H5 38238495
    810018 8g2a:1R (2.45) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q9Z9H5 38238495
    810019 8g2a:1R (2.45) BS03 MG ? GO:0003735 ... Q9Z9H5 38238495
    810020 8g2a:1R (2.45) BS04 MG ? GO:0003735 ... Q9Z9H5 38238495
    810021 8g2a:1S (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 38238495
    810022 8g2a:1S (2.45) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 38238495
    810023 8g2a:1S (2.45) BS03 MG ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 38238495
    810024 8g2a:1S (2.45) BS04 MG ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 38238495
    810025 8g2a:1T (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60490 38238495
    810026 8g2a:1T (2.45) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60490 38238495
    810027 8g2a:1U (2.45) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60491 38238495
    810028 8g2a:1U (2.45) BS02 MG ? GO:0000027 ... P60491 38238495
    810029 8g2a:1U (2.45) BS03 MG ? GO:0000027 ... P60491 38238495
    810030 8g2a:1U (2.45) BS04 MG ? GO:0000027 ... P60491 38238495
    810031 8g2a:1U (2.45) BS05 MG ? GO:0000027 ... P60491 38238495
    810032 8g2a:1U (2.45) BS06 MG ? GO:0000027 ... P60491 38238495
    810033 8g2a:1U (2.45) BS07 MG ? GO:0000027 ... P60491 38238495
    810034 8g2a:1U (2.45) BS08 MG ? GO:0000027 ... P60491 38238495
    810035 8g2a:1U (2.45) BS09 MG ? GO:0000027 ... P60491 38238495
    810036 8g2a:1U (2.45) BS10 MG ? GO:0000027 ... P60491 38238495
    810037 8g2a:1U (2.45) BS11 MG ? GO:0000027 ... P60491 38238495
    810038 8g2a:1V (2.45) BS01 rna ? GO:0003723 ... P60492 38238495
    810039 8g2a:1V (2.45) BS02 MG ? GO:0003723 ... P60492 38238495
    810040 8g2a:1V (2.45) BS03 MG ? GO:0003723 ... P60492 38238495
    810041 8g2a:1V (2.45) BS04 MG ? GO:0003723 ... P60492 38238495
    810042 8g2a:1V (2.45) BS05 MG ? GO:0003723 ... P60492 38238495
    810043 8g2a:1V (2.45) BS06 MG ? GO:0003723 ... P60492 38238495
    810044 8g2a:1W (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP3 38238495
    810045 8g2a:1W (2.45) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHP3 38238495
    810046 8g2a:1W (2.45) BS03 MG ? GO:0003735 ... Q5SHP3 38238495
    810047 8g2a:1W (2.45) BS04 MG ? GO:0003735 ... Q5SHP3 38238495
    810048 8g2a:1W (2.45) BS05 MG ? GO:0003735 ... Q5SHP3 38238495
    810049 8g2a:1X (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP0 38238495
    810050 8g2a:1X (2.45) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHP0 38238495
    810051 8g2a:1X (2.45) BS03 MG ? GO:0003735 ... Q5SHP0 38238495
    810052 8g2a:1X (2.45) BS04 MG ? GO:0003735 ... Q5SHP0 38238495
    810053 8g2a:1X (2.45) BS05 MG ? GO:0003735 ... Q5SHP0 38238495
    810054 8g2a:1Y (2.45) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP9 38238495
    810055 8g2a:1Y (2.45) BS02 MG ? GO:0003723 ... Q5SHP9 38238495
    810056 8g2a:1Y (2.45) BS03 ZN ? GO:0003723 ... Q5SHP9 38238495
    810057 8g2a:1Z (2.45) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHZ1 38238495
    810058 8g2a:1Z (2.45) BS02 rna ? GO:0003723 ... Q5SHZ1 38238495
    810059 8g2a:1b (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80371 38238495
    810060 8g2a:1c (2.45) BS01 rna ? GO:0003676 ... P80372 38238495
    810061 8g2a:1d (2.45) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80373 38238495
    810062 8g2a:1d (2.45) BS02 SF4 ? GO:0003723 ... P80373 38238495
    810063 8g2a:1e (2.45) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 38238495
