1s58/1/8:A/9:A |
| >1s58-a1-m8-cA (length=523) [Search sequence] |
NPVKSMWSEGATFSANSVTCTFSRQFLIPYDPEHHYKVFSPAASSCHNASGKEAKVCTIT
PIMGYSTPWRYLDFNALNLFFSPLEFQHLIENYGSIAPDALTVTISEIAVKDVTDKTGGG
VQVTDSATGRLCMLVDHEYKYPYVLGQGQDTLAPELPIWVYFPPQYAYLTVGDVNTQGIS
GDSKKLASEESAFYVLEHSSFQLLGTGGTATMSYKFPPVPPENLEGCSQHFYEMYNPLYG
SRLGVPDTLGGDPKFRSLTHEDHAIQPQNFMPGPLVNSVSTKTGLSTGTSQNTRISLRPG
PVSQPYHHWDTDKYVTGINAISHGQTTYGNAEDKEYQQGVGRFPNEKEQLKQLQGLNMHT
YFPNKGTQQYTDQIERPLMVGSVWNRRALHYESQLWSKIPNLDDSFKTQFAALGGWGLHQ
PPPQIFLKILPQSGPIGGIKSMGITTLVQYAVGIMTVTMTFKLGPRKATGRWNPQPGVYP
PHAAGHLPYVLYDPTATDAKQHHRHGYEKPEELWTAKSRVHPL |
| >1s58-a1-m9-cA (length=523) [Search sequence] |
NPVKSMWSEGATFSANSVTCTFSRQFLIPYDPEHHYKVFSPAASSCHNASGKEAKVCTIT
PIMGYSTPWRYLDFNALNLFFSPLEFQHLIENYGSIAPDALTVTISEIAVKDVTDKTGGG
VQVTDSATGRLCMLVDHEYKYPYVLGQGQDTLAPELPIWVYFPPQYAYLTVGDVNTQGIS
GDSKKLASEESAFYVLEHSSFQLLGTGGTATMSYKFPPVPPENLEGCSQHFYEMYNPLYG
SRLGVPDTLGGDPKFRSLTHEDHAIQPQNFMPGPLVNSVSTKTGLSTGTSQNTRISLRPG
PVSQPYHHWDTDKYVTGINAISHGQTTYGNAEDKEYQQGVGRFPNEKEQLKQLQGLNMHT
YFPNKGTQQYTDQIERPLMVGSVWNRRALHYESQLWSKIPNLDDSFKTQFAALGGWGLHQ
PPPQIFLKILPQSGPIGGIKSMGITTLVQYAVGIMTVTMTFKLGPRKATGRWNPQPGVYP
PHAAGHLPYVLYDPTATDAKQHHRHGYEKPEELWTAKSRVHPL |
|
| PDB ID |
1s58 (database links:
RCSB PDB
PDBe
PDBj
PDBsum) |
| Title |
The structure of B19 parvovirus capsid |
| Assembly ID |
1 |
| Resolution |
3.5Å |
| Method of structure determination |
X-RAY DIFFRACTION |
| Number of inter-chain contacts |
144 |
| Sequence identity between the two chains |
1.0 |
|
|
Chain 1 |
Chain 2 |
| Model ID |
8 |
9 |
| Chain ID |
A |
A |
| UniProt accession |
Q9PZT0 |
Q9PZT0 |
| Species |
10798 (Human parvovirus B19) |
10798 (Human parvovirus B19) |
|
Switch viewer: [NGL] [JSmol]
|
Dimer structure:
Chain 1 in red;
Chain 2 in blue.
