SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 1072681 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 4154 4155 4156 4157 4158 4159 4160 4161 4162 4163 4164 4165 4166 4167 4168 4169 4170 4171 4172 4173 4174 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    832601 8ink:v (3.2) BS01 rna ? GO:0000027 ... Q9UKD2 37491604
    832602 8ink:w (3.2) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q13823 37491604
    832603 8ink:w (3.2) BS02 GTP ? GO:0003723 ... Q13823 37491604
    832604 8ink:y (3.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... P30050 37491604
    832605 8ink:z (3.2) BS01 rna ? GO:0003723 ... Q9BRT6 37491604
    832606 8inl:A (2.62) BS01 DJ0 1.14.99.66 GO:0005634 ... O60341 39501082
    832607 8inl:A (2.62) BS02 FAD 1.14.99.66 GO:0005634 ... O60341 39501082
    832608 8ino:A (2.3) BS01 Q30 2.4.1.- GO:0008194 ... W8JMV4 N/A
    832609 8ino:A (2.3) BS02 UDP 2.4.1.- GO:0008194 ... W8JMV4 N/A
    832610 8inp:A (2.12) BS01 UDP N/A GO:0008194 ... A0AA96QCN7 37581303
    832611 8inp:A (2.12) BS02 BGC N/A GO:0008194 ... A0AA96QCN7 37581303
    832612 8inr:R (2.73) BS01 peptide ? GO:0001659 ... P03435
    P33032
    37524700
    832613 8inr:R (2.73) BS02 CA ? GO:0001659 ... P03435
    P33032
    37524700
    832614 8inu:A (1.69) BS01 4WI 2.1.1.56
    2.1.1.57
    2.7.7.48
    2.7.7.50
    3.1.13.-
    3.4.19.12
    3.4.22.-
    3.4.22.69
    3.6.4.12
    3.6.4.13
    4.6.1.-
    GO:0008233 ... P0DTD1 37407698
    832615 8inv:A (1.85) BS01 UDP 2.4.1.- GO:0008194 ... W8JMV4 N/A
    832616 8inv:A (1.85) BS02 BUF 2.4.1.- GO:0008194 ... W8JMV4 N/A
    832617 8inw:A (2.4) BS01 4WI 2.1.1.56
    2.1.1.57
    2.7.7.48
    2.7.7.50
    3.1.13.-
    3.4.19.12
    3.4.22.-
    3.4.22.69
    3.6.4.12
    3.6.4.13
    4.6.1.-
    GO:0008233 ... P0DTD1 37407698
    832618 8inx:A (1.66) BS01 7YY 2.1.1.56
    2.1.1.57
    2.7.7.48
    2.7.7.50
    3.1.13.-
    3.4.19.12
    3.4.22.-
    3.4.22.69
    3.6.4.12
    3.6.4.13
    4.6.1.-
    GO:0008233 ... P0DTD1 37407698
    832619 8iny:A (1.59) BS01 7YY 2.1.1.56
    2.1.1.57
    2.7.7.48
    2.7.7.50
    3.1.13.-
    3.4.19.12
    3.4.22.-
    3.4.22.69
    3.6.4.12
    3.6.4.13
    4.6.1.-
    GO:0008233 ... P0DTD1 37407698
    832620 8inz:A (2.72) BS01 VX9 ? GO:0003254 ... Q9P1Z3 38636662
    832621 8inz:B (2.72) BS01 VX9 ? GO:0003254 ... Q9P1Z3 38636662
    832622 8inz:C (2.72) BS01 VX9 ? GO:0003254 ... Q9P1Z3 38636662
    832623 8inz:D (2.72) BS01 VX9 ? GO:0003254 ... Q9P1Z3 38636662
    832624 8io0:A (3.19) BS01 CMP N/A GO:0003254 ... Q9P1Z3 38636662
    832625 8io0:B (3.19) BS01 CMP N/A GO:0003254 ... Q9P1Z3 38636662
    832626 8io0:C (3.19) BS01 CMP N/A GO:0003254 ... Q9P1Z3 38636662
    832627 8io0:D (3.19) BS01 CMP N/A GO:0003254 ... Q9P1Z3 38636662
    832628 8io3:A (3.02) BS01 VXI ? GO:0003254 ... Q9P1Z3 N/A
    832629 8io3:B (3.02) BS01 VXI ? GO:0003254 ... Q9P1Z3 N/A
    832630 8io3:C (3.02) BS01 VXI ? GO:0003254 ... Q9P1Z3 N/A
    832631 8io3:D (3.02) BS01 VXI ? GO:0003254 ... Q9P1Z3 N/A
    832632 8io6:A (2.68) BS01 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832633 8io6:A (2.68) BS02 MG ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832634 8io6:A (2.68) BS03 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832635 8io6:B (2.68) BS01 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832636 8io6:B (2.68) BS02 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832637 8io6:B (2.68) BS03 MG ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832638 8io6:C (2.68) BS01 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832639 8io6:C (2.68) BS02 MG ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832640 8io6:C (2.68) BS03 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832641 8io6:D (2.68) BS01 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832642 8io6:D (2.68) BS02 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832643 8io6:D (2.68) BS03 MG ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832644 8io6:E (2.68) BS01 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832645 8io6:E (2.68) BS02 MG ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832646 8io6:E (2.68) BS03 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832647 8io6:F (2.68) BS01 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832648 8io6:F (2.68) BS02 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832649 8io6:F (2.68) BS03 MG ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832650 8io6:G (2.68) BS01 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832651 8io6:G (2.68) BS02 MG ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832652 8io6:G (2.68) BS03 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832653 8io6:H (2.68) BS01 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832654 8io6:H (2.68) BS02 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832655 8io6:H (2.68) BS03 MG ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832656 8io7:A (2.62) BS01 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832657 8io7:A (2.62) BS02 MG ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832658 8io7:A (2.62) BS03 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832659 8io7:B (2.62) BS01 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832660 8io7:B (2.62) BS02 TPP ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832661 8io7:B (2.62) BS03 MG ? GO:0005975 ... N/A 37349485
