5sbf/1/2:A/3:A |
| >5sbf-a1-m2-cA (length=348) [Search sequence] |
AMSLENVAFNVVNKGHFDGQQGEVPVSIINNTVYTKVDGVDVELFENKTTLPVNVAFELW
AKRNIKPVPEVKILNNLGVDIAANTVIWDYKRDAPAHISTIGVCSMTDIAKKPTETICAP
LTVFFDGRVDGQVDLFRNARNGVLITEGSVKGLQPSVGPKQASLNGVTLIGEAVKTQFNY
YKKVDGVVQQLPETYFTQSRNLQEFKPRSQMEIDFLELAMDEFIERYKLEGYAFEHIVYG
DFSHSQLGGLHLLIGLAKRFKESPFELEDFIPMDSTVKNYFITDAQTGSSKCVCSVIDLL
LDDFVEIIKSQDLSVVSKVVKVTIDYTEISFMLWCKDGHVETFYPKLQ |
| >5sbf-a1-m3-cA (length=348) [Search sequence] |
AMSLENVAFNVVNKGHFDGQQGEVPVSIINNTVYTKVDGVDVELFENKTTLPVNVAFELW
AKRNIKPVPEVKILNNLGVDIAANTVIWDYKRDAPAHISTIGVCSMTDIAKKPTETICAP
LTVFFDGRVDGQVDLFRNARNGVLITEGSVKGLQPSVGPKQASLNGVTLIGEAVKTQFNY
YKKVDGVVQQLPETYFTQSRNLQEFKPRSQMEIDFLELAMDEFIERYKLEGYAFEHIVYG
DFSHSQLGGLHLLIGLAKRFKESPFELEDFIPMDSTVKNYFITDAQTGSSKCVCSVIDLL
LDDFVEIIKSQDLSVVSKVVKVTIDYTEISFMLWCKDGHVETFYPKLQ |
|
| PDB ID |
5sbf (database links:
RCSB PDB
PDBe
PDBj
PDBsum) |
| Title |
PanDDA analysis group deposition of ground-state model of SARS-CoV-2 NendoU |
| Assembly ID |
1 |
| Resolution |
1.64Å |
| Method of structure determination |
X-RAY DIFFRACTION |
| Number of inter-chain contacts |
89 |
| Sequence identity between the two chains |
1.0 |
|
|
Chain 1 |
Chain 2 |
| Model ID |
2 |
3 |
| Chain ID |
A |
A |
| UniProt accession |
P0DTD1 |
P0DTD1 |
| Species |
2697049 (Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2) |
2697049 (Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2) |
|
Switch viewer: [NGL] [JSmol]
|
Dimer structure:
Chain 1 in red;
Chain 2 in blue.
|
Full biological assembly
|
|
| Other dimers with similar sequences and structures |
5s6x/1/1:A/2:A 5s6x/1/1:A/3:A 5s6x/1/2:A/3:A 5s6x/1/4:B/5:B 5s6x/1/4:B/6:B 5s6x/1/5:B/6:B 5s6y/1/1:A/2:A 5s6y/1/1:A/3:A 5s6y/1/2:A/3:A 5s6y/1/4:B/5:B 5s6y/1/4:B/6:B 5s6y/1/5:B/6:B 5s6z/1/1:A/2:A 5s6z/1/1:A/3:A 5s6z/1/2:A/3:A 5s6z/1/4:B/5:B 5s6z/1/4:B/6:B 5s6z/1/5:B/6:B 5s70/1/1:A/2:A 5s70/1/1:A/3:A 5s70/1/2:A/3:A 5s70/1/4:B/5:B 5s70/1/4:B/6:B 5s70/1/5:B/6:B 5s71/1/1:A/2:A 5s71/1/1:A/3:A 5s71/1/2:A/3:A 5s71/1/4:B/5:B 5s71/1/4:B/6:B 5s71/1/5:B/6:B 5s72/1/1:A/2:A 5s72/1/1:A/3:A 5s72/1/2:A/3:A 5s72/1/4:B/5:B 5s72/1/4:B/6:B 5s72/1/5:B/6:B 5sa4/1/1:A/2:A 5sa4/1/1:A/3:A 5sa4/1/2:A/3:A 5sa4/1/4:B/5:B 5sa4/1/4:B/6:B 5sa4/1/5:B/6:B 5sa5/1/1:A/2:A 5sa5/1/1:A/3:A 5sa5/1/2:A/3:A 5sa5/1/4:B/5:B 5sa5/1/4:B/6:B 5sa5/1/5:B/6:B 5sa6/1/1:A/2:A 5sa6/1/1:A/3:A 5sa6/1/2:A/3:A 5sa6/1/4:B/5:B 5sa6/1/4:B/6:B 5sa6/1/5:B/6:B 5sa7/1/1:A/2:A 5sa7/1/1:A/3:A 5sa7/1/2:A/3:A 5sa7/1/4:B/5:B 5sa7/1/4:B/6:B 5sa7/1/5:B/6:B 5sa8/1/1:A/2:A 5sa8/1/1:A/3:A 5sa8/1/2:A/3:A 5sa8/1/4:B/5:B 5sa8/1/4:B/6:B 5sa8/1/5:B/6:B 5sa9/1/1:A/2:A 5sa9/1/1:A/3:A 5sa9/1/2:A/3:A 5sa9/1/4:B/5:B 5sa9/1/4:B/6:B 5sa9/1/5:B/6:B 5saa/1/1:A/2:A 5saa/1/1:A/3:A 5saa/1/2:A/3:A 5saa/1/4:B/5:B 5saa/1/4:B/6:B 5saa/1/5:B/6:B 5sab/1/1:A/2:A 5sab/1/1:A/3:A 5sab/1/2:A/3:A 5sab/1/4:B/5:B 5sab/1/4:B/6:B 5sab/1/5:B/6:B 5sac/1/1:A/2:A 5sac/1/1:A/3:A 5sac/1/2:A/3:A 5sac/1/4:B/5:B 5sac/1/4:B/6:B 5sac/1/5:B/6:B 5sad/1/1:A/2:A 5sad/1/1:A/3:A 5sad/1/2:A/3:A 5sad/1/4:B/5:B 5sad/1/4:B/6:B 5sad/1/5:B/6:B 5sae/1/1:A/2:A 5sae/1/1:A/3:A 5sae/1/2:A/3:A 5sae/1/4:B/5:B 5sae/1/4:B/6:B 5sae/1/5:B/6:B 5saf/1/1:A/2:A 5saf/1/1:A/3:A 5saf/1/2:A/3:A 5saf/1/4:B/5:B 5saf/1/4:B/6:B 5saf/1/5:B/6:B 5sag/1/1:A/2:A 5sag/1/1:A/3:A 5sag/1/2:A/3:A 5sag/1/4:B/5:B 5sag/1/4:B/6:B 5sag/1/5:B/6:B 5sah/1/1:A/2:A 5sah/1/1:A/3:A 5sah/1/2:A/3:A 5sah/1/4:B/5:B 5sah/1/4:B/6:B 5sah/1/5:B/6:B 5sai/1/1:A/2:A 5sai/1/1:A/3:A 5sai/1/2:A/3:A 5sai/1/4:B/5:B 5sai/1/4:B/6:B 5sai/1/5:B/6:B 5sbf/1/1:A/2:A 5sbf/1/1:A/3:A 5sbf/1/4:B/5:B 5sbf/1/4:B/6:B 5sbf/1/5:B/6:B 6vww/1/1:A/2:A 6vww/1/1:A/3:A 6vww/1/1:B/2:B 6vww/1/1:B/3:B 6vww/1/2:A/3:A 6vww/1/2:B/3:B 6w01/1/1:A/2:A 6w01/1/1:A/3:A 6w01/1/1:B/2:B 6w01/1/1:B/3:B 6w01/1/2:A/3:A 6w01/1/2:B/3:B 6wlc/1/1:A/2:A 6wlc/1/1:A/3:A 6wlc/1/1:B/2:B 6wlc/1/1:B/3:B 6wlc/1/2:A/3:A 6wlc/1/2:B/3:B 6wxc/1/1:A/2:A 6wxc/1/1:A/3:A 6wxc/1/1:B/2:B 6wxc/1/1:B/3:B 6wxc/1/2:A/3:A 6wxc/1/2:B/3:B 6x1b/1/1:A/2:A 6x1b/1/1:A/3:A 6x1b/1/1:B/2:B 6x1b/1/1:B/3:B 6x1b/1/2:A/3:A 6x1b/1/2:B/3:B 6x4i/1/1:A/2:A 6x4i/1/1:A/3:A 6x4i/1/1:B/2:B 6x4i/1/1:B/3:B 6x4i/1/2:A/3:A 6x4i/1/2:B/3:B 6xdh/1/1:A/2:A 6xdh/1/1:A/4:A 6xdh/1/2:A/4:A 6xdh/2/1:B/3:B 6xdh/2/1:B/5:B 6xdh/2/3:B/5:B 7k0r/1/1:A/1:B 7k0r/1/1:A/1:C 7k0r/1/1:B/1:C 7k0r/1/1:D/1:E 7k0r/1/1:D/1:F 7k0r/1/1:E/1:F 7k1l/1/1:A/2:A 7k1l/1/1:A/3:A 7k1l/1/1:B/2:B 7k1l/1/1:B/3:B 7k1l/1/2:A/3:A 7k1l/1/2:B/3:B 7k1o/1/1:A/1:C 7k1o/1/1:A/2:B 7k1o/1/1:B/2:C 7k1o/1/1:C/2:B 7k1o/1/2:A/1:B 7k1o/1/2:A/2:C 7k9p/1/1:A/2:A 7k9p/1/1:A/3:A 7k9p/1/2:A/3:A 7k9p/1/4:B/5:B 7k9p/1/4:B/6:B 7k9p/1/5:B/6:B 7keg/1/1:A/2:A 7keg/1/1:A/3:A 7keg/1/2:A/3:A 7keg/1/4:B/5:B 7keg/1/4:B/6:B 7keg/1/5:B/6:B 7keh/1/1:A/2:A 7keh/1/1:A/3:A 7keh/1/2:A/3:A 7keh/1/4:B/5:B 7keh/1/4:B/6:B 7keh/1/5:B/6:B 7kf4/1/1:A/1:D 7kf4/1/1:A/1:E 7kf4/1/1:B/1:C 7kf4/1/1:B/1:F 7kf4/1/1:C/1:F 7kf4/1/1:D/1:E 7me0/1/1:A/1:D 7me0/1/1:A/1:E 7me0/1/1:B/1:C 7me0/1/1:B/1:F 7me0/1/1:C/1:F 7me0/1/1:D/1:E 7n06/1/1:A/1:B 7n06/1/1:A/1:C 7n06/1/1:B/1:C 7n06/1/1:D/1:E 7n06/1/1:D/1:F 7n06/1/1:E/1:F 7n33/1/1:A/1:B 7n33/1/1:A/1:C 7n33/1/1:B/1:C 7n33/1/1:D/1:E 7n33/1/1:D/1:F 7n33/1/1:E/1:F 7n7r/1/1:A/2:A 7n7r/1/1:A/3:A 7n7r/1/2:A/3:A 7n7r/1/4:B/5:B 7n7r/1/4:B/6:B 7n7r/1/5:B/6:B 7n7u/1/1:A/2:A 7n7u/1/1:A/3:A 7n7u/1/2:A/3:A 7n7u/1/4:B/5:B 7n7u/1/4:B/6:B 7n7u/1/5:B/6:B 7n7w/1/1:A/2:A 7n7w/1/1:A/3:A 7n7w/1/2:A/3:A 7n7w/1/4:B/5:B 7n7w/1/4:B/6:B 7n7w/1/5:B/6:B 7n7y/1/1:A/2:A 7n7y/1/1:A/3:A 7n7y/1/2:A/3:A 7n7y/1/4:B/5:B 7n7y/1/4:B/6:B 7n7y/1/5:B/6:B 7n83/1/1:A/2:A 7n83/1/1:A/3:A 7n83/1/2:A/3:A 7n83/1/4:B/5:B 7n83/1/4:B/6:B 7n83/1/5:B/6:B 7rb0/1/1:A/1:C 7rb0/1/1:A/1:E 7rb0/1/1:B/1:D 7rb0/1/1:B/1:F 7rb0/1/1:C/1:E 7rb0/1/1:D/1:F 7rb2/1/1:A/1:D 7rb2/1/1:A/1:E 7rb2/1/1:B/1:C 7rb2/1/1:B/1:F 7rb2/1/1:C/1:F 7rb2/1/1:D/1:E 7tj2/1/1:B/1:A 7tj2/1/1:B/1:C 7tj2/1/1:C/1:A 7tj2/1/1:E/1:F 7tqv/1/1:B/1:A 7tqv/1/1:B/1:C 7tqv/1/1:C/1:A 7tqv/1/1:D/1:E 7tqv/1/1:D/1:F 7tqv/1/1:E/1:F |
| Other dimers with similar sequences but different poses |
6wlc/1/2:A/3:B 5s6x/1/1:A/5:B 5s6x/1/2:A/6:B 5s6x/1/3:A/4:B 5s6y/1/1:A/5:B 5s6y/1/2:A/6:B 5s6y/1/3:A/4:B 5s6z/1/1:A/5:B 5s6z/1/2:A/6:B 5s6z/1/3:A/4:B 5s70/1/1:A/5:B 5s70/1/2:A/6:B 5s70/1/3:A/4:B 5s71/1/1:A/5:B 5s71/1/2:A/6:B 5s71/1/3:A/4:B 5s72/1/1:A/5:B 5s72/1/2:A/6:B 5s72/1/3:A/4:B 5sa4/1/1:A/5:B 5sa4/1/2:A/6:B 5sa4/1/3:A/4:B 5sa5/1/1:A/5:B 5sa5/1/2:A/6:B 5sa5/1/3:A/4:B 5sa6/1/1:A/5:B 5sa6/1/2:A/6:B 5sa6/1/3:A/4:B 5sa7/1/1:A/5:B 5sa7/1/2:A/6:B 5sa7/1/3:A/4:B 5sa8/1/1:A/5:B 5sa8/1/2:A/6:B 5sa8/1/3:A/4:B 5sa9/1/1:A/5:B 5sa9/1/2:A/6:B 5sa9/1/3:A/4:B 5saa/1/1:A/5:B 5saa/1/2:A/6:B 5saa/1/3:A/4:B 5sab/1/1:A/5:B 5sab/1/2:A/6:B 5sab/1/3:A/4:B 5sac/1/1:A/5:B 5sac/1/2:A/6:B 5sac/1/3:A/4:B 5sad/1/1:A/5:B 5sad/1/2:A/6:B 5sad/1/3:A/4:B 5sae/1/1:A/5:B 5sae/1/2:A/6:B 5sae/1/3:A/4:B 5saf/1/1:A/5:B 5saf/1/2:A/6:B 5saf/1/3:A/4:B 5sag/1/1:A/5:B 5sag/1/2:A/6:B 5sag/1/3:A/4:B 5sah/1/1:A/5:B 5sah/1/2:A/6:B 5sah/1/3:A/4:B 5sai/1/1:A/5:B 5sai/1/2:A/6:B 5sai/1/3:A/4:B 5sbf/1/1:A/5:B 5sbf/1/2:A/6:B 5sbf/1/3:A/4:B 6vww/1/1:A/2:B 6vww/1/1:B/3:A 6vww/1/2:A/3:B 6w01/1/1:A/3:B 6w01/1/1:B/2:A 6w01/1/2:B/3:A 6wlc/1/1:A/2:B 6wlc/1/1:B/3:A 6wxc/1/1:B/2:A 6wxc/1/2:B/3:A 6wxc/1/3:B/1:A 6x1b/1/1:B/3:A 6x1b/1/2:B/1:A 6x1b/1/3:B/2:A 6x4i/1/1:B/3:A 6x4i/1/2:B/1:A 6x4i/1/3:B/2:A 7k0r/1/1:A/1:D 7k0r/1/1:B/1:F 7k0r/1/1:C/1:E 7k1l/1/1:A/2:B 7k1l/1/1:B/3:A 7k1l/1/2:A/3:B 7k1o/1/1:A/2:C 7k1o/1/1:B/2:B 7k1o/1/2:A/1:C 7k9p/1/1:A/5:B 7k9p/1/2:A/6:B 7k9p/1/3:A/4:B 7keg/1/1:A/5:B 7keg/1/2:A/6:B 7keg/1/3:A/4:B 7keh/1/1:A/6:B 7keh/1/2:A/4:B 7keh/1/3:A/5:B 7kf4/1/1:A/1:F 7kf4/1/1:B/1:E 7kf4/1/1:C/1:D 7me0/1/1:A/1:F 7me0/1/1:B/1:E 7me0/1/1:C/1:D 7n06/1/1:A/1:D 7n06/1/1:B/1:F 7n06/1/1:C/1:E 7n33/1/1:A/1:D 7n33/1/1:B/1:F 7n33/1/1:C/1:E 7n7r/1/1:A/5:B 7n7r/1/2:A/6:B 7n7r/1/3:A/4:B 7n7u/1/1:A/5:B 7n7u/1/2:A/6:B 7n7u/1/3:A/4:B 7n7w/1/1:A/5:B 7n7w/1/2:A/6:B 7n7w/1/3:A/4:B 7n7y/1/1:A/5:B 7n7y/1/2:A/6:B 7n7y/1/3:A/4:B 7n83/1/1:A/5:B 7n83/1/2:A/6:B 7n83/1/3:A/4:B 7rb0/1/1:A/1:F 7rb0/1/1:B/1:C 7rb0/1/1:D/1:E 7rb2/1/1:A/1:F 7rb2/1/1:B/1:E 7rb2/1/1:C/1:D 7tj2/1/1:B/1:F 7tj2/1/1:C/1:E 7tj2/1/1:D/1:A 7tqv/1/1:B/1:F 7tqv/1/1:C/1:E 7tqv/1/1:D/1:A
7rb0/1/1:E/1:F 7rb0/1/1:A/1:B 7rb0/1/1:C/1:D |
|