|
Full biological assembly
|
|
| Other dimers with similar sequences and structures |
1s58/1/10:A/6:A 1s58/1/10:A/9:A 1s58/1/11:A/12:A 1s58/1/11:A/15:A 1s58/1/12:A/13:A 1s58/1/13:A/14:A 1s58/1/14:A/15:A 1s58/1/16:A/17:A 1s58/1/16:A/20:A 1s58/1/17:A/18:A 1s58/1/18:A/19:A 1s58/1/19:A/20:A 1s58/1/1:A/2:A 1s58/1/1:A/5:A 1s58/1/21:A/22:A 1s58/1/21:A/25:A 1s58/1/22:A/23:A 1s58/1/23:A/24:A 1s58/1/24:A/25:A 1s58/1/26:A/27:A 1s58/1/26:A/30:A 1s58/1/27:A/28:A 1s58/1/28:A/29:A 1s58/1/29:A/30:A 1s58/1/2:A/3:A 1s58/1/31:A/32:A 1s58/1/31:A/35:A 1s58/1/32:A/33:A 1s58/1/33:A/34:A 1s58/1/34:A/35:A 1s58/1/36:A/37:A 1s58/1/36:A/40:A 1s58/1/37:A/38:A 1s58/1/38:A/39:A 1s58/1/39:A/40:A 1s58/1/3:A/4:A 1s58/1/41:A/42:A 1s58/1/41:A/45:A 1s58/1/42:A/43:A 1s58/1/43:A/44:A 1s58/1/44:A/45:A 1s58/1/46:A/47:A 1s58/1/46:A/50:A 1s58/1/47:A/48:A 1s58/1/48:A/49:A 1s58/1/49:A/50:A 1s58/1/4:A/5:A 1s58/1/51:A/52:A 1s58/1/51:A/55:A 1s58/1/52:A/53:A 1s58/1/53:A/54:A 1s58/1/54:A/55:A 1s58/1/56:A/57:A 1s58/1/56:A/60:A 1s58/1/57:A/58:A 1s58/1/58:A/59:A 1s58/1/59:A/60:A 1s58/1/6:A/7:A 1s58/1/7:A/8:A 6nn3/1/10:A/6:A 6nn3/1/10:A/9:A 6nn3/1/11:A/12:A 6nn3/1/11:A/15:A 6nn3/1/12:A/13:A 6nn3/1/13:A/14:A 6nn3/1/14:A/15:A 6nn3/1/16:A/17:A 6nn3/1/16:A/20:A 6nn3/1/17:A/18:A 6nn3/1/18:A/19:A 6nn3/1/19:A/20:A 6nn3/1/1:A/2:A 6nn3/1/1:A/5:A 6nn3/1/21:A/22:A 6nn3/1/21:A/25:A 6nn3/1/22:A/23:A 6nn3/1/23:A/24:A 6nn3/1/24:A/25:A 6nn3/1/26:A/27:A 6nn3/1/26:A/30:A 6nn3/1/27:A/28:A 6nn3/1/28:A/29:A 6nn3/1/29:A/30:A 6nn3/1/2:A/3:A 6nn3/1/31:A/32:A 6nn3/1/31:A/35:A 6nn3/1/32:A/33:A 6nn3/1/33:A/34:A 6nn3/1/34:A/35:A 6nn3/1/36:A/37:A 6nn3/1/36:A/40:A 6nn3/1/37:A/38:A 6nn3/1/38:A/39:A 6nn3/1/39:A/40:A 6nn3/1/3:A/4:A 6nn3/1/41:A/42:A 6nn3/1/41:A/45:A 6nn3/1/42:A/43:A 6nn3/1/43:A/44:A 6nn3/1/44:A/45:A 6nn3/1/46:A/47:A 6nn3/1/46:A/50:A 6nn3/1/47:A/48:A 6nn3/1/48:A/49:A 6nn3/1/49:A/50:A 6nn3/1/4:A/5:A 6nn3/1/51:A/52:A 6nn3/1/51:A/55:A 6nn3/1/52:A/53:A 6nn3/1/53:A/54:A 6nn3/1/54:A/55:A 6nn3/1/56:A/57:A 6nn3/1/56:A/60:A 6nn3/1/57:A/58:A 6nn3/1/58:A/59:A 6nn3/1/59:A/60:A 6nn3/1/6:A/7:A 6nn3/1/7:A/8:A 6nn3/1/8:A/9:A |
| Other dimers with similar sequences but different poses |
1s58/1/54:A/9:A 1s58/1/10:A/23:A 1s58/1/11:A/20:A 1s58/1/11:A/38:A 1s58/1/12:A/37:A 1s58/1/12:A/47:A 1s58/1/13:A/45:A 1s58/1/13:A/46:A 1s58/1/14:A/29:A 1s58/1/14:A/44:A 1s58/1/15:A/16:A 1s58/1/15:A/28:A 1s58/1/16:A/28:A 1s58/1/17:A/27:A 1s58/1/17:A/52:A 1s58/1/18:A/51:A 1s58/1/18:A/60:A 1s58/1/19:A/39:A 1s58/1/19:A/59:A 1s58/1/1:A/10:A 1s58/1/1:A/23:A 1s58/1/20:A/38:A 1s58/1/21:A/30:A 1s58/1/21:A/43:A 1s58/1/22:A/42:A 1s58/1/24:A/54:A 