SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 1072681 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 4680 4681 4682 4683 4684 4685 4686 4687 4688 4689 4690 4691 4692 4693 4694 4695 4696 4697 4698 4699 4700 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    937801 9auw:C (2.3) BS02 IMP N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937802 9auw:C (2.3) BS03 VP4 N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937803 9auw:D (2.3) BS01 VP4 N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937804 9auw:D (2.3) BS02 IMP N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937805 9auw:D (2.3) BS03 VP4 N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937806 9auw:E (2.3) BS01 IMP N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937807 9auw:E (2.3) BS02 VP4 N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937808 9auw:E (2.3) BS03 VP4 N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937809 9auw:F (2.3) BS01 VP4 N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937810 9auw:F (2.3) BS02 IMP N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937811 9auw:F (2.3) BS03 VP4 N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937812 9auw:G (2.3) BS01 VP4 N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937813 9auw:G (2.3) BS02 IMP N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937814 9auw:G (2.3) BS03 VP4 N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937815 9auw:H (2.3) BS01 VP4 N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937816 9auw:H (2.3) BS02 IMP N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937817 9auw:H (2.3) BS03 VP4 N/A GO:0003824 ... A0A059ZJE9
    P31002
    39207111
    937818 9aux:A (2.46) BS01 IMP N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937819 9aux:A (2.46) BS02 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937820 9aux:A (2.46) BS03 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937821 9aux:B (2.46) BS01 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937822 9aux:B (2.46) BS02 IMP N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937823 9aux:B (2.46) BS03 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937824 9aux:C (2.46) BS01 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937825 9aux:C (2.46) BS02 IMP N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937826 9aux:C (2.46) BS03 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937827 9aux:D (2.46) BS01 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937828 9aux:D (2.46) BS02 IMP N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937829 9aux:D (2.46) BS03 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937830 9aux:E (2.46) BS01 IMP N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937831 9aux:E (2.46) BS02 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937832 9aux:E (2.46) BS03 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937833 9aux:F (2.46) BS01 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937834 9aux:F (2.46) BS02 IMP N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937835 9aux:F (2.46) BS03 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937836 9aux:G (2.46) BS01 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937837 9aux:G (2.46) BS02 IMP N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937838 9aux:G (2.46) BS03 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937839 9aux:H (2.46) BS01 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937840 9aux:H (2.46) BS02 IMP N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937841 9aux:H (2.46) BS03 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P31002 39207111
    937842 9auy:A (1.94) BS01 IMP N/A GO:0003824 ... Q2FJM6 39207111
    937843 9auy:A (1.94) BS02 VOA N/A GO:0003824 ... Q2FJM6 39207111