    810064 8g2a:1e (2.45) BS02 MG ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 38238495
    810065 8g2a:1e (2.45) BS03 MG ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 38238495
    810066 8g2a:1f (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLP8 38238495
    810067 8g2a:1g (2.45) BS01 rna ? GO:0000049 ... P17291 38238495
    810068 8g2a:1g (2.45) BS02 rna ? GO:0000049 ... P17291 38238495
    810069 8g2a:1h (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY9 38238495
    810070 8g2a:1i (2.45) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80374 38238495
    810071 8g2a:1i (2.45) BS02 rna ? GO:0000049 ... P80374 38238495
    810072 8g2a:1j (2.45) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN7 38238495
    810073 8g2a:1k (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80376 38238495
    810074 8g2a:1k (2.45) BS02 MG ? GO:0003735 ... P80376 38238495
    810075 8g2a:1k (2.45) BS03 MG ? GO:0003735 ... P80376 38238495
    810076 8g2a:1l (2.45) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN3 38238495
    810077 8g2a:1l (2.45) BS02 MG ? GO:0000049 ... Q5SHN3 38238495
    810078 8g2a:1m (2.45) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80377 38238495
    810079 8g2a:1m (2.45) BS02 rna ? GO:0000049 ... P80377 38238495
    810080 8g2a:1m (2.45) BS03 rna ? GO:0000049 ... P80377 38238495
    810081 8g2a:1m (2.45) BS04 MG ? GO:0000049 ... P80377 38238495
    810082 8g2a:1n (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY6 38238495
    810083 8g2a:1n (2.45) BS02 ZN ? GO:0003735 ... P0DOY6 38238495
    810084 8g2a:1o (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 38238495
    810085 8g2a:1o (2.45) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 38238495
    810086 8g2a:1p (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJH3 38238495
    810087 8g2a:1q (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY7 38238495
    810088 8g2a:1r (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ0 38238495
    810089 8g2a:1s (2.45) BS01 rna ? GO:0000028 ... Q5SHP2 38238495
    810090 8g2a:1t (2.45) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80380 38238495
    810091 8g2a:20 (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60493 38238495
    810092 8g2a:20 (2.45) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60493 38238495
    810093 8g2a:20 (2.45) BS03 rna ? GO:0003735 ... P60493 38238495
    810094 8g2a:21 (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60494 38238495
    810095 8g2a:21 (2.45) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60494 38238495
    810096 8g2a:21 (2.45) BS03 MG ? GO:0003735 ... P60494 38238495
    810097 8g2a:22 (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP6 38238495
    810098 8g2a:23 (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 38238495
    810099 8g2a:23 (2.45) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 38238495
    810100 8g2a:23 (2.45) BS03 MG ? GO:0003735 ... Q5SHQ6 38238495
    810101 8g2a:24 (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJE1 38238495
    810102 8g2a:24 (2.45) BS02 ZN ? GO:0003735 ... Q5SJE1 38238495
    810103 8g2a:25 (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80339 38238495
    810104 8g2a:25 (2.45) BS02 MG ? GO:0003735 ... P80339 38238495
    810105 8g2a:25 (2.45) BS03 ZN ? GO:0003735 ... P80339 38238495
    810106 8g2a:26 (2.45) BS01 rna ? GO:0000049 ... P35871 38238495
    810107 8g2a:26 (2.45) BS02 MG ? GO:0000049 ... P35871 38238495
    810108 8g2a:26 (2.45) BS03 ZN ? GO:0000049 ... P35871 38238495
