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BioLiP
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    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    862801 8que:A (3.3) BS02 rna N/A GO:0003677 ... L7T138
    Q8SDA7
    39029888
    862802 8que:A (3.3) BS03 ZN N/A GO:0003677 ... L7T138
    Q8SDA7
    39029888
    862803 8que:C (3.3) BS01 dna N/A GO:0000428 ... Q8SD89
    Q8SD91
    39029888
    862804 8que:C (3.3) BS02 rna N/A GO:0000428 ... Q8SD89
    Q8SD91
    39029888
    862805 8que:D (3.3) BS01 dna N/A N/A Q8SD88 39029888
    862806 8que:D (3.3) BS02 dna N/A N/A Q8SD88 39029888
    862807 8que:D (3.3) BS03 ZN N/A N/A Q8SD88 39029888
    862808 8que:E (3.3) BS01 dna N/A N/A Q8SD39 39029888
    862809 8que:E (3.3) BS02 dna N/A N/A Q8SD39 39029888
    862810 8que:E (3.3) BS03 rna N/A N/A Q8SD39 39029888
    862811 8quf:AAA (1.141) BS01 ZN N/A GO:0002009 ... P00918 N/A
    862812 8quf:AAA (1.141) BS02 WYZ N/A GO:0002009 ... P00918 N/A
    862813 8quf:AAA (1.141) BS03 WYZ N/A GO:0002009 ... P00918 N/A
    862814 8qug:A (1.56) BS01 GDP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 39298590
    862815 8qug:A (1.56) BS02 WYU 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 39298590
    862816 8quh:A (1.55) BS01 AJ2 ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    862817 8qui:A (1.69) BS01 XXL ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    862818 8quj:A (1.63) BS01 WWR ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    862819 8quk:A (1.38) BS01 WVU ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    862820 8qul:A (1.67) BS01 3IP ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    862821 8qun:AAA (1.606) BS01 ZN N/A GO:0004064 ... P00915 N/A
    862822 8qun:AAA (1.606) BS02 WZH N/A GO:0004064 ... P00915 N/A
    862823 8qun:BBB (1.606) BS01 ZN N/A GO:0004064 ... P00915 N/A
    862824 8qun:BBB (1.606) BS02 WZH N/A GO:0004064 ... P00915 N/A
    862825 8quo:A (1.94) BS01 HEM N/A N/A Q6NGV6 39865384
    862826 8quo:B (1.94) BS01 HEM N/A N/A Q6NGV6 39865384
    862827 8quo:C (1.94) BS01 HEM N/A N/A Q6NGV6 39865384
    862828 8quo:D (1.94) BS01 HEM N/A N/A Q6NGV6 39865384
    862829 8quo:E (1.94) BS01 HEM N/A N/A Q6NGV6 39865384
    862830 8quu:A (2.7) BS01 HEM N/A GO:0016491 ... B8HNS6 38846772
    862831 8quu:B (2.7) BS01 HEM N/A GO:0016491 ... B8HNS6 38846772
    862832 8quv:A (2.7) BS01 HEM N/A GO:0016491 ... B8HNS6 38846772
    862833 8quv:B (2.7) BS01 HEM N/A GO:0016491 ... B8HNS6 38846772
    862834 8quw:A (2.02) BS01 WZR ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    862835 8qux:A (2.3) BS01 S0I ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    862836 8quy:A (1.88) BS01 X0L ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    862837 8quz:A (2.7) BS01 HEM N/A GO:0016491 ... B8HNS6 38846772
    862838 8quz:B (2.7) BS01 HEM N/A GO:0016491 ... B8HNS6 38846772
    862839 8qv1:A (2.2) BS01 X0H ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    862840 8qv2:Sn (9.2) BS01 peptide ? GO:0000022 ... P32380 38609662
    862841 8qv2:a (9.2) BS01 peptide ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862842 8qv2:a (9.2) BS02 GDP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862843 8qv2:b (9.2) BS01 GTP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862844 8qv2:c (9.2) BS01 GTP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862845 8qv2:d (9.2) BS01 GTP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862846 8qv2:e (9.2) BS01 GTP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862847 8qv2:f (9.2) BS01 GTP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862848 8qv2:g (9.2) BS01 GTP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862849 8qv2:h (9.2) BS01 GTP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862850 8qv2:i (9.2) BS01 GTP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862851 8qv2:j (9.2) BS01 GTP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862852 8qv2:k (9.2) BS01 GTP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862853 8qv2:l (9.2) BS01 GTP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862854 8qv2:m (9.2) BS01 GTP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862855 8qv2:n (9.2) BS01 GTP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862856 8qv3:c (8.2) BS01 GTP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862857 8qv3:d (8.2) BS01 GTP ? GO:0000070 ... P53378 38609662
    862858 8qv4:A (2.7) BS01 WZX ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    862859 8qv7:A (2.928) BS01 ZIQ 1.13.11.11 GO:0004833 ... P48775 39537789
    862860 8qv7:B (2.928) BS01 ZIQ 1.13.11.11 GO:0004833 ... P48775 39537789
    862861 8qv7:C (2.928) BS01 ZIQ 1.13.11.11 GO:0004833 ... P48775 39537789
    862862 8qv7:D (2.928) BS01 ZIQ 1.13.11.11 GO:0004833 ... P48775 39537789
    862863 8qv9:A (1.76) BS01 WZL ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    862864 8qva:A (2.0) BS01 WZ9 ? GO:0016032 ... P12493 38581280
    862865 8qvb:A (2.7) BS01 HEM N/A GO:0016491 ... B8HNS6 38846772
    862866 8qvb:B (2.7) BS01 HEM N/A GO:0016491 ... B8HNS6 38846772
    862867 8qve:A (1.7) BS01 FAD ? GO:0000166 ... A0A2I9D0D5 38508304
    862868 8qvf:A (2.4) BS01 XQ9 N/A GO:0000287 ... P34913 39072424
    862869 8qvg:A (2.2) BS01 6N8 N/A GO:0000287 ... P34913 39072424
    862870 8qvh:A (2.24) BS01 AUB N/A GO:0000287 ... P34913 39072424
    862871 8qvk:A (2.1) BS01 6N0 N/A GO:0000287 ... P34913 39072424
