SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 4304 4305 4306 4307 4308 4309 4310 4311 4312 4313 4314 4315 4316 4317 4318 4319 4320 4321 4322 4323 4324 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    862601 8qtf:G (1.9) BS01 peptide ? GO:0000325 ... Q01525 38783418
    862602 8qtf:H (1.9) BS01 peptide ? GO:0000325 ... Q01525 38783418
    862603 8qtf:I (1.9) BS01 peptide ? GO:0000325 ... Q01525 38783418
    862604 8qtf:J (1.9) BS01 peptide ? GO:0000325 ... Q01525 38783418
    862605 8qtg:A (1.419) BS01 WUQ 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
    862606 8qtg:A (1.419) BS02 ZN 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
    862607 8qtg:A (1.419) BS03 ZN 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
    862608 8qth:A (2.198) BS01 WX0 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
    862609 8qth:A (2.198) BS02 ZN 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
    862610 8qth:A (2.198) BS03 ZN 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
    862611 8qti:C (3.09) BS01 dna N/A GO:0000428 ... P60281 39384756
    862612 8qti:C (3.09) BS02 dna N/A GO:0000428 ... P60281 39384756
    862613 8qti:D (3.09) BS01 dna N/A GO:0000287 ... A0QS66 39384756
    862614 8qti:D (3.09) BS02 dna N/A GO:0000287 ... A0QS66 39384756
    862615 8qti:D (3.09) BS03 ZN N/A GO:0000287 ... A0QS66 39384756
    862616 8qti:D (3.09) BS04 ZN N/A GO:0000287 ... A0QS66 39384756
    862617 8qti:D (3.09) BS05 MG N/A GO:0000287 ... A0QS66 39384756
    862618 8qti:F (3.09) BS01 dna N/A GO:0003677 ... A0QW02 39384756
    862619 8qti:F (3.09) BS02 dna N/A GO:0003677 ... A0QW02 39384756
    862620 8qtj:A (1.523) BS01 ZN 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
    862621 8qtj:A (1.523) BS02 ZN 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
    862622 8qtj:A (1.523) BS03 WUI 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
    862623 8qtk:A (1.873) BS01 ZN 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
    862624 8qtk:A (1.873) BS02 ZN 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
    862625 8qtk:A (1.873) BS03 WX9 2.3.2.27 GO:0001784 ... Q13191 38227216
    862626 8qtl:A (1.85) BS01 WSP ? GO:0004888 ... Q8WSF8 38667766
    862627 8qtl:B (1.85) BS01 WSP ? GO:0004888 ... Q8WSF8 38667766
    862628 8qtl:C (1.85) BS01 WSP ? GO:0004888 ... Q8WSF8 38667766
    862629 8qtl:D (1.85) BS01 WSP ? GO:0004888 ... Q8WSF8 38667766
    862630 8qtl:E (1.85) BS01 WSP ? GO:0004888 ... Q8WSF8 38667766
    862631 8qtn:A (3.0) BS01 7PO N/A N/A P38703 39528796
    862632 8qtn:A (3.0) BS02 PIJ N/A N/A P38703 39528796
    862633 8qtn:B (3.0) BS01 7PO N/A N/A P28496 39528796
    862634 8qtn:B (3.0) BS02 PIJ N/A N/A P28496 39528796
    862635 8qtn:C (3.0) BS01 PIJ N/A N/A Q03579 39528796
    862636 8qtn:D (3.0) BS01 PIJ N/A N/A Q03579 39528796
    862637 8qto:A (2.4) BS01 SF4 ? GO:0003677 ... Q70ET4 N/A
    862638 8qtr:A (3.2) BS01 WXE N/A N/A P38703 39528796
    862639 8qtr:A (3.2) BS02 7PO N/A N/A P38703 39528796
    862640 8qtr:B (3.2) BS01 WXE N/A N/A P28496 39528796
    862641 8qtr:B (3.2) BS02 7PO N/A N/A P28496 39528796
    862642 8qtr:B (3.2) BS03 PIJ N/A N/A P28496 39528796
    862643 8qtr:C (3.2) BS01 PIJ N/A N/A Q03579 39528796
    862644 8qtr:D (3.2) BS01 PIJ N/A N/A Q03579 39528796
    862645 8qtt:A (2.35) BS01 peptide ? GO:0000325 ... Q01525 38783418
    862646 8qtt:B (2.35) BS01 peptide ? GO:0000325 ... Q01525 38783418
    862647 8qtt:C (2.35) BS01 peptide ? GO:0000325 ... Q01525 38783418
    862648 8qtt:D (2.35) BS01 peptide ? GO:0000325 ... Q01525 38783418
    862649 8qtt:E (2.35) BS01 peptide ? GO:0000325 ... Q01525 38783418
    862650 8qtt:F (2.35) BS01 peptide ? GO:0000325 ... Q01525 38783418
    862651 8qtt:G (2.35) BS01 peptide ? GO:0000325 ... Q01525 38783418
    862652 8qtt:H (2.35) BS01 peptide ? GO:0000325 ... Q01525 38783418
    862653 8qtt:I (2.35) BS01 peptide ? GO:0000325 ... Q01525 38783418