    810109 8g2a:27 (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80340 38238495
    810110 8g2a:27 (2.45) BS02 MG ? GO:0003735 ... P80340 38238495
    810111 8g2a:28 (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SKU1 38238495
    810112 8g2a:29 (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHR2 38238495
    810113 8g2a:29 (2.45) BS02 ZN ? GO:0003735 ... Q5SHR2 38238495
    810114 8g2a:2D (2.45) BS01 rna ? GO:0002181 ... P60405 38238495
    810115 8g2a:2D (2.45) BS02 rna ? GO:0002181 ... P60405 38238495
    810116 8g2a:2D (2.45) BS03 MG ? GO:0002181 ... P60405 38238495
    810117 8g2a:2D (2.45) BS04 MG ? GO:0002181 ... P60405 38238495
    810118 8g2a:2D (2.45) BS05 MG ? GO:0002181 ... P60405 38238495
    810119 8g2a:2D (2.45) BS06 MG ? GO:0002181 ... P60405 38238495
    810120 8g2a:2D (2.45) BS07 MG ? GO:0002181 ... P60405 38238495
    810121 8g2a:2D (2.45) BS08 MG ? GO:0002181 ... P60405 38238495
    810122 8g2a:2E (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN8 38238495
    810123 8g2a:2E (2.45) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHN8 38238495
    810124 8g2a:2F (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHN9 38238495
    810125 8g2a:2F (2.45) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHN9 38238495
    810126 8g2a:2F (2.45) BS03 MG ? GO:0003735 ... Q5SHN9 38238495
    810127 8g2a:2F (2.45) BS04 MG ? GO:0003735 ... Q5SHN9 38238495
    810128 8g2a:2F (2.45) BS05 MG ? GO:0003735 ... Q5SHN9 38238495
    810129 8g2a:2G (2.45) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 38238495
    810130 8g2a:2G (2.45) BS02 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 38238495
    810131 8g2a:2G (2.45) BS03 rna ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 38238495
    810132 8g2a:2G (2.45) BS04 MG ? GO:0000049 ... Q5SHQ0 38238495
    810133 8g2a:2H (2.45) BS01 rna ? GO:0002181 ... P0DOY8 38238495
    810134 8g2a:2I (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ1 38238495
    810135 8g2a:2N (2.45) BS01 rna ? GO:0003729 ... P60488 38238495
    810136 8g2a:2O (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 38238495
    810137 8g2a:2O (2.45) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP8 38238495
    810138 8g2a:2P (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ7 38238495
    810139 8g2a:2Q (2.45) BS01 rna ? GO:0000049 ... P60489 38238495
    810140 8g2a:2Q (2.45) BS02 rna ? GO:0000049 ... P60489 38238495
    810141 8g2a:2Q (2.45) BS03 rna ? GO:0000049 ... P60489 38238495
    810142 8g2a:2Q (2.45) BS04 rna ? GO:0000049 ... P60489 38238495
    810143 8g2a:2Q (2.45) BS05 MG ? GO:0000049 ... P60489 38238495
    810144 8g2a:2Q (2.45) BS06 MG ? GO:0000049 ... P60489 38238495
    810145 8g2a:2R (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q9Z9H5 38238495
    810146 8g2a:2S (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 38238495
    810147 8g2a:2S (2.45) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SHQ4 38238495
    810148 8g2a:2T (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60490 38238495
    810149 8g2a:2T (2.45) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60490 38238495
    810150 8g2a:2U (2.45) BS01 rna ? GO:0000027 ... P60491 38238495
    810151 8g2a:2U (2.45) BS02 MG ? GO:0000027 ... P60491 38238495
    810152 8g2a:2V (2.45) BS01 rna ? GO:0003723 ... P60492 38238495
    810153 8g2a:2V (2.45) BS02 MG ? GO:0003723 ... P60492 38238495
    810154 8g2a:2W (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP3 38238495
