SEQ2FUN

BioLiP
Download all results in tab-seperated text for 942758 receptor-ligand interactions, whose format is explained at readme.txt.
  • Hover over PDB to view the title of the structure. Click PDB to view the structure at the RCSB PDB database. Resolution -1.00 means the resolution is unavailable, e.g., for NMR structures.
  • Click Site # to view the binding site structure. Hover over Site # to view the binding residues.
  • Hover over Ligand to view the full ligand name. Click Ligand to view the 2D diagram and other detail information of the ligand.
  • Hover over EC number to view the full name of enzymatic activity.
  • Hover over GO terms to view all GO terms.
  • Hover over UniProt to view the protein name.
  • Sort results by
    << < 2333 2334 2335 2336 2337 2338 2339 2340 2341 2342 2343 2344 2345 2346 2347 2348 2349 2350 2351 2352 2353 > >>
    Go to page

    # PDB
    (Resolution Å)
    Site # Ligand EC number GO terms UniProt PubMed Binding
    affinity
    468401 6g5i:M (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P25398 29875412
    468402 6g5i:N (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62277 29875412
    468403 6g5i:O (3.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62263 29875412
    468404 6g5i:P (3.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62841 29875412
    468405 6g5i:Q (3.5) BS01 rna ? GO:0000462 ... P62249 29875412
    468406 6g5i:R (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P08708 29875412
    468407 6g5i:S (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62269 29875412
    468408 6g5i:T (3.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P39019 29875412
    468409 6g5i:U (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P60866 29875412
    468410 6g5i:W (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62244 29875412
    468411 6g5i:X (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62266 29875412
    468412 6g5i:Y (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62847 29875412
    468413 6g5i:Z (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62851 29875412
    468414 6g5i:b (3.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P42677 29875412
    468415 6g5i:c (3.5) BS01 rna ? GO:0000028 ... P62857 29875412
    468416 6g5i:d (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62273 29875412
    468417 6g5i:d (3.5) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P62273 29875412
    468418 6g5i:e (3.5) BS01 rna ? GO:0003735 ... P62861 29875412
    468419 6g5i:f (3.5) BS01 rna ? GO:0002181 ... P62979 29875412
    468420 6g5i:f (3.5) BS02 ZN ? GO:0002181 ... P62979 29875412
    468421 6g5i:g (3.5) BS01 rna ? GO:0001891 ... P63244 29875412
    468422 6g5i:x (3.5) BS01 rna ? GO:0003676 ... Q9NRX1 29875412
    468423 6g5i:y (3.5) BS01 rna 3.1.-.- GO:0004519 ... Q9ULX3 29875412
    468424 6g5i:y (3.5) BS02 ZN 3.1.-.- GO:0004519 ... Q9ULX3 29875412
    468425 6g5j:A (1.85) BS01 CA 3.1.1.4 GO:0004623 ... O15496 30034586
    468426 6g5j:A (1.85) BS02 EM8 3.1.1.4 GO:0004623 ... O15496 30034586 MOAD: ic50=0.2uM
    BindingDB: IC50=200nM
    468427 6g5j:A (1.85) BS03 EM8 3.1.1.4 GO:0004623 ... O15496 30034586 MOAD: ic50=0.2uM
    BindingDB: IC50=200nM
    468428 6g5j:B (1.85) BS01 CA 3.1.1.4 GO:0004623 ... O15496 30034586
    468429 6g5j:B (1.85) BS02 EM8 3.1.1.4 GO:0004623 ... O15496 30034586 MOAD: ic50=0.2uM
    BindingDB: IC50=200nM
    468430 6g5k:A (2.0) BS01 peptide 3.4.24.69 GO:0005576 ... P10844 30746458
    468431 6g5k:B (2.0) BS01 peptide 3.4.24.69 GO:0005576 ... P10844 30746458
    468432 6g5l:A (1.21) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175
    468433 6g5l:A (1.21) BS02 EM5 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175 MOAD: Kd=0.019nM
    BindingDB: Kd=24nM
    468434 6g5l:B (1.21) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175
    468435 6g5l:B (1.21) BS02 EM5 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175 MOAD: Kd=0.019nM
    BindingDB: Kd=24nM
    468436 6g5l:C (1.21) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175
    468437 6g5l:C (1.21) BS02 EM5 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175 MOAD: Kd=0.019nM
    BindingDB: Kd=24nM
    468438 6g5l:D (1.21) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175
    468439 6g5l:D (1.21) BS02 EM5 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175 MOAD: Kd=0.019nM
    BindingDB: Kd=24nM
    468440 6g5m:A (2.31) BS01 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468441 6g5m:A (2.31) BS02 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468442 6g5m:A (2.31) BS03 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468443 6g5m:A (2.31) BS04 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468444 6g5m:A (2.31) BS05 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468445 6g5m:B (2.31) BS01 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468446 6g5m:B (2.31) BS02 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468447 6g5m:B (2.31) BS03 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468448 6g5m:B (2.31) BS04 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468449 6g5m:B (2.31) BS05 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468450 6g5m:C (2.31) BS01 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468451 6g5m:C (2.31) BS02 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468452 6g5m:C (2.31) BS03 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468453 6g5m:C (2.31) BS04 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468454 6g5m:C (2.31) BS05 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468455 6g5m:C (2.31) BS06 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468456 6g5m:D (2.31) BS01 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468457 6g5m:D (2.31) BS02 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468458 6g5m:D (2.31) BS03 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468459 6g5m:D (2.31) BS04 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468460 6g5m:D (2.31) BS05 CU ? N/A W0DP94 N/A
    468461 6g5n:A (1.765) BS01 ZN ? N/A P23497 N/A
    468462 6g5n:A (1.765) BS02 ZN ? N/A P23497 N/A
    468463 6g5n:A (1.765) BS03 ENK ? N/A P23497 N/A
    468464 6g5n:B (1.765) BS01 ZN ? N/A P23497 N/A
    468465 6g5n:B (1.765) BS02 ZN ? N/A P23497 N/A
    468466 6g5o:A (2.25) BS01 HEM 1.14.15.- GO:0004497 ... G0L713 30404923
    468467 6g5o:B (2.25) BS01 HEM 1.14.15.- GO:0004497 ... G0L713 30404923
    468468 6g5p:A (1.35) BS01 ZN ? N/A P23497 N/A
    468469 6g5p:A (1.35) BS02 ZN ? N/A P23497 N/A
    468470 6g5p:A (1.35) BS03 EN8 ? N/A P23497 N/A
    468471 6g5p:B (1.35) BS01 ZN ? N/A P23497 N/A
    468472 6g5p:B (1.35) BS02 ZN ? N/A P23497 N/A
    468473 6g5q:A (2.4) BS01 EMZ 1.14.15.- GO:0004497 ... G0L713 30404923 MOAD: Kd=0.98mM
    468474 6g5q:A (2.4) BS02 HEM 1.14.15.- GO:0004497 ... G0L713 30404923
    468475 6g5q:B (2.4) BS01 EMZ 1.14.15.- GO:0004497 ... G0L713 30404923 MOAD: Kd=0.98mM
    468476 6g5q:B (2.4) BS02 HEM 1.14.15.- GO:0004497 ... G0L713 30404923
    468477 6g5t:A (1.5) BS01 HEM 1.11.1.-
    1.7.-.-
    GO:0004601 ... P02185 N/A
    468478 6g5u:A (1.7) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q8N1Q1 30006175
    468479 6g5u:A (1.7) BS02 ENN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q8N1Q1 30006175 MOAD: Kd=6.3nM
    BindingDB: Kd=5.7nM
    468480 6g5u:B (1.7) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q8N1Q1 30006175
    468481 6g5u:B (1.7) BS02 ENN 4.2.1.1 GO:0004089 ... Q8N1Q1 30006175 MOAD: Kd=6.3nM
    BindingDB: Kd=5.7nM
    468482 6g5v:A (1.96) BS01 PT 3.2.1.17 GO:0003796 ... P00698 29904761
    468483 6g5v:A (1.96) BS02 PT 3.2.1.17 GO:0003796 ... P00698 29904761
    468484 6g5w:A (1.83) BS01 ZN 1.14.11.66
    1.14.11.69
    N/A O75164 34555281
    468485 6g5w:B (1.83) BS01 ZN 1.14.11.66
    1.14.11.69
    N/A O75164 34555281
    468486 6g5w:B (1.83) BS02 ENZ 1.14.11.66
    1.14.11.69
    N/A O75164 34555281
    468487 6g5x:A (1.78) BS01 ZN 1.14.11.66
    1.14.11.69
    N/A O75164 34555281
    468488 6g5x:A (1.78) BS02 MY7 1.14.11.66
    1.14.11.69
    N/A O75164 34555281
    468489 6g5x:B (1.78) BS01 ZN 1.14.11.66
    1.14.11.69
    N/A O75164 34555281
    468490 6g5x:B (1.78) BS02 MY7 1.14.11.66
    1.14.11.69
    N/A O75164 34555281
    468491 6g5y:A (1.49) BS01 PT 3.2.1.17 GO:0003796 ... P00698 29904761
    468492 6g5y:A (1.49) BS02 PT 3.2.1.17 GO:0003796 ... P00698 29904761
    468493 6g5z:A (1.98) BS01 MG 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468494 6g5z:A (1.98) BS02 SO4 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468495 6g5z:A (1.98) BS03 SO4 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468496 6g5z:B (1.98) BS01 MG 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468497 6g5z:B (1.98) BS02 SO4 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468498 6g5z:B (1.98) BS03 SO4 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468499 6g5z:B (1.98) BS04 SO4 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468500 6g5z:B (1.98) BS05 SO4 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468501 6g5z:B (1.98) BS06 SO4 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468502 6g5z:C (1.98) BS01 MG 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468503 6g5z:C (1.98) BS02 SO4 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468504 6g5z:D (1.98) BS01 MG 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468505 6g5z:D (1.98) BS02 SO4 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468506 6g60:A (1.84) BS01 CHT 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468507 6g60:A (1.84) BS02 MG 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468508 6g60:A (1.84) BS03 SO4 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468509 6g60:B (1.84) BS01 CHT 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468510 6g60:B (1.84) BS02 MG 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468511 6g60:B (1.84) BS03 SO4 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468512 6g60:B (1.84) BS04 SO4 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468513 6g60:C (1.84) BS01 CHT 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468514 6g60:C (1.84) BS02 MG 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468515 6g60:D (1.84) BS01 CHT 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468516 6g60:D (1.84) BS02 MG 3.1.6.6 GO:0005737 ... O69787 35503214
    468517 6g63:A (3.95) BS01 rna 3.1.26.12 GO:0003676 ... P21513 30270108
    468518 6g63:A (3.95) BS02 ZN 3.1.26.12 GO:0003676 ... P21513 30270108
    468519 6g63:G (3.95) BS01 rna 3.1.26.12 GO:0003676 ... P21513 30270108
    468520 6g63:G (3.95) BS02 ZN 3.1.26.12 GO:0003676 ... P21513 30270108
    468521 6g63:L (3.95) BS01 ZN 3.1.26.12 GO:0003676 ... P21513 30270108
    468522 6g63:N (3.95) BS01 ZN 3.1.26.12 GO:0003676 ... P21513 30270108
    468523 6g63:N (3.95) BS02 U 3.1.26.12 GO:0003676 ... P21513 30270108
    468524 6g68:H (1.95) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468525 6g68:L (1.95) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468526 6g68:M (1.95) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468527 6g68:O (1.95) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468528 6g69:I (2.2) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468529 6g69:M (2.2) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468530 6g6a:B (2.701) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468531 6g6b:A (2.3) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468532 6g6c:H (1.55) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468533 6g6c:I (1.55) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468534 6g6c:P (1.55) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468535 6g6c:P (1.55) BS02 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468536 6g6c:Q (1.55) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468537 6g6c:R (1.55) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468538 6g6c:S (1.55) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468539 6g6c:U (1.55) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468540 6g6c:X (1.55) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468541 6g6f:A (1.7) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468542 6g6f:A (1.7) BS02 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468543 6g6f:B (1.7) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468544 6g6f:C (1.7) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468545 6g6f:C (1.7) BS02 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468546 6g6f:F (1.7) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468547 6g6f:G (1.7) BS01 peptide N/A N/A N/A 30297707
    468548 6g6r:A (1.35) BS01 PPK 2.5.1.6 GO:0004478 ... P31153 30776190
    468549 6g6r:A (1.35) BS02 SAM 2.5.1.6 GO:0004478 ... P31153 30776190
    468550 6g6t:A (1.12) BS01 ZN 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 30006175
    468551 6g6t:A (1.12) BS02 ENN 4.2.1.1
    4.2.1.69
    GO:0002009 ... P00918 30006175 MOAD: Kd=0.16nM
    BindingDB: Kd=20nM
    468552 6g6v:A (1.942) BS01 EO8 2.7.7.3 GO:0003824 ... P9WPA5 N/A
    468553 6g6w:A (2.72) BS01 EO5 2.7.1.137
    2.7.1.153
    GO:0001779 ... O00329 30351000
    468554 6g6x:A (1.13) BS01 peptide ? GO:0000122 ... P31947 31763628
    468555 6g6y:A (1.8) BS01 ADP ? GO:0003777 ... P52732 30031975 MOAD: ic50=0.74uM
    468556 6g6y:A (1.8) BS02 EOK ? GO:0003777 ... P52732 30031975 MOAD: Kd=220nM
    468557 6g6z:A (2.8) BS01 ADP ? GO:0003777 ... P52732 30031975
    468558 6g6z:A (2.8) BS02 EOK ? GO:0003777 ... P52732 30031975
    468559 6g71:A (1.7) BS01 PP9 1.14.13.1 GO:0004497 ... A0A4V8GZW5 30759214
    468560 6g72:B (3.9) BS01 SF4 7.1.1.2 GO:0003954 ... Q9DC70 29915388
    468561 6g72:D (3.9) BS01 SF4 7.1.1.2 GO:0003954 ... Q91WD5 29915388
    468562 6g72:E (3.9) BS01 FES 7.1.1.2 GO:0005739 ... Q9D6J6 29915388
    468563 6g72:F (3.9) BS01 FMN 7.1.1.2 GO:0005515 ... Q91YT0 29915388
    468564 6g72:F (3.9) BS02 SF4 7.1.1.2 GO:0005515 ... Q91YT0 29915388
    468565 6g72:G (3.9) BS01 SF4 7.1.1.2 GO:0005515 ... Q91VD9 29915388
    468566 6g72:G (3.9) BS02 SF4 7.1.1.2 GO:0005515 ... Q91VD9 29915388
    468567 6g72:G (3.9) BS03 FES 7.1.1.2 GO:0005515 ... Q91VD9 29915388
    468568 6g72:I (3.9) BS01 SF4 7.1.1.2 GO:0003954 ... Q8K3J1 29915388
    468569 6g72:I (3.9) BS02 SF4 7.1.1.2 GO:0003954 ... Q8K3J1 29915388
    468570 6g72:O (3.9) BS01 ADP ? GO:0005739 ... Q99LC3 29915388
    468571 6g72:P (3.9) BS01 NDP ? GO:0003954 ... Q9DC69 29915388
    468572 6g72:R (3.9) BS01 ZN ? GO:0001822 ... P52503 29915388
    468573 6g72:U (3.9) BS01 EHZ ? GO:0005654 ... Q9CR21 29915388
    468574 6g72:W (3.9) BS01 EHZ ? GO:0003674 ... Q9CQZ5 29915388
    468575 6g72:n (3.9) BS01 EHZ ? GO:0005739 ... Q9CQJ8 29915388
    468576 6g74:A (2.0) BS01 SF4 2.5.1.72 GO:0005737 ... Q9X1X7 29641168
    468577 6g74:A (2.0) BS02 PHT 2.5.1.72 GO:0005737 ... Q9X1X7 29641168
    468578 6g74:B (2.0) BS01 SF4 2.5.1.72 GO:0005737 ... Q9X1X7 29641168
    468579 6g74:B (2.0) BS02 PHT 2.5.1.72 GO:0005737 ... Q9X1X7 29641168
    468580 6g75:B (1.391) BS01 OXY N/A GO:0003824 ... N/A N/A
    468581 6g76:A (3.0) BS01 ANP 2.7.11.1 GO:0004672 ... Q9UK32 34261798
    468582 6g76:A (3.0) BS02 ANP 2.7.11.1 GO:0004672 ... Q9UK32 34261798
    468583 6g76:B (3.0) BS01 ANP 2.7.11.1 GO:0004672 ... Q9UK32 34261798
    468584 6g77:A (2.499) BS01 ANP 2.7.11.1 GO:0004672 ... Q9UK32 34261798
    468585 6g77:A (2.499) BS02 ANP 2.7.11.1 GO:0004672 ... Q9UK32 34261798
    468586 6g77:A (2.499) BS03 ZN 2.7.11.1 GO:0004672 ... Q9UK32 34261798
    468587 6g77:B (2.499) BS01 ANP 2.7.11.1 GO:0004672 ... Q9UK32 34261798
    468588 6g77:B (2.499) BS02 ANP 2.7.11.1 GO:0004672 ... Q9UK32 34261798
    468589 6g77:B (2.499) BS03 ZN 2.7.11.1 GO:0004672 ... Q9UK32 34261798
    468590 6g78:A (2.5) BS01 ANP 2.7.11.1 GO:0004672 ... Q9UK32 34261798
    468591 6g78:B (2.5) BS01 ANP 2.7.11.1 GO:0004672 ... Q9UK32 34261798
    468592 6g79:S (3.78) BS01 EP5 ? GO:0001586 ... P28222 29925951
    468593 6g7a:A (1.42) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175
    468594 6g7a:A (1.42) BS02 EOQ 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175 MOAD: Kd=0.041nM
    BindingDB: Kd=0.041000nM
    468595 6g7a:B (1.42) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175
    468596 6g7a:B (1.42) BS02 EOQ 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175 MOAD: Kd=0.041nM
    BindingDB: Kd=0.041000nM
    468597 6g7a:C (1.42) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175
    468598 6g7a:C (1.42) BS02 EOQ 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175 MOAD: Kd=0.041nM
    BindingDB: Kd=0.041000nM
    468599 6g7a:D (1.42) BS01 ZN 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175
    468600 6g7a:D (1.42) BS02 EOQ 4.2.1.1 GO:0004089 ... O43570 30006175 MOAD: Kd=0.041nM
    BindingDB: Kd=0.041000nM

    Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Lydia Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).