    937844 9auz:A (1.94) BS01 IMP N/A GO:0003824 ... Q2FJM6 39207111
    937845 9auz:A (1.94) BS02 VP4 N/A GO:0003824 ... Q2FJM6 39207111
    937846 9av0:A (2.2) BS01 IMP N/A GO:0003824 ... Q2G0Y7 39207111
    937847 9av0:A (2.2) BS02 A1AG0 N/A GO:0003824 ... Q2G0Y7 39207111
    937848 9av1:A (1.7) BS01 IMP N/A GO:0003824 ... P0ADG7 39207111
    937849 9av1:A (1.7) BS02 VOA N/A GO:0003824 ... P0ADG7 39207111
    937850 9av2:A (1.7) BS01 IMP N/A GO:0003824 ... P0ADG7 39207111
    937851 9av2:A (1.7) BS02 VP4 N/A GO:0003824 ... P0ADG7 39207111
    937852 9av3:A (1.82) BS01 IMP N/A GO:0003824 ... P0ADG7 39207111
    937853 9av3:A (1.82) BS02 A1AG0 N/A GO:0003824 ... P0ADG7 39207111
    937854 9av4:A (2.09) BS01 NAD N/A GO:0004303 ... A0A8C0PP93 39746932
    937855 9av4:A (2.09) BS02 A1AG4 N/A GO:0004303 ... A0A8C0PP93 39746932
    937856 9av4:B (2.09) BS01 NAD N/A GO:0004303 ... A0A8C0PP93 39746932
    937857 9av4:B (2.09) BS02 A1AG4 N/A GO:0004303 ... A0A8C0PP93 39746932
    937858 9av5:A (2.363) BS01 NAD N/A GO:0004303 ... A0A8C0PP93 39746932
    937859 9av5:A (2.363) BS02 A1AG5 N/A GO:0004303 ... A0A8C0PP93 39746932
    937860 9av5:B (2.363) BS01 NAD N/A GO:0004303 ... A0A8C0PP93 39746932
    937861 9av5:B (2.363) BS02 A1AG5 N/A GO:0004303 ... A0A8C0PP93 39746932
    937862 9av7:A (2.1) BS01 ANP 2.7.11.1 GO:0000166 ... A2F9N1 N/A
    937863 9av8:A (2.592) BS01 NAD N/A GO:0004303 ... A0A8C0PP93 39746932
    937864 9av8:A (2.592) BS02 A1AG6 N/A GO:0004303 ... A0A8C0PP93 39746932
    937865 9av8:B (2.592) BS01 NAD N/A GO:0004303 ... A0A8C0PP93 39746932
    937866 9av9:A (1.94) BS01 HEM N/A GO:0004601 ... P69905 39920120
    937867 9av9:B (1.94) BS01 HEM N/A GO:0004601 ... P68871 39920120
    937868 9av9:C (1.94) BS01 HEM N/A GO:0004601 ... P69905 39920120
    937869 9av9:D (1.94) BS01 HEM N/A GO:0004601 ... P68871 39920120
    937870 9ava:A (2.3) BS01 A1AG1 3.1.11.2 GO:0003676 ... Q9NSU2 N/A
    937871 9ava:B (2.3) BS01 A1AG1 3.1.11.2 GO:0003676 ... Q9NSU2 N/A
    937872 9ava:C (2.3) BS01 A1AG1 3.1.11.2 GO:0003676 ... Q9NSU2 N/A
    937873 9ava:D (2.3) BS01 A1AG1 3.1.11.2 GO:0003676 ... Q9NSU2 N/A
    937874 9ava:E (2.3) BS01 A1AG1 3.1.11.2 GO:0003676 ... Q9NSU2 N/A
    937875 9ava:F (2.3) BS01 A1AG1 3.1.11.2 GO:0003676 ... Q9NSU2 N/A
    937876 9ava:F (2.3) BS02 A1AG1 3.1.11.2 GO:0003676 ... Q9NSU2 N/A
    937877 9ava:G (2.3) BS01 A1AG1 3.1.11.2 GO:0003676 ... Q9NSU2 N/A
    937878 9ava:H (2.3) BS01 A1AG1 3.1.11.2 GO:0003676 ... Q9NSU2 N/A
    937879 9ava:I (2.3) BS01 A1AG1 3.1.11.2 GO:0003676 ... Q9NSU2 N/A
    937880 9ava:J (2.3) BS01 A1AG1 3.1.11.2 GO:0003676 ... Q9NSU2 N/A
    937881 9ava:K (2.3) BS01 A1AG1 3.1.11.2 GO:0003676 ... Q9NSU2 N/A
    937882 9ava:L (2.3) BS01 A1AG1 3.1.11.2 GO:0003676 ... Q9NSU2 N/A
    937883 9avg:Q (3.6) BS01 TCR ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937884 9avg:Q (3.6) BS02 CA ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937885 9avg:Q (3.6) BS03 CA ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937886 9avg:Q (3.6) BS04 9IG ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937887 9avg:Q (3.6) BS05 Y01 ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937888 9avg:Q (3.6) BS06 A1AF7 ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937889 9avg:R (3.6) BS01 Y01 ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937890 9avg:R (3.6) BS02 TCR ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937891 9avg:R (3.6) BS03 CA ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937892 9avg:R (3.6) BS04 CA ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937893 9avg:R (3.6) BS05 CA ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937894 9avg:R (3.6) BS06 9IG ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937895 9avg:R (3.6) BS07 A1AF7 ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937896 9avh:A (1.8) BS01 FAD N/A GO:0016614 ... N/A 39161354
    937897 9avh:A (1.8) BS02 ANN N/A GO:0016614 ... N/A 39161354
    937898 9avj:A (3.72) BS01 ANP N/A GO:0005524 ... P09219 39428050
    937899 9avj:B (3.72) BS01 ANP N/A GO:0005524 ... P09219 39428050
    937900 9avj:C (3.72) BS01 ANP N/A GO:0005524 ... P09219 39428050
    937901 9avj:D (3.72) BS01 ANP N/A GO:0005515 ... P07677 39428050
    937902 9avj:D (3.72) BS02 MG N/A GO:0005515 ... P07677 39428050
    937903 9avj:F (3.72) BS01 ANP N/A GO:0005515 ... P07677 39428050
    937904 9avl:Q (3.8) BS01 TCR ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937905 9avl:Q (3.8) BS02 CA ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937906 9avl:Q (3.8) BS03 9IG ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937907 9avl:Q (3.8) BS04 Y01 ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937908 9avl:Q (3.8) BS05 A1AF7 ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937909 9avl:R (3.8) BS01 TCR ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937910 9avl:R (3.8) BS02 CA ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937911 9avl:R (3.8) BS03 CA ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937912 9avl:R (3.8) BS04 9IG ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937913 9avl:R (3.8) BS05 A1AF7 ? GO:0004930 ... P41180 38632411
    937914 9avn:A (2.726) BS01 A1AG7 N/A N/A Q9H257 N/A
    937915 9avn:B (2.726) BS01 A1AG7 N/A N/A Q9H257 N/A
    937916 9avn:C (2.726) BS01 A1AG7 N/A N/A Q9H257 N/A
    937917 9avn:D (2.726) BS01 A1AG7 N/A N/A Q9H257 N/A
    937918 9avq:A (2.58) BS01 4WI 2.1.1.56
    2.1.1.57
    2.7.7.48
    2.7.7.50
    3.1.13.-
    3.4.19.12
    3.4.22.-
    3.4.22.69
    3.6.4.12
    3.6.4.13
    4.6.1.-
    GO:0008233 ... P0DTD1 39236245
    937919 9avr:A (1.91) BS01 rna N/A GO:0000339 ... P60842 39351865
    937920 9avr:A (1.91) BS02 ANP N/A GO:0000339 ... P60842 39351865
    937921 9avr:A (1.91) BS03 A1AG8 N/A GO:0000339 ... P60842 39351865
    937922 9avt:C (1.5) BS01 ZN N/A N/A Q9NYJ8 N/A
    937923 9avu:A (2.45) BS01 MAN N/A GO:0003009 ... P02709 39085615
    937924 9avu:A (2.45) BS02 ACH N/A GO:0003009 ... P02709 39085615
    937925 9avu:B (2.45) BS01 ACH N/A GO:0003008 ... P13536 39085615
    937926 9avu:C (2.45) BS01 MAN N/A GO:0003009 ... P02709 39085615
    937927 9avu:C (2.45) BS02 ACH N/A GO:0003009 ... P02709 39085615
    937928 9avu:D (2.45) BS01 ACH N/A GO:0003009 ... P04759 39085615
    937929 9avv:C (2.09) BS01 MAN N/A GO:0003009 ... P02709 39085615
    937930 9avv:D (2.09) BS01 MAN N/A GO:0003009 ... P04759 39085615
    937931 9avv:F (2.09) BS01 MAN N/A GO:0005576 ... N/A 39085615
    937932 9avv:G (2.09) BS01 MAN N/A GO:0005576 ... N/A 39085615
    937933 9avw:C (1.747) BS01 ZN N/A N/A Q9NYJ8 N/A
    937934 9avx:A (1.497) BS01 CA N/A GO:0004175 ... P00760 N/A
    937935 9avy:A (1.497) BS01 CA N/A GO:0004175 ... P00760 N/A
    937936 9avz:A (1.499) BS01 CA N/A GO:0004175 ... P00760 N/A
    937937 9aw0:A (1.498) BS01 CA N/A GO:0004175 ... P00760 N/A
    937938 9aw1:A (1.5) BS01 CA N/A GO:0004175 ... P00760 N/A
    937939 9aw2:A (1.498) BS01 CA N/A GO:0004175 ... P00760 N/A
    937940 9aw3:H (3.42) BS01 MG N/A GO:0004298 ... P25043 40237633
    937941 9aw3:I (3.42) BS01 MG N/A GO:0005515 ... P25451 40237633
    937942 9aw3:L (3.42) BS01 MG N/A GO:0003674 ... P23724 40237633
    937943 9aw3:V (3.42) BS01 MG N/A GO:0004298 ... P25043 40237633
    937944 9aw3:W (3.42) BS01 MG N/A GO:0005515 ... P25451 40237633
    937945 9aw3:Y (3.42) BS01 MG N/A GO:0004298 ... P30656 40237633
    937946 9aw3:Z (3.42) BS01 MG N/A GO:0003674 ... P23724 40237633
    937947 9aw4:A (1.499) BS01 CA N/A GO:0004175 ... P00760 N/A
    937948 9aw5:H (3.44) BS01 MG N/A GO:0004298 ... P25043 40237633
    937949 9aw5:K (3.44) BS01 A1A9B N/A GO:0004298 ... P30656 40237633
    937950 9aw5:K (3.44) BS02 MG N/A GO:0004298 ... P30656 40237633
    937951 9aw5:L (3.44) BS01 MG N/A GO:0003674 ... P23724 40237633
    937952 9aw5:V (3.44) BS01 MG N/A GO:0004298 ... P25043 40237633
    937953 9aw5:W (3.44) BS01 MG N/A GO:0005515 ... P25451 40237633
    937954 9aw5:Y (3.44) BS01 A1A9B N/A GO:0004298 ... P30656 40237633
    937955 9aw5:Y (3.44) BS02 MG N/A GO:0004298 ... P30656 40237633
    937956 9aw5:Z (3.44) BS01 A1A9B N/A GO:0003674 ... P23724 40237633
    937957 9aw5:Z (3.44) BS02 MG N/A GO:0003674 ... P23724 40237633
    937958 9aw6:H (3.44) BS01 A1A9B N/A GO:0004298 ... P25043 40237633
    937959 9aw6:H (3.44) BS02 A1A9B N/A GO:0004298 ... P25043 40237633
    937960 9aw6:I (3.44) BS01 A1A9B N/A GO:0005515 ... P25451 40237633
    937961 9aw6:I (3.44) BS02 MG N/A GO:0005515 ... P25451 40237633
    937962 9aw6:K (3.44) BS01 A1A9B N/A GO:0004298 ... P30656 40237633
    937963 9aw6:L (3.44) BS01 A1A9B N/A GO:0003674 ... P23724 40237633
    937964 9aw6:L (3.44) BS02 MG N/A GO:0003674 ... P23724 40237633
    937965 9aw6:N (3.44) BS01 A1A9B N/A GO:0004175 ... P38624 40237633
    937966 9aw6:V (3.44) BS01 A1A9B N/A GO:0004298 ... P25043 40237633
    937967 9aw6:V (3.44) BS02 A1A9B N/A GO:0004298 ... P25043 40237633
    937968 9aw6:W (3.44) BS01 A1A9B N/A GO:0005515 ... P25451 40237633
    937969 9aw6:Y (3.44) BS01 A1A9B N/A GO:0004298 ... P30656 40237633
    937970 9aw6:Y (3.44) BS02 MG N/A GO:0004298 ... P30656 40237633
    937971 9aw6:Z (3.44) BS01 MG N/A GO:0003674 ... P23724 40237633
    937972 9aw6:b (3.44) BS01 A1A9B N/A GO:0004175 ... P38624 40237633
    937973 9aw7:G (2.91) BS01 MG N/A GO:0003674 ... P21243 40237633
    937974 9aw7:H (2.91) BS01 A1AHA N/A GO:0004298 ... P25043 40237633
    937975 9aw7:H (2.91) BS02 MG N/A GO:0004298 ... P25043 40237633
    937976 9aw7:H (2.91) BS03 A1AHA N/A GO:0004298 ... P25043 40237633
    937977 9aw7:I (2.91) BS01 A1AHA N/A GO:0005515 ... P25451 40237633
    937978 9aw7:I (2.91) BS02 MG N/A GO:0005515 ... P25451 40237633
    937979 9aw7:K (2.91) BS01 A1AHA N/A GO:0004298 ... P30656 40237633
    937980 9aw7:K (2.91) BS02 MG N/A GO:0004298 ... P30656 40237633
    937981 9aw7:L (2.91) BS01 MG N/A GO:0003674 ... P23724 40237633
    937982 9aw7:N (2.91) BS01 A1AHA N/A GO:0004175 ... P38624 40237633
    937983 9aw7:U (2.91) BS01 MG N/A GO:0003674 ... P21243 40237633
    937984 9aw7:V (2.91) BS01 A1AHA N/A GO:0004298 ... P25043 40237633
    937985 9aw7:V (2.91) BS02 MG N/A GO:0004298 ... P25043 40237633
    937986 9aw7:V (2.91) BS03 A1AHA N/A GO:0004298 ... P25043 40237633
    937987 9aw7:W (2.91) BS01 A1AHA N/A GO:0005515 ... P25451 40237633
    937988 9aw7:W (2.91) BS02 MG N/A GO:0005515 ... P25451 40237633
    937989 9aw7:X (2.91) BS01 MG N/A GO:0005515 ... P22141 40237633
    937990 9aw7:Y (2.91) BS01 A1AHA N/A GO:0004298 ... P30656 40237633
    937991 9aw7:Y (2.91) BS02 MG N/A GO:0004298 ... P30656 40237633
    937992 9aw7:Z (2.91) BS01 A1AHA N/A GO:0003674 ... P23724 40237633
    937993 9aw7:Z (2.91) BS02 MG N/A GO:0003674 ... P23724 40237633
    937994 9aw7:b (2.91) BS01 A1AHA N/A GO:0004175 ... P38624 40237633
    937995 9aw8:A (1.496) BS01 CA N/A GO:0004175 ... P00760 N/A
    937996 9aw9:A (1.495) BS01 CA N/A GO:0004175 ... P00760 N/A
    937997 9awa:A (1.497) BS01 CA N/A GO:0004175 ... P00760 N/A
    937998 9awb:A (1.495) BS01 CA N/A GO:0004175 ... P00760 N/A
    937999 9awc:A (1.487) BS01 CA N/A GO:0004175 ... P00760 N/A
    938000 9awd:A (1.491) BS01 CA N/A GO:0004175 ... P00760 N/A

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).