4bdy/1/2:B/2:A |
| >4bdy-a1-m2-cB (length=184) [Search sequence] |
DRPQKPFDKFFIDYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTS
IAIPKVIHSDQGAAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSSGKVERKNSDIKRLLTKLL
VGRPTKWYDLLPVVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLL
QEIR |
| >4bdy-a1-m2-cA (length=368) [Search sequence] |
LDAELDQLLQGHYIKGYPKQYTYFLEDGKVKVSRPEGVKIIPPQSDRQKIVLQAHNLAHT
GREATLLKIANLYWWPNMRKDVVKQLGRCQQCLITNASNKASGPILRPDRPQKPFDKFFI
DYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTSIAIPKVIHSDQG
AAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSSGKVERKNSDIKRLLTKLLVGRPTKWYDLLP
VVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLLQEIRTSLYHPST
PPASSRSWSPVVGQLVQERVARPASLRPRWHKPSTVLKVLNPRTVVILDHLGNNRTVSID
NLKPTSHQ |
|
| PDB ID |
4bdy (database links:
RCSB PDB
PDBe
PDBj
PDBsum) |
| Title |
PFV intasome with inhibitor XZ-89 |
| Assembly ID |
1 |
| Resolution |
2.52Å |
| Method of structure determination |
X-RAY DIFFRACTION |
| Number of inter-chain contacts |
85 |
| Sequence identity between the two chains |
1.0 |
| PubMed citation |
23075516 |
|
|
Chain 1 |
Chain 2 |
| Model ID |
2 |
2 |
| Chain ID |
B |
A |
| UniProt accession |
P14350 |
P14350 |
| Species |
11963 (Human spumaretrovirus) |
11963 (Human spumaretrovirus) |
| Function annotation |
BioLiP:4bdyA |
|
Switch viewer: [NGL] [JSmol]
|
Dimer structure:
Chain 1 in red;
Chain 2 in blue.
|
Full biological assembly
|
|
| Other dimers with similar sequences and structures |
3l2q/1/1:B/1:A 3l2q/1/2:B/2:A 3l2r/1/1:B/1:A 3l2r/1/2:B/2:A 3l2u/1/1:B/1:A 3l2u/1/2:B/2:A 3l2v/1/1:B/1:A 3l2v/1/2:B/2:A 3l2w/1/1:B/1:A 3l2w/1/2:B/2:A 3os0/1/1:B/1:A 3os0/1/2:B/2:A 3os1/1/1:B/1:A 3os1/1/2:B/2:A 3os2/1/1:B/1:A 3os2/1/2:B/2:A 3oy9/1/1:B/1:A 3oy9/1/2:B/2:A 3oya/1/1:B/1:A 3oya/1/2:B/2:A 3oyb/1/1:B/1:A 3oyb/1/2:B/2:A 3oyc/1/1:B/1:A 3oyc/1/2:B/2:A 3oyd/1/1:B/1:A 3oyd/1/2:B/2:A 3oye/1/1:B/1:A 3oye/1/2:B/2:A 3oyf/1/1:B/1:A 3oyf/1/2:B/2:A 3oyg/1/1:B/1:A 3oyg/1/2:B/2:A 3oyh/1/1:B/1:A 3oyh/1/2:B/2:A 