    862654 8qtt:J (2.35) BS01 peptide ? GO:0000325 ... Q01525 38783418
    862655 8qtu:A (1.8) BS01 peptide N/A N/A Q8IXJ6 N/A
    862656 8qtu:A (1.8) BS02 ZN N/A N/A Q8IXJ6 N/A
    862657 8qtu:A (1.8) BS03 NAD N/A N/A Q8IXJ6 N/A
    862658 8qtu:A (1.8) BS04 WWE N/A N/A Q8IXJ6 N/A
    862659 8qtw:A (2.24) BS01 FUC N/A GO:0001540 ... P06276 N/A
    862660 8qtw:A (2.24) BS02 FUC N/A GO:0001540 ... P06276 N/A
    862661 8qtw:A (2.24) BS03 GOA N/A GO:0001540 ... P06276 N/A
    862662 8qtw:A (2.24) BS04 SIA N/A GO:0001540 ... P06276 N/A
    862663 8qtw:A (2.24) BS05 WXR N/A GO:0001540 ... P06276 N/A
    862664 8qtx:A (2.12) BS01 FUC N/A GO:0001540 ... P06276 N/A
    862665 8qtx:A (2.12) BS02 FUC N/A GO:0001540 ... P06276 N/A
    862666 8qtx:A (2.12) BS03 WXN N/A GO:0001540 ... P06276 N/A
    862667 8qtx:A (2.12) BS04 CO3 N/A GO:0001540 ... P06276 N/A
    862668 8qu1:0 (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9BYC8 38969660
    862669 8qu1:1 (2.74) BS01 rna N/A GO:0003735 ... O75394 38969660
    862670 8qu1:2 (2.74) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q9BQ48 38969660
    862671 8qu1:3 (2.74) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q9NZE8 38969660
    862672 8qu1:5 (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9BZE1 38969660
    862673 8qu1:6 (2.74) BS01 rna N/A GO:0005515 ... Q96DV4 38969660
    862674 8qu1:6 (2.74) BS02 rna N/A GO:0005515 ... Q96DV4 38969660
    862675 8qu1:D (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q5T653 38969660
    862676 8qu1:E (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... P09001 38969660
    862677 8qu1:F (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9BYD3 38969660
    862678 8qu1:H (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9BYD2 38969660
    862679 8qu1:I (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q7Z7H8 38969660
    862680 8qu1:J (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9Y3B7 38969660
    862681 8qu1:K (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9BYD1 38969660
    862682 8qu1:L (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q6P1L8 38969660
    862683 8qu1:M (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9P015 38969660
    862684 8qu1:N (2.74) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q9NX20 38969660
    862685 8qu1:O (2.74) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q9NRX2 38969660
    862686 8qu1:P (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9H0U6 38969660
    862687 8qu1:P (2.74) BS02 rna N/A GO:0003723 ... Q9H0U6 38969660
    862688 8qu1:Q (2.74) BS01 rna N/A GO:0003735 ... P49406 38969660
    862689 8qu1:R (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9BYC9 38969660
    862690 8qu1:S (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q7Z2W9 38969660
    862691 8qu1:T (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9NWU5 38969660
    862692 8qu1:U (2.74) BS01 rna N/A GO:0001650 ... Q16540 38969660
    862693 8qu1:V (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q96A35 38969660
    862694 8qu1:W (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9P0M9 38969660
    862695 8qu1:X (2.74) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q13084 38969660
    862696 8qu1:Y (2.74) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q9HD33 38969660
    862697 8qu1:Z (2.74) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q8TCC3 38969660
    862698 8qu2:B (1.45) BS01 peptide ? GO:0001228 ... P25208 38470946
    862699 8qu2:C (1.45) BS01 peptide ? GO:0003677 ... Q13952 38470946
    862700 8qu3:B (1.41) BS01 peptide ? GO:0001228 ... P25208 38470946
    862701 8qu3:C (1.41) BS01 peptide ? GO:0003677 ... Q13952 38470946
    862702 8qu4:B (1.38) BS01 peptide ? GO:0001228 ... P25208 38470946
    862703 8qu4:C (1.38) BS01 peptide ? GO:0003677 ... Q13952 38470946