    810155 8g2a:2W (2.45) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHP3 38238495
    810156 8g2a:2W (2.45) BS03 MG ? GO:0003735 ... Q5SHP3 38238495
    810157 8g2a:2X (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SHP0 38238495
    810158 8g2a:2X (2.45) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SHP0 38238495
    810159 8g2a:2Y (2.45) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHP9 38238495
    810160 8g2a:2Y (2.45) BS02 ZN ? GO:0003723 ... Q5SHP9 38238495
    810161 8g2a:2Z (2.45) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHZ1 38238495
    810162 8g2a:2b (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80371 38238495
    810163 8g2a:2c (2.45) BS01 rna ? GO:0003676 ... P80372 38238495
    810164 8g2a:2d (2.45) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80373 38238495
    810165 8g2a:2d (2.45) BS02 MG ? GO:0003723 ... P80373 38238495
    810166 8g2a:2d (2.45) BS03 SF4 ? GO:0003723 ... P80373 38238495
    810167 8g2a:2e (2.45) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 38238495
    810168 8g2a:2e (2.45) BS02 MG ? GO:0003723 ... Q5SHQ5 38238495
    810169 8g2a:2f (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLP8 38238495
    810170 8g2a:2f (2.45) BS02 MG ? GO:0003735 ... Q5SLP8 38238495
    810171 8g2a:2g (2.45) BS01 rna ? GO:0000049 ... P17291 38238495
    810172 8g2a:2g (2.45) BS02 rna ? GO:0000049 ... P17291 38238495
    810173 8g2a:2h (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY9 38238495
    810174 8g2a:2i (2.45) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80374 38238495
    810175 8g2a:2i (2.45) BS02 rna ? GO:0000049 ... P80374 38238495
    810176 8g2a:2j (2.45) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN7 38238495
    810177 8g2a:2k (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P80376 38238495
    810178 8g2a:2k (2.45) BS02 MG ? GO:0003735 ... P80376 38238495
    810179 8g2a:2l (2.45) BS01 rna ? GO:0000049 ... Q5SHN3 38238495
    810180 8g2a:2l (2.45) BS02 MG ? GO:0000049 ... Q5SHN3 38238495
    810181 8g2a:2l (2.45) BS03 MG ? GO:0000049 ... Q5SHN3 38238495
    810182 8g2a:2m (2.45) BS01 rna ? GO:0000049 ... P80377 38238495
    810183 8g2a:2m (2.45) BS02 rna ? GO:0000049 ... P80377 38238495
    810184 8g2a:2m (2.45) BS03 rna ? GO:0000049 ... P80377 38238495
    810185 8g2a:2n (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY6 38238495
    810186 8g2a:2n (2.45) BS02 MG ? GO:0003735 ... P0DOY6 38238495
    810187 8g2a:2n (2.45) BS03 ZN ? GO:0003735 ... P0DOY6 38238495
    810188 8g2a:2o (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 38238495
    810189 8g2a:2o (2.45) BS02 rna ? GO:0003735 ... Q5SJ76 38238495
    810190 8g2a:2p (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SJH3 38238495
    810191 8g2a:2q (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... P0DOY7 38238495
    810192 8g2a:2q (2.45) BS02 MG ? GO:0003735 ... P0DOY7 38238495
    810193 8g2a:2r (2.45) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q5SLQ0 38238495
    810194 8g2a:2s (2.45) BS01 rna ? GO:0000028 ... Q5SHP2 38238495
    810195 8g2a:2t (2.45) BS01 rna ? GO:0003723 ... P80380 38238495
    810196 8g2a:2t (2.45) BS02 MG ? GO:0003723 ... P80380 38238495
    810197 8g2b:10 (2.55) BS01 rna ? GO:0003735 ... P60493 38238495
    810198 8g2b:10 (2.55) BS02 rna ? GO:0003735 ... P60493 38238495
    810199 8g2b:10 (2.55) BS03 MG ? GO:0003735 ... P60493 38238495
    810200 8g2b:10 (2.55) BS04 MG ? GO:0003735 ... P60493 38238495

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).