3oyi/1/1:B/1:A 3oyi/1/2:B/2:A 3oyj/1/1:B/1:A 3oyj/1/2:B/2:A 3oyk/1/1:B/1:A 3oyk/1/2:B/2:A 3oyl/1/1:B/1:A 3oyl/1/2:B/2:A 3oym/1/1:B/1:A 3oym/1/2:B/2:A 3oyn/1/1:B/1:A 3oyn/1/2:B/2:A 3s3m/1/1:B/1:A 3s3m/1/2:B/2:A 3s3n/1/1:B/1:A 3s3n/1/2:B/2:A 3s3o/1/1:B/1:A 3s3o/1/2:B/2:A 4bac/1/1:B/1:A 4bac/1/2:B/2:A 4bdy/1/1:B/1:A 4bdz/1/1:B/1:A 4bdz/1/2:B/2:A 4be0/1/1:B/1:A 4be0/1/2:B/2:A 4be1/1/1:B/1:A 4be1/1/2:B/2:A 4be2/1/1:B/1:A 4be2/1/2:B/2:A 4e7h/1/1:B/1:A 4e7h/1/2:B/2:A 4e7i/1/1:B/1:A 4e7i/1/2:B/2:A 4e7j/1/1:B/1:A 4e7j/1/2:B/2:A 4e7k/1/1:B/1:A 4e7k/1/2:B/2:A 4e7l/1/1:B/1:A 4e7l/1/2:B/2:A 4ikf/1/1:B/1:A 4ikf/1/2:B/2:A 4ztf/1/1:B/1:A 4ztf/1/2:B/2:A 4ztj/1/1:B/1:A 4ztj/1/2:B/2:A 5frm/1/1:B/1:A 5frm/1/2:B/2:A 5frn/1/1:B/1:A 5frn/1/2:B/2:A 5fro/1/1:B/1:A 5fro/1/2:B/2:A 5mma/1/1:B/1:A 5mma/1/2:B/2:A 5mmb/1/1:B/1:A 5mmb/1/2:B/2:A 5no1/1/1:B/1:A 5no1/1/2:B/2:A 5uop/1/1:B/1:A 5uop/1/2:B/2:A 5uoq/1/1:B/1:A 5uoq/1/2:B/2:A 6rny/1/1:L/1:K 6rny/1/1:P/1:O 7adu/1/1:B/1:A 7adu/1/2:B/2:A 7adv/1/1:B/1:A 7adv/1/2:B/2:A |
| Other dimers with similar sequences but different poses |
2x6s/3/1:B/1:A 2x6n/1/1:B/1:A 2x6n/2/1:E/1:F 2x6n/3/1:D/1:C 2x6s/1/1:F/1:E 2x6s/2/1:D/1:C 2x74/1/1:D/1:C 2x74/2/1:B/1:A 2x74/3/1:F/1:E 2x78/1/1:A/1:B 2x78/2/1:C/2:C
4be2/1/1:A/2:A 3l2q/1/1:A/2:A 3l2r/1/1:A/2:A 3l2u/1/1:A/2:A 3l2v/1/1:A/2:A 3l2w/1/1:A/2:A 3os0/1/1:A/2:A 3os1/1/1:A/2:A 3os2/1/1:A/2:A 3oy9/1/1:A/2:A 3oya/1/1:A/2:A 3oyb/1/1:A/2:A 3oyc/1/1:A/2:A 3oyd/1/1:A/2:A 3oye/1/1:A/2:A 3oyf/1/1:A/2:A 3oyg/1/1:A/2:A 3oyh/1/1:A/2:A 3oyi/1/1:A/2:A 3oyj/1/1:A/2:A 3oyk/1/1:A/2:A 3oyl/1/1:A/2:A 3oym/1/1:A/2:A 3oyn/1/1:A/2:A 3s3m/1/1:A/2:A 3s3n/1/1:A/2:A 3s3o/1/1:A/2:A 4bac/1/1:A/2:A 4bdy/1/1:A/2:A 4bdz/1/1:A/2:A 4be0/1/1:A/2:A 4be1/1/1:A/2:A 4e7h/1/1:A/2:A 4e7i/1/1:A/2:A 4e7j/1/1:A/2:A 4e7k/1/1:A/2:A 4e7l/1/1:A/2:A 4ikf/1/1:A/2:A 4ztf/1/1:A/2:A 4ztj/1/1:A/2:A 5frm/1/1:A/2:A 5frn/1/1:A/2:A 5fro/1/1:A/2:A 5mma/1/1:A/2:A 5mmb/1/1:A/2:A 5no1/1/1:A/2:A 5uop/1/1:A/2:A 5uoq/1/1:A/2:A 6rny/1/1:K/1:O 7adu/1/1:A/2:A 7adv/1/1:A/2:A |
|