SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 4299 4300 4301 4302 4303 4304 4305 4306 4307 4308 4309 4310 4311 4312 4313 4314 4315 4316 4317 4318 4319 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    861601 8qoa:v (2.0) BS03 rna ? GO:0000027 ... P0A7L8 38503753
    861602 8qoa:w (2.0) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M2 38503753
    861603 8qoa:x (2.0) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7M6 38503753
    861604 8qoa:y (2.0) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 38503753
    861605 8qoa:y (2.0) BS02 rna ? GO:0000027 ... P0AG51 38503753
    861606 8qoa:z (2.0) BS01 rna ? GO:0000027 ... P0A7N4 38503753
    861607 8qob:A (2.74) BS01 WHT N/A N/A Q8YI30 N/A
    861608 8qob:A (2.74) BS02 MG N/A N/A Q8YI30 N/A
    861609 8qoc:G (2.83) BS01 MG N/A GO:0006520 ... Q2G0Q1 38782204
    861610 8qod:A (1.573) BS01 CA N/A N/A P08709 N/A
    861611 8qod:A (1.573) BS02 MG N/A N/A P08709 N/A
    861612 8qod:A (1.573) BS03 GLC N/A N/A P08709 N/A
    861613 8qod:A (1.573) BS04 FUC N/A N/A P08709 N/A
    861614 8qod:A (1.573) BS05 CA N/A N/A P08709 N/A
    861615 8qod:A (1.573) BS06 CA N/A N/A P08709 N/A
    861616 8qod:B (1.573) BS01 WIZ N/A N/A P08709 N/A
    861617 8qod:B (1.573) BS02 CA N/A N/A P08709 N/A
    861618 8qof:A (3.3) BS01 WAR N/A GO:0005789 ... N/A 39167489
    861619 8qof:B (3.3) BS01 PLP N/A GO:0004758 ... P25045 39167489
    861620 8qof:C (3.3) BS01 WAR N/A GO:0004758 ... P40970 39167489
    861621 8qof:C (3.3) BS02 PLP N/A GO:0004758 ... P40970 39167489
    861622 8qof:E (3.3) BS01 WAR N/A GO:0005789 ... N/A 39167489
    861623 8qof:E (3.3) BS02 Q7G N/A GO:0005789 ... N/A 39167489
    861624 8qof:F (3.3) BS01 PLP N/A GO:0004758 ... P25045 39167489
    861625 8qof:G (3.3) BS01 WAR N/A GO:0004758 ... P40970 39167489
    861626 8qof:G (3.3) BS02 PLP N/A GO:0004758 ... P40970 39167489
    861627 8qof:G (3.3) BS03 Q7G N/A GO:0004758 ... P40970 39167489
    861628 8qog:A (3.1) BS01 WAR N/A GO:0005789 ... N/A 39167489
    861629 8qog:A (3.1) BS02 Q7G N/A GO:0005789 ... N/A 39167489
    861630 8qog:B (3.1) BS01 PLP N/A GO:0004758 ... P25045 39167489
    861631 8qog:C (3.1) BS01 WAR N/A GO:0004758 ... P40970 39167489
    861632 8qog:C (3.1) BS02 PLP N/A GO:0004758 ... P40970 39167489
    861633 8qog:C (3.1) BS03 Q7G N/A GO:0004758 ... P40970 39167489
    861634 8qoi:LA (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62917 38844527
    861635 8qoi:LA (1.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P62917 38844527
    861636 8qoi:LB (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P39023 38844527
    861637 8qoi:LC (1.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... P36578 38844527
    861638 8qoi:LC (1.9) BS02 rna ? GO:0003735 ... P36578 38844527
    861639 8qoi:LD (1.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P46777 38844527
    861640 8qoi:LD (1.9) BS02 rna ? GO:0000027 ... P46777 38844527
    861641 8qoi:LE (1.9) BS01 rna ? GO:0003735 ... Q02878 38844527
    861642 8qoi:LF (1.9) BS01 rna ? GO:0000463 ... P18124 38844527
    861643 8qoi:LF (1.9) BS02 rna ? GO:0000463 ... P18124 38844527
    861644 8qoi:LG (1.9) BS01 rna ? GO:0000470 ... P62424 38844527
    861645 8qoi:LG (1.9) BS02 rna ? GO:0000470 ... P62424 38844527
    861646 8qoi:LH (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P32969 38844527
    861647 8qoi:LI (1.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... Q96L21 38844527
    861648 8qoi:LI (1.9) BS02 rna ? GO:0000027 ... Q96L21 38844527
    861649 8qoi:LJ (1.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P62913 38844527
    861650 8qoi:LJ (1.9) BS02 rna ? GO:0000027 ... P62913 38844527
    861651 8qoi:LL (1.9) BS01 rna ? GO:0001824 ... P26373 38844527
    861652 8qoi:LL (1.9) BS02 rna ? GO:0001824 ... P26373 38844527