    862704 8qu5:0 (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9BYC8 38969660
    862705 8qu5:0 (2.42) BS02 ZN N/A GO:0003723 ... Q9BYC8 38969660
    862706 8qu5:1 (2.42) BS01 rna N/A GO:0003735 ... O75394 38969660
    862707 8qu5:2 (2.42) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q9BQ48 38969660
    862708 8qu5:3 (2.42) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q9NZE8 38969660
    862709 8qu5:5 (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9BZE1 38969660
    862710 8qu5:6 (2.42) BS01 rna N/A GO:0005515 ... Q96DV4 38969660
    862711 8qu5:6 (2.42) BS02 rna N/A GO:0005515 ... Q96DV4 38969660
    862712 8qu5:8 (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9NQ50 38969660
    862713 8qu5:9 (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q8IXM3 38969660
    862714 8qu5:D (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q5T653 38969660
    862715 8qu5:E (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... P09001 38969660
    862716 8qu5:F (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9BYD3 38969660
    862717 8qu5:H (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9BYD2 38969660
    862718 8qu5:I (2.42) BS01 peptide N/A GO:0003723 ... Q7Z7H8 38969660
    862719 8qu5:I (2.42) BS02 rna N/A GO:0003723 ... Q7Z7H8 38969660
    862720 8qu5:J (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9Y3B7 38969660
    862721 8qu5:K (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9BYD1 38969660
    862722 8qu5:L (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q6P1L8 38969660
    862723 8qu5:M (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9P015 38969660
    862724 8qu5:N (2.42) BS01 peptide N/A GO:0003735 ... Q9NX20 38969660
    862725 8qu5:N (2.42) BS02 rna N/A GO:0003735 ... Q9NX20 38969660
    862726 8qu5:O (2.42) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q9NRX2 38969660
    862727 8qu5:P (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9H0U6 38969660
    862728 8qu5:P (2.42) BS02 rna N/A GO:0003723 ... Q9H0U6 38969660
    862729 8qu5:Q (2.42) BS01 rna N/A GO:0003735 ... P49406 38969660
    862730 8qu5:R (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9BYC9 38969660
    862731 8qu5:S (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q7Z2W9 38969660
    862732 8qu5:T (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9NWU5 38969660
    862733 8qu5:U (2.42) BS01 rna N/A GO:0001650 ... Q16540 38969660
    862734 8qu5:V (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q96A35 38969660
    862735 8qu5:W (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9P0M9 38969660
    862736 8qu5:X (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q13084 38969660
    862737 8qu5:Y (2.42) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q9HD33 38969660
    862738 8qu5:Z (2.42) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q8TCC3 38969660
    862739 8qu5:a (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9Y6G3 38969660
    862740 8qu5:b (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q8N983 38969660
    862741 8qu5:c (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9H9J2 38969660
    862742 8qu5:d (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9BRJ2 38969660
    862743 8qu5:f (2.42) BS01 rna N/A GO:0005515 ... Q96GC5 38969660
    862744 8qu5:f (2.42) BS02 rna N/A GO:0005515 ... Q96GC5 38969660
    862745 8qu5:g (2.42) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q13405 38969660
    862746 8qu5:i (2.42) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q4U2R6 38969660
    862747 8qu5:j (2.42) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q86TS9 38969660
    862748 8qu5:o (2.42) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q9BQC6 38969660
    862749 8qu5:r (2.42) BS01 rna N/A GO:0003735 ... Q9NVS2 38969660
    862750 8qu5:s (2.42) BS01 rna N/A GO:0003723 ... Q9NP92 38969660
    862751 8qu5:u (2.42) BS01 rna N/A GO:0005515 ... Q96EH3 38969660