    862872 8qvl:A (2.14) BS01 4VY N/A GO:0000287 ... P34913 39072424
    862873 8qvl:A (2.14) BS02 4VY N/A GO:0000287 ... P34913 39072424
    862874 8qvo:A (1.96) BS01 ZN 3.4.17.18 GO:0004181 ... P29068 N/A
    862875 8qvo:A (1.96) BS02 CA 3.4.17.18 GO:0004181 ... P29068 N/A
    862876 8qvo:A (1.96) BS03 CA 3.4.17.18 GO:0004181 ... P29068 N/A
    862877 8qvo:A (1.96) BS04 CA 3.4.17.18 GO:0004181 ... P29068 N/A
    862878 8qvo:A (1.96) BS05 CA 3.4.17.18 GO:0004181 ... P29068 N/A
    862879 8qvo:A (1.96) BS06 CA 3.4.17.18 GO:0004181 ... P29068 N/A
    862880 8qvt:A (1.65) BS01 FAD N/A GO:0016491 ... E3T1X0 N/A
    862881 8qvt:B (1.65) BS01 FAD N/A GO:0016491 ... E3T1X0 N/A
    862882 8qvu:A (2.24) BS01 WYL 3.6.5.2 GO:0000139 ... P01116 39298590
    862883 8qvu:A (2.24) BS02 GDP 3.6.5.2 GO:0000139 ... P01116 39298590
    862884 8qvu:A (2.24) BS03 MG 3.6.5.2 GO:0000139 ... P01116 39298590
    862885 8qvu:B (2.24) BS01 WYL ? GO:0000122 ... P40337 39298590
    862886 8qvu:E (2.24) BS01 WYL 3.6.5.2 GO:0000139 ... P01116 39298590
    862887 8qvu:E (2.24) BS02 GDP 3.6.5.2 GO:0000139 ... P01116 39298590
    862888 8qvu:E (2.24) BS03 MG 3.6.5.2 GO:0000139 ... P01116 39298590
    862889 8qvu:F (2.24) BS01 WYL ? GO:0000122 ... P40337 39298590
    862890 8qvy:A (2.64) BS01 PO4 N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862891 8qvy:B (2.64) BS01 PO4 N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862892 8qvy:C (2.64) BS01 PO4 N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862893 8qvy:D (2.64) BS01 PO4 N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862894 8qvy:E (2.64) BS01 PO4 N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862895 8qvy:F (2.64) BS01 PO4 N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862896 8qvz:A (1.774) BS01 CMP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862897 8qvz:B (1.774) BS01 CMP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862898 8qvz:C (1.774) BS01 CMP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862899 8qvz:D (1.774) BS01 CMP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862900 8qvz:E (1.774) BS01 CMP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862901 8qvz:F (1.774) BS01 CMP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862902 8qw0:A (2.175) BS01 GDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862903 8qw0:B (2.175) BS01 GDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862904 8qw0:C (2.175) BS01 GDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862905 8qw0:D (2.175) BS01 GDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862906 8qw0:E (2.175) BS01 GDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862907 8qw0:F (2.175) BS01 GDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862908 8qw0:G (2.175) BS01 GDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862909 8qw0:H (2.175) BS01 GDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862910 8qw0:I (2.175) BS01 GDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862911 8qw0:J (2.175) BS01 GDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862912 8qw0:K (2.175) BS01 GDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862913 8qw0:L (2.175) BS01 GDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862914 8qw1:A (2.1) BS01 ADP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862915 8qw1:B (2.1) BS01 ADP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862916 8qw1:C (2.1) BS01 ADP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862917 8qw1:D (2.1) BS01 ADP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862918 8qw1:E (2.1) BS01 ADP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862919 8qw1:F (2.1) BS01 ADP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862920 8qw2:A (1.87) BS01 UDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862921 8qw2:B (1.87) BS01 UDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862922 8qw2:C (1.87) BS01 UDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862923 8qw2:D (1.87) BS01 UDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862924 8qw2:E (1.87) BS01 UDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862925 8qw2:F (1.87) BS01 UDP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862926 8qw3:A (1.255) BS01 ADP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862927 8qw3:B (1.255) BS01 ADP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862928 8qw3:C (1.255) BS01 ADP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862929 8qw3:D (1.255) BS01 ADP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862930 8qw3:E (1.255) BS01 ADP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862931 8qw3:F (1.255) BS01 ADP N/A GO:0004550 ... Q13232 39337255
    862932 8qw6:A (2.2) BS01 GDP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 39298590
    862933 8qw6:A (2.2) BS02 X4R 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 39298590
    862934 8qw6:B (2.2) BS01 X4R ? N/A P40337 39298590
    862935 8qw6:E (2.2) BS01 GDP 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 39298590
    862936 8qw6:E (2.2) BS02 X4R 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 39298590
    862937 8qw6:E (2.2) BS03 MG 3.6.5.2 GO:0003924 ... P01116 39298590
    862938 8qw6:F (2.2) BS01 X4R ? N/A P40337 39298590
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    863000 8qx4:E (2.03) BS01 MAN N/A GO:0016020 ... M1IUY5 39614099

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).