6cfg/1/3:A/2:A

Sequences
>6cfg-a1-m3-cA (length=324) [Search sequence]
DPGDQICIGYHANNSTEQVDTIMEKNVTVTHAQDILEKKHNGKLCDLDGVKPLILRDCSV
AGWLLGNPMCDEFINVPEWSYIVEKANPVNDLCYPGDFNDYEELKHLLSRINHFEKIQII
PKSSWSSHEASLGVSSACPYQGKSSFFRNVVWLIKKNSTYPTIKRSYNNTNQEDLLVLWG
IHHPNDAAEQTKLYQNPTTYISVGTSTLNQRLVPRIATRSKVNGQSGRMEFFWTILKPND
AINFESNGNFIAPEYAYKIVKKGDSTIMKSELEYGNCNTKCQTPMGAINSSMPFHNIHPL
TIGECPKYVKSNRLVLATGLRNSP
>6cfg-a1-m2-cA (length=324) [Search sequence]
DPGDQICIGYHANNSTEQVDTIMEKNVTVTHAQDILEKKHNGKLCDLDGVKPLILRDCSV
AGWLLGNPMCDEFINVPEWSYIVEKANPVNDLCYPGDFNDYEELKHLLSRINHFEKIQII
PKSSWSSHEASLGVSSACPYQGKSSFFRNVVWLIKKNSTYPTIKRSYNNTNQEDLLVLWG
IHHPNDAAEQTKLYQNPTTYISVGTSTLNQRLVPRIATRSKVNGQSGRMEFFWTILKPND
AINFESNGNFIAPEYAYKIVKKGDSTIMKSELEYGNCNTKCQTPMGAINSSMPFHNIHPL
TIGECPKYVKSNRLVLATGLRNSP
Structure information
PDB ID 6cfg (database links: RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum)
Title Crystal structure of the A/Vietnam/1203/2004 (H5N1) influenza virus hemagglutinin in complex with small molecule JNJ4796
Assembly ID 1
Resolution 2.32Å
Method of structure determination X-RAY DIFFRACTION
Number of inter-chain contacts 37
Sequence identity between the two chains 1.0
PubMed citation 30846569
Chain information
Chain 1 Chain 2
Model ID 3 2
Chain ID A A
UniProt accession Q5EP31 Q5EP31
Species 284218 (Influenza A virus (A/Viet Nam/1203/2004(H5N1))) 284218 (Influenza A virus (A/Viet Nam/1203/2004(H5N1)))
Function annotation BioLiP:6cfgA BioLiP:6cfgA
3D structure
Switch viewer: [NGL] [JSmol]
Dimer structure: Chain 1 in red; Chain 2 in blue.
Download: 6cfg-a1-m3-cA_6cfg-a1-m2-cA.pdb.gz
Full biological assembly
Download: 6cfg-assembly1.cif.gz
Similar dimers
Other dimers with similar sequences and structures 1jsm/2/1:A/2:A 1jsm/2/1:A/3:A 1jsm/2/2:A/3:A 1jso/2/1:A/2:A 1jso/2/1:A/3:A 1jso/2/2:A/3:A 2fk0/1/1:A/1:C 2fk0/1/1:E/1:A 2fk0/1/1:E/1:C 2fk0/2/1:G/1:I 2fk0/2/1:K/1:G 2fk0/2/1:K/1:I 2fk0/3/1:M/2:M 2fk0/3/3:M/1:M 2fk0/3/3:M/2:M 2fk0/4/1:O/4:O 2fk0/4/5:O/1:O 2fk0/4/5:O/4:O 2fk0/5/1:Q/6:Q 2fk0/5/7:Q/1:Q 2fk0/5/7:Q/6:Q 2ibx/1/1:A/1:C 2ibx/1/1:A/1:E 2ibx/1/1:C/1:E 3fku/1/1:A/1:C 3fku/1/1:A/1:E 3fku/1/1:C/1:E 3fku/2/1:G/1:I 3fku/2/1:G/1:K 3fku/2/1:I/1:K 3gbm/1/1:A/2:A 3gbm/1/3:A/1:A 3gbm/1/3:A/2:A 3gbm/2/1:C/4:C 3gbm/2/5:C/1:C 3gbm/2/5:C/4:C 3s11/1/1:C/1:A 3s11/1/1:E/1:A 3s11/1/1:E/1:C 3s12/1/1:A/2:A 3s12/1/3:A/1:A 3s12/1/3:A/2:A 3s13/1/1:A/2:A 3s13/1/3:A/1:A 3s13/1/3:A/2:A 3znk/1/1:A/1:C 3znk/1/1:A/1:E 3znk/1/1:C/1:E 3znl/1/1:A/1:C 3znl/1/1:A/1:E 3znl/1/1:C/1:E 3znm/1/1:A/1:C 3znm/1/1:A/1:E 3znm/1/1:C/1:E 3zp0/1/1:E/2:E 3zp0/1/1:E/3:E 3zp0/1/2:E/3:E 3zp1/1/1:E/2:E 3zp1/1/1:E/3:E 3zp1/1/2:E/3:E 3zp2/1/1:E/2:E 3zp2/1/1:E/3:E 3zp2/1/2:E/3:E 3zp3/1/1:E/2:E 3zp3/1/1:E/3:E 3zp3/1/2:E/3:E 3zp6/1/1:E/2:E 3zp6/1/1:E/3:E 3zp6/1/2:E/3:E 3zpa/1/1:E/2:E 3zpa/1/1:E/3:E 3zpa/1/2:E/3:E 3zpb/1/1:E/2:E 3zpb/1/1:E/3:E 3zpb/1/2:E/3:E 4bgw/1/1:A/2:A 4bgw/1/1:A/3:A 4bgw/1/2:A/3:A 4bgx/1/1:A/2:A 4bgx/1/1:A/3:A 4bgx/1/2:A/3:A 4bgy/1/1:A/2:A 4bgy/1/1:A/3:A 4bgy/1/2:A/3:A 4bgz/1/1:A/1:C 4bgz/1/1:A/1:E 4bgz/1/1:C/1:E 4bh0/1/1:A/1:C 4bh0/1/1:A/1:E 4bh0/1/1:C/1:E 4bh1/1/1:A/1:C 4bh1/1/1:A/1:E 4bh1/1/1:C/1:E 4bh2/1/1:A/2:A 4bh2/1/1:A/3:A 4bh2/1/2:A/3:A 4bh3/1/1:A/2:A 4bh3/1/1:A/3:A 4bh3/1/2:A/3:A 4bh4/1/1:A/2:A 4bh4/1/1:A/3:A 4bh4/1/2:A/3:A 4cqp/1/1:A/2:A 4cqp/1/1:A/3:A 4cqp/1/2:A/3:A 4cqq/1/1:A/2:A 4cqq/1/1:A/3:A 4cqq/1/2:A/3:A 4cqr/1/1:A/2:A 4cqr/1/1:A/3:A 4cqr/1/2:A/3:A 4cqs/1/1:A/2:A 4cqs/1/1:A/3:A 4cqs/1/2:A/3:A 4cqu/1/1:A/2:A 4cqu/1/1:A/3:A 4cqu/1/2:A/3:A 4cqv/1/1:A/1:C 4cqv/1/1:A/1:E 4cqv/1/1:C/1:E 4cqw/1/1:C/1:A 4cqw/1/1:C/1:E 4cqw/1/1:E/1:A 4cqx/1/1:A/1:E 4cqx/1/1:C/1:A 4cqx/1/1:C/1:E 4cqy/1/1:C/1:A 4cqy/1/1:C/1:E 4cqy/1/1:E/1:A 4cqz/1/1:A/2:A 4cqz/1/1:A/3:A 4cqz/1/2:A/3:A 4cr0/1/1:A/2:A 4cr0/1/1:A/3:A 4cr0/1/2:A/3:A 4fqi/1/1:A/2:A 4fqi/1/3:A/1:A 4fqi/1/3:A/2:A 4juk/1/1:A/2:A 4juk/1/3:A/1:A 4juk/1/3:A/2:A 4jul/1/1:A/1:C 4jul/1/1:E/1:A 4jul/1/1:E/1:C 4jul/2/1:H/1:J 4jul/2/1:L/1:H 4jul/2/1:L/1:J 4jum/1/1:A/2:A 4jum/1/3:A/1:A 4jum/1/3:A/2:A 4jun/1/1:A/1:C 4jun/1/1:E/1:A 4jun/1/1:E/1:C 4k62/1/1:A/2:A 4k62/1/1:A/3:A 4k62/1/2:A/3:A 4k62/2/1:C/4:C 4k62/2/1:C/5:C 4k62/2/4:C/5:C 4k62/3/1:E/6:E 4k62/3/1:E/7:E 4k62/3/6:E/7:E 4k62/4/1:G/6:G 4k62/4/1:G/7:G 4k62/4/6:G/7:G 4k63/1/1:A/2:A 4k63/1/1:A/3:A 4k63/1/2:A/3:A 4k63/2/1:C/4:C 4k63/2/1:C/5:C 4k63/2/4:C/5:C 4k63/3/1:E/6:E 4k63/3/1:E/7:E 4k63/3/6:E/7:E 4k63/4/1:G/4:G 4k63/4/1:G/5:G 4k63/4/4:G/5:G 4k64/1/1:A/2:A 4k64/1/1:A/3:A 4k64/1/2:A/3:A 4k64/2/1:C/4:C 4k64/2/1:C/5:C 4k64/2/4:C/5:C 4k64/3/1:E/6:E 4k64/3/1:E/7:E 4k64/3/6:E/7:E 4k64/4/1:G/8:G 4k64/4/1:G/9:G 4k64/4/8:G/9:G 4k65/1/1:A/2:A 4k65/1/1:A/3:A 4k65/1/2:A/3:A 4k65/2/1:C/4:C 4k65/2/1:C/5:C 4k65/2/4:C/5:C 4k65/3/1:E/6:E 4k65/3/1:E/7:E 4k65/3/6:E/7:E 4k65/4/1:G/6:G 4k65/4/1:G/7:G 4k65/4/6:G/7:G 4k66/1/1:A/2:A 4k66/1/1:A/3:A 4k66/1/2:A/3:A 4k66/2/1:C/4:C 4k66/2/1:C/5:C 4k66/2/4:C/5:C 4k66/3/1:E/6:E 4k66/3/1:E/7:E 4k66/3/6:E/7:E 4k66/4/1:G/6:G 4k66/4/1:G/7:G 4k66/4/6:G/7:G 4k67/1/1:A/2:A 4k67/1/1:A/3:A 4k67/1/2:A/3:A 4k67/2/1:C/2:C 4k67/2/1:C/3:C 4k67/2/2:C/3:C 4k67/3/1:E/4:E 4k67/3/1:E/5:E 4k67/3/4:E/5:E 4k67/4/1:G/6:G 4k67/4/1:G/7:G 4k67/4/6:G/7:G 4kdm/1/1:A/1:C 4kdm/1/1:A/1:E 4kdm/1/1:C/1:E 4kdn/1/1:A/1:C 4kdn/1/1:A/1:E 4kdn/1/1:C/1:E 4kdo/1/1:A/1:C 4kdo/1/1:A/1:E 4kdo/1/1:C/1:E 4kdq/1/1:A/1:C 4kdq/1/1:A/1:E 4kdq/1/1:C/1:E 4kth/2/1:C/1:A 4kth/2/1:C/1:E 4kth/2/1:E/1:A 4kth/3/1:C/1:A 4kth/3/1:C/1:E 4kth/3/1:E/1:A 4kw1/1/1:A/2:A 4kw1/1/1:A/3:A 4kw1/1/2:A/3:A 4kw1/2/1:C/4:C 4kw1/2/1:C/5:C 4kw1/2/4:C/5:C 4kw1/3/1:E/2:E 4kw1/3/1:E/3:E 4kw1/3/2:E/3:E 4kw1/4/1:G/6:G 4kw1/4/1:G/7:G 4kw1/4/6:G/7:G 4kwm/1/1:A/2:A 4kwm/1/1:A/3:A 4kwm/1/2:A/3:A 4kwm/2/1:C/4:C 4kwm/2/1:C/5:C 4kwm/2/4:C/5:C 4kwm/3/1:E/6:E 4kwm/3/1:E/7:E 4kwm/3/6:E/7:E 4mhh/1/1:A/1:C 4mhh/1/1:E/1:A 4mhh/1/1:E/1:C 4mhh/2/1:A/1:C 4mhh/2/1:E/1:A 4mhh/2/1:E/1:C 4mhi/1/1:A/1:C 4mhi/1/1:E/1:A 4mhi/1/1:E/1:C 4mhi/2/1:G/1:I 4mhi/2/1:K/1:G 4mhi/2/1:K/1:I 4mhi/3/1:M/1:O 4mhi/3/1:Q/1:M 4mhi/3/1:Q/1:O 4mhj/1/1:C/1:A 4mhj/1/1:G/1:A 4mhj/1/1:G/1:C 4mhj/2/1:O/1:M 4mhj/2/1:S/1:M 4mhj/2/1:S/1:O 4mhj/3/1:C/1:A 4mhj/3/1:G/1:A 4mhj/3/1:G/1:C 4mhj/4/1:O/1:M 4mhj/4/1:S/1:M 4mhj/4/1:S/1:O 4n5y/1/1:A/1:G 4n5y/1/1:I/1:A 4n5y/1/1:I/1:G 4n5y/2/1:C/1:E 4n5y/2/1:K/1:C 4n5y/2/1:K/1:E 4n5y/3/1:M/1:O 4n5y/3/1:Q/1:M 4n5y/3/1:Q/1:O 4n5y/4/1:S/1:U 4n5y/4/1:W/1:S 4n5y/4/1:W/1:U 4n5y/5/1:c/1:a 4n5y/5/1:c/1:Y 4n5y/5/1:Y/1:a 4n5z/1/1:A/1:G 4n5z/1/1:I/1:A 4n5z/1/1:I/1:G 4n5z/2/1:C/1:E 4n5z/2/1:K/1:C 4n5z/2/1:K/1:E 4n5z/3/1:M/1:O 4n5z/3/1:Q/1:M 4n5z/3/1:Q/1:O 4n5z/4/1:S/1:U 4n5z/4/1:W/1:S 4n5z/4/1:W/1:U 4n5z/5/1:c/1:a 4n5z/5/1:c/1:Y 4n5z/5/1:Y/1:a 5ajm/1/1:A/2:A 5ajm/1/1:A/3:A 5ajm/1/2:A/3:A 5e2y/1/1:A/1:C 5e2y/1/1:E/1:A 5e2y/1/1:E/1:C 5e2z/1/1:A/1:C 5e2z/1/1:E/1:A 5e2z/1/1:E/1:C 5e30/1/1:A/1:C 5e30/1/1:E/1:A 5e30/1/1:E/1:C 5hu8/1/1:A/1:C 5hu8/1/1:A/1:E 5hu8/1/1:C/1:E 5huf/1/1:A/1:C 5huf/1/1:A/1:E 5huf/1/1:C/1:E 5jw4/1/1:A/1:C 5jw4/1/1:A/1:E 5jw4/1/1:C/1:E 5jw4/2/1:G/1:I 5jw4/2/1:G/1:K 5jw4/2/1:I/1:K 6b3m/1/1:A/1:G 6b3m/1/1:A/1:K 6b3m/1/1:G/1:K 6b3m/2/1:E/1:Q 6b3m/2/1:E/2:S 6b3m/2/1:Q/2:S 6cf5/1/1:C/1:A 6cf5/1/1:E/1:A 6cf5/1/1:E/1:C 6cfg/1/1:A/2:A 6cfg/1/3:A/1:A 6e3h/1/1:A/2:A 6e3h/1/3:A/1:A 6e3h/1/3:A/2:A 6e7g/1/1:A/1:C 6e7g/1/1:E/1:A 6e7g/1/1:E/1:C 6e7h/1/1:C/1:A 6e7h/1/1:E/1:A 6e7h/1/1:E/1:C 6pcx/1/1:A/2:A 6pcx/1/1:A/3:A 6pcx/1/2:A/3:A 6pd3/1/1:A/2:A 6pd3/1/1:A/3:A 6pd3/1/2:A/3:A 6pd5/1/1:A/2:A 6pd5/1/1:A/3:A 6pd5/1/2:A/3:A 6pd6/1/1:A/2:A 6pd6/1/1:A/3:A 6pd6/1/2:A/3:A 6vmz/1/1:A/1:C 6vmz/1/1:A/1:E 6vmz/1/1:C/1:E 7dea/1/1:A/1:C 7dea/1/1:A/1:E 7dea/1/1:C/1:E 7deb/1/1:A/1:B 7deb/1/1:A/1:C 7deb/1/1:B/1:C 7wl5/1/1:A/1:C 7wl5/1/1:A/1:E 7wl5/1/1:C/1:E
Other dimers with similar sequences but different poses
  • 6ntf/1/2:A/3:A 3fku/1/1:B/1:D 3fku/1/1:B/1:F 3fku/1/1:D/1:F 3gbm/1/1:B/2:B 3gbm/1/1:B/3:B 3gbm/1/2:B/3:B 3s11/1/1:B/1:D 3s11/1/1:B/1:F 3s11/1/1:D/1:F 3zpb/1/1:F/2:F 3zpb/1/1:F/3:F 3zpb/1/2:F/3:F 4jum/1/1:B/2:B 4jum/1/1:B/3:B 4jum/1/2:B/3:B 4k62/1/1:B/2:B 4k62/1/1:B/3:B 4k62/1/2:B/3:B 4k62/2/1:D/4:D 4k62/2/1:D/5:D 4k62/2/4:D/5:D 4k62/3/1:F/6:F 4k62/3/1:F/7:F 4k62/3/6:F/7:F 4k62/4/1:H/6:H 4k62/4/1:H/7:H 4k62/4/6:H/7:H 4k63/1/1:B/2:B 4k63/1/1:B/3:B 4k63/1/2:B/3:B 4k63/2/1:D/4:D 4k63/2/1:D/5:D 4k63/2/4:D/5:D 4k63/3/1:F/6:F 4k63/3/1:F/7:F 4k63/3/6:F/7:F 4k63/4/1:H/4:H 4k63/4/1:H/5:H 4k63/4/4:H/5:H 4k64/1/1:B/2:B 4k64/1/1:B/3:B 4k64/1/2:B/3:B 4k64/2/1:D/4:D 4k64/2/1:D/5:D 4k64/2/4:D/5:D 4k64/3/1:F/6:F 4k64/3/1:F/7:F 4k64/3/6:F/7:F 4k64/4/1:H/8:H 4k64/4/1:H/9:H 4k64/4/8:H/9:H 4k65/1/1:B/2:B 4k65/1/1:B/3:B 4k65/1/2:B/3:B 4k65/2/1:D/4:D 4k65/2/1:D/5:D 4k65/2/4:D/5:D 4k65/3/1:F/6:F 4k65/3/1:F/7:F 4k65/3/6:F/7:F 4k65/4/1:H/6:H 4k65/4/1:H/7:H 4k65/4/6:H/7:H 4k66/1/1:B/2:B 4k66/1/1:B/3:B 4k66/1/2:B/3:B 4k66/2/1:D/4:D 4k66/2/1:D/5:D 4k66/2/4:D/5:D 4k66/3/1:F/6:F 4k66/3/1:F/7:F 4k66/3/6:F/7:F 4k66/4/1:H/6:H 4k66/4/1:H/7:H 4k66/4/6:H/7:H 4k67/1/1:B/2:B 4k67/1/1:B/3:B 4k67/1/2:B/3:B 4k67/2/1:D/2:D 4k67/2/1:D/3:D 4k67/2/2:D/3:D 4k67/3/1:F/4:F 4k67/3/1:F/5:F 4k67/3/4:F/5:F 4k67/4/1:H/6:H 4k67/4/1:H/7:H 4k67/4/6:H/7:H 4kdm/1/1:B/1:D 4kdm/1/1:B/1:F 4kdm/1/1:D/1:F 4kdn/1/1:B/1:D 4kdn/1/1:B/1:F 4kdn/1/1:D/1:F 4kdo/1/1:B/1:D 4kdo/1/1:B/1:F 4kdo/1/1:D/1:F 4kw1/2/1:D/4:D 4kw1/2/1:D/5:D 4kw1/2/4:D/5:D 4kw1/3/1:F/2:F 4kw1/3/1:F/3:F 4kw1/3/2:F/3:F 4mhh/1/1:B/1:D 4mhh/1/1:B/1:F 4mhh/1/1:D/1:F 4mhh/2/1:B/1:D 4mhh/2/1:B/1:F 4mhh/2/1:D/1:F 4mhi/1/1:B/1:D 4mhi/1/1:B/1:F 4mhi/1/1:D/1:F 4mhi/2/1:H/1:J 4mhi/2/1:H/1:L 4mhi/2/1:J/1:L 4mhi/3/1:N/1:P 4mhi/3/1:N/1:R 4mhi/3/1:P/1:R 4mhj/2/1:N/1:P 4mhj/2/1:N/1:U 4mhj/4/1:N/1:P 4mhj/4/1:N/1:U 4n5y/1/1:B/1:H 4n5y/1/1:B/1:J 4n5y/1/1:H/1:J 4n5y/2/1:D/1:F 4n5y/2/1:D/1:L 4n5y/2/1:F/1:L 4n5y/3/1:N/1:P 4n5y/3/1:N/1:R 4n5y/3/1:P/1:R 4n5y/4/1:T/1:V 4n5y/4/1:T/1:X 4n5y/4/1:V/1:X 4n5y/5/1:b/1:d 4n5y/5/1:Z/1:b 4n5y/5/1:Z/1:d 4n5z/1/1:B/1:H 4n5z/1/1:B/1:J 4n5z/1/1:H/1:J 4n5z/2/1:D/1:F 4n5z/2/1:D/1:L 4n5z/2/1:F/1:L 4n5z/3/1:N/1:P 4n5z/3/1:N/1:R 4n5z/3/1:P/1:R 4n5z/4/1:T/1:V 4n5z/4/1:T/1:X 4n5z/4/1:V/1:X 4n5z/5/1:b/1:d 4n5z/5/1:Z/1:b 4n5z/5/1:Z/1:d 5e32/1/1:B/2:B 5e32/1/1:B/3:B 5e32/1/2:B/3:B 5e34/1/1:B/2:B 5e34/1/1:B/3:B 5e34/1/2:B/3:B 5huf/1/1:B/1:D 5huf/1/1:B/1:F 5huf/1/1:D/1:F 6ntf/1/1:A/2:A 6ntf/1/1:A/3:A
  • 4xnq/1/1:C/1:D 4xnm/1/1:C/1:D
  • [Back to Home]