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BioLiP
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    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    866601 8qoi:LS (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... Q02543 38844527
    866602 8qoi:LS (1.9) BS02 rna ? GO:0002181 ... Q02543 38844527
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    866604 8qoi:LT (1.9) BS02 rna ? GO:0001650 ... P46778 38844527
    866605 8qoi:LU (1.9) BS01 rna ? GO:0002181 ... P35268 38844527
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    3.4.11.4
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    866712 8qoz:N (3.1) BS03 rna ? GO:0000244 ... O94906 38778104
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    866722 8qp8:A (3.5) BS04 IHP ? GO:0000244 ... Q6P2Q9 38778104
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    866725 8qp8:D (3.5) BS02 rna ? GO:0000245 ... P83876 38778104
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    866800 8qpe:r (3.1) BS01 rna ? GO:0000398 ... Q96NC0 38778104

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).