    861653 8qoi:LM (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P50914 38844527
    861654 8qoi:LN (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61313 38844527
    861655 8qoi:LN (1.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P61313 38844527
    861656 8qoi:LN (1.9) BS03 MG ? GO:0002181 ... P61313 38844527
    861657 8qoi:LO (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P40429 38844527
    861658 8qoi:LP (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P18621 38844527
    861659 8qoi:LP (1.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P18621 38844527
    861660 8qoi:LQ (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q07020 38844527
    861661 8qoi:LR (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P84098 38844527
    861662 8qoi:LR (1.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P84098 38844527
    861663 8qoi:LS (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q02543 38844527
    861664 8qoi:LS (1.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... Q02543 38844527
    861665 8qoi:LT (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46778 38844527
    861666 8qoi:LT (1.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P46778 38844527
    861667 8qoi:LU (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P35268 38844527
    861668 8qoi:LV (1.9) BS01 rna ? GO:0000122 ... P62829 38844527
    861669 8qoi:LW (1.9) BS01 rna ? GO:0000027 ... P83731 38844527
    861670 8qoi:LW (1.9) BS02 rna ? GO:0000027 ... P83731 38844527
    861671 8qoi:LX (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62750 38844527
    861672 8qoi:LX (1.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P62750 38844527
    861673 8qoi:LY (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61254 38844527
    861674 8qoi:LY (1.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P61254 38844527
    861675 8qoi:LZ (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61353 38844527
    861676 8qoi:La (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46776 38844527
    861677 8qoi:Lb (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P47914 38844527
    861678 8qoi:Lc (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62888 38844527
    861679 8qoi:Ld (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62899 38844527
    861680 8qoi:Le (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62910 38844527
    861681 8qoi:Lf (1.9) BS01 rna ? GO:0000049 ... P18077 38844527
    861682 8qoi:Lg (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P49207 38844527
    861683 8qoi:Lg (1.9) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P49207 38844527
    861684 8qoi:Lh (1.9) BS01 rna ? GO:0000463 ... P42766 38844527
    861685 8qoi:Lh (1.9) BS02 rna ? GO:0000463 ... P42766 38844527
    861686 8qoi:Li (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q9Y3U8 38844527
    861687 8qoi:Lj (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61927 38844527
    861688 8qoi:Lj (1.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P61927 38844527
    861689 8qoi:Lj (1.9) BS03 ZN ? GO:0002181 ... P61927 38844527
    861690 8qoi:Lk (1.9) BS01 rna ? GO:0001501 ... P63173 38844527
    861691 8qoi:Ll (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62891 38844527
    861692 8qoi:Ll (1.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P62891 38844527
    861693 8qoi:Lm (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62987 38844527
    861694 8qoi:Lm (1.9) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P62987 38844527
    861695 8qoi:Lo (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P83881 38844527
    861696 8qoi:Lo (1.9) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P83881 38844527
    861697 8qoi:Lp (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61513 38844527
