4yq1/2/2:A/3:A |
| >4yq1-a2-m2-cA (length=244) [Search sequence] |
GLVPRGSHMWIGVISLFPEMFKAITEFGVTGRAVKHNLLKVECWNPRDFTFDKHKTVDDR
PYGGGPGMLMMVQPLRDAIHTAKAAAGEGAKVIYLSPQGRKLDQGGVTELAQNQKLILVC
GRYEGIDERLIQTEIDEEWSIGDYVLTGGELPAMTLIDAVARFIPGVLGFADGLLDCPHY
TRPEVLEGLTVPPVLMSGHHEEIRKWRLKQSLQRTWLRRPELLEGLALTDEQRKLLKEAQ
AEHN |
| >4yq1-a2-m3-cA (length=244) [Search sequence] |
GLVPRGSHMWIGVISLFPEMFKAITEFGVTGRAVKHNLLKVECWNPRDFTFDKHKTVDDR
PYGGGPGMLMMVQPLRDAIHTAKAAAGEGAKVIYLSPQGRKLDQGGVTELAQNQKLILVC
GRYEGIDERLIQTEIDEEWSIGDYVLTGGELPAMTLIDAVARFIPGVLGFADGLLDCPHY
TRPEVLEGLTVPPVLMSGHHEEIRKWRLKQSLQRTWLRRPELLEGLALTDEQRKLLKEAQ
AEHN |
|
| PDB ID |
4yq1 (database links:
RCSB PDB
PDBe
PDBj
PDBsum) |
| Title |
Crystal structure of TrmD, a M1G37 tRNA Methyltransferase with SAM-competitive compounds |
| Assembly ID |
2 |
| Resolution |
2Å |
| Method of structure determination |
X-RAY DIFFRACTION |
| Number of inter-chain contacts |
58 |
| Sequence identity between the two chains |
1.0 |
| PubMed citation |
|
|
|
Chain 1 |
Chain 2 |
| Model ID |
2 |
3 |
| Chain ID |
A |
A |
| UniProt accession |
P43912 |
P43912 |
| Species |
71421 (Haemophilus influenzae Rd KW20) |
71421 (Haemophilus influenzae Rd KW20) |
| Function annotation |
BioLiP:4yq1A |
BioLiP:4yq1A |
|
Switch viewer: [NGL] [JSmol]
|
Dimer structure:
Chain 1 in red;
Chain 2 in blue.
|
Full biological assembly
|
|
| Other dimers with similar sequences and structures |
4yq1/2/1:A/2:A 4yq1/2/1:A/3:A |
| Other dimers with similar sequences but different poses |
4yq4/1/1:A/2:A 1uaj/1/1:A/2:A 1uak/1/1:A/2:A 1ual/1/1:A/2:A 1uam/1/1:A/2:A 3axz/1/1:A/2:A 4mcb/1/1:A/1:B 4mcc/1/1:A/1:B 4mcd/2/1:A/2:A 4ypw/1/1:A/2:A 4ypx/1/1:A/2:A 4ypy/1/1:A/2:A 4ypz/1/1:A/2:A 4yq0/1/1:A/2:A 4yq1/1/1:A/4:A 4yq2/1/1:A/2:A 4yq3/1/1:A/2:A 4yq5/1/1:A/2:A 4yq6/1/1:A/2:A 4yq7/1/1:A/2:A 4yq8/1/1:A/2:A 4yq9/1/1:A/2:A 4yqa/1/1:A/2:A 4yqb/1/1:A/2:A 4yqc/1/1:A/2:A 4yqd/1/1:A/2:A 4yqg/1/1:A/2:A 4yqi/1/1:A/2:A 4yqj/1/1:A/2:A 4yqk/1/1:A/2:A 4yql/1/1:A/2:A 4yqn/1/1:A/2:A 4yqo/1/1:A/2:A 4yqp/1/1:A/2:A 4yqq/1/1:A/2:A 4yqr/1/1:A/2:A 4yqs/1/1:A/2:A 4yqt/1/1:A/2:A 4yvg/1/1:A/2:A 4yvh/1/1:A/2:A 4yvi/1/1:A/1:B 4yvj/1/1:A/1:B 4yvk/1/1:A/1:B 5d9f/1/1:A/2:A |
|