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HomodimerDB
This page describes membership of homodimers to sequence and structure clusters. The database is built by first clustering by sequence and then by structural clustering within each sequence cluster. As a result, one sequence cluster may include multiple structure clusters, while each structural cluster may include multiple homodimers. Homodimers that share membership to one structure cluster therefore exhibit both sequence and structure similarity, while homodimers that have membership in different structure clusters but the same sequence structure would exhibit sequence similarity but have distinct structures.
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# Sequence cluster Cluster members
20401 6tyi/1/1:Y
  • 5zfu/1/1:G/1:H:
  • 5zfu/1/1:G/1:I:
  • 7ajq/1/1:F/1:G: 6tyi/1/1:Z/1:Y;
    • 20402 6tzl/1/1:C
  • 6tzl/1/1:D/1:C:
  • 6tzl/1/2:A/1:C: 6tzl/1/1:B/1:D;
  • 6tzl/1/2:A/1:D: 6tzl/1/1:B/1:C; 6ubv/1/1:A/1:B; 6ubv/1/1:D/1:C;
  • 6ubv/1/1:A/1:C:
    • 20403 6u0i/1/1:A
  • 6u0i/2/1:D/1:C: 6hpb/1/1:B/1:D; 6hpc/1/1:A/1:B; 6u0i/1/1:B/1:A;
    • 20404 6u11/1/1:A
  • 6u11/1/1:A/2:A:
    • 20405 6u14/1/1:A
  • 6u14/1/1:A/1:B:
    • 20406 6u18/1/1:A
  • 3frq/1/1:B/1:A: 3g56/1/1:B/1:A; 6u18/1/1:B/1:A;
    • 20407 6u1b/1/1:A
  • 6u1b/1/1:A/2:A:
    • 20408 6u1q/1/1:A
  • 6u1q/1/1:B/1:A:
    • 20409 6u1r/1/1:A
  • 6u1r/1/1:B/1:A:
    • 20410 6u1s/1/1:A
  • 6u1s/1/1:L/1:N: 6u1s/1/1:A/1:B; 6u1s/1/1:A/1:N; 6u1s/1/1:B/1:D; 6u1s/1/1:D/1:F; 6u1s/1/1:F/1:H; 6u1s/1/1:H/1:J; 6u1s/1/1:J/1:L;
    • 20411 6u1v/1/1:B
  • 6u1v/1/1:D/1:B: 6u1v/1/1:C/1:A;
  • 6u1v/1/1:D/1:C: 6u1v/1/1:A/1:B;
    • 20412 6u2u/1/1:A
  • 6u2u/1/1:B/1:A: 6mgm/1/1:A/1:B;
    • 20413 6u3e/1/1:A
  • 1fhw/3/1:A/1:B: 1fhx/3/1:A/1:B;
  • 6u3e/1/1:A/1:B:
  • 6u3g/1/1:A/1:B:
    • 20414 6u3j/1/1:A
  • 6sy1/1/1:A/1:B: 5rvw/1/1:A/1:B; 5rvx/1/1:A/1:B; 5rvy/1/1:A/1:B; 5rvz/1/1:A/1:B; 5rw0/1/1:A/1:B; 5rw1/1/1:B/1:A; 6u3j/1/1:A/1:B;
    • 20415 6u3v/1/1:B
  • 6u3v/1/1:B/2:B: 6tzt/1/1:B/2:B;
    • 20416 6u42/1/1:4O
  • 8glv/1/1:Gd/1:5D: 6u42/1/1:4P/1:4O;
  • 8glv/1/1:OA/1:4O: 6u42/1/1:4N/1:4O; 8glv/1/1:4O/1:5D;
    • 20417 6u42/1/1:4R
  • 8glv/1/1:Gi/1:Ga: 6u42/1/1:4S/1:4R; 8glv/1/1:Gf/1:4R;
  • 8glv/1/1:OG/1:4R: 6u42/1/1:4Q/1:4R; 8glv/1/1:Gj/1:Ga;
    • 20418 6u42/1/1:5F
  • 8glv/1/1:7B/1:5F: 6u42/1/1:7B/1:5F;
  • 8glv/1/1:Gs/1:5F: 6u42/1/1:5G/1:5F;
    • 20419 6u4b/1/1:A
  • 6u4b/1/2:A/3:A: 6u4b/1/1:A/2:A; 6u4b/1/1:A/3:A;
    • 20420 6u4y/1/1:B
  • 6u4y/1/1:C/1:A: 6u4y/1/1:A/1:B; 6u4y/1/1:C/1:B;
    • 20421 6u4y/1/1:E
  • 6u4y/1/1:F/1:E:
    • 20422 6u5b/1/1:g
  • 6u5b/1/1:k/1:l: 6u5b/1/1:g/1:h; 6u5b/1/1:g/1:l; 6u5b/1/1:h/1:i; 6u5b/1/1:i/1:j; 6u5b/1/1:j/1:k;
    • 20423 6u5h/1/1:A
  • 6u5h/1/1:B/1:C: 6u5h/1/1:A/1:B; 6u5h/1/1:A/1:C;
    • 20424 6u6t/1/1:A
  • 6u6t/1/1:A/1:B:
    • 20425 6u7a/1/1:A
  • 6u78/1/1:C/1:A: 5c6u/1/1:A/2:A; 6u78/2/1:D/1:B; 6u7a/1/1:A/1:B; 6u7a/4/1:F/1:G;
  • 6u7a/3/1:H/1:E:
    • 20426 6u7b/1/1:B
  • 6u7b/1/1:D/1:B:
    • 20427 6u7h/1/1:A
  • 7cyd/1/1:B/1:C: 6u7h/1/1:A/1:B; 6u7h/1/1:A/1:C; 6u7h/1/1:B/1:C; 7cyc/1/1:A/1:B; 7cyc/1/1:A/1:C; 7cyc/1/1:B/1:C; 7cyd/1/1:A/1:B; 7cyd/1/1:A/1:C;
    • 20428 6u7i/1/1:C
  • 6u7i/1/1:A/1:D: 6u7i/1/1:B/1:C;
  • 6u7i/1/1:B/1:D: 6u7i/1/1:A/1:C;
  • 6u7i/1/1:D/1:C: 6u7i/1/1:A/1:B;
    • 20429 6u7j/1/1:B
  • 6u7j/1/1:A/1:D: 6u7j/1/1:C/1:B;
  • 6u7j/1/1:C/1:D: 6u7j/1/1:A/1:B;
  • 6u7j/1/1:D/1:B: 6u7j/1/1:A/1:C;
    • 20430 6u7l/1/1:A
  • 3laz/2/1:B/3:B: 3laz/1/1:A/2:A;
  • 6u7l/2/1:D/1:C: 6u7l/1/1:B/1:A;
    • 20431 6u7n/1/1:A
  • 6dlf/1/1:B/1:A:
  • 6u7n/1/1:A/2:A:
    • 20432 6u8t/2/1:C
  • 6u8t/2/1:D/1:C: 6u8t/1/1:A/1:B;
    • 20433 6u9e/1/1:B
  • 6u9g/1/1:D/1:F: 6u9e/1/1:B/1:D; 6u9e/1/1:B/1:F; 6u9e/1/1:D/1:F; 6u9f/1/1:B/1:D; 6u9f/1/1:B/1:F; 6u9f/1/1:D/1:F; 6u9g/1/1:B/1:D; 6u9g/1/1:B/1:F;
    • 20434 6u9f/1/1:A
  • 6u9e/1/1:C/1:E: 6u9e/1/1:A/1:C; 6u9e/1/1:A/1:E; 6u9f/1/1:A/1:C; 6u9f/1/1:A/1:E; 6u9f/1/1:C/1:E; 6u9g/1/1:A/1:C; 6u9g/1/1:A/1:E; 6u9g/1/1:C/1:E;
    • 20435 6u9h/1/1:F
  • 6u9h/1/1:N/1:R: 6u9h/1/1:F/1:J; 6u9h/1/1:F/1:R; 6u9h/1/1:J/1:N;
    • 20436 6u9h/1/1:G
  • 6vz8/1/1:O/1:S: 6u9h/1/1:G/1:K; 6u9h/1/1:G/1:S; 6u9h/1/1:K/1:O; 6u9h/1/1:O/1:S; 6vz8/1/1:G/1:K; 6vz8/1/1:G/1:S; 6vz8/1/1:K/1:O;
    • 20437 6u9i/1/1:A
  • 6u9i/1/1:B/1:A:
    • 20438 6u9j/1/1:A
  • 6u9j/1/1:C/1:A: 2ovi/1/1:D/1:A; 2ovi/2/1:C/1:B; 6u9j/2/1:B/1:D;
    • 20439 6u9w/1/1:A
  • 6u9w/1/1:B/1:C: 6u9v/1/1:A/1:B; 6u9v/1/1:A/1:C; 6u9v/1/1:B/1:C; 6u9w/1/1:A/1:B; 6u9w/1/1:A/1:C;
    • 20440 6uak/1/1:A
  • 6uak/1/1:A/2:A:
    • 20441 6uan/1/1:A
  • 6q0j/1/1:X/1:Y: 6nyb/1/1:C/1:D; 6q0t/1/1:X/1:Y; 6uan/1/1:Z/1:A;
    • 20442 6ubl/1/1:A
  • 6ubl/1/1:A/1:B:
    • 20443 6ucv/1/1:a
  • 6ucu/1/1:A/1:I: 6jnf/1/1:A/1:F; 6ucv/1/1:i/1:a; 6ucv/1/1:I/1:A;
    • 20444 6ud5/1/1:C
  • 6a4i/1/1:B/1:C: 4pw8/2/1:F/1:G;
  • 6a4i/1/1:D/1:B: 4pw8/2/1:H/1:F;
  • 6ud5/1/1:C/1:D: 4pw8/2/1:H/1:G;
    • 20445 6ude/1/1:B
  • 6ude/1/1:D/1:B: 6ude/1/1:A/1:C;
  • 6ude/1/1:D/1:C: 6ude/1/1:A/1:B;
    • 20446 6udg/1/1:A
  • 6udg/1/1:B/1:A:
  • 6udg/1/1:C/1:D:
  • 6udg/1/1:D/1:A: 6udg/1/1:B/1:C;
    • 20447 6ue2/2/1:B
  • 6ue2/2/1:B/1:C:
    • 20448 6ue4/1/1:A
  • 6ue4/1/1:B/1:A:
    • 20449 6uek/1/1:A
  • 6uek/2/1:D/1:C: 6uek/1/1:B/1:A;
    • 20450 6uex/2/1:A
  • 6uex/2/1:A/2:A:
    • 20451 6uf6/2/1:A
  • 6uf6/2/1:A/2:A:
    • 20452 6uh2/1/1:A
  • 6uh2/1/1:A/1:B:
    • 20453 6uh8/3/1:A
  • 6uh8/3/1:A/1:B:
    • 20454 6uhw/1/1:A
  • 6uhw/1/1:A/1:B:
    • 20455 6uhx/1/1:A
  • 3kzv/1/1:A/4:A: 3kzv/1/2:A/3:A; 6uhx/1/1:A/1:B;
  • 3kzv/1/2:A/4:A: 3kzv/1/1:A/3:A;
    • 20456 6ui5/1/1:A
  • 6ui5/1/1:A/1:B:
    • 20457 6uio/1/1:C
  • 6uio/1/1:D/2:A: 6uio/1/1:B/1:C; 6uio/1/1:B/1:D; 6uio/1/1:C/2:A;
    • 20458 6ujd/1/1:A
  • 6ujd/1/1:A/2:A:
    • 20459 6uji/1/1:D
  • 6uji/1/1:E/1:D: 6uji/1/1:C/1:D; 6uji/2/1:H/1:I; 6uji/2/1:L/1:K;
    • 20460 6ujk/1/1:A
  • 6ujk/1/1:B/1:A:
    • 20461 6uk3/1/1:A
  • 6uk3/2/1:B/1:D: 6uk3/1/1:A/1:C;
    • 20462 6uld/1/1:A
  • 6uld/1/1:A/1:B: 3h7f/1/1:A/1:B;
    • 20463 6ulw/2/1:B
  • 6ulw/2/1:D/1:B: 6ulw/1/1:A/1:C;
  • 6uly/1/1:B/1:A:
    • 20464 6um4/1/1:A
  • 6um4/6/1:K/1:L: 6um4/1/1:A/1:B; 6um4/2/1:D/1:C; 6um4/3/1:E/1:F; 6um4/4/1:G/1:H; 6um4/5/1:J/1:I;
    • 20465 6umm/1/1:B
  • 6sgw/1/1:B/1:C: 6lar/1/1:B/1:C; 6lar/1/1:E/1:H; 6sgw/1/1:E/1:H; 6umm/1/1:B/1:C; 6umm/1/1:G/1:H;
    • 20466 6umm/1/1:D
  • 6umm/1/1:I/1:D:
    • 20467 6umx/1/1:A
  • 6umx/1/1:B/1:A:
    • 20468 6umx/1/1:L
  • 6umx/1/1:l/1:L:
  • 6yax/1/1:MMM/1:LLL:
    • 20469 6un9/1/1:A
  • 6un9/1/1:D/1:A: 6un9/1/1:B/1:C;
    • 20470 6unb/1/1:A
  • 6ity/1/1:A/1:B: 5zb7/1/1:A/1:B; 6j25/1/1:A/1:B; 6j2b/1/1:A/1:B; 6j2k/1/1:A/1:B; 6j2o/1/1:A/1:B; 6unb/1/1:B/1:A;
    • 20471 6unc/6/1:C
  • 6unc/6/3:D/1:C: 6unc/5/1:A/2:B;
    • 20472 6unw/1/1:A
  • 6unw/1/2:B/2:A: 6unw/1/1:B/1:A; 6unw/1/1:C/2:C;
  • 6unw/1/2:C/2:B: 6unw/1/1:A/2:A; 6unw/1/1:C/1:B;
    • 20473 6ur7/1/1:A
  • 6ur7/1/1:A/1:B:
    • 20474 6urf/2/1:C
  • 6urf/2/1:C/1:D:
    • 20475 6uss/1/1:A
  • 6uss/1/1:A/1:B:
    • 20476 6ust/1/1:A
  • 6ust/2/1:B/2:C: 6ust/1/3:D/1:A;
    • 20477 6ut7/1/1:G
  • 6ut7/1/1:G/1:N:
    • 20478 6utu/1/1:B
  • 6utu/1/1:H/1:B:
    • 20479 6uug/1/1:A
  • 6uug/1/1:A/2:B: 6u76/1/1:A/2:B; 6u76/1/1:B/2:A; 6uug/1/1:B/2:A;
  • 6uug/1/2:A/2:B: 6u76/1/1:A/1:B; 6u76/1/2:A/2:B; 6uug/1/1:A/1:B;
    • 20480 6uuk/1/1:A
  • 6uuk/1/1:A/1:B:
    • 20481 6uut/1/1:A
  • 6uut/1/1:B/1:A: 6uuv/1/1:A/1:B;
    • 20482 6uv8/1/1:A
  • 6uv8/1/1:A/2:A: 6uvb/1/1:A/2:A;
    • 20483 6uvn/1/1:I
  • 6v9p/2/1:A/2:A: 6lnb/1/1:J/1:I; 6lnc/1/1:I/1:J; 6lnd/1/1:K/2:K; 6pif/1/1:I/1:J; 6uvn/1/1:I/1:J; 6v9q/1/1:I/1:J; 6vbw/1/1:I/1:J;
    • 20484 6uvq/3/1:A
  • 6uvq/3/1:A/2:B: 6uvq/3/1:B/2:A;
  • 6uvq/4/1:A/1:B: 6uvq/3/1:A/1:B; 6uvq/3/2:A/2:B; 6uwd/2/1:A/2:A;
    • 20485 6uvu/1/1:A
  • 6uvu/1/1:A/1:B:
    • 20486 6uw3/1/1:A
  • 6uw5/1/1:A/1:B: 6uvx/1/1:A/1:B; 6uw1/1/1:B/1:A; 6uw3/1/1:A/1:B;
    • 20487 6ux3/1/1:B
  • 6ux3/1/1:A/1:D: 6ux3/1/1:C/1:B;
  • 6ux3/1/1:C/1:D: 6ux3/1/1:A/1:B;
  • 6ux3/1/1:D/1:B: 6ux3/1/1:A/1:C;
    • 20488 6uxe/1/1:B
  • 5usr/2/1:F/1:D: 5usr/1/1:B/1:H;
  • 6uxe/1/1:B/2:B: 5wkp/1/1:B/1:F; 5wlw/1/1:B/1:F; 6w1d/1/1:B/2:B; 7rtk/1/1:B/2:B;
    • 20489 6uxt/1/1:C
  • 6uxt/2/1:E/1:G: 6uxt/1/1:A/1:C; 6uxt/1/1:B/1:D; 6uxt/2/1:F/1:H;
  • 6uxt/2/1:G/1:H: 6uxt/1/1:A/1:B; 6uxt/1/1:C/1:D; 6uxt/2/1:E/1:F;
    • 20490 6uxu/1/1:A
  • 6uxu/1/1:A/1:B:
    • 20491 6uyk/2/1:C
  • 6uyk/1/1:A/1:B: 3fwy/1/1:A/1:B; 6uyk/2/1:D/1:C;
    • 20492 6uzi/2/1:C
  • 6uzi/2/1:D/1:C: 6uzi/1/1:A/1:B;
    • 20493 6v05/1/1:A
  • 6v05/1/1:F/1:A:
    • 20494 6v0a/1/1:A
  • 6v0a/1/1:A/1:B: 6v0a/2/1:C/1:D; 6v0a/3/1:F/1:E;
    • 20495 6v0q/5/1:A
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    Reference:
    Jacob Schwartz et al.

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