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BioLiP
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    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    860201 8qfd:P (2.2) BS02 rna ? GO:0002181 ... P18621 38383789
    860202 8qfd:Q (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q07020 38383789
    860203 8qfd:R (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... P84098 38383789
    860204 8qfd:S (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q02543 38383789
    860205 8qfd:S (2.2) BS02 rna ? GO:0002181 ... Q02543 38383789
    860206 8qfd:T (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46778 38383789
    860207 8qfd:T (2.2) BS02 rna ? GO:0002181 ... P46778 38383789
    860208 8qfd:U (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... P35268 38383789
    860209 8qfd:V (2.2) BS01 rna ? GO:0000122 ... P62829 38383789
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    860211 8qfd:X (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62750 38383789
    860212 8qfd:X (2.2) BS02 rna ? GO:0002181 ... P62750 38383789
    860213 8qfd:Y (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61254 38383789
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    860215 8qfd:Z (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61353 38383789
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    860217 8qfd:b (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... P47914 38383789
    860218 8qfd:c (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62888 38383789
    860219 8qfd:d (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62899 38383789
    860220 8qfd:e (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62910 38383789
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    860222 8qfd:g (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... P49207 38383789
    860223 8qfd:g (2.2) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P49207 38383789
    860224 8qfd:h (2.2) BS01 rna ? GO:0000463 ... P42766 38383789
    860225 8qfd:h (2.2) BS02 rna ? GO:0000463 ... P42766 38383789
    860226 8qfd:i (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q9Y3U8 38383789
    860227 8qfd:j (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61927 38383789
    860228 8qfd:j (2.2) BS02 rna ? GO:0002181 ... P61927 38383789
    860229 8qfd:j (2.2) BS03 ZN ? GO:0002181 ... P61927 38383789
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    860232 8qfd:l (2.2) BS02 rna ? GO:0002181 ... P62891 38383789
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    860234 8qfd:m (2.2) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P62987 38383789
    860235 8qfd:o (2.2) BS01 rna ? GO:0002181 ... P83881 38383789
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    860237 8qfd:p (2.2) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P61513 38383789
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    860239 8qfe:A (1.5) BS01 FMN ? GO:0004016 ... K9TLZ5 38185322
    860240 8qfe:A (1.5) BS02 MG ? GO:0004016 ... K9TLZ5 38185322
    860241 8qff:A (2.1) BS01 FMN ? GO:0004016 ... K9TLZ5 38185322
    860242 8qff:A (2.1) BS02 ATP ? GO:0004016 ... K9TLZ5 38185322
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    860244 8qff:A (2.1) BS04 MG ? GO:0004016 ... K9TLZ5 38185322
    860245 8qfg:A (1.7) BS01 FMN ? GO:0004016 ... K9TLZ5 38185322
    860246 8qfg:A (1.7) BS02 ATP ? GO:0004016 ... K9TLZ5 38185322
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    860249 8qfh:A (1.8) BS01 FMN ? GO:0004016 ... K9TLZ5 38185322
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    860253 8qfi:A (1.9) BS01 FMN ? GO:0004016 ... K9TLZ5 38185322
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    860257 8qfj:A (1.9) BS01 FMN ? GO:0004016 ... K9TLZ5 38185322
    860258 8qfj:A (1.9) BS02 ATP ? GO:0004016 ... K9TLZ5 38185322
    860259 8qfj:A (1.9) BS03 MG ? GO:0004016 ... K9TLZ5 38185322
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    860262 8qfk:AAA (1.11) BS02 ZN N/A GO:0002009 ... P00918 N/A
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    860264 8qfl:B (1.75) BS01 FE ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
    860265 8qfm:A (1.9) BS01 PEO ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
    860266 8qfm:A (1.9) BS02 MN ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
    860267 8qfm:B (1.9) BS01 PEO ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
    860268 8qfm:B (1.9) BS02 MN ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
    860269 8qfm:B (1.9) BS03 MG ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
    860270 8qfn:A (1.75) BS01 MN ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
    860271 8qfn:B (1.75) BS01 MN ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
