SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 4232 4233 4234 4235 4236 4237 4238 4239 4240 4241 4242 4243 4244 4245 4246 4247 4248 4249 4250 4251 4252 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    848201 8otz:MM (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848202 8otz:MN (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848203 8otz:N0 (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848204 8otz:N0 (3.6) BS02 GTP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848205 8otz:NA (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848206 8otz:NB (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848207 8otz:NC (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848208 8otz:ND (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848209 8otz:NE (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848210 8otz:NF (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848211 8otz:NG (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848212 8otz:NG (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848213 8otz:NH (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848214 8otz:NI (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848215 8otz:NI (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848216 8otz:NJ (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848217 8otz:NJ (3.6) BS02 GTP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848218 8otz:NK (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848219 8otz:NK (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848220 8otz:NL (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848221 8otz:O0 (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848222 8otz:OA (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848223 8otz:OB (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848224 8otz:OC (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848225 8otz:OD (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848226 8otz:OE (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848227 8otz:OE (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848228 8otz:OF (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848229 8otz:OG (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848230 8otz:OG (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848231 8otz:OH (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848232 8otz:OI (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848233 8otz:OI (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848234 8otz:OJ (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848235 8otz:OK (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848236 8otz:OL (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848237 8otz:PA (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848238 8otz:PA (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848239 8otz:PB (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848240 8otz:PC (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848241 8otz:PC (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848242 8otz:PD (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848243 8otz:PE (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848244 8otz:PE (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848245 8otz:PF (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848246 8otz:PG (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848247 8otz:PG (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848248 8otz:PH (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848249 8otz:PI (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848250 8otz:PJ (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848251 8otz:PK (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848252 8otz:PK (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848253 8otz:PL (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848254 8otz:PM (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848255 8otz:QA (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848256 8otz:QB (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848257 8otz:QC (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848258 8otz:QC (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848259 8otz:QD (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848260 8otz:QE (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848261 8otz:QF (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848262 8otz:QG (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848263 8otz:QG (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848264 8otz:QH (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848265 8otz:QI (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848266 8otz:QI (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848267 8otz:QJ (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848268 8otz:QK (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848269 8otz:QK (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848270 8otz:QL (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848271 8otz:QM (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848272 8otz:QM (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848273 8otz:RA (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848274 8otz:RA (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848275 8otz:RB (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848276 8otz:RC (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848277 8otz:RC (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848278 8otz:RD (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848279 8otz:RE (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848280 8otz:RE (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848281 8otz:RF (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848282 8otz:RG (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848283 8otz:RG (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848284 8otz:RH (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848285 8otz:RI (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848286 8otz:RJ (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848287 8otz:RK (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848288 8otz:RK (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848289 8otz:RL (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848290 8otz:RM (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848291 8otz:RM (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848292 8otz:SA (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848293 8otz:SB (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848294 8otz:SC (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848295 8otz:SD (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848296 8otz:SE (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848297 8otz:SE (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848298 8otz:SF (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848299 8otz:SG (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848300 8otz:SH (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848301 8otz:SI (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848302 8otz:SI (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848303 8otz:SJ (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848304 8otz:SK (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848305 8otz:SL (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848306 8otz:SM (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848307 8otz:TB (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848308 8otz:TC (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848309 8otz:TD (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848310 8otz:TD (3.6) BS02 GTP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848311 8otz:TE (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848312 8otz:TF (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848313 8otz:TF (3.6) BS02 GTP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848314 8otz:TG (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848315 8otz:TH (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848316 8otz:TI (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848317 8otz:TJ (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848318 8otz:TJ (3.6) BS02 GTP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848319 8otz:TK (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848320 8otz:TL (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848321 8otz:TL (3.6) BS02 GTP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848322 8otz:TM (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848323 8otz:UB (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848324 8otz:UC (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848325 8otz:UD (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848326 8otz:UE (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848327 8otz:UF (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848328 8otz:UG (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848329 8otz:UH (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848330 8otz:UI (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848331 8otz:UJ (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848332 8otz:UK (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848333 8otz:UL (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848334 8otz:UM (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848335 8otz:UN (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848336 8otz:VB (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848337 8otz:VC (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848338 8otz:VC (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848339 8otz:VD (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848340 8otz:VE (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848341 8otz:VE (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848342 8otz:VF (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848343 8otz:VG (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848344 8otz:VG (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848345 8otz:VH (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848346 8otz:VI (3.6) BS01 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848347 8otz:VI (3.6) BS02 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848348 8otz:VJ (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848349 8otz:VK (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848350 8otz:VK (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848351 8otz:VL (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848352 8otz:VM (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848353 8otz:VN (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848354 8otz:WB (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848355 8otz:WC (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848356 8otz:WC (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848357 8otz:WD (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848358 8otz:WE (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848359 8otz:WE (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848360 8otz:WF (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848361 8otz:WG (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848362 8otz:WG (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848363 8otz:WH (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848364 8otz:WI (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848365 8otz:WJ (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848366 8otz:WK (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848367 8otz:WL (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848368 8otz:WM (3.6) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848369 8otz:WM (3.6) BS02 MG 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848370 8otz:WN (3.6) BS01 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848371 8ou0:A (3.5) BS01 GTP 3.6.5.- GO:0000226 ... Q32KN8 37327785
    848372 8ou0:B (3.5) BS01 peptide ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848373 8ou0:B (3.5) BS02 GDP ? GO:0000226 ... Q3MHM5 37327785
    848374 8ou0:C (3.5) BS01 peptide ? GO:0001669 ... A0A3Q1MYU9 37327785
    848375 8ou2:A (1.6) BS01 W2W ? GO:0006357 ... Q12830 N/A
    848376 8ou2:B (1.6) BS01 W2W ? GO:0006357 ... Q12830 N/A
    848377 8ou2:B (1.6) BS02 W2W ? GO:0006357 ... Q12830 N/A
    848378 8ou3:A (1.47) BS01 ZN ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848379 8ou3:A (1.47) BS02 EF2 ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848380 8ou3:B (1.47) BS01 ZN ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848381 8ou3:B (1.47) BS02 W1T ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848382 8ou3:C (1.47) BS01 ZN ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848383 8ou3:C (1.47) BS02 EF2 ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848384 8ou4:A (2.25) BS01 ZN ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848385 8ou4:A (2.25) BS02 W2F ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848386 8ou4:B (2.25) BS01 ZN ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848387 8ou4:B (2.25) BS02 W2F ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848388 8ou4:C (2.25) BS01 ZN ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848389 8ou5:A (2.3) BS01 ZN ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848390 8ou5:A (2.3) BS02 W1X ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848391 8ou5:B (2.3) BS01 ZN ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848392 8ou5:B (2.3) BS02 W1X ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848393 8ou5:C (2.3) BS01 ZN ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848394 8ou6:A (1.84) BS01 ZN ? N/A A4TVL0 37902300
    848395 8ou6:A (1.84) BS02 W26 ? N/A A4TVL0 37902300
    848396 8ou6:B (1.84) BS01 ZN ? N/A A4TVL0 37902300
    848397 8ou6:B (1.84) BS02 W26 ? N/A A4TVL0 37902300
    848398 8ou6:C (1.84) BS01 ZN ? N/A A4TVL0 37902300
    848399 8ou7:A (1.7) BS01 ZN ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300
    848400 8ou7:A (1.7) BS02 W1F ? GO:0046872 ... A4TVL0 37902300

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).