    832662 8io8:A (2.17) BS01 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832663 8io8:A (2.17) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832664 8io8:A (2.17) BS03 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832665 8io8:A (2.17) BS04 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832666 8io8:A (2.17) BS05 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832667 8io8:B (2.17) BS01 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832668 8io8:B (2.17) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832669 8io8:B (2.17) BS03 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832670 8io8:B (2.17) BS04 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832671 8io8:B (2.17) BS05 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832672 8io9:A (2.36) BS01 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832673 8io9:A (2.36) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832674 8io9:A (2.36) BS03 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832675 8io9:A (2.36) BS04 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832676 8io9:A (2.36) BS05 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832677 8io9:B (2.36) BS01 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832678 8io9:B (2.36) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832679 8io9:B (2.36) BS03 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832680 8io9:B (2.36) BS04 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832681 8io9:B (2.36) BS05 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832682 8io9:C (2.36) BS01 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832683 8io9:C (2.36) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832684 8io9:C (2.36) BS03 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832685 8io9:C (2.36) BS04 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832686 8io9:C (2.36) BS05 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832687 8io9:D (2.36) BS01 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832688 8io9:D (2.36) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832689 8io9:D (2.36) BS03 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832690 8io9:D (2.36) BS04 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832691 8io9:D (2.36) BS05 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832692 8io9:E (2.36) BS01 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832693 8io9:E (2.36) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832694 8io9:E (2.36) BS03 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832695 8io9:E (2.36) BS04 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832696 8io9:E (2.36) BS05 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832697 8io9:F (2.36) BS01 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832698 8io9:F (2.36) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832699 8io9:F (2.36) BS03 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832700 8io9:F (2.36) BS04 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832701 8io9:F (2.36) BS05 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832702 8io9:G (2.36) BS01 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832703 8io9:G (2.36) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832704 8io9:G (2.36) BS03 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832705 8io9:G (2.36) BS04 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832706 8io9:G (2.36) BS05 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832707 8io9:H (2.36) BS01 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832708 8io9:H (2.36) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832709 8io9:H (2.36) BS03 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832710 8io9:H (2.36) BS04 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832711 8io9:H (2.36) BS05 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832712 8io9:I (2.36) BS01 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832713 8io9:I (2.36) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832714 8io9:I (2.36) BS03 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832715 8io9:I (2.36) BS04 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832716 8io9:I (2.36) BS05 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832717 8io9:J (2.36) BS01 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832718 8io9:J (2.36) BS02 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832719 8io9:J (2.36) BS03 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832720 8io9:J (2.36) BS04 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832721 8io9:K (2.36) BS01 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832722 8io9:K (2.36) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832723 8io9:K (2.36) BS03 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832724 8io9:K (2.36) BS04 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832725 8io9:K (2.36) BS05 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832726 8io9:L (2.36) BS01 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832727 8io9:L (2.36) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832728 8io9:L (2.36) BS03 ANP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832729 8io9:L (2.36) BS04 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832730 8io9:L (2.36) BS05 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832731 8ioa:A (2.63) BS01 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832732 8ioa:A (2.63) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832733 8ioa:A (2.63) BS03 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832734 8ioa:B (2.63) BS01 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832735 8ioa:B (2.63) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832736 8ioa:B (2.63) BS03 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832737 8ioc:R (2.86) BS01 peptide ? GO:0002027 ... P03435