    862752 8qu5:v (2.42) BS01 PNS N/A GO:0000266 ... L0R8F8 38969660
    862753 8qu5:w (2.42) BS01 PNS N/A GO:0000035 ... O14561 38969660
    862754 8qu6:D (3.45) BS01 dna N/A GO:0000287 ... A0QS66 39384756
    862755 8qu6:D (3.45) BS02 ZN N/A GO:0000287 ... A0QS66 39384756
    862756 8qu6:D (3.45) BS03 ZN N/A GO:0000287 ... A0QS66 39384756
    862757 8qu6:D (3.45) BS04 MG N/A GO:0000287 ... A0QS66 39384756
    862758 8qu6:F (3.45) BS01 dna N/A GO:0003677 ... A0QW02 39384756
    862759 8qu6:F (3.45) BS02 dna N/A GO:0003677 ... A0QW02 39384756
    862760 8qu8:A (3.5) BS01 WYL ? GO:0000122 ... P40337 39298590
    862761 8qu8:E (3.5) BS01 ZN 2.3.2.27
    2.3.2.32
    GO:0000165 ... P62877 39298590
    862762 8qu8:E (3.5) BS02 ZN 2.3.2.27
    2.3.2.32
    GO:0000165 ... P62877 39298590
    862763 8qu8:F (3.5) BS01 GDP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 39298590
    862764 8qu8:F (3.5) BS02 WYL 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 39298590
    862765 8qu9:A (2.88) BS01 peptide 1.16.3.1 N/A N/A 38714719
    862766 8qu9:A (2.88) BS02 FE 1.16.3.1 N/A N/A 38714719
    862767 8qu9:A (2.88) BS03 FE 1.16.3.1 N/A N/A 38714719
    862768 8qub:A (1.63) BS01 WVZ ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    862769 8quc:A (2.9) BS01 WY9 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862770 8quc:A (2.9) BS02 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862771 8quc:A (2.9) BS03 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862772 8quc:A (2.9) BS04 WY9 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862773 8quc:B (2.9) BS01 WY9 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862774 8quc:B (2.9) BS02 WY9 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862775 8quc:B (2.9) BS03 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862776 8quc:B (2.9) BS04 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862777 8quc:C (2.9) BS01 WY9 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862778 8quc:C (2.9) BS02 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862779 8quc:C (2.9) BS03 WY9 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862780 8quc:C (2.9) BS04 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862781 8quc:D (2.9) BS01 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862782 8quc:D (2.9) BS02 WY9 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862783 8quc:D (2.9) BS03 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862784 8quc:D (2.9) BS04 WY9 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862785 8qud:A (2.5) BS01 WY0 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862786 8qud:A (2.5) BS02 ZN ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862787 8qud:A (2.5) BS03 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862788 8qud:B (2.5) BS01 WY0 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862789 8qud:B (2.5) BS02 WY0 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862790 8qud:B (2.5) BS03 ZN ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862791 8qud:B (2.5) BS04 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862792 8qud:C (2.5) BS01 WY0 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862793 8qud:C (2.5) BS02 WY0 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862794 8qud:C (2.5) BS03 ZN ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862795 8qud:C (2.5) BS04 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862796 8qud:D (2.5) BS01 WY0 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862797 8qud:D (2.5) BS02 ZN ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862798 8qud:D (2.5) BS03 Y01 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862799 8qud:D (2.5) BS04 WY0 ? GO:0001508 ... P48547 38514618
    862800 8que:A (3.3) BS01 dna N/A GO:0003677 ... L7T138
    Q8SDA7
    39029888

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).