    861698 8qoi:Lp (1.9) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P61513 38844527
    861699 8qoi:Lr (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46779 38844527
    861700 8qoi:SA (1.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P08865 38844527
    861701 8qoi:SB (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P61247 38844527
    861702 8qoi:SC (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P15880 38844527
    861703 8qoi:SD (1.9) BS01 rna 4.2.99.18 GO:0000977 ... P23396 38844527
    861704 8qoi:SE (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62701 38844527
    861705 8qoi:SF (1.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P46782 38844527
    861706 8qoi:SG (1.9) BS01 rna ? GO:0000082 ... P62753 38844527
    861707 8qoi:SH (1.9) BS01 rna ? GO:0001843 ... P62081 38844527
    861708 8qoi:SI (1.9) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62241 38844527
    861709 8qoi:SI (1.9) BS02 rna ? GO:0000462 ... P62241 38844527
    861710 8qoi:SJ (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46781 38844527
    861711 8qoi:SK (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P46783 38844527
    861712 8qoi:SL (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62280 38844527
    861713 8qoi:SM (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P25398 38844527
    861714 8qoi:SN (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62277 38844527
    861715 8qoi:SN (1.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... P62277 38844527
    861716 8qoi:SO (1.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62263 38844527
    861717 8qoi:SP (1.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62841 38844527
    861718 8qoi:SQ (1.9) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62249 38844527
    861719 8qoi:SR (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P08708 38844527
    861720 8qoi:SS (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62269 38844527
    861721 8qoi:ST (1.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P39019 38844527
    861722 8qoi:SU (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P60866 38844527
    861723 8qoi:SW (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62244 38844527
    861724 8qoi:SX (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62266 38844527
    861725 8qoi:SY (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62847 38844527
    861726 8qoi:SZ (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62851 38844527
    861727 8qoi:Sa (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62854 38844527
    861728 8qoi:Sa (1.9) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P62854 38844527
    861729 8qoi:Sb (1.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P42677 38844527
    861730 8qoi:Sc (1.9) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62857 38844527
    861731 8qoi:Sd (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62273 38844527
    861732 8qoi:Sd (1.9) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P62273 38844527
    861733 8qoi:Se (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62861 38844527
    861734 8qoi:Sf (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62979 38844527
    861735 8qoi:Sf (1.9) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P62979 38844527
    861736 8qoi:Sg (1.9) BS01 rna ? GO:0001891 ... P63244 38844527
    861737 8qoj:A (2.13) BS01 YMZ N/A GO:0005243 ... Q9UKL4 38890333
    861738 8qoj:B (2.13) BS01 YMZ N/A GO:0005243 ... Q9UKL4 38890333
    861739 8qoj:C (2.13) BS01 YMZ N/A GO:0005243 ... Q9UKL4 38890333
    861740 8qoj:D (2.13) BS01 YMZ N/A GO:0005243 ... Q9UKL4 38890333
    861741 8qoj:E (2.13) BS01 YMZ N/A GO:0005243 ... Q9UKL4 38890333
    861742 8qoj:F (2.13) BS01 YMZ N/A GO:0005243 ... Q9UKL4 38890333
    861743 8qoj:G (2.13) BS01 YMZ N/A GO:0005243 ... Q9UKL4 38890333
    861744 8qoj:H (2.13) BS01 YMZ N/A GO:0005243 ... Q9UKL4 38890333
    861745 8qoj:I (2.13) BS01 YMZ N/A GO:0005243 ... Q9UKL4 38890333
    861746 8qoj:J (2.13) BS01 YMZ N/A GO:0005243 ... Q9UKL4 38890333
    861747 8qoj:K (2.13) BS01 YMZ N/A GO:0005243 ... Q9UKL4 38890333
    861748 8qoj:L (2.13) BS01 YMZ N/A GO:0005243 ... Q9UKL4 38890333
    861749 8qoo:A (1.55) BS01 peptide N/A N/A Q8IXJ6 N/A
    861750 8qoo:A (1.55) BS02 ZN N/A N/A Q8IXJ6 N/A
    861751 8qoo:A (1.55) BS03 WH8 N/A N/A Q8IXJ6 N/A
    861752 8qoo:A (1.55) BS04 WGN N/A N/A Q8IXJ6 N/A
    861753 8qow:A (2.35) BS01 ZN 3.3.2.6
    3.4.11.4
    GO:0003723 ... P09960 38015154
    861754 8qow:A (2.35) BS02 WID 3.3.2.6
    3.4.11.4
    GO:0003723 ... P09960 38015154
    861755 8qoy:A (3.0) BS01 ZN N/A GO:0005886 ... A0A2S0ETM3 38951648
    861756 8qoz:7 (3.1) BS01 rna ? GO:0000389 ... Q15459 38778104
    861757 8qoz:7 (3.1) BS02 rna ? GO:0000389 ... Q15459 38778104
    861758 8qoz:A (3.1) BS01 peptide ? GO:0000244 ... Q6P2Q9 38778104
    861759 8qoz:A (3.1) BS02 rna ? GO:0000244 ... Q6P2Q9 38778104
    861760 8qoz:A (3.1) BS03 rna ? GO:0000244 ... Q6P2Q9 38778104
    861761 8qoz:A (3.1) BS04 rna ? GO:0000244 ... Q6P2Q9 38778104
    861762 8qoz:A (3.1) BS05 rna ? GO:0000244 ... Q6P2Q9 38778104
    861763 8qoz:A (3.1) BS06 IHP ? GO:0000244 ... Q6P2Q9 38778104
    861764 8qoz:D (3.1) BS01 rna ? GO:0000245 ... P83876 38778104
    861765 8qoz:D (3.1) BS02 rna ? GO:0000245 ... P83876 38778104
    861766 8qoz:J (3.1) BS01 rna ? GO:0000244 ... O43395 38778104
    861767 8qoz:J (3.1) BS02 rna ? GO:0000244 ... O43395 38778104
    861768 8qoz:L (3.1) BS01 rna ? GO:0000244 ... Q8WWY3 38778104
    861769 8qoz:L (3.1) BS02 rna ? GO:0000244 ... Q8WWY3 38778104
    861770 8qoz:M (3.1) BS01 rna ? GO:0000398 ... P55769 38778104
    861771 8qoz:M (3.1) BS02 rna ? GO:0000398 ... P55769 38778104
    861772 8qoz:N (3.1) BS01 rna ? GO:0000244 ... O94906 38778104
    861773 8qoz:N (3.1) BS02 rna ? GO:0000244 ... O94906 38778104
    861774 8qoz:N (3.1) BS03 rna ? GO:0000244 ... O94906 38778104
    861775 8qp6:A (2.59) BS01 peptide N/A N/A N/A N/A
    861776 8qp6:B (2.59) BS01 peptide N/A N/A N/A N/A
    861777 8qp6:E (2.59) BS01 peptide N/A N/A N/A N/A
    861778 8qp6:F (2.59) BS01 peptide N/A N/A N/A N/A
    861779 8qp6:H (2.59) BS01 peptide N/A N/A N/A N/A
    861780 8qp6:I (2.59) BS01 peptide N/A N/A N/A N/A
    861781 8qp8:A (3.5) BS01 peptide ? GO:0000244 ... Q6P2Q9 38778104
    861782 8qp8:A (3.5) BS02 rna ? GO:0000244 ... Q6P2Q9 38778104
    861783 8qp8:A (3.5) BS03 peptide ? GO:0000244 ... Q6P2Q9 38778104
    861784 8qp8:A (3.5) BS04 IHP ? GO:0000244 ... Q6P2Q9 38778104
    861785 8qp8:C (3.5) BS01 rna ? GO:0000398 ... Q15029 38778104
    861786 8qp8:D (3.5) BS01 peptide ? GO:0000245 ... P83876 38778104
    861787 8qp8:D (3.5) BS02 rna ? GO:0000245 ... P83876 38778104
    861788 8qp8:G (3.5) BS01 rna 3.6.4.13 GO:0000354 ... Q9BUQ8 38778104
    861789 8qp8:J (3.5) BS01 rna ? GO:0000244 ... O43395 38778104
    861790 8qp8:L (3.5) BS01 rna ? GO:0000244 ... Q8WWY3 38778104
    861791 8qp8:L (3.5) BS02 rna ? GO:0000244 ... Q8WWY3 38778104
    861792 8qp8:N (3.5) BS01 rna ? GO:0000244 ... O94906 38778104
    861793 8qp8:R (3.5) BS01 rna ? GO:0000398 ... Q9BTD8 38778104
    861794 8qp8:R (3.5) BS02 rna ? GO:0000398 ... Q9BTD8 38778104
    861795 8qp8:S (3.5) BS01 rna ? GO:0000387 ... O43290 38778104
    861796 8qp8:S (3.5) BS02 peptide ? GO:0000387 ... O43290 38778104
    861797 8qp9:A (4.1) BS01 peptide ? GO:0000244 ... Q6P2Q9 38778104
    861798 8qp9:A (4.1) BS02 rna ? GO:0000244 ... Q6P2Q9 38778104
    861799 8qp9:J (4.1) BS01 rna ? GO:0000244 ... O43395 38778104
    861800 8qp9:L (4.1) BS01 rna ? GO:0000244 ... Q8WWY3 38778104

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).