    P41968
    37524700
    832738 8ioc:R (2.86) BS02 CA ? GO:0002027 ... P03435
    P41968
    37524700
    832739 8iod:R (2.59) BS01 peptide ? GO:0001659 ... P03435
    P33032
    37524700
    832740 8iod:R (2.59) BS02 CA ? GO:0001659 ... P03435
    P33032
    37524700
    832741 8ioe:A (2.86) BS01 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832742 8ioe:A (2.86) BS02 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832743 8ioe:B (2.86) BS01 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832744 8ioe:B (2.86) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832745 8ioe:B (2.86) BS03 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832746 8ioe:C (2.86) BS01 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832747 8ioe:C (2.86) BS02 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832748 8ioe:D (2.86) BS01 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832749 8ioe:D (2.86) BS02 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832750 8ioe:E (2.86) BS01 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832751 8ioe:E (2.86) BS02 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832752 8ioe:F (2.86) BS01 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832753 8ioe:F (2.86) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832754 8ioe:F (2.86) BS03 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832755 8ioe:G (2.86) BS01 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832756 8ioe:G (2.86) BS02 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832757 8ioe:H (2.86) BS01 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832758 8ioe:H (2.86) BS02 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832759 8ioe:H (2.86) BS03 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832760 8ioe:I (2.86) BS01 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832761 8ioe:I (2.86) BS02 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832762 8ioe:J (2.86) BS01 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832763 8ioe:J (2.86) BS02 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832764 8ioe:K (2.86) BS01 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832765 8ioe:K (2.86) BS02 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832766 8ioe:L (2.86) BS01 TPP 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832767 8ioe:L (2.86) BS02 MG 4.1.2.- GO:0005975 ... Q31LF9 37349485
    832768 8iof:A (2.33) BS01 87I 4.1.99.11 GO:0003824 ... A0ACD6B9W5 N/A
    832769 8iof:B (2.33) BS01 87I 4.1.99.11 GO:0003824 ... A0ACD6B9W5 N/A
    832770 8iof:C (2.33) BS01 87I 4.1.99.11 GO:0003824 ... A0ACD6B9W5 N/A
    832771 8iof:D (2.33) BS01 87I 4.1.99.11 GO:0003824 ... A0ACD6B9W5 N/A
    832772 8iog:A (2.88) BS01 HEM ? GO:0005743 ... P24964 N/A
    832773 8iog:A (2.88) BS02 HEM ? GO:0005743 ... P24964 N/A
    832774 8iog:B (2.88) BS01 HEC ? GO:0005739 ... A0A287AZF9 N/A
    832775 8iog:C (2.88) BS01 FES 7.1.1.8 GO:0008121 ... F1RNZ1 N/A
    832776 8iog:a (2.88) BS01 HEM ? GO:0005743 ... P24964 N/A
    832777 8iog:a (2.88) BS02 HEM ? GO:0005743 ... P24964 N/A
    832778 8iog:b (2.88) BS01 HEC ? GO:0005739 ... A0A287AZF9 N/A
    832779 8iog:c (2.88) BS01 FES 7.1.1.8 GO:0008121 ... F1RNZ1 N/A
    832780 8iok:A (1.991) BS01 CO 1.13.11.27 GO:0003868 ... P93836 N/A
    832781 8iok:A (1.991) BS02 SYI 1.13.11.27 GO:0003868 ... P93836 N/A
    832782 8ioo:A (2.0) BS01 MG ? GO:0003676 ... Q9RW43 38804263
    832783 8ioo:A (2.0) BS02 MG ? GO:0003676 ... Q9RW43 38804263
    832784 8ioo:B (2.0) BS01 MG ? GO:0003676 ... Q9RW43 38804263
    832785 8ioo:B (2.0) BS02 MG ? GO:0003676 ... Q9RW43 38804263
    832786 8ioo:C (2.0) BS01 MG ? GO:0003676 ... Q9RW43 38804263
    832787 8ioo:C (2.0) BS02 MG ? GO:0003676 ... Q9RW43 38804263
    832788 8iou:D (3.18) BS01 MAN 3.4.17.-
    3.4.17.23
    GO:0006508 ... Q9BYF1 37193706
    832789 8iov:A (3.29) BS01 MAN 3.4.17.-
    3.4.17.23
    GO:0006508 ... Q9BYF1 37193706
    832790 8iow:I (3.2) BS01 peptide ? GO:0004896 ... P08887 38393945
    832791 8iox:A (2.95) BS01 GLC ? GO:0005975 ... P40120 37735577
    832792 8iox:A (2.95) BS02 GLC ? GO:0005975 ... P40120 37735577
    832793 8iox:C (2.95) BS01 GLC ? GO:0005975 ... P40120 37735577
    832794 8iox:D (2.95) BS01 GLC ? GO:0005975 ... P40120 37735577
    832795 8iox:E (2.95) BS01 GLC ? GO:0005975 ... P40120 37735577
    832796 8iox:E (2.95) BS02 GLC ? GO:0005975 ... P40120 37735577
    832797 8iox:F (2.95) BS01 GLC ? GO:0005975 ... P40120 37735577
    832798 8iox:G (2.95) BS01 GLC ? GO:0005975 ... P40120 37735577
    832799 8iox:G (2.95) BS02 GLC ? GO:0005975 ... P40120 37735577
    832800 8iox:H (2.95) BS01 GLC ? GO:0005975 ... P40120 37735577

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).