1s58/1/24:A/9:A 1s58/1/25:A/26:A 1s58/1/25:A/53:A 1s58/1/26:A/53:A 1s58/1/27:A/52:A 1s58/1/29:A/44:A 1s58/1/2:A/22:A 1s58/1/2:A/42:A 1s58/1/30:A/43:A 1s58/1/31:A/40:A 1s58/1/31:A/58:A 1s58/1/32:A/57:A 1s58/1/32:A/7:A 1s58/1/33:A/5:A 1s58/1/33:A/6:A 1s58/1/34:A/49:A 1s58/1/34:A/4:A 1s58/1/35:A/36:A 1s58/1/35:A/48:A 1s58/1/36:A/48:A 1s58/1/37:A/47:A 1s58/1/39:A/59:A 1s58/1/3:A/41:A 1s58/1/3:A/50:A 1s58/1/40:A/58:A 1s58/1/41:A/50:A 1s58/1/45:A/46:A 1s58/1/4:A/49:A 1s58/1/51:A/60:A 1s58/1/55:A/56:A 1s58/1/55:A/8:A 1s58/1/56:A/8:A 1s58/1/57:A/7:A 1s58/1/5:A/6:A 6nn3/1/10:A/23:A 6nn3/1/11:A/20:A 6nn3/1/11:A/38:A 6nn3/1/12:A/37:A 6nn3/1/12:A/47:A 6nn3/1/13:A/45:A 6nn3/1/13:A/46:A 6nn3/1/14:A/29:A 6nn3/1/14:A/44:A 6nn3/1/15:A/16:A 6nn3/1/15:A/28:A 6nn3/1/16:A/28:A 6nn3/1/17:A/27:A 6nn3/1/17:A/52:A 6nn3/1/18:A/51:A 6nn3/1/18:A/60:A 6nn3/1/19:A/39:A 6nn3/1/19:A/59:A 6nn3/1/1:A/10:A 6nn3/1/1:A/23:A 6nn3/1/20:A/38:A 6nn3/1/21:A/30:A 6nn3/1/21:A/43:A 6nn3/1/22:A/42:A 6nn3/1/24:A/54:A 6nn3/1/24:A/9:A 6nn3/1/25:A/26:A 6nn3/1/25:A/53:A 6nn3/1/26:A/53:A 6nn3/1/27:A/52:A 6nn3/1/29:A/44:A 6nn3/1/2:A/22:A 6nn3/1/2:A/42:A 6nn3/1/30:A/43:A 6nn3/1/31:A/40:A 6nn3/1/31:A/58:A 6nn3/1/32:A/57:A 6nn3/1/32:A/7:A 6nn3/1/33:A/5:A 6nn3/1/33:A/6:A 6nn3/1/34:A/49:A 6nn3/1/34:A/4:A 6nn3/1/35:A/36:A 6nn3/1/35:A/48:A 6nn3/1/36:A/48:A 6nn3/1/37:A/47:A 6nn3/1/39:A/59:A 6nn3/1/3:A/41:A 6nn3/1/3:A/50:A 6nn3/1/40:A/58:A 6nn3/1/41:A/50:A 6nn3/1/45:A/46:A 6nn3/1/4:A/49:A 6nn3/1/51:A/60:A 6nn3/1/54:A/9:A 6nn3/1/55:A/56:A 6nn3/1/55:A/8:A 6nn3/1/56:A/8:A 6nn3/1/57:A/7:A 6nn3/1/5:A/6:A
1s58/1/55:A/9:A 1s58/1/10:A/24:A 1s58/1/11:A/16:A 1s58/1/12:A/38:A 1s58/1/13:A/47:A 1s58/1/14:A/45:A 1s58/1/15:A/29:A 1s58/1/17:A/28:A 1s58/1/18:A/52:A 1s58/1/19:A/60:A 1s58/1/1:A/6:A 1s58/1/20:A/39:A 1s58/1/21:A/26:A 1s58/1/22:A/43:A 1s58/1/25:A/54:A 1s58/1/27:A/53:A 1s58/1/2:A/23:A 1s58/1/30:A/44:A 1s58/1/31:A/36:A 1s58/1/32:A/58:A 1s58/1/33:A/7:A 1s58/1/34:A/5:A 1s58/1/35:A/49:A 1s58/1/37:A/48:A 1s58/1/3:A/42:A 1s58/1/40:A/59:A 1s58/1/41:A/46:A 1s58/1/4:A/50:A 1s58/1/51:A/56:A 1s58/1/57:A/8:A 6nn3/1/10:A/24:A 6nn3/1/11:A/16:A 6nn3/1/12:A/38:A 6nn3/1/13:A/47:A 6nn3/1/14:A/45:A 6nn3/1/15:A/29:A 6nn3/1/17:A/28:A 6nn3/1/18:A/52:A 6nn3/1/19:A/60:A 6nn3/1/1:A/6:A 6nn3/1/20:A/39:A 6nn3/1/21:A/26:A 6nn3/1/22:A/43:A 6nn3/1/25:A/54:A 6nn3/1/27:A/53:A 6nn3/1/2:A/23:A 6nn3/1/30:A/44:A 6nn3/1/31:A/36:A 6nn3/1/32:A/58:A 6nn3/1/33:A/7:A 6nn3/1/34:A/5:A 6nn3/1/35:A/49:A 6nn3/1/37:A/48:A 6nn3/1/3:A/42:A 6nn3/1/40:A/59:A 6nn3/1/41:A/46:A 6nn3/1/4:A/50:A 6nn3/1/51:A/56:A 6nn3/1/55:A/9:A 6nn3/1/57:A/8:A |
|