    860272 8qfo:A (2.05) BS01 MN ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
    860273 8qfo:B (2.05) BS01 MN ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
    860274 8qfo:B (2.05) BS02 MG ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
    860275 8qfp:A (2.2) BS01 MN ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
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    860277 8qfp:B (2.2) BS02 MN ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
    860278 8qfq:A (2.1) BS01 MN ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
    860279 8qfq:B (2.1) BS01 MN ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
    860280 8qfq:B (2.1) BS02 MG ? GO:0005506 ... A0A840P3H4 38095354
    860281 8qfr:A (2.2) BS01 LW8 N/A GO:0005506 ... A0A840P3H4 N/A
    860282 8qfr:B (2.2) BS01 CA N/A GO:0005506 ... A0A840P3H4 N/A
    860283 8qfs:A (2.7) BS01 rna ? N/A Q5ZRQ1 37923743
    860284 8qfs:C (2.7) BS01 rna ? GO:0003723 ... P0CE48 37923743
    860285 8qfs:C (2.7) BS02 MG ? GO:0003723 ... P0CE48 37923743
    860286 8qfs:C (2.7) BS03 GTP ? GO:0003723 ... P0CE48 37923743
    860287 8qfw:A (2.0) BS01 MG 3.1.3.16
    3.1.3.74
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    860288 8qfw:A (2.0) BS02 PO4 3.1.3.16
    3.1.3.74
    GO:0000287 ... P60487 38856179
    860289 8qfw:A (2.0) BS03 UK9 3.1.3.16
    3.1.3.74
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    860290 8qfw:B (2.0) BS01 MG 3.1.3.16
    3.1.3.74
    GO:0000287 ... P60487 38856179
    860291 8qfw:B (2.0) BS02 PO4 3.1.3.16
    3.1.3.74
    GO:0000287 ... P60487 38856179
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    860294 8qfx:A (1.6) BS03 ZN 3.4.15.1 GO:0006508 ... P12821 37904282
    860295 8qfx:A (1.6) BS04 MG 3.4.15.1 GO:0006508 ... P12821 37904282
    860296 8qfx:B (1.6) BS01 peptide 3.4.15.1 GO:0006508 ... P12821 37904282
    860297 8qfx:B (1.6) BS02 ZN 3.4.15.1 GO:0006508 ... P12821 37904282
    860298 8qfx:B (1.6) BS03 MG 3.4.15.1 GO:0006508 ... P12821 37904282
    860299 8qfx:C (1.6) BS01 peptide 3.4.15.1 GO:0006508 ... P12821 37904282
    860300 8qfx:C (1.6) BS02 FUC 3.4.15.1 GO:0006508 ... P12821 37904282
    860301 8qfx:C (1.6) BS03 ZN 3.4.15.1 GO:0006508 ... P12821 37904282
    860302 8qfx:C (1.6) BS04 MG 3.4.15.1 GO:0006508 ... P12821 37904282
    860303 8qfx:D (1.6) BS01 peptide 3.4.15.1 GO:0006508 ... P12821 37904282
    860304 8qfx:D (1.6) BS02 ZN 3.4.15.1 GO:0006508 ... P12821 37904282
    860305 8qfx:D (1.6) BS03 MG 3.4.15.1 GO:0006508 ... P12821 37904282
    860306 8qfy:AAA (2.33) BS01 peptide ? N/A P13747 38691588
    860307 8qfy:DDD (2.33) BS01 peptide N/A N/A N/A 38691588
    860308 8qfy:FFF (2.33) BS01 peptide ? N/A P13747 38691588
    860309 8qfy:III (2.33) BS01 peptide N/A N/A N/A 38691588
    860310 8qfy:JJJ (2.33) BS01 peptide N/A N/A N/A 38691588
    860311 8qfz:A (1.65) BS01 peptide ? GO:0001961 ... Q969D9 38284169
    860312 8qg0:A (3.43) BS01 dna ? GO:0003676 ... O28951 38197228
    860313 8qg0:A (3.43) BS02 rna ? GO:0003676 ... O28951 38197228
    860314 8qg0:B (3.43) BS01 dna ? N/A A0A075WKW4 38197228
    860315 8qg0:B (3.43) BS02 rna ? N/A A0A075WKW4 38197228
    860316 8qg1:A (2.0) BS01 FES 7.1.1.- GO:0003954 ... O66842 38503292
    860317 8qg1:B (2.0) BS01 SF4 7.1.1.- GO:0008137 ... O66841 38503292
    860318 8qg1:B (2.0) BS02 FMN 7.1.1.- GO:0008137 ... O66841 38503292
    860319 8qg1:B (2.0) BS03 APR 7.1.1.- GO:0008137 ... O66841 38503292
    860320 8qg1:C (2.0) BS01 FES 7.1.1.- GO:0003954 ... O66842 38503292
    860321 8qg1:D (2.0) BS01 SF4 7.1.1.- GO:0008137 ... O66841 38503292
    860322 8qg1:D (2.0) BS02 FMN 7.1.1.- GO:0008137 ... O66841 38503292
    860323 8qg1:D (2.0) BS03 APR 7.1.1.- GO:0008137 ... O66841 38503292
    860324 8qgf:A (1.32) BS01 CU N/A GO:0005507 ... I6NAW4 N/A
    860325 8qgf:A (1.32) BS02 CU N/A GO:0005507 ... I6NAW4 N/A
    860326 8qgf:A (1.32) BS03 HEC N/A GO:0005507 ... I6NAW4 N/A
    860327 8qgr:B (2.2) BS01 ZN N/A GO:0046872 ... A1YTN7 N/A
    860328 8qgt:A (2.8) BS01 rna 2.7.7.48
    3.1.-.-
    GO:0000166 ... P23456 38480734
    860329 8qgv:AAA (1.84) BS01 ZN N/A GO:0004064 ... P00915 N/A
    860330 8qgv:AAA (1.84) BS02 V2I N/A GO:0004064 ... P00915 N/A
    860331 8qgv:BBB (1.84) BS01 ZN N/A GO:0004064 ... P00915 N/A
    860332 8qgv:BBB (1.84) BS02 V2I N/A GO:0004064 ... P00915 N/A
    860333 8qgw:A (1.6) BS01 FES 7.1.1.- GO:0003954 ... O66842 38503292
    860334 8qgw:B (1.6) BS01 SF4 7.1.1.- GO:0008137 ... O66841 38503292
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    860336 8qgw:B (1.6) BS03 A3D 7.1.1.- GO:0008137 ... O66841 38503292
    860337 8qgw:C (1.6) BS01 FES 7.1.1.- GO:0003954 ... O66842 38503292
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    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).