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BioLiP
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    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    341801 5epo:C (2.0) BS02 TUD 1.1.1.- GO:0000166 ... G9FRD7 26961171
    341802 5epo:D (2.0) BS01 NAP 1.1.1.- GO:0000166 ... G9FRD7 26961171
    341803 5epo:D (2.0) BS02 TUD 1.1.1.- GO:0000166 ... G9FRD7 26961171
    341804 5epp:A (1.88) BS01 peptide 3.6.4.6 N/A P55072 27407164
    341805 5epr:A (1.65) BS01 5QY ? N/A P55201 27167503 MOAD: Kd=91uM
    BindingDB: Kd=91000nM
    341806 5eps:A (1.47) BS01 5QX ? N/A P55201 27167503 MOAD: Kd=38uM
    BindingDB: Kd=38000nM
    341807 5epu:A (1.06) BS01 CYT 2.4.2.3 GO:0003824 ... Q9K4U1 N/A
    341808 5epu:B (1.06) BS01 CYT 2.4.2.3 GO:0003824 ... Q9K4U1 N/A
    341809 5epu:C (1.06) BS01 CYT 2.4.2.3 GO:0003824 ... Q9K4U1 N/A
    341810 5epu:D (1.06) BS01 CYT 2.4.2.3 GO:0003824 ... Q9K4U1 N/A
    341811 5epu:E (1.06) BS01 CYT 2.4.2.3 GO:0003824 ... Q9K4U1 N/A
    341812 5epu:F (1.06) BS01 CYT 2.4.2.3 GO:0003824 ... Q9K4U1 N/A
    341813 5epv:A (2.51) BS01 ACP 2.7.13.3 GO:0004673 ... Q2YKK7 26851072
    341814 5epv:A (2.51) BS02 MG 2.7.13.3 GO:0004673 ... Q2YKK7 26851072
    341815 5epv:B (2.51) BS01 ACP 2.7.13.3 GO:0004673 ... Q2YKK7 26851072
    341816 5epv:B (2.51) BS02 MG 2.7.13.3 GO:0004673 ... Q2YKK7 26851072
    341817 5epv:C (2.51) BS01 ACP 2.7.13.3 GO:0004673 ... Q2YKK7 26851072
    341818 5epv:D (2.51) BS01 ACP 2.7.13.3 GO:0004673 ... Q2YKK7 26851072
    341819 5epy:A (2.3) BS01 ZN 3.6.4.13 GO:0006508 ... C1KIK8 26682473
    341820 5epy:A (2.3) BS02 5R2 3.6.4.13 GO:0006508 ... C1KIK8 26682473
    341821 5epz:A (1.85) BS01 SO4 3.1.27.- GO:0001525 ... P03950 27483019
    341822 5eq0:A (1.18) BS01 peptide ? N/A Q9HC52 26807715
    341823 5eq1:A (1.55) BS01 BEA ? N/A P55201 27167503 MOAD: Kd=21uM
    341824 5eq2:A (1.8) BS01 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341825 5eq2:A (1.8) BS02 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341826 5eq2:B (1.8) BS01 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341827 5eq2:B (1.8) BS02 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341828 5eq3:A (2.0) BS01 NGC ? N/A A3CM52 26833566
    341829 5eq3:A (2.0) BS02 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341830 5eq3:A (2.0) BS03 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341831 5eq3:B (2.0) BS01 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341832 5eq3:B (2.0) BS02 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341833 5eq4:A (2.3) BS01 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341834 5eq4:A (2.3) BS02 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341835 5eq4:B (2.3) BS01 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341836 5eq4:B (2.3) BS02 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341837 5eq4:C (2.3) BS01 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341838 5eq4:C (2.3) BS02 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341839 5eq4:D (2.3) BS01 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341840 5eq4:D (2.3) BS02 CA ? N/A A3CM52 26833566
    341841 5eq6:A (3.5) BS01 ANP ? GO:0005524 ... G3XD28 27022027
    341842 5eq6:B (3.5) BS01 ANP ? GO:0005524 ... G3XD28 27022027
    341843 5eq8:A (1.3) BS01 HSO 3.1.3.15 GO:0004401 ... G7J7Q5 26994138
    341844 5eq9:A (1.36) BS01 HSA 3.1.3.15 GO:0004401 ... G7J7Q5 26994138
    341845 5eq9:A (1.36) BS02 MG 3.1.3.15 GO:0004401 ... G7J7Q5 26994138
    341846 5eq9:B (1.36) BS01 HSA 3.1.3.15 GO:0004401 ... G7J7Q5 26994138
    341847 5eq9:B (1.36) BS02 MG 3.1.3.15 GO:0004401 ... G7J7Q5 26994138
    341848 5eq9:C (1.36) BS01 HSA 3.1.3.15 GO:0004401 ... G7J7Q5 26994138
    341849 5eq9:C (1.36) BS02 MG 3.1.3.15 GO:0004401 ... G7J7Q5 26994138
    341850 5eq9:D (1.36) BS01 HSA 3.1.3.15 GO:0004401 ... G7J7Q5 26994138
    341851 5eq9:D (1.36) BS02 MG 3.1.3.15 GO:0004401 ... G7J7Q5 26994138
    341852 5eqb:A (2.19) BS01 HEM 1.14.14.154 GO:0004497 ... P10614 24613931
    341853 5eqb:A (2.19) BS02 1YN 1.14.14.154 GO:0004497 ... P10614 24613931
    341854 5eqc:A (2.2) BS01 GLC 2.6.1.13 GO:0004587 ... S8EY38 N/A
    341855 5eqc:A (2.2) BS02 BGC 2.6.1.13 GO:0004587 ... S8EY38 N/A
    341856 5eqc:A (2.2) BS03 PLP 2.6.1.13 GO:0004587 ... S8EY38 N/A
    341857 5eqc:B (2.2) BS01 BGC 2.6.1.13 GO:0004587 ... S8EY38 N/A
    341858 5eqc:B (2.2) BS02 BGC 2.6.1.13 GO:0004587 ... S8EY38 N/A
    341859 5eqc:B (2.2) BS03 BGC 2.6.1.13 GO:0004587 ... S8EY38 N/A
    341860 5eqc:B (2.2) BS04 PLP 2.6.1.13 GO:0004587 ... S8EY38 N/A
    341861 5eqd:A (1.83) BS01 FAD 5.4.99.9 GO:0000166 ... A0R629 N/A
    341862 5eqd:B (1.83) BS01 UDP 5.4.99.9 GO:0000166 ... A0R629 N/A
    341863 5eqd:B (1.83) BS02 FAD 5.4.99.9 GO:0000166 ... A0R629 N/A
    341864 5eqe:A (2.4) BS01 5R8 2.7.1.32
    2.7.1.82
    N/A P35790 26700752 MOAD: Kd=132uM
    BindingDB: Kd=132000nM, IC50=87000nM
    341865 5eqe:B (2.4) BS01 5R8 2.7.1.32
    2.7.1.82
    N/A P35790 26700752 MOAD: Kd=132uM
    BindingDB: Kd=132000nM, IC50=87000nM
    341866 5eqf:A (2.145) BS01 UDP 5.4.99.9 GO:0000166 ... Q6NER4 28608671
    341867 5eqf:A (2.145) BS02 FAD 5.4.99.9 GO:0000166 ... Q6NER4 28608671
    341868 5eqf:B (2.145) BS01 UDP 5.4.99.9 GO:0000166 ... Q6NER4 28608671
    341869 5eqf:B (2.145) BS02 FAD 5.4.99.9 GO:0000166 ... Q6NER4 28608671
    341870 5eqg:A (2.9) BS01 5RE ? GO:0000139 ... P11166 27078104
    341871 5eqh:A (2.99) BS01 5RF ? GO:0000139 ... P11166 27078104
    341872 5eqi:A (3.002) BS01 5RH ? GO:0000139 ... P11166 27078104
    341873 5eqm:A (2.05) BS01 HEM 1.7.-.- GO:0005092 ... Q9ER97 28500341
    341874 5eqn:A (2.3) BS01 MG 1.14.11.- GO:0004497 ... Q0ZQ39 27139827
    341875 5eqn:B (2.3) BS01 MG 1.14.11.- GO:0004497 ... Q0ZQ39 27139827
    341876 5eqo:A (2.4) BS01 SO4 3.1.27.- GO:0001525 ... P03950 27483019
    341877 5eqo:A (2.4) BS02 SO4 3.1.27.- GO:0001525 ... P03950 27483019
    341878 5eqo:A (2.4) BS03 SO4 3.1.27.- GO:0001525 ... P03950 27483019
    341879 5eqp:A (2.35) BS01 5R9 2.7.1.32
    2.7.1.82
    N/A P35790 26700752 MOAD: Kd=4uM
    BindingDB: Kd=4000nM, IC50=3900nM
    341880 5eqp:B (2.35) BS01 5R9 2.7.1.32
    2.7.1.82
    N/A P35790 26700752 MOAD: Kd=4uM
    BindingDB: Kd=4000nM, IC50=3900nM
    341881 5eqq:A (1.65) BS01 ZN 3.6.4.13 GO:0006508 ... C1KIK8 26682473
    341882 5eqq:A (1.65) BS02 5RS 3.6.4.13 GO:0006508 ... C1KIK8 26682473 MOAD: Kd=6.7nM
    341883 5eqr:A (1.96) BS01 TSV 3.6.4.13 GO:0006508 ... A0A0B4WYC6 27512818
    341884 5eqr:A (1.96) BS02 ZN 3.6.4.13 GO:0006508 ... A0A0B4WYC6 27512818
    341885 5eqs:A (1.839) BS01 2R9 3.6.4.13 GO:0006508 ... A0A0B4WYC6 27512818
    341886 5eqs:A (1.839) BS02 ZN 3.6.4.13 GO:0006508 ... A0A0B4WYC6 27512818
    341887 5eqt:A (1.943) BS01 ADP ? GO:0005524 ... O57940 N/A
    341888 5equ:A (2.2) BS01 FE ? GO:0046872 ... Q9EYI0
    Q9RN67
    27114534
    341889 5equ:A (2.2) BS02 AKG ? GO:0046872 ... Q9EYI0
    Q9RN67
    27114534
    341890 5equ:A (2.2) BS03 5R6 ? GO:0046872 ... Q9EYI0
    Q9RN67
    27114534
    341891 5equ:B (2.2) BS01 FE ? GO:0046872 ... Q9EYI0
    Q9RN67
    27114534
    341892 5equ:B (2.2) BS02 AKG ? GO:0046872 ... Q9EYI0
    Q9RN67
    27114534
    341893 5equ:B (2.2) BS03 5R6 ? GO:0046872 ... Q9EYI0
    Q9RN67
    27114534
    341894 5equ:C (2.2) BS01 FE ? GO:0046872 ... Q9EYI0
    Q9RN67
    27114534
    341895 5equ:C (2.2) BS02 AKG ? GO:0046872 ... Q9EYI0
    Q9RN67
    27114534
    341896 5equ:C (2.2) BS03 5R6 ? GO:0046872 ... Q9EYI0
    Q9RN67
    27114534
    341897 5equ:D (2.2) BS01 FE ? GO:0046872 ... Q9EYI0
    Q9RN67
    27114534
    341898 5equ:D (2.2) BS02 AKG ? GO:0046872 ... Q9EYI0
    Q9RN67
    27114534
    341899 5equ:D (2.2) BS03 5R6 ? GO:0046872 ... Q9EYI0
    Q9RN67
    27114534
    341900 5eqv:A (1.45) BS01 FE 3.1.3.6
    3.1.4.16
    GO:0000166 ... A0A5P8YBY3 N/A
    341901 5eqv:A (1.45) BS02 FE 3.1.3.6
    3.1.4.16
    GO:0000166 ... A0A5P8YBY3 N/A
    341902 5eqx:A (3.05) BS01 CA ? GO:0005509 ... P32926 27298358
    341903 5eqx:A (3.05) BS02 CA ? GO:0005509 ... P32926 27298358
    341904 5eqx:A (3.05) BS03 CA ? GO:0005509 ... P32926 27298358
    341905 5eqx:A (3.05) BS04 CA ? GO:0005509 ... P32926 27298358
    341906 5eqx:A (3.05) BS05 CA ? GO:0005509 ... P32926 27298358
    341907 5eqx:A (3.05) BS06 CA ? GO:0005509 ... P32926 27298358
    341908 5eqx:A (3.05) BS07 CA ? GO:0005509 ... P32926 27298358
    341909 5eqx:A (3.05) BS08 CA ? GO:0005509 ... P32926 27298358
    341910 5eqx:A (3.05) BS09 MAN ? GO:0005509 ... P32926 27298358
    341911 5eqx:A (3.05) BS10 MAN ? GO:0005509 ... P32926 27298358
    341912 5eqx:A (3.05) BS11 MAN ? GO:0005509 ... P32926 27298358
    341913 5eqy:A (2.5) BS01 5RA 2.7.1.32
    2.7.1.82
    N/A P35790 26700752 MOAD: Kd=10nM
    BindingDB: IC50=66nM, Kd=10.0nM
    341914 5eqy:B (2.5) BS01 5RA 2.7.1.32
    2.7.1.82
    N/A P35790 26700752 MOAD: Kd=10nM
    BindingDB: IC50=66nM, Kd=10.0nM
    341915 5er0:A (2.406) BS01 FAD ? GO:0000166 ... Q03Q85 27124460
    341916 5er0:B (2.406) BS01 FAD ? GO:0000166 ... Q03Q85 27124460
    341917 5er0:C (2.406) BS01 FAD ? GO:0000166 ... Q03Q85 27124460
    341918 5er0:D (2.406) BS01 FAD ? GO:0000166 ... Q03Q85 27124460
    341919 5er1:E (2.0) BS01 0HT 3.4.23.22 GO:0004190 ... P11838 N/A MOAD: Ki=960nM
    341920 5er2:E (1.8) BS01 0EK 3.4.23.22 GO:0004190 ... P11838 2676515 MOAD: Ki=0.27uM
    341921 5er4:X (1.813) BS01 CA ? GO:0005509 ... P02638 27303795
    341922 5er4:X (1.813) BS02 CA ? GO:0005509 ... P02638 27303795
    341923 5er4:X (1.813) BS03 5RL ? GO:0005509 ... P02638 27303795
    341924 5er5:A (1.26) BS01 CA ? GO:0005509 ... P02638 27303795
    341925 5er5:A (1.26) BS02 CA ? GO:0005509 ... P02638 27303795
    341926 5er5:A (1.26) BS03 ET ? GO:0005509 ... P02638 27303795
    341927 5er7:A (3.286) BS01 CA ? GO:0002931 ... P29033 26753910
    341928 5er7:B (3.286) BS01 CA ? GO:0002931 ... P29033 26753910
    341929 5er8:A (2.5) BS01 MN 2.5.1.29
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    342000 5erp:A (2.7) BS01 MAN ? GO:0005509 ... Q02487 27298358

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).