1pfo/1/1:A/2:A

Sequences
>1pfo-a1-m1-cA (length=471) [Search sequence]
DITDKNQSIDSGISSLSYNRNEVLASNGDKIESFVPKEGKKAGNKFIVVERQKRSLTTSP
VDISIIDSVNDRTYPGALQLADKALVENRPTILMVKRKPININIDLPGLKGENSIKVDDP
TYGKVSGAIDELVSKWNEKYSSTHTLPARTQYSESMVYSKSQISSALNVNAKVLENSLGV
DFNAVANNEKKVMILAYKQIFYTVSADLPKNPSDLFDDSVTFNDLKQKGVSNEAPPLMVS
NVAYGRTIYVKLETTSSSKDVQAAFKALIKNTDIKNSQQYKDIYENSSFTAVVLGGDAQE
HNKVVTKDFDEIRKVIKDNATFSTKNPAYPISYTSVFLKDNSVAAVHNKTDYIETTSTEY
SKGKINLDHSGAYVAQFEVAWDEVSYDKEGNEVLTHKTWDGNYQDKTAHYSTVIPLEANA
RNIRIKARECTGLAWEWWRDVISEYDVPLTNNINVSIWGTTLYPGSSITYN
>1pfo-a1-m2-cA (length=471) [Search sequence]
DITDKNQSIDSGISSLSYNRNEVLASNGDKIESFVPKEGKKAGNKFIVVERQKRSLTTSP
VDISIIDSVNDRTYPGALQLADKALVENRPTILMVKRKPININIDLPGLKGENSIKVDDP
TYGKVSGAIDELVSKWNEKYSSTHTLPARTQYSESMVYSKSQISSALNVNAKVLENSLGV
DFNAVANNEKKVMILAYKQIFYTVSADLPKNPSDLFDDSVTFNDLKQKGVSNEAPPLMVS
NVAYGRTIYVKLETTSSSKDVQAAFKALIKNTDIKNSQQYKDIYENSSFTAVVLGGDAQE
HNKVVTKDFDEIRKVIKDNATFSTKNPAYPISYTSVFLKDNSVAAVHNKTDYIETTSTEY
SKGKINLDHSGAYVAQFEVAWDEVSYDKEGNEVLTHKTWDGNYQDKTAHYSTVIPLEANA
RNIRIKARECTGLAWEWWRDVISEYDVPLTNNINVSIWGTTLYPGSSITYN
Structure information
PDB ID 1pfo (database links: RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum)
Title PERFRINGOLYSIN O
Assembly ID 1
Resolution 2.2Å
Method of structure determination X-RAY DIFFRACTION
Number of inter-chain contacts 94
Sequence identity between the two chains 1.0
Chain information
Chain 1 Chain 2
Model ID 1 2
Chain ID A A
UniProt accession P0C2E9 P0C2E9
Species 1502 (Clostridium perfringens) 1502 (Clostridium perfringens)
3D structure
Switch viewer: [NGL] [JSmol]
Dimer structure: Chain 1 in red; Chain 2 in blue.
Download: 1pfo-a1-m1-cA_1pfo-a1-m2-cA.pdb.gz
Full biological assembly
Download: 1pfo-assembly1.cif.gz
Similar dimers
Other dimers with similar sequences but different poses
  • 2bk1/1/8:A/9:A 2bk1/1/10:A/11:A 2bk1/1/10:A/9:A 2bk1/1/11:A/12:A 2bk1/1/12:A/13:A 2bk1/1/13:A/14:A 2bk1/1/14:A/15:A 2bk1/1/15:A/16:A 2bk1/1/16:A/17:A 2bk1/1/17:A/18:A 2bk1/1/18:A/19:A 2bk1/1/19:A/20:A 2bk1/1/1:A/2:A 2bk1/1/1:A/38:A 2bk1/1/20:A/21:A 2bk1/1/21:A/22:A 2bk1/1/22:A/23:A 2bk1/1/23:A/24:A 2bk1/1/24:A/25:A 2bk1/1/25:A/26:A 2bk1/1/26:A/27:A 2bk1/1/27:A/28:A 2bk1/1/28:A/29:A 2bk1/1/29:A/30:A 2bk1/1/2:A/3:A 2bk1/1/30:A/31:A 2bk1/1/31:A/32:A 2bk1/1/32:A/33:A 2bk1/1/33:A/34:A 2bk1/1/34:A/35:A 2bk1/1/35:A/36:A 2bk1/1/36:A/37:A 2bk1/1/37:A/38:A 2bk1/1/3:A/4:A 2bk1/1/4:A/5:A 2bk1/1/5:A/6:A 2bk1/1/6:A/7:A 2bk1/1/7:A/8:A
  • 2bk2/1/8:A/9:A 2bk2/1/10:A/11:A 2bk2/1/10:A/9:A 2bk2/1/11:A/12:A 2bk2/1/12:A/13:A 2bk2/1/13:A/14:A 2bk2/1/14:A/15:A 2bk2/1/15:A/16:A 2bk2/1/16:A/17:A 2bk2/1/17:A/18:A 2bk2/1/18:A/19:A 2bk2/1/19:A/20:A 2bk2/1/1:A/2:A 2bk2/1/1:A/31:A 2bk2/1/20:A/21:A 2bk2/1/21:A/22:A 2bk2/1/22:A/23:A 2bk2/1/23:A/24:A 2bk2/1/24:A/25:A 2bk2/1/25:A/26:A 2bk2/1/26:A/27:A 2bk2/1/27:A/28:A 2bk2/1/28:A/29:A 2bk2/1/29:A/30:A 2bk2/1/2:A/3:A 2bk2/1/30:A/31:A 2bk2/1/3:A/4:A 2bk2/1/4:A/5:A 2bk2/1/5:A/6:A 2bk2/1/6:A/7:A 2bk2/1/7:A/8:A